MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113501	NC_010524	CCGT	2	8	4320490	4320497	0 %	25 %	25 %	50 %	171060523
113502	NC_010524	CAC	2	6	4320508	4320513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060523
113503	NC_010524	CGC	2	6	4320572	4320577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060523
113504	NC_010524	GC	3	6	4320586	4320591	0 %	0 %	50 %	50 %	171060523
113505	NC_010524	AGC	2	6	4320608	4320613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060523
113506	NC_010524	GCG	2	6	4320616	4320621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060523
113507	NC_010524	GGC	2	6	4320634	4320639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060523
113508	NC_010524	GC	3	6	4320672	4320677	0 %	0 %	50 %	50 %	171060523
113509	NC_010524	CGGC	2	8	4320702	4320709	0 %	0 %	50 %	50 %	171060523
113510	NC_010524	GCC	2	6	4320776	4320781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060523
113511	NC_010524	CAGCGC	2	12	4320823	4320834	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060523
113512	NC_010524	CGA	2	6	4320849	4320854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060523
113513	NC_010524	TGA	2	6	4320855	4320860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060523
113514	NC_010524	GCT	2	6	4320888	4320893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060523
113515	NC_010524	GAA	2	6	4320934	4320939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060523
113516	NC_010524	TTC	2	6	4320973	4320978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060523
113517	NC_010524	GGC	2	6	4320979	4320984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060523
113518	NC_010524	GAA	2	6	4321024	4321029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060523
113519	NC_010524	GCC	2	6	4321061	4321066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060523
113520	NC_010524	CGC	2	6	4321087	4321092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060523
113521	NC_010524	CG	3	6	4321119	4321124	0 %	0 %	50 %	50 %	171060523
113522	NC_010524	GC	3	6	4321132	4321137	0 %	0 %	50 %	50 %	171060523
113523	NC_010524	CAG	2	6	4321147	4321152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060523
113524	NC_010524	GCA	2	6	4321158	4321163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060523
113525	NC_010524	ATCAGC	2	12	4321178	4321189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171060523
113526	NC_010524	GCA	2	6	4321209	4321214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060523
113527	NC_010524	GCC	2	6	4321270	4321275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060523
113528	NC_010524	GCG	2	6	4321290	4321295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060523
113529	NC_010524	CAGCAC	3	18	4321300	4321317	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171060523
113530	NC_010524	CCA	3	9	4321332	4321340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060523
113531	NC_010524	CGC	2	6	4321380	4321385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060523
113532	NC_010524	GC	3	6	4321384	4321389	0 %	0 %	50 %	50 %	171060523
113533	NC_010524	AGC	2	6	4321403	4321408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060523
113534	NC_010524	ACC	2	6	4321409	4321414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060523
113535	NC_010524	CGACAG	2	12	4321426	4321437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060523
113536	NC_010524	CAC	2	6	4321472	4321477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060523
113537	NC_010524	CAC	2	6	4321519	4321524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060523
113538	NC_010524	CAG	2	6	4321555	4321560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060523
113539	NC_010524	GTC	2	6	4321561	4321566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060523
113540	NC_010524	GGCCG	2	10	4321663	4321672	0 %	0 %	60 %	40 %	171060523
113541	NC_010524	CCA	2	6	4321686	4321691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060523
113542	NC_010524	CCA	2	6	4321698	4321703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060523
113543	NC_010524	CGG	2	6	4321761	4321766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060523
113544	NC_010524	GTG	2	6	4321772	4321777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060523
113545	NC_010524	TGT	2	6	4321788	4321793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060523
113546	NC_010524	CGG	2	6	4321972	4321977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060524
113547	NC_010524	CCG	2	6	4321998	4322003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060524
113548	NC_010524	TGC	2	6	4322034	4322039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060524
113549	NC_010524	GGCC	2	8	4322140	4322147	0 %	0 %	50 %	50 %	171060524
113550	NC_010524	TCG	2	6	4322189	4322194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060524
113551	NC_010524	GAC	2	6	4322212	4322217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060524
113552	NC_010524	CTG	2	6	4322231	4322236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060524
113553	NC_010524	GCGACT	2	12	4322238	4322249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060524
113554	NC_010524	GCG	2	6	4322259	4322264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060524
113555	NC_010524	TGA	2	6	4322274	4322279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060524
113556	NC_010524	GCG	2	6	4322313	4322318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060524
113557	NC_010524	CG	3	6	4322317	4322322	0 %	0 %	50 %	50 %	171060524
113558	NC_010524	GAT	2	6	4322338	4322343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060524
113559	NC_010524	GACC	2	8	4322365	4322372	25 %	0 %	25 %	50 %	171060524
113560	NC_010524	GAG	2	6	4322438	4322443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060524
113561	NC_010524	CGA	2	6	4322566	4322571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060524
113562	NC_010524	AAG	2	6	4322627	4322632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060524
113563	NC_010524	GGC	2	6	4322636	4322641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060524
113564	NC_010524	CCG	2	6	4322649	4322654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060524
113565	NC_010524	ACG	2	6	4322673	4322678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060524
113566	NC_010524	GCC	2	6	4322681	4322686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060524
113567	NC_010524	TTC	2	6	4322687	4322692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060524
113568	NC_010524	CGC	2	6	4322704	4322709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060524
113569	NC_010524	CGCC	2	8	4322740	4322747	0 %	0 %	25 %	75 %	171060524
113570	NC_010524	CCA	2	6	4322808	4322813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060524
113571	NC_010524	AAG	2	6	4322825	4322830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060524
113572	NC_010524	CGAA	2	8	4322868	4322875	50 %	0 %	25 %	25 %	171060524
113573	NC_010524	CG	3	6	4322902	4322907	0 %	0 %	50 %	50 %	171060524
113574	NC_010524	CGG	2	6	4322944	4322949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060524
113575	NC_010524	GCT	2	6	4322976	4322981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060524
113576	NC_010524	CGG	3	9	4323061	4323069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060524
113577	NC_010524	CGA	2	6	4323081	4323086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060524
113578	NC_010524	GTAG	2	8	4323222	4323229	25 %	25 %	50 %	0 %	171060525
113579	NC_010524	ATCG	2	8	4323264	4323271	25 %	25 %	25 %	25 %	171060525
113580	NC_010524	ACG	2	6	4323311	4323316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060525
113581	NC_010524	CTG	2	6	4323341	4323346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060525
113582	NC_010524	CTT	2	6	4323396	4323401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060525
113583	NC_010524	TGA	2	6	4323503	4323508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060525
113584	NC_010524	GAA	2	6	4323511	4323516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060525
113585	NC_010524	ACC	2	6	4323519	4323524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060525
113586	NC_010524	ACTC	2	8	4323678	4323685	25 %	25 %	0 %	50 %	171060526
113587	NC_010524	CAG	2	6	4323695	4323700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060526
113588	NC_010524	CCA	2	6	4323712	4323717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060526
113589	NC_010524	CGG	2	6	4323719	4323724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060526
113590	NC_010524	CGA	2	6	4323742	4323747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060526
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113592	NC_010524	ATC	2	6	4323819	4323824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060526
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113594	NC_010524	CTTGGC	2	12	4323881	4323892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060526
113595	NC_010524	GGC	2	6	4323940	4323945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060526
113596	NC_010524	ATC	2	6	4323978	4323983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060526
113597	NC_010524	TTA	2	6	4324131	4324136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171060527
113598	NC_010524	TCCG	2	8	4324167	4324174	0 %	25 %	25 %	50 %	171060527
113599	NC_010524	GAG	2	6	4324180	4324185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060527
113600	NC_010524	TCG	2	6	4324255	4324260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060527
113601	NC_010524	GAC	2	6	4324261	4324266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060527
113602	NC_010524	GGC	2	6	4324280	4324285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060527
113603	NC_010524	CGA	2	6	4324287	4324292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060527
113604	NC_010524	CGA	2	6	4324332	4324337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060527
113605	NC_010524	TGC	2	6	4324343	4324348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060527
113606	NC_010524	CGA	2	6	4324368	4324373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060527
113607	NC_010524	TGC	3	9	4324376	4324384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060527
113608	NC_010524	TGG	2	6	4324414	4324419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060527
113609	NC_010524	ACA	2	6	4324424	4324429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060527
113610	NC_010524	CGCA	2	8	4324440	4324447	25 %	0 %	25 %	50 %	171060527
113611	NC_010524	CGC	2	6	4324497	4324502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060527
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113613	NC_010524	CGGC	2	8	4324606	4324613	0 %	0 %	50 %	50 %	171060527
113614	NC_010524	CGC	2	6	4324797	4324802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060528
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113728	NC_010524	CGT	2	6	4329364	4329369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060532
113729	NC_010524	CCTG	2	8	4329393	4329400	0 %	25 %	25 %	50 %	171060532
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113840	NC_010524	GC	3	6	4334439	4334444	0 %	0 %	50 %	50 %	171060536
113841	NC_010524	CGA	2	6	4334486	4334491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
113842	NC_010524	TCG	2	6	4334518	4334523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
113843	NC_010524	ATG	2	6	4334533	4334538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060536
113844	NC_010524	GCC	2	6	4334539	4334544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060536
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113846	NC_010524	GCC	2	6	4334578	4334583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060536
113847	NC_010524	GTCG	2	8	4334595	4334602	0 %	25 %	50 %	25 %	171060536
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113851	NC_010524	TCG	2	6	4334839	4334844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060536
113852	NC_010524	GC	3	6	4334853	4334858	0 %	0 %	50 %	50 %	171060536
113853	NC_010524	CAG	2	6	4334874	4334879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060536
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