MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
112501	NC_010524	CAC	2	6	4283342	4283347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060488
112502	NC_010524	CGA	2	6	4283351	4283356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060488
112503	NC_010524	CGG	2	6	4283527	4283532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060488
112504	NC_010524	GAA	3	9	4283561	4283569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060488
112505	NC_010524	CGC	2	6	4283573	4283578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060488
112506	NC_010524	GAT	2	6	4283586	4283591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060488
112507	NC_010524	CGA	2	6	4283612	4283617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060488
112508	NC_010524	CGC	2	6	4283645	4283650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060488
112509	NC_010524	GCC	2	6	4283658	4283663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060488
112510	NC_010524	CCA	2	6	4283666	4283671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060488
112511	NC_010524	GGT	2	6	4283720	4283725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060488
112512	NC_010524	TGC	2	6	4283758	4283763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060488
112513	NC_010524	AAC	2	6	4283775	4283780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060488
112514	NC_010524	AGC	2	6	4283800	4283805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060488
112515	NC_010524	CGC	2	6	4283822	4283827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060488
112516	NC_010524	TCA	2	6	4283830	4283835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060488
112517	NC_010524	AAC	2	6	4283847	4283852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060488
112518	NC_010524	GCCG	2	8	4283882	4283889	0 %	0 %	50 %	50 %	171060488
112519	NC_010524	GAC	2	6	4283978	4283983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060489
112520	NC_010524	GAC	2	6	4283996	4284001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060489
112521	NC_010524	CAC	3	9	4284002	4284010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060489
112522	NC_010524	ACCA	2	8	4284044	4284051	50 %	0 %	0 %	50 %	171060489
112523	NC_010524	CTG	2	6	4284074	4284079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060489
112524	NC_010524	TGA	2	6	4284096	4284101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060489
112525	NC_010524	CGG	2	6	4284103	4284108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060489
112526	NC_010524	GCT	2	6	4284118	4284123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060489
112527	NC_010524	CAC	2	6	4284187	4284192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060489
112528	NC_010524	TCG	2	6	4284237	4284242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060489
112529	NC_010524	TGC	2	6	4284258	4284263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060489
112530	NC_010524	CG	3	6	4284295	4284300	0 %	0 %	50 %	50 %	171060489
112531	NC_010524	AAC	2	6	4284305	4284310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060489
112532	NC_010524	TGA	2	6	4284324	4284329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060489
112533	NC_010524	TGG	2	6	4284348	4284353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060489
112534	NC_010524	CTT	2	6	4284358	4284363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060489
112535	NC_010524	CGG	2	6	4284370	4284375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060489
112536	NC_010524	CGC	2	6	4284405	4284410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060489
112537	NC_010524	GATG	2	8	4284433	4284440	25 %	25 %	50 %	0 %	171060489
112538	NC_010524	TCG	2	6	4284473	4284478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060489
112539	NC_010524	CAT	2	6	4284496	4284501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060489
112540	NC_010524	GC	3	6	4284520	4284525	0 %	0 %	50 %	50 %	171060489
112541	NC_010524	TGA	2	6	4284540	4284545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060489
112542	NC_010524	CTG	2	6	4284587	4284592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060489
112543	NC_010524	GACC	2	8	4284637	4284644	25 %	0 %	25 %	50 %	171060489
112544	NC_010524	CTT	2	6	4284661	4284666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060489
112545	NC_010524	GGC	3	9	4284677	4284685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060489
112546	NC_010524	TCT	2	6	4284708	4284713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060489
112547	NC_010524	TTC	2	6	4284716	4284721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060489
112548	NC_010524	CAT	2	6	4284739	4284744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060489
112549	NC_010524	CAT	2	6	4284763	4284768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060489
112550	NC_010524	CAC	2	6	4284872	4284877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060489
112551	NC_010524	TTC	2	6	4284914	4284919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060489
112552	NC_010524	CGA	2	6	4284927	4284932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060489
112553	NC_010524	GGC	2	6	4285055	4285060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060489
112554	NC_010524	CTA	2	6	4285114	4285119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060489
112555	NC_010524	GTG	2	6	4285121	4285126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060489
112556	NC_010524	TGG	2	6	4285146	4285151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060489
112557	NC_010524	CTA	2	6	4285183	4285188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060489
112558	NC_010524	CG	3	6	4285227	4285232	0 %	0 %	50 %	50 %	171060489
112559	NC_010524	TTC	2	6	4285277	4285282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060489
112560	NC_010524	GGC	2	6	4285373	4285378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060489
112561	NC_010524	CTT	2	6	4285405	4285410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060489
112562	NC_010524	TCG	2	6	4285416	4285421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060489
112563	NC_010524	GAT	2	6	4285429	4285434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060489
112564	NC_010524	GCCACC	2	12	4285550	4285561	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171060489
112565	NC_010524	CGA	2	6	4285587	4285592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060490
112566	NC_010524	GCC	2	6	4285598	4285603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060490
112567	NC_010524	CCG	2	6	4285608	4285613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060490
112568	NC_010524	TTC	2	6	4285648	4285653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060490
112569	NC_010524	GTC	2	6	4285672	4285677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060490
112570	NC_010524	ATG	2	6	4285678	4285683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060490
112571	NC_010524	ACCGA	2	10	4285703	4285712	40 %	0 %	20 %	40 %	171060491
112572	NC_010524	GC	3	6	4285728	4285733	0 %	0 %	50 %	50 %	171060491
112573	NC_010524	GCG	2	6	4285753	4285758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060491
112574	NC_010524	TGA	2	6	4285800	4285805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060491
112575	NC_010524	TTCGGC	2	12	4285808	4285819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060491
112576	NC_010524	CGGC	2	8	4285920	4285927	0 %	0 %	50 %	50 %	171060491
112577	NC_010524	CG	4	8	4285978	4285985	0 %	0 %	50 %	50 %	171060491
112578	NC_010524	GGTGCA	2	12	4286017	4286028	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171060491
112579	NC_010524	GAC	2	6	4286041	4286046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060491
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112581	NC_010524	TGCTTC	2	12	4286150	4286161	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	171060491
112582	NC_010524	GGT	2	6	4286203	4286208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060491
112583	NC_010524	GATC	2	8	4286215	4286222	25 %	25 %	25 %	25 %	171060491
112584	NC_010524	CTT	2	6	4286266	4286271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060491
112585	NC_010524	GCC	2	6	4286294	4286299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060491
112586	NC_010524	CGCAG	2	10	4286379	4286388	20 %	0 %	40 %	40 %	171060492
112587	NC_010524	GCT	2	6	4286400	4286405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060492
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112589	NC_010524	ACG	2	6	4286468	4286473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060492
112590	NC_010524	CAA	2	6	4286475	4286480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060492
112591	NC_010524	CGGCG	2	10	4286517	4286526	0 %	0 %	60 %	40 %	171060492
112592	NC_010524	TCA	2	6	4286531	4286536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060492
112593	NC_010524	GCG	2	6	4286573	4286578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060492
112594	NC_010524	CAGC	2	8	4286579	4286586	25 %	0 %	25 %	50 %	171060492
112595	NC_010524	TAC	2	6	4286724	4286729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060493
112596	NC_010524	TGA	2	6	4286755	4286760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060493
112597	NC_010524	AGCG	2	8	4286901	4286908	25 %	0 %	50 %	25 %	171060493
112598	NC_010524	TCT	2	6	4286965	4286970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060493
112599	NC_010524	TTC	2	6	4286982	4286987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060493
112600	NC_010524	GCC	2	6	4286988	4286993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060493
112601	NC_010524	TTC	2	6	4286994	4286999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060493
112602	NC_010524	GC	3	6	4287001	4287006	0 %	0 %	50 %	50 %	171060493
112603	NC_010524	CG	3	6	4287018	4287023	0 %	0 %	50 %	50 %	171060493
112604	NC_010524	GCT	2	6	4287059	4287064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060493
112605	NC_010524	GCCG	2	8	4287119	4287126	0 %	0 %	50 %	50 %	171060493
112606	NC_010524	TCG	2	6	4287130	4287135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060493
112607	NC_010524	GTC	2	6	4287147	4287152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060493
112608	NC_010524	GCT	3	9	4287185	4287193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060493
112609	NC_010524	CAC	2	6	4287222	4287227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060493
112610	NC_010524	GC	3	6	4287245	4287250	0 %	0 %	50 %	50 %	171060493
112611	NC_010524	TGC	2	6	4287280	4287285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060493
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112613	NC_010524	CTT	2	6	4287380	4287385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060493
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