MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_010524	TGA	2	6	4302002	4302007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060508
113002	NC_010524	CG	3	6	4302039	4302044	0 %	0 %	50 %	50 %	171060508
113003	NC_010524	TCA	2	6	4302074	4302079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060508
113004	NC_010524	CCA	2	6	4302089	4302094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060508
113005	NC_010524	CGC	2	6	4302216	4302221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060508
113006	NC_010524	GCC	3	9	4302249	4302257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060508
113007	NC_010524	GCCG	2	8	4302265	4302272	0 %	0 %	50 %	50 %	171060508
113008	NC_010524	ACA	2	6	4302323	4302328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060508
113009	NC_010524	CGA	2	6	4302372	4302377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113010	NC_010524	GATC	2	8	4302390	4302397	25 %	25 %	25 %	25 %	171060508
113011	NC_010524	CGGC	2	8	4302434	4302441	0 %	0 %	50 %	50 %	171060508
113012	NC_010524	CAG	2	6	4302502	4302507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113013	NC_010524	GC	3	6	4302529	4302534	0 %	0 %	50 %	50 %	171060508
113014	NC_010524	CTG	2	6	4302538	4302543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113015	NC_010524	CGA	2	6	4302546	4302551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113016	NC_010524	CTG	2	6	4302598	4302603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113017	NC_010524	CGA	2	6	4302633	4302638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113018	NC_010524	CAG	2	6	4302654	4302659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113019	NC_010524	CTG	2	6	4302709	4302714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113020	NC_010524	GACC	2	8	4302762	4302769	25 %	0 %	25 %	50 %	171060508
113021	NC_010524	GTCG	2	8	4302873	4302880	0 %	25 %	50 %	25 %	171060508
113022	NC_010524	AGC	2	6	4302901	4302906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113023	NC_010524	GCT	2	6	4302939	4302944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113024	NC_010524	GCC	2	6	4302989	4302994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060508
113025	NC_010524	GC	4	8	4303040	4303047	0 %	0 %	50 %	50 %	171060508
113026	NC_010524	GCT	2	6	4303071	4303076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113027	NC_010524	CGA	2	6	4303077	4303082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113028	NC_010524	GCA	2	6	4303112	4303117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060508
113029	NC_010524	CGC	2	6	4303131	4303136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060508
113030	NC_010524	TGG	2	6	4303139	4303144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060508
113031	NC_010524	GGC	2	6	4303164	4303169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060508
113032	NC_010524	CAGGC	2	10	4303225	4303234	20 %	0 %	40 %	40 %	171060509
113033	NC_010524	GCG	2	6	4303237	4303242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060509
113034	NC_010524	GCA	2	6	4303262	4303267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060509
113035	NC_010524	ACC	2	6	4303291	4303296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060509
113036	NC_010524	TGG	2	6	4303328	4303333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060509
113037	NC_010524	CGC	2	6	4303337	4303342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060509
113038	NC_010524	CGC	2	6	4303367	4303372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060509
113039	NC_010524	GCT	2	6	4303376	4303381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060509
113040	NC_010524	GCC	2	6	4303428	4303433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060509
113041	NC_010524	TCA	2	6	4303436	4303441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060509
113042	NC_010524	TGG	2	6	4303457	4303462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060509
113043	NC_010524	CGG	2	6	4303499	4303504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060509
113044	NC_010524	CCG	2	6	4303555	4303560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060509
113045	NC_010524	AGC	2	6	4303565	4303570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060509
113046	NC_010524	ACG	2	6	4303615	4303620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060509
113047	NC_010524	GCCCG	2	10	4303641	4303650	0 %	0 %	40 %	60 %	171060509
113048	NC_010524	CG	4	8	4303670	4303677	0 %	0 %	50 %	50 %	171060509
113049	NC_010524	GGT	2	6	4303718	4303723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060509
113050	NC_010524	GCC	2	6	4303740	4303745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060509
113051	NC_010524	ACC	2	6	4303762	4303767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060509
113052	NC_010524	GCG	2	6	4303772	4303777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060509
113053	NC_010524	GCT	2	6	4303796	4303801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060509
113054	NC_010524	GCG	3	9	4303809	4303817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060509
113055	NC_010524	CAG	2	6	4303929	4303934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060509
113056	NC_010524	GGC	2	6	4303950	4303955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060509
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113058	NC_010524	CG	3	6	4304106	4304111	0 %	0 %	50 %	50 %	171060510
113059	NC_010524	GC	3	6	4304122	4304127	0 %	0 %	50 %	50 %	171060510
113060	NC_010524	GC	3	6	4304204	4304209	0 %	0 %	50 %	50 %	171060510
113061	NC_010524	GCA	2	6	4304217	4304222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060510
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113064	NC_010524	GC	3	6	4304278	4304283	0 %	0 %	50 %	50 %	171060510
113065	NC_010524	GTC	2	6	4304305	4304310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060510
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113070	NC_010524	CAG	2	6	4304509	4304514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060510
113071	NC_010524	TCG	2	6	4304567	4304572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060510
113072	NC_010524	CAG	4	12	4304593	4304604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060510
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113074	NC_010524	CGT	2	6	4304911	4304916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060511
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113081	NC_010524	CGT	2	6	4305049	4305054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060511
113082	NC_010524	CAT	2	6	4305062	4305067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060511
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113085	NC_010524	GC	3	6	4305120	4305125	0 %	0 %	50 %	50 %	171060511
113086	NC_010524	CAG	2	6	4305161	4305166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060511
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113097	NC_010524	GGCC	2	8	4305475	4305482	0 %	0 %	50 %	50 %	171060511
113098	NC_010524	CAG	2	6	4305491	4305496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060511
113099	NC_010524	CGC	2	6	4305541	4305546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060511
113100	NC_010524	GC	3	6	4305545	4305550	0 %	0 %	50 %	50 %	171060511
113101	NC_010524	GCA	2	6	4305628	4305633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060511
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113111	NC_010524	CG	3	6	4305966	4305971	0 %	0 %	50 %	50 %	171060512
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113113	NC_010524	GGC	2	6	4306073	4306078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060512
113114	NC_010524	GCCAG	2	10	4306105	4306114	20 %	0 %	40 %	40 %	171060512
113115	NC_010524	GCA	2	6	4306129	4306134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060512
113116	NC_010524	TGA	2	6	4306138	4306143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060512
113117	NC_010524	GCC	2	6	4306212	4306217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060512
113118	NC_010524	CGA	2	6	4306247	4306252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060512
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113120	NC_010524	GCCGG	2	10	4306341	4306350	0 %	0 %	60 %	40 %	171060512
113121	NC_010524	GCT	2	6	4306354	4306359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060512
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113143	NC_010524	CGT	2	6	4306962	4306967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060513
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113148	NC_010524	GGT	2	6	4307223	4307228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060513
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113201	NC_010524	GCTC	2	8	4309208	4309215	0 %	25 %	25 %	50 %	171060514
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113203	NC_010524	TGA	2	6	4309370	4309375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060514
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113213	NC_010524	CG	4	8	4309765	4309772	0 %	0 %	50 %	50 %	171060514
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113218	NC_010524	GCT	2	6	4309923	4309928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060514
113219	NC_010524	CGT	2	6	4309974	4309979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060514
113220	NC_010524	CAC	2	6	4310019	4310024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060514
113221	NC_010524	CAA	2	6	4310034	4310039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060514
113222	NC_010524	CCG	2	6	4310132	4310137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060514
113223	NC_010524	GCGAGG	2	12	4310156	4310167	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	171060514
113224	NC_010524	CGC	2	6	4310215	4310220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060514
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113226	NC_010524	CGA	2	6	4310361	4310366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060514
113227	NC_010524	ACG	2	6	4310381	4310386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060514
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113455	NC_010524	TCGA	2	8	4318533	4318540	25 %	25 %	25 %	25 %	171060520
113456	NC_010524	CG	3	6	4318553	4318558	0 %	0 %	50 %	50 %	171060520
113457	NC_010524	CCATC	2	10	4318730	4318739	20 %	20 %	0 %	60 %	171060521
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113462	NC_010524	CGAG	2	8	4318845	4318852	25 %	0 %	50 %	25 %	171060521
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113485	NC_010524	GGCG	2	8	4319957	4319964	0 %	0 %	75 %	25 %	171060522
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113490	NC_010524	TCC	2	6	4320158	4320163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060523
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