MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
111001	NC_010524	CAG	3	9	4223729	4223737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060434
111002	NC_010524	CCG	3	9	4223809	4223817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060434
111003	NC_010524	CCAGCA	2	12	4223872	4223883	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171060434
111004	NC_010524	CAGC	2	8	4223959	4223966	25 %	0 %	25 %	50 %	171060434
111005	NC_010524	ATCG	2	8	4224005	4224012	25 %	25 %	25 %	25 %	171060434
111006	NC_010524	GTT	2	6	4224153	4224158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060435
111007	NC_010524	GCG	2	6	4224181	4224186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111008	NC_010524	GCG	2	6	4224281	4224286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111009	NC_010524	TGC	2	6	4224299	4224304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111010	NC_010524	CGG	2	6	4224324	4224329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111011	NC_010524	CAG	3	9	4224349	4224357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111012	NC_010524	TG	3	6	4224363	4224368	0 %	50 %	50 %	0 %	171060435
111013	NC_010524	CAG	2	6	4224382	4224387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111014	NC_010524	GCGCC	2	10	4224405	4224414	0 %	0 %	40 %	60 %	171060435
111015	NC_010524	CAG	2	6	4224580	4224585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111016	NC_010524	CGCGG	2	10	4224592	4224601	0 %	0 %	60 %	40 %	171060435
111017	NC_010524	TCG	2	6	4224620	4224625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111018	NC_010524	GC	3	6	4224740	4224745	0 %	0 %	50 %	50 %	171060435
111019	NC_010524	GC	4	8	4224756	4224763	0 %	0 %	50 %	50 %	171060435
111020	NC_010524	GCG	2	6	4224767	4224772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111021	NC_010524	CTC	2	6	4224793	4224798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060435
111022	NC_010524	CG	3	6	4224860	4224865	0 %	0 %	50 %	50 %	171060435
111023	NC_010524	GGCG	2	8	4224876	4224883	0 %	0 %	75 %	25 %	171060435
111024	NC_010524	AGC	2	6	4224884	4224889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111025	NC_010524	CGG	2	6	4224912	4224917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111026	NC_010524	GCG	2	6	4224993	4224998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111027	NC_010524	CCG	2	6	4225011	4225016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060435
111028	NC_010524	GCG	2	6	4225017	4225022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111029	NC_010524	GCG	2	6	4225030	4225035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111030	NC_010524	CTT	2	6	4225053	4225058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060435
111031	NC_010524	GTC	2	6	4225096	4225101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111032	NC_010524	GGC	2	6	4225155	4225160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111033	NC_010524	CGG	2	6	4225200	4225205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111034	NC_010524	CG	3	6	4225241	4225246	0 %	0 %	50 %	50 %	171060435
111035	NC_010524	GC	3	6	4225298	4225303	0 %	0 %	50 %	50 %	171060435
111036	NC_010524	GAC	2	6	4225331	4225336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111037	NC_010524	CAG	2	6	4225384	4225389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111038	NC_010524	GCA	2	6	4225416	4225421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111039	NC_010524	GGT	2	6	4225425	4225430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060435
111040	NC_010524	GC	3	6	4225435	4225440	0 %	0 %	50 %	50 %	171060435
111041	NC_010524	GGCT	2	8	4225499	4225506	0 %	25 %	50 %	25 %	171060435
111042	NC_010524	GCAGGC	2	12	4225593	4225604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171060435
111043	NC_010524	GCC	2	6	4225691	4225696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060435
111044	NC_010524	CAG	2	6	4225741	4225746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111045	NC_010524	GCA	2	6	4225767	4225772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111046	NC_010524	GC	3	6	4225773	4225778	0 %	0 %	50 %	50 %	171060435
111047	NC_010524	GC	3	6	4225827	4225832	0 %	0 %	50 %	50 %	171060435
111048	NC_010524	GGCTCG	2	12	4225926	4225937	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060435
111049	NC_010524	CGCCAG	2	12	4225993	4226004	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060435
111050	NC_010524	GC	3	6	4226038	4226043	0 %	0 %	50 %	50 %	171060435
111051	NC_010524	GGCA	2	8	4226047	4226054	25 %	0 %	50 %	25 %	171060435
111052	NC_010524	GCA	2	6	4226061	4226066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111053	NC_010524	GCG	2	6	4226069	4226074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111054	NC_010524	GGCCG	2	10	4226077	4226086	0 %	0 %	60 %	40 %	171060435
111055	NC_010524	GCCA	2	8	4226143	4226150	25 %	0 %	25 %	50 %	171060435
111056	NC_010524	CCG	2	6	4226160	4226165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060435
111057	NC_010524	CAG	2	6	4226185	4226190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111058	NC_010524	CGG	2	6	4226222	4226227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111059	NC_010524	GCG	2	6	4226256	4226261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060435
111060	NC_010524	TCG	2	6	4226279	4226284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111061	NC_010524	CGT	2	6	4226301	4226306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060435
111062	NC_010524	CGT	2	6	4226422	4226427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060436
111063	NC_010524	CAG	2	6	4226507	4226512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060436
111064	NC_010524	GGC	2	6	4226551	4226556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060436
111065	NC_010524	GC	3	6	4226555	4226560	0 %	0 %	50 %	50 %	171060436
111066	NC_010524	CGG	2	6	4226584	4226589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060436
111067	NC_010524	TCA	2	6	4226704	4226709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060436
111068	NC_010524	GC	4	8	4226758	4226765	0 %	0 %	50 %	50 %	171060436
111069	NC_010524	AGC	2	6	4226766	4226771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060436
111070	NC_010524	CTT	2	6	4226777	4226782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060436
111071	NC_010524	GCG	2	6	4226798	4226803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060436
111072	NC_010524	GGTC	2	8	4226806	4226813	0 %	25 %	50 %	25 %	171060436
111073	NC_010524	GAC	2	6	4226825	4226830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060436
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111076	NC_010524	TCG	2	6	4226859	4226864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060436
111077	NC_010524	CG	3	6	4226886	4226891	0 %	0 %	50 %	50 %	171060436
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111081	NC_010524	TCG	2	6	4227114	4227119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060436
111082	NC_010524	GTA	2	6	4227131	4227136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060436
111083	NC_010524	GTG	2	6	4227144	4227149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060436
111084	NC_010524	CG	3	6	4227593	4227598	0 %	0 %	50 %	50 %	171060437
111085	NC_010524	GATCG	2	10	4227625	4227634	20 %	20 %	40 %	20 %	171060437
111086	NC_010524	CCGC	2	8	4227716	4227723	0 %	0 %	25 %	75 %	171060437
111087	NC_010524	TGA	2	6	4227729	4227734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060437
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111089	NC_010524	GCC	2	6	4227787	4227792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060437
111090	NC_010524	TGA	2	6	4227795	4227800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060437
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111092	NC_010524	GAT	2	6	4227868	4227873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060437
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111097	NC_010524	GTC	2	6	4228189	4228194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060437
111098	NC_010524	CGT	2	6	4228257	4228262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060437
111099	NC_010524	TCT	2	6	4228278	4228283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060437
111100	NC_010524	TCG	2	6	4228316	4228321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060437
111101	NC_010524	TGA	2	6	4228326	4228331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060437
111102	NC_010524	CGC	2	6	4228335	4228340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060437
111103	NC_010524	CCAG	2	8	4228341	4228348	25 %	0 %	25 %	50 %	171060437
111104	NC_010524	TGA	2	6	4228401	4228406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060437
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111106	NC_010524	CG	4	8	4228501	4228508	0 %	0 %	50 %	50 %	171060437
111107	NC_010524	GTT	2	6	4228561	4228566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060437
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111109	NC_010524	CTCG	2	8	4228660	4228667	0 %	25 %	25 %	50 %	171060437
111110	NC_010524	TCG	2	6	4228670	4228675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060437
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111114	NC_010524	GCC	3	9	4228769	4228777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060437
111115	NC_010524	GGC	2	6	4228830	4228835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060437
111116	NC_010524	CTT	2	6	4228851	4228856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060437
111117	NC_010524	CAC	2	6	4229017	4229022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060438
111118	NC_010524	GCT	4	12	4229035	4229046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060438
111119	NC_010524	CGC	2	6	4229050	4229055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060438
111120	NC_010524	GCC	3	9	4229104	4229112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060438
111121	NC_010524	GCA	2	6	4229115	4229120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060438
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111123	NC_010524	GTC	2	6	4229182	4229187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060438
111124	NC_010524	CAG	2	6	4229192	4229197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060438
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111126	NC_010524	GCC	2	6	4229320	4229325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060438
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111128	NC_010524	GCGG	2	8	4229389	4229396	0 %	0 %	75 %	25 %	171060438
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111130	NC_010524	TCG	2	6	4229525	4229530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060438
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111132	NC_010524	CCG	3	9	4229549	4229557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060438
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111135	NC_010524	TGC	2	6	4229630	4229635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060438
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111198	NC_010524	GCC	2	6	4231765	4231770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060441
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111205	NC_010524	CTG	2	6	4232031	4232036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060442
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111215	NC_010524	ATG	2	6	4232439	4232444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060442
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111218	NC_010524	GGCC	2	8	4232507	4232514	0 %	0 %	50 %	50 %	171060442
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111220	NC_010524	CGG	2	6	4232558	4232563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060442
111221	NC_010524	GCCC	2	8	4232602	4232609	0 %	0 %	25 %	75 %	171060442
111222	NC_010524	GC	3	6	4232621	4232626	0 %	0 %	50 %	50 %	171060442
111223	NC_010524	AAG	2	6	4232649	4232654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060442
111224	NC_010524	GATCCT	2	12	4232672	4232683	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171060442
111225	NC_010524	ACGTC	2	10	4232698	4232707	20 %	20 %	20 %	40 %	171060442
111226	NC_010524	AAG	2	6	4232724	4232729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060442
111227	NC_010524	CCGC	2	8	4232765	4232772	0 %	0 %	25 %	75 %	171060442
111228	NC_010524	GGCGGT	2	12	4232780	4232791	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171060442
111229	NC_010524	GAC	2	6	4232829	4232834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060442
111230	NC_010524	TGC	2	6	4232857	4232862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060442
111231	NC_010524	GCAG	2	8	4232874	4232881	25 %	0 %	50 %	25 %	171060442
111232	NC_010524	GCCAAC	2	12	4232904	4232915	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171060442
111233	NC_010524	CCG	2	6	4232956	4232961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060442
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111235	NC_010524	TCG	2	6	4233130	4233135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060442
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111242	NC_010524	GC	3	6	4233406	4233411	0 %	0 %	50 %	50 %	171060443
111243	NC_010524	GC	3	6	4233420	4233425	0 %	0 %	50 %	50 %	171060443
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111257	NC_010524	CTG	2	6	4233960	4233965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060444
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111332	NC_010524	AGAT	2	8	4236682	4236689	50 %	25 %	25 %	0 %	171060446
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111335	NC_010524	CAG	2	6	4236759	4236764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060446
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111340	NC_010524	AGC	2	6	4237004	4237009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060447
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111453	NC_010524	GGTCG	2	10	4242311	4242320	0 %	20 %	60 %	20 %	171060453
111454	NC_010524	GC	3	6	4242326	4242331	0 %	0 %	50 %	50 %	171060453
111455	NC_010524	CGT	2	6	4242349	4242354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060453
111456	NC_010524	CGG	2	6	4242355	4242360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060453
111457	NC_010524	CCAC	2	8	4242366	4242373	25 %	0 %	0 %	75 %	171060453
111458	NC_010524	GCG	2	6	4242376	4242381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060453
111459	NC_010524	GCCG	2	8	4242578	4242585	0 %	0 %	50 %	50 %	171060453
111460	NC_010524	TTC	2	6	4242634	4242639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060453
111461	NC_010524	GTT	2	6	4242678	4242683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060454
111462	NC_010524	CG	3	6	4242711	4242716	0 %	0 %	50 %	50 %	171060454
111463	NC_010524	TCG	2	6	4242751	4242756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060454
111464	NC_010524	GAT	2	6	4242771	4242776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060454
111465	NC_010524	GCCGG	2	10	4242845	4242854	0 %	0 %	60 %	40 %	171060454
111466	NC_010524	CGAC	2	8	4242875	4242882	25 %	0 %	25 %	50 %	171060454
111467	NC_010524	CTT	2	6	4242891	4242896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060454
111468	NC_010524	CCAGG	2	10	4242915	4242924	20 %	0 %	40 %	40 %	171060454
111469	NC_010524	TGT	2	6	4242932	4242937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060454
111470	NC_010524	AGC	2	6	4242952	4242957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060454
111471	NC_010524	GCC	2	6	4242963	4242968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060454
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111473	NC_010524	GCC	2	6	4243026	4243031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060454
111474	NC_010524	TGC	2	6	4243067	4243072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060454
111475	NC_010524	CACC	2	8	4243085	4243092	25 %	0 %	0 %	75 %	171060454
111476	NC_010524	GCG	2	6	4243098	4243103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060454
111477	NC_010524	CAC	2	6	4243140	4243145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060454
111478	NC_010524	GCA	2	6	4243175	4243180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060454
111479	NC_010524	CGA	2	6	4243254	4243259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060454
111480	NC_010524	GTC	2	6	4243515	4243520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060454
111481	NC_010524	ATC	2	6	4243531	4243536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060454
111482	NC_010524	TGCT	2	8	4243543	4243550	0 %	50 %	25 %	25 %	171060454
111483	NC_010524	CCA	2	6	4243563	4243568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060454
111484	NC_010524	TGG	3	9	4243573	4243581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060454
111485	NC_010524	GCG	2	6	4243631	4243636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060454
111486	NC_010524	CGA	2	6	4243647	4243652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060454
111487	NC_010524	CGGC	2	8	4243680	4243687	0 %	0 %	50 %	50 %	171060454
111488	NC_010524	CGC	2	6	4243790	4243795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060454
111489	NC_010524	GCGCCA	2	12	4243820	4243831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060454
111490	NC_010524	CG	3	6	4243866	4243871	0 %	0 %	50 %	50 %	171060454
111491	NC_010524	CTT	2	6	4243901	4243906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060454
111492	NC_010524	TGA	2	6	4243955	4243960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060454
111493	NC_010524	GGC	2	6	4243961	4243966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060454
111494	NC_010524	CCG	2	6	4244270	4244275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060455
111495	NC_010524	CGGG	2	8	4244489	4244496	0 %	0 %	75 %	25 %	171060455
111496	NC_010524	GCCG	2	8	4244502	4244509	0 %	0 %	50 %	50 %	171060455
111497	NC_010524	GCA	2	6	4244510	4244515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060455
111498	NC_010524	GAC	2	6	4244516	4244521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060455
111499	NC_010524	GCG	2	6	4244567	4244572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060455
111500	NC_010524	TGC	4	12	4244605	4244616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060455

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