MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010524	GGC	2	6	408102	408107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057064
11002	NC_010524	GAA	2	6	408151	408156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057064
11003	NC_010524	CAG	2	6	408190	408195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057064
11004	NC_010524	GGGC	2	8	408280	408287	0 %	0 %	75 %	25 %	171057064
11005	NC_010524	TGC	2	6	408291	408296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057064
11006	NC_010524	CAG	2	6	408325	408330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057064
11007	NC_010524	GCC	2	6	408409	408414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057064
11008	NC_010524	GCC	2	6	408431	408436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057064
11009	NC_010524	CGC	2	6	408467	408472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057064
11010	NC_010524	GCCA	2	8	408479	408486	25 %	0 %	25 %	50 %	171057064
11011	NC_010524	GCC	2	6	408493	408498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057064
11012	NC_010524	CGG	2	6	408499	408504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057064
11013	NC_010524	GTC	2	6	408544	408549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057064
11014	NC_010524	CG	3	6	408559	408564	0 %	0 %	50 %	50 %	171057064
11015	NC_010524	TCGGG	2	10	408567	408576	0 %	20 %	60 %	20 %	171057064
11016	NC_010524	GCT	2	6	408589	408594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057065
11017	NC_010524	GCA	2	6	408598	408603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057065
11018	NC_010524	CGGCGC	2	12	408643	408654	0 %	0 %	50 %	50 %	171057065
11019	NC_010524	CAT	2	6	408677	408682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057065
11020	NC_010524	CGT	2	6	408688	408693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057065
11021	NC_010524	GCCA	2	8	408696	408703	25 %	0 %	25 %	50 %	171057065
11022	NC_010524	GGC	4	12	408710	408721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057065
11023	NC_010524	CGC	2	6	408739	408744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057065
11024	NC_010524	CGC	2	6	408789	408794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057065
11025	NC_010524	TCG	2	6	408879	408884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057065
11026	NC_010524	CTT	2	6	408911	408916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057065
11027	NC_010524	GCCG	2	8	408935	408942	0 %	0 %	50 %	50 %	171057065
11028	NC_010524	ATG	2	6	409002	409007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057065
11029	NC_010524	GC	3	6	409036	409041	0 %	0 %	50 %	50 %	171057065
11030	NC_010524	CAT	2	6	409067	409072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057065
11031	NC_010524	CGA	2	6	409084	409089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057065
11032	NC_010524	TCG	2	6	409146	409151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057065
11033	NC_010524	GTC	2	6	409169	409174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057065
11034	NC_010524	TCA	2	6	409225	409230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057065
11035	NC_010524	GCG	2	6	409247	409252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057065
11036	NC_010524	GCA	2	6	409393	409398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057065
11037	NC_010524	GC	3	6	409522	409527	0 %	0 %	50 %	50 %	171057065
11038	NC_010524	GGC	2	6	409558	409563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057065
11039	NC_010524	GCTG	2	8	409574	409581	0 %	25 %	50 %	25 %	171057065
11040	NC_010524	CCG	2	6	409990	409995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057066
11041	NC_010524	GTGG	2	8	410025	410032	0 %	25 %	75 %	0 %	171057066
11042	NC_010524	CGAG	2	8	410048	410055	25 %	0 %	50 %	25 %	171057066
11043	NC_010524	TCG	2	6	410077	410082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057066
11044	NC_010524	TGC	2	6	410090	410095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057066
11045	NC_010524	GCG	2	6	410096	410101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057066
11046	NC_010524	TCG	3	9	410122	410130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057066
11047	NC_010524	C	7	7	410160	410166	0 %	0 %	0 %	100 %	171057066
11048	NC_010524	GCT	2	6	410180	410185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057066
11049	NC_010524	GCA	2	6	410270	410275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057066
11050	NC_010524	GCA	2	6	410315	410320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057066
11051	NC_010524	CCA	2	6	410387	410392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057066
11052	NC_010524	ATC	2	6	410422	410427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057066
11053	NC_010524	AC	4	8	410434	410441	50 %	0 %	0 %	50 %	171057066
11054	NC_010524	TGA	2	6	410492	410497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057066
11055	NC_010524	GC	3	6	410563	410568	0 %	0 %	50 %	50 %	171057066
11056	NC_010524	TGG	2	6	410569	410574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057066
11057	NC_010524	GGC	2	6	410602	410607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057066
11058	NC_010524	GGCC	3	12	410644	410655	0 %	0 %	50 %	50 %	171057066
11059	NC_010524	CCG	2	6	410935	410940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057067
11060	NC_010524	TCA	2	6	410948	410953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057067
11061	NC_010524	TCA	2	6	410957	410962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057067
11062	NC_010524	TCT	2	6	410978	410983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057067
11063	NC_010524	TCA	2	6	410984	410989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057067
11064	NC_010524	CCTGCA	2	12	411032	411043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171057067
11065	NC_010524	CGG	2	6	411053	411058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057067
11066	NC_010524	GCG	2	6	411063	411068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057067
11067	NC_010524	GCG	2	6	411099	411104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057067
11068	NC_010524	GCG	2	6	411110	411115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057067
11069	NC_010524	GGCC	2	8	411179	411186	0 %	0 %	50 %	50 %	171057067
11070	NC_010524	GGC	2	6	411189	411194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057067
11071	NC_010524	CGGC	2	8	411200	411207	0 %	0 %	50 %	50 %	171057067
11072	NC_010524	GCCC	2	8	411230	411237	0 %	0 %	25 %	75 %	171057067
11073	NC_010524	TCT	2	6	411239	411244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057067
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11077	NC_010524	TCT	2	6	411434	411439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057067
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11079	NC_010524	TGC	2	6	411476	411481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057067
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11081	NC_010524	CCT	2	6	411554	411559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057067
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11083	NC_010524	GCGTG	2	10	411635	411644	0 %	20 %	60 %	20 %	171057067
11084	NC_010524	TCG	2	6	411673	411678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057067
11085	NC_010524	CGGC	2	8	411688	411695	0 %	0 %	50 %	50 %	171057067
11086	NC_010524	CAG	2	6	411705	411710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057067
11087	NC_010524	GTG	2	6	411720	411725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057067
11088	NC_010524	CG	3	6	411761	411766	0 %	0 %	50 %	50 %	171057067
11089	NC_010524	GCCT	2	8	411805	411812	0 %	25 %	25 %	50 %	171057067
11090	NC_010524	GCT	2	6	411827	411832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057067
11091	NC_010524	GGC	2	6	411837	411842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057067
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11093	NC_010524	GGT	4	12	411918	411929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057067
11094	NC_010524	GGCC	2	8	411947	411954	0 %	0 %	50 %	50 %	171057067
11095	NC_010524	CCG	2	6	411965	411970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057067
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11098	NC_010524	CCT	2	6	412079	412084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057067
11099	NC_010524	CAC	2	6	412125	412130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057067
11100	NC_010524	GCA	2	6	412175	412180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057067
11101	NC_010524	GC	3	6	412206	412211	0 %	0 %	50 %	50 %	171057067
11102	NC_010524	CGG	2	6	412480	412485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057068
11103	NC_010524	CTGG	2	8	412618	412625	0 %	25 %	50 %	25 %	171057068
11104	NC_010524	TGCCGG	2	12	412659	412670	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057068
11105	NC_010524	GCG	2	6	412675	412680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057068
11106	NC_010524	CTG	2	6	412682	412687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057068
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11108	NC_010524	TGC	2	6	412710	412715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057068
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11110	NC_010524	TGC	2	6	412821	412826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057068
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11112	NC_010524	GCCG	2	8	412876	412883	0 %	0 %	50 %	50 %	171057068
11113	NC_010524	GCT	2	6	412903	412908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057068
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11116	NC_010524	TGC	2	6	412971	412976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057068
11117	NC_010524	GCTGG	2	10	413032	413041	0 %	20 %	60 %	20 %	171057068
11118	NC_010524	CGG	2	6	413062	413067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057068
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11120	NC_010524	GC	3	6	413095	413100	0 %	0 %	50 %	50 %	171057068
11121	NC_010524	CTG	4	12	413129	413140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057068
11122	NC_010524	TGC	3	9	413172	413180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057068
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11228	NC_010524	GCA	2	6	416011	416016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057071
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11231	NC_010524	GGCC	2	8	416048	416055	0 %	0 %	50 %	50 %	171057071
11232	NC_010524	GCA	2	6	416069	416074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057071
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11240	NC_010524	CTT	2	6	416306	416311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057071
11241	NC_010524	CG	4	8	416318	416325	0 %	0 %	50 %	50 %	171057071
11242	NC_010524	CGA	2	6	416342	416347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057071
11243	NC_010524	GCT	2	6	416381	416386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057071
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11270	NC_010524	GGTG	2	8	417223	417230	0 %	25 %	75 %	0 %	171057072
11271	NC_010524	ATCG	2	8	417232	417239	25 %	25 %	25 %	25 %	171057072
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11345	NC_010524	CAT	2	6	420428	420433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057073
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11349	NC_010524	AGA	2	6	420620	420625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057073
11350	NC_010524	AAG	2	6	420753	420758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057073
11351	NC_010524	GAC	2	6	420800	420805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057073
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11353	NC_010524	CGGCT	2	10	420893	420902	0 %	20 %	40 %	40 %	171057073
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11355	NC_010524	CGA	2	6	420962	420967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057073
11356	NC_010524	CGT	2	6	420970	420975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057073
11357	NC_010524	TC	3	6	421160	421165	0 %	50 %	0 %	50 %	171057074
11358	NC_010524	GCC	2	6	421270	421275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057074
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11360	NC_010524	CGC	2	6	421288	421293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057074
11361	NC_010524	CAT	2	6	421314	421319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057074
11362	NC_010524	CG	3	6	421430	421435	0 %	0 %	50 %	50 %	171057074
11363	NC_010524	TCA	2	6	421487	421492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057074
11364	NC_010524	CTT	2	6	421506	421511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057074
11365	NC_010524	CCG	2	6	421517	421522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057074
11366	NC_010524	TCGC	2	8	421525	421532	0 %	25 %	25 %	50 %	171057074
11367	NC_010524	CAA	2	6	421536	421541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057074
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11369	NC_010524	TCG	2	6	421646	421651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057074
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11373	NC_010524	CAGTAC	2	12	421912	421923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171057074
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11376	NC_010524	TTC	2	6	422248	422253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057074
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11389	NC_010524	GCT	2	6	423537	423542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057075
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11480	NC_010524	CAG	2	6	427058	427063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057079
11481	NC_010524	CGG	2	6	427081	427086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057079
11482	NC_010524	CAC	2	6	427088	427093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057079
11483	NC_010524	CGA	2	6	427099	427104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057079
11484	NC_010524	GCCG	2	8	427157	427164	0 %	0 %	50 %	50 %	171057079
11485	NC_010524	GCG	2	6	427179	427184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057079
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11490	NC_010524	TGC	2	6	427362	427367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057079
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11492	NC_010524	GCT	2	6	427373	427378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057079
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