MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114501	NC_010524	ACGGC	2	10	4360624	4360633	20 %	0 %	40 %	40 %	171060556
114502	NC_010524	GCG	2	6	4360698	4360703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060557
114503	NC_010524	ACCT	2	8	4360706	4360713	25 %	25 %	0 %	50 %	171060557
114504	NC_010524	GCT	3	9	4360717	4360725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060557
114505	NC_010524	GCG	2	6	4360745	4360750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060557
114506	NC_010524	GCC	2	6	4360754	4360759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060557
114507	NC_010524	GCG	2	6	4360786	4360791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060557
114508	NC_010524	GCT	2	6	4360807	4360812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060557
114509	NC_010524	GGGC	2	8	4360815	4360822	0 %	0 %	75 %	25 %	171060557
114510	NC_010524	CGC	2	6	4360843	4360848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060557
114511	NC_010524	CG	3	6	4360852	4360857	0 %	0 %	50 %	50 %	171060557
114512	NC_010524	CTG	2	6	4360904	4360909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060557
114513	NC_010524	GCGCC	2	10	4360928	4360937	0 %	0 %	40 %	60 %	171060557
114514	NC_010524	ACG	2	6	4360956	4360961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060557
114515	NC_010524	GCA	2	6	4360974	4360979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060557
114516	NC_010524	TCG	2	6	4361016	4361021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060557
114517	NC_010524	GCCG	2	8	4361043	4361050	0 %	0 %	50 %	50 %	171060557
114518	NC_010524	CGC	3	9	4361068	4361076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060557
114519	NC_010524	CCG	2	6	4361124	4361129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060557
114520	NC_010524	CCG	3	9	4361153	4361161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060557
114521	NC_010524	CGG	2	6	4361259	4361264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060557
114522	NC_010524	CGCC	2	8	4361265	4361272	0 %	0 %	25 %	75 %	171060557
114523	NC_010524	CCG	2	6	4361279	4361284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060557
114524	NC_010524	C	6	6	4361292	4361297	0 %	0 %	0 %	100 %	171060557
114525	NC_010524	CCCGAA	2	12	4361330	4361341	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171060557
114526	NC_010524	CGA	2	6	4361371	4361376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060557
114527	NC_010524	CCG	2	6	4361403	4361408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060557
114528	NC_010524	CGAG	2	8	4361419	4361426	25 %	0 %	50 %	25 %	171060557
114529	NC_010524	CAG	2	6	4361483	4361488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114530	NC_010524	CG	3	6	4361514	4361519	0 %	0 %	50 %	50 %	171060558
114531	NC_010524	CTG	2	6	4361537	4361542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114532	NC_010524	CGT	2	6	4361551	4361556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114533	NC_010524	CGG	2	6	4361565	4361570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060558
114534	NC_010524	CGG	2	6	4361605	4361610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060558
114535	NC_010524	TCG	2	6	4361619	4361624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114536	NC_010524	GCCG	2	8	4361642	4361649	0 %	0 %	50 %	50 %	171060558
114537	NC_010524	GC	3	6	4361671	4361676	0 %	0 %	50 %	50 %	171060558
114538	NC_010524	GCTG	2	8	4361716	4361723	0 %	25 %	50 %	25 %	171060558
114539	NC_010524	GC	3	6	4361743	4361748	0 %	0 %	50 %	50 %	171060558
114540	NC_010524	GT	3	6	4361777	4361782	0 %	50 %	50 %	0 %	171060558
114541	NC_010524	GC	3	6	4361817	4361822	0 %	0 %	50 %	50 %	171060558
114542	NC_010524	CAG	2	6	4361825	4361830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114543	NC_010524	GC	3	6	4361846	4361851	0 %	0 %	50 %	50 %	171060558
114544	NC_010524	CCA	2	6	4361890	4361895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060558
114545	NC_010524	GGC	2	6	4361957	4361962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060558
114546	NC_010524	CGA	2	6	4361995	4362000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114547	NC_010524	TGCGC	2	10	4362001	4362010	0 %	20 %	40 %	40 %	171060558
114548	NC_010524	CAG	2	6	4362026	4362031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114549	NC_010524	GT	3	6	4362039	4362044	0 %	50 %	50 %	0 %	171060558
114550	NC_010524	TGGC	2	8	4362051	4362058	0 %	25 %	50 %	25 %	171060558
114551	NC_010524	TCG	2	6	4362060	4362065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114552	NC_010524	TGCGC	2	10	4362082	4362091	0 %	20 %	40 %	40 %	171060558
114553	NC_010524	GC	3	6	4362119	4362124	0 %	0 %	50 %	50 %	171060558
114554	NC_010524	GC	3	6	4362135	4362140	0 %	0 %	50 %	50 %	171060558
114555	NC_010524	CCG	2	6	4362145	4362150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060558
114556	NC_010524	CTG	2	6	4362182	4362187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114557	NC_010524	CAG	2	6	4362191	4362196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114558	NC_010524	CG	3	6	4362238	4362243	0 %	0 %	50 %	50 %	171060558
114559	NC_010524	CCGGG	2	10	4362245	4362254	0 %	0 %	60 %	40 %	171060558
114560	NC_010524	GGCG	2	8	4362262	4362269	0 %	0 %	75 %	25 %	171060558
114561	NC_010524	GCA	2	6	4362289	4362294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114562	NC_010524	CG	3	6	4362348	4362353	0 %	0 %	50 %	50 %	171060558
114563	NC_010524	CAG	2	6	4362419	4362424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060558
114564	NC_010524	GCG	2	6	4362437	4362442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060558
114565	NC_010524	GGGCA	2	10	4362467	4362476	20 %	0 %	60 %	20 %	171060558
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114569	NC_010524	GCG	2	6	4362585	4362590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060559
114570	NC_010524	GCA	2	6	4362591	4362596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060559
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114572	NC_010524	GCG	2	6	4362643	4362648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060559
114573	NC_010524	CAG	3	9	4362685	4362693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060559
114574	NC_010524	CGG	2	6	4362696	4362701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060559
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114576	NC_010524	CGGCC	2	10	4362746	4362755	0 %	0 %	40 %	60 %	171060559
114577	NC_010524	CAG	2	6	4362781	4362786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060559
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114581	NC_010524	CGG	2	6	4362942	4362947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060559
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114585	NC_010524	GTG	2	6	4363019	4363024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060559
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114589	NC_010524	GC	3	6	4363105	4363110	0 %	0 %	50 %	50 %	171060559
114590	NC_010524	CG	3	6	4363135	4363140	0 %	0 %	50 %	50 %	171060559
114591	NC_010524	CG	4	8	4363197	4363204	0 %	0 %	50 %	50 %	171060559
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114598	NC_010524	GC	3	6	4363394	4363399	0 %	0 %	50 %	50 %	171060559
114599	NC_010524	GCAC	2	8	4363412	4363419	25 %	0 %	25 %	50 %	171060559
114600	NC_010524	GC	3	6	4363422	4363427	0 %	0 %	50 %	50 %	171060559
114601	NC_010524	ACC	2	6	4363460	4363465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060559
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114615	NC_010524	TCG	2	6	4363874	4363879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060559
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