MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
116001	NC_010524	CAG	3	9	4417979	4417987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060610
116002	NC_010524	GGC	2	6	4418027	4418032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060610
116003	NC_010524	GCA	2	6	4418047	4418052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060610
116004	NC_010524	GTT	2	6	4418066	4418071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060610
116005	NC_010524	C	6	6	4418076	4418081	0 %	0 %	0 %	100 %	171060610
116006	NC_010524	CGG	2	6	4418150	4418155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060610
116007	NC_010524	TCCA	2	8	4418163	4418170	25 %	25 %	0 %	50 %	171060610
116008	NC_010524	GC	3	6	4418216	4418221	0 %	0 %	50 %	50 %	171060610
116009	NC_010524	CTT	3	9	4418455	4418463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060611
116010	NC_010524	CGA	2	6	4418491	4418496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060611
116011	NC_010524	GACCA	2	10	4418526	4418535	40 %	0 %	20 %	40 %	171060611
116012	NC_010524	CAG	2	6	4418672	4418677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060611
116013	NC_010524	GCC	2	6	4418690	4418695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060611
116014	NC_010524	GTC	2	6	4418726	4418731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060611
116015	NC_010524	AGC	2	6	4418739	4418744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060611
116016	NC_010524	TTC	2	6	4418745	4418750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060611
116017	NC_010524	CAGG	2	8	4418768	4418775	25 %	0 %	50 %	25 %	171060611
116018	NC_010524	CCAG	2	8	4418781	4418788	25 %	0 %	25 %	50 %	171060611
116019	NC_010524	ATG	2	6	4418799	4418804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060611
116020	NC_010524	CGGC	2	8	4418830	4418837	0 %	0 %	50 %	50 %	171060611
116021	NC_010524	CCA	2	6	4418845	4418850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060611
116022	NC_010524	TCA	2	6	4418899	4418904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060611
116023	NC_010524	CCAGG	2	10	4418921	4418930	20 %	0 %	40 %	40 %	171060611
116024	NC_010524	TGA	2	6	4418959	4418964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060611
116025	NC_010524	GCG	2	6	4418973	4418978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060611
116026	NC_010524	CCCA	2	8	4419024	4419031	25 %	0 %	0 %	75 %	171060611
116027	NC_010524	CAG	2	6	4419032	4419037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060611
116028	NC_010524	CGTCAG	2	12	4419053	4419064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060611
116029	NC_010524	CAC	2	6	4419155	4419160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060611
116030	NC_010524	GCC	2	6	4419164	4419169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060611
116031	NC_010524	GC	3	6	4419181	4419186	0 %	0 %	50 %	50 %	171060611
116032	NC_010524	GGCC	2	8	4419202	4419209	0 %	0 %	50 %	50 %	171060611
116033	NC_010524	CGA	2	6	4419364	4419369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060611
116034	NC_010524	GCA	2	6	4419374	4419379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060611
116035	NC_010524	GCG	2	6	4419408	4419413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060611
116036	NC_010524	CGC	2	6	4419452	4419457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060611
116037	NC_010524	GCCG	2	8	4419470	4419477	0 %	0 %	50 %	50 %	171060611
116038	NC_010524	TCGA	2	8	4419506	4419513	25 %	25 %	25 %	25 %	171060611
116039	NC_010524	ACG	2	6	4419576	4419581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060611
116040	NC_010524	ATC	2	6	4419582	4419587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060611
116041	NC_010524	GC	3	6	4419633	4419638	0 %	0 %	50 %	50 %	171060611
116042	NC_010524	GCC	2	6	4419644	4419649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060611
116043	NC_010524	TCA	2	6	4419676	4419681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060611
116044	NC_010524	CAG	2	6	4419689	4419694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060611
116045	NC_010524	CAT	2	6	4419704	4419709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060611
116046	NC_010524	CGC	2	6	4419767	4419772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060611
116047	NC_010524	CGG	2	6	4419778	4419783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060611
116048	NC_010524	GCA	2	6	4419792	4419797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060611
116049	NC_010524	GGC	2	6	4419800	4419805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060611
116050	NC_010524	GCCGCA	2	12	4419816	4419827	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060611
116051	NC_010524	TTC	2	6	4419909	4419914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060611
116052	NC_010524	GCA	2	6	4419977	4419982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060612
116053	NC_010524	CGAG	2	8	4419989	4419996	25 %	0 %	50 %	25 %	171060612
116054	NC_010524	CGA	2	6	4420067	4420072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060612
116055	NC_010524	CGT	2	6	4420076	4420081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060612
116056	NC_010524	CGG	2	6	4420085	4420090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060612
116057	NC_010524	GGC	2	6	4420163	4420168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060612
116058	NC_010524	TGA	2	6	4420253	4420258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060612
116059	NC_010524	CGT	2	6	4420570	4420575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060613
116060	NC_010524	AGG	2	6	4420686	4420691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060613
116061	NC_010524	CGCGC	2	10	4420706	4420715	0 %	0 %	40 %	60 %	171060613
116062	NC_010524	CAA	2	6	4420744	4420749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060613
116063	NC_010524	GCCG	2	8	4420771	4420778	0 %	0 %	50 %	50 %	171060613
116064	NC_010524	AGG	2	6	4420788	4420793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060613
116065	NC_010524	CGATCG	2	12	4420812	4420823	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060613
116066	NC_010524	CGC	2	6	4420831	4420836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060613
116067	NC_010524	CAG	2	6	4420849	4420854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060613
116068	NC_010524	CTCG	2	8	4420891	4420898	0 %	25 %	25 %	50 %	171060613
116069	NC_010524	GCGCG	2	10	4420918	4420927	0 %	0 %	60 %	40 %	171060613
116070	NC_010524	CG	3	6	4420963	4420968	0 %	0 %	50 %	50 %	171060613
116071	NC_010524	TGC	2	6	4420977	4420982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060613
116072	NC_010524	GCC	2	6	4421003	4421008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060613
116073	NC_010524	GCCA	2	8	4421036	4421043	25 %	0 %	25 %	50 %	171060613
116074	NC_010524	GTC	2	6	4421054	4421059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060613
116075	NC_010524	CGGCAC	2	12	4421124	4421135	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060613
116076	NC_010524	AGGCC	2	10	4421158	4421167	20 %	0 %	40 %	40 %	171060613
116077	NC_010524	CTG	2	6	4421213	4421218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060613
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116082	NC_010524	GCC	2	6	4421312	4421317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060613
116083	NC_010524	GGCC	2	8	4421329	4421336	0 %	0 %	50 %	50 %	171060613
116084	NC_010524	CGCC	2	8	4421344	4421351	0 %	0 %	25 %	75 %	171060613
116085	NC_010524	CG	3	6	4421361	4421366	0 %	0 %	50 %	50 %	171060613
116086	NC_010524	CGC	2	6	4421376	4421381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060613
116087	NC_010524	CGT	2	6	4421391	4421396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060613
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116097	NC_010524	GCG	2	6	4421830	4421835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060613
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116109	NC_010524	GAA	2	6	4422244	4422249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060614
116110	NC_010524	GCG	2	6	4422272	4422277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060614
116111	NC_010524	CG	3	6	4422294	4422299	0 %	0 %	50 %	50 %	171060614
116112	NC_010524	AGGTGC	2	12	4422314	4422325	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171060614
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116114	NC_010524	TCG	2	6	4422338	4422343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060614
116115	NC_010524	TGG	2	6	4422377	4422382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060614
116116	NC_010524	AACG	2	8	4422397	4422404	50 %	0 %	25 %	25 %	171060614
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116229	NC_010524	GTC	2	6	4426918	4426923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060618
116230	NC_010524	GCTGC	2	10	4426927	4426936	0 %	20 %	40 %	40 %	171060618
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116339	NC_010524	CTGGCG	2	12	4431171	4431182	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060621
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116343	NC_010524	GCT	2	6	4431353	4431358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060621
116344	NC_010524	TGC	4	12	4431370	4431381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060621
116345	NC_010524	CGG	2	6	4431469	4431474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060621
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116443	NC_010524	GCCGC	2	10	4434841	4434850	0 %	0 %	40 %	60 %	171060625
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116448	NC_010524	GCGCG	2	10	4435035	4435044	0 %	0 %	60 %	40 %	171060625
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116450	NC_010524	GGC	2	6	4435062	4435067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060625
116451	NC_010524	CGC	2	6	4435088	4435093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060625
116452	NC_010524	GC	3	6	4435161	4435166	0 %	0 %	50 %	50 %	171060625
116453	NC_010524	AAG	2	6	4435168	4435173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060625
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116455	NC_010524	CGGG	2	8	4435193	4435200	0 %	0 %	75 %	25 %	171060625
116456	NC_010524	CGG	2	6	4435216	4435221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060625
116457	NC_010524	GCC	2	6	4435342	4435347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060625
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116483	NC_010524	CTG	2	6	4436361	4436366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060627
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116491	NC_010524	CAG	2	6	4436613	4436618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060627
116492	NC_010524	GCA	2	6	4436621	4436626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060627
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116496	NC_010524	CCAC	2	8	4436696	4436703	25 %	0 %	0 %	75 %	171060627
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116500	NC_010524	CGCA	2	8	4436757	4436764	25 %	0 %	25 %	50 %	171060628

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