MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114001	NC_010524	GAA	2	6	4341129	4341134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060537
114002	NC_010524	ACGCA	2	10	4341280	4341289	40 %	0 %	20 %	40 %	171060537
114003	NC_010524	CGG	2	6	4341292	4341297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060537
114004	NC_010524	GGT	2	6	4341305	4341310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060537
114005	NC_010524	GTC	2	6	4341315	4341320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
114006	NC_010524	GCCGTT	2	12	4341327	4341338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
114007	NC_010524	GAC	2	6	4341360	4341365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
114008	NC_010524	GTC	2	6	4341375	4341380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
114009	NC_010524	CG	3	6	4341449	4341454	0 %	0 %	50 %	50 %	171060537
114010	NC_010524	TCGG	2	8	4341514	4341521	0 %	25 %	50 %	25 %	171060537
114011	NC_010524	CAT	2	6	4341537	4341542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060537
114012	NC_010524	CG	4	8	4341557	4341564	0 %	0 %	50 %	50 %	171060537
114013	NC_010524	CGG	2	6	4341575	4341580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060537
114014	NC_010524	TGA	2	6	4341605	4341610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060537
114015	NC_010524	CTT	2	6	4341675	4341680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060537
114016	NC_010524	AGC	3	9	4341682	4341690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
114017	NC_010524	GC	3	6	4341750	4341755	0 %	0 %	50 %	50 %	171060537
114018	NC_010524	AGCG	2	8	4341817	4341824	25 %	0 %	50 %	25 %	171060537
114019	NC_010524	CGA	3	9	4341857	4341865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
114020	NC_010524	CGA	2	6	4341923	4341928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
114021	NC_010524	GAA	2	6	4341975	4341980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060537
114022	NC_010524	GCG	3	9	4342044	4342052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060537
114023	NC_010524	GAA	2	6	4342062	4342067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060537
114024	NC_010524	CAG	2	6	4342137	4342142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
114025	NC_010524	GAA	2	6	4342179	4342184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060537
114026	NC_010524	TCA	2	6	4342259	4342264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060537
114027	NC_010524	CCT	2	6	4342286	4342291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060537
114028	NC_010524	ACC	2	6	4342309	4342314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060537
114029	NC_010524	ATC	2	6	4342351	4342356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060537
114030	NC_010524	GC	3	6	4342366	4342371	0 %	0 %	50 %	50 %	171060537
114031	NC_010524	CGG	3	9	4342373	4342381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060537
114032	NC_010524	GCT	2	6	4342397	4342402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
114033	NC_010524	CGG	2	6	4342422	4342427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060537
114034	NC_010524	CAG	2	6	4342587	4342592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060537
114035	NC_010524	GC	3	6	4342615	4342620	0 %	0 %	50 %	50 %	171060537
114036	NC_010524	TGCGCT	2	12	4342640	4342651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060537
114037	NC_010524	ATCA	2	8	4342681	4342688	50 %	25 %	0 %	25 %	171060537
114038	NC_010524	CAG	2	6	4343053	4343058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060538
114039	NC_010524	CTT	2	6	4343059	4343064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060538
114040	NC_010524	CCTT	2	8	4343096	4343103	0 %	50 %	0 %	50 %	171060538
114041	NC_010524	TTC	2	6	4343108	4343113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060538
114042	NC_010524	CTTC	2	8	4343139	4343146	0 %	50 %	0 %	50 %	171060538
114043	NC_010524	AGGCCC	2	12	4343147	4343158	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060538
114044	NC_010524	TGA	2	6	4343178	4343183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060538
114045	NC_010524	AGC	2	6	4343210	4343215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060538
114046	NC_010524	ACG	2	6	4343216	4343221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060538
114047	NC_010524	TCT	2	6	4343232	4343237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060538
114048	NC_010524	CGG	3	9	4343247	4343255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060538
114049	NC_010524	GGC	2	6	4343278	4343283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060538
114050	NC_010524	GCG	2	6	4343291	4343296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060538
114051	NC_010524	GCT	2	6	4343441	4343446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060539
114052	NC_010524	CG	3	6	4343528	4343533	0 %	0 %	50 %	50 %	171060539
114053	NC_010524	GCA	2	6	4343553	4343558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060539
114054	NC_010524	CAC	2	6	4343649	4343654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060539
114055	NC_010524	ACC	2	6	4343696	4343701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060539
114056	NC_010524	GCA	2	6	4343708	4343713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060539
114057	NC_010524	GCC	2	6	4343762	4343767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060539
114058	NC_010524	TTC	2	6	4343810	4343815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060539
114059	NC_010524	AC	3	6	4343829	4343834	50 %	0 %	0 %	50 %	171060539
114060	NC_010524	CG	3	6	4343841	4343846	0 %	0 %	50 %	50 %	171060539
114061	NC_010524	GCG	2	6	4343851	4343856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060539
114062	NC_010524	GAGC	2	8	4343915	4343922	25 %	0 %	50 %	25 %	171060539
114063	NC_010524	GCC	2	6	4343930	4343935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060539
114064	NC_010524	CCA	2	6	4343943	4343948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060539
114065	NC_010524	GCT	2	6	4343951	4343956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060539
114066	NC_010524	TCA	2	6	4344256	4344261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060540
114067	NC_010524	ACGCCC	2	12	4344308	4344319	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171060540
114068	NC_010524	CGA	2	6	4344325	4344330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060540
114069	NC_010524	CAG	2	6	4344394	4344399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060540
114070	NC_010524	CGAA	2	8	4344432	4344439	50 %	0 %	25 %	25 %	171060540
114071	NC_010524	CGA	2	6	4344440	4344445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060540
114072	NC_010524	GAT	2	6	4344460	4344465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060540
114073	NC_010524	GCC	2	6	4344466	4344471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060540
114074	NC_010524	CGG	2	6	4344516	4344521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060540
114075	NC_010524	CGG	2	6	4344531	4344536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060540
114076	NC_010524	CG	3	6	4344570	4344575	0 %	0 %	50 %	50 %	171060540
114077	NC_010524	GACC	2	8	4344597	4344604	25 %	0 %	25 %	50 %	171060540
114078	NC_010524	GGCGA	2	10	4344620	4344629	20 %	0 %	60 %	20 %	171060540
114079	NC_010524	CAG	2	6	4344666	4344671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060540
114080	NC_010524	GTC	2	6	4344676	4344681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060540
114081	NC_010524	CGA	2	6	4344687	4344692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060540
114082	NC_010524	TCA	2	6	4344716	4344721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060540
114083	NC_010524	ACG	2	6	4344782	4344787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060540
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114085	NC_010524	CTT	2	6	4344811	4344816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060540
114086	NC_010524	TCGA	2	8	4344845	4344852	25 %	25 %	25 %	25 %	171060540
114087	NC_010524	TCG	2	6	4344854	4344859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060540
114088	NC_010524	TGG	2	6	4344918	4344923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060540
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114097	NC_010524	GCCG	2	8	4345358	4345365	0 %	0 %	50 %	50 %	171060541
114098	NC_010524	CGA	2	6	4345387	4345392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060541
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114101	NC_010524	TGG	2	6	4345575	4345580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060542
114102	NC_010524	CCTT	2	8	4345689	4345696	0 %	50 %	0 %	50 %	171060542
114103	NC_010524	CAC	2	6	4345703	4345708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060542
114104	NC_010524	CAC	2	6	4345819	4345824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060542
114105	NC_010524	CGA	2	6	4345825	4345830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060542
114106	NC_010524	CATC	2	8	4345876	4345883	25 %	25 %	0 %	50 %	171060542
114107	NC_010524	GAA	2	6	4345910	4345915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060542
114108	NC_010524	GCG	2	6	4345916	4345921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060542
114109	NC_010524	CTT	2	6	4345934	4345939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060542
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114111	NC_010524	CGA	2	6	4345954	4345959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060542
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114113	NC_010524	GCC	2	6	4346094	4346099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060542
114114	NC_010524	CCG	2	6	4346356	4346361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060543
114115	NC_010524	GCC	2	6	4346382	4346387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060543
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114227	NC_010524	TCG	2	6	4351574	4351579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060548
114228	NC_010524	ATC	2	6	4351658	4351663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060548
114229	NC_010524	AGC	2	6	4351664	4351669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060548
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114233	NC_010524	GCT	2	6	4352175	4352180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060549
114234	NC_010524	CTG	2	6	4352215	4352220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060549
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114254	NC_010524	GCG	2	6	4352688	4352693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060549
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114330	NC_010524	GCT	2	6	4355467	4355472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060551
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114332	NC_010524	CGGCCG	2	12	4355566	4355577	0 %	0 %	50 %	50 %	171060551
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114338	NC_010524	CG	3	6	4355725	4355730	0 %	0 %	50 %	50 %	171060551
114339	NC_010524	GC	3	6	4355735	4355740	0 %	0 %	50 %	50 %	171060551
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114341	NC_010524	GCC	2	6	4355757	4355762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060551
114342	NC_010524	CG	3	6	4355780	4355785	0 %	0 %	50 %	50 %	171060551
114343	NC_010524	GCG	2	6	4355790	4355795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060551
114344	NC_010524	GCG	2	6	4355803	4355808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060551
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114439	NC_010524	GCCGG	2	10	4358576	4358585	0 %	0 %	60 %	40 %	171060554
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114444	NC_010524	GC	3	6	4358735	4358740	0 %	0 %	50 %	50 %	171060554
114445	NC_010524	TCG	2	6	4358781	4358786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060554
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114447	NC_010524	AAC	2	6	4358807	4358812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060554
114448	NC_010524	GCCGA	2	10	4358867	4358876	20 %	0 %	40 %	40 %	171060554
114449	NC_010524	CGA	2	6	4358887	4358892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060554
114450	NC_010524	TCG	2	6	4358924	4358929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060554
114451	NC_010524	CAC	2	6	4358959	4358964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060554
114452	NC_010524	TGC	2	6	4359000	4359005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060554
114453	NC_010524	CGA	3	9	4359049	4359057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060554
114454	NC_010524	GCA	2	6	4359120	4359125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060554
114455	NC_010524	ACCG	2	8	4359131	4359138	25 %	0 %	25 %	50 %	171060554
114456	NC_010524	TGC	2	6	4359156	4359161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060554
114457	NC_010524	CGC	2	6	4359168	4359173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060554
114458	NC_010524	GCCG	2	8	4359193	4359200	0 %	0 %	50 %	50 %	171060554
114459	NC_010524	GGC	2	6	4359235	4359240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060554
114460	NC_010524	GCCACC	4	24	4359296	4359319	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171060554
114461	NC_010524	ACGCTC	2	12	4359335	4359346	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171060554
114462	NC_010524	GCCG	2	8	4359358	4359365	0 %	0 %	50 %	50 %	171060554
114463	NC_010524	TGCCGC	2	12	4359369	4359380	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171060554
114464	NC_010524	TGGC	2	8	4359392	4359399	0 %	25 %	50 %	25 %	171060554
114465	NC_010524	GC	3	6	4359446	4359451	0 %	0 %	50 %	50 %	171060554
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114467	NC_010524	CGG	2	6	4359529	4359534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060554
114468	NC_010524	CGG	2	6	4359550	4359555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060554
114469	NC_010524	CGC	2	6	4359570	4359575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060554
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114473	NC_010524	GCT	2	6	4359834	4359839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060555
114474	NC_010524	TCG	2	6	4359854	4359859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060555
114475	NC_010524	GC	3	6	4359927	4359932	0 %	0 %	50 %	50 %	171060555
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114478	NC_010524	CGA	2	6	4360008	4360013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060555
114479	NC_010524	CG	3	6	4360062	4360067	0 %	0 %	50 %	50 %	171060555
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114482	NC_010524	CG	3	6	4360109	4360114	0 %	0 %	50 %	50 %	171060555
114483	NC_010524	GCCG	2	8	4360140	4360147	0 %	0 %	50 %	50 %	171060555
114484	NC_010524	ACG	2	6	4360184	4360189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060555
114485	NC_010524	CGC	2	6	4360190	4360195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060555
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114489	NC_010524	CTG	2	6	4360308	4360313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060556
114490	NC_010524	GTG	2	6	4360314	4360319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060556
114491	NC_010524	CAT	2	6	4360325	4360330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060556
114492	NC_010524	GCT	2	6	4360337	4360342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060556
114493	NC_010524	GC	3	6	4360379	4360384	0 %	0 %	50 %	50 %	171060556
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