MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
109001	NC_010524	GTG	2	6	4149844	4149849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060379
109002	NC_010524	CGGCG	2	10	4149863	4149872	0 %	0 %	60 %	40 %	171060379
109003	NC_010524	GGC	2	6	4149873	4149878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060379
109004	NC_010524	GATC	2	8	4149973	4149980	25 %	25 %	25 %	25 %	171060380
109005	NC_010524	CTT	2	6	4150000	4150005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060380
109006	NC_010524	CGGC	2	8	4150038	4150045	0 %	0 %	50 %	50 %	171060380
109007	NC_010524	GTG	2	6	4150079	4150084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060380
109008	NC_010524	CCG	2	6	4150085	4150090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060380
109009	NC_010524	CCG	2	6	4150106	4150111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060380
109010	NC_010524	CCTTG	2	10	4150203	4150212	0 %	40 %	20 %	40 %	171060380
109011	NC_010524	GCC	2	6	4150228	4150233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060380
109012	NC_010524	CCG	2	6	4150235	4150240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060380
109013	NC_010524	GCC	2	6	4150249	4150254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060380
109014	NC_010524	GGC	2	6	4150261	4150266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060380
109015	NC_010524	CAG	3	9	4150342	4150350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060380
109016	NC_010524	GGCC	2	8	4150380	4150387	0 %	0 %	50 %	50 %	171060380
109017	NC_010524	GC	3	6	4150407	4150412	0 %	0 %	50 %	50 %	171060380
109018	NC_010524	CGC	3	9	4150410	4150418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060380
109019	NC_010524	ACCGCC	2	12	4150426	4150437	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171060380
109020	NC_010524	GCC	3	9	4150498	4150506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060380
109021	NC_010524	TGC	2	6	4150512	4150517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060380
109022	NC_010524	CGC	2	6	4150518	4150523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060380
109023	NC_010524	CAT	2	6	4150558	4150563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060380
109024	NC_010524	GTT	2	6	4150564	4150569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060380
109025	NC_010524	ACC	2	6	4150589	4150594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060380
109026	NC_010524	CTG	2	6	4150609	4150614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060380
109027	NC_010524	ATC	2	6	4150616	4150621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060380
109028	NC_010524	TCC	2	6	4150691	4150696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060380
109029	NC_010524	GCTG	2	8	4150737	4150744	0 %	25 %	50 %	25 %	171060380
109030	NC_010524	GCCGC	2	10	4150772	4150781	0 %	0 %	40 %	60 %	171060380
109031	NC_010524	CAA	3	9	4150834	4150842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060380
109032	NC_010524	CGAC	3	12	4150886	4150897	25 %	0 %	25 %	50 %	171060380
109033	NC_010524	GCC	2	6	4151135	4151140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060381
109034	NC_010524	GTA	2	6	4151144	4151149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060381
109035	NC_010524	CG	3	6	4151176	4151181	0 %	0 %	50 %	50 %	171060381
109036	NC_010524	CTT	2	6	4151243	4151248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060381
109037	NC_010524	GCT	2	6	4151252	4151257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060381
109038	NC_010524	TCT	2	6	4151278	4151283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060381
109039	NC_010524	CCGG	2	8	4151303	4151310	0 %	0 %	50 %	50 %	171060381
109040	NC_010524	TCGCG	2	10	4151392	4151401	0 %	20 %	40 %	40 %	171060381
109041	NC_010524	GATCTC	2	12	4151420	4151431	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171060381
109042	NC_010524	CAGC	2	8	4151471	4151478	25 %	0 %	25 %	50 %	171060381
109043	NC_010524	CTT	2	6	4151549	4151554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060381
109044	NC_010524	GAT	2	6	4151564	4151569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060381
109045	NC_010524	GCA	2	6	4151572	4151577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060381
109046	NC_010524	CGG	2	6	4151587	4151592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060381
109047	NC_010524	CA	3	6	4151635	4151640	50 %	0 %	0 %	50 %	171060381
109048	NC_010524	GGCG	2	8	4151653	4151660	0 %	0 %	75 %	25 %	171060381
109049	NC_010524	GCC	2	6	4151787	4151792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060382
109050	NC_010524	CTG	2	6	4151820	4151825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109051	NC_010524	CGG	2	6	4151858	4151863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060382
109052	NC_010524	GCTG	2	8	4151901	4151908	0 %	25 %	50 %	25 %	171060382
109053	NC_010524	GGCG	2	8	4151936	4151943	0 %	0 %	75 %	25 %	171060382
109054	NC_010524	CG	4	8	4151948	4151955	0 %	0 %	50 %	50 %	171060382
109055	NC_010524	CGG	2	6	4152020	4152025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060382
109056	NC_010524	GGC	2	6	4152036	4152041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060382
109057	NC_010524	CG	3	6	4152048	4152053	0 %	0 %	50 %	50 %	171060382
109058	NC_010524	CGGC	2	8	4152115	4152122	0 %	0 %	50 %	50 %	171060382
109059	NC_010524	CGC	2	6	4152246	4152251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060382
109060	NC_010524	CCGCG	2	10	4152252	4152261	0 %	0 %	40 %	60 %	171060382
109061	NC_010524	GTTGGC	2	12	4152267	4152278	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171060382
109062	NC_010524	GCT	2	6	4152287	4152292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109063	NC_010524	CAC	2	6	4152303	4152308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060382
109064	NC_010524	GCA	3	9	4152320	4152328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109065	NC_010524	ACCG	2	8	4152342	4152349	25 %	0 %	25 %	50 %	171060382
109066	NC_010524	CAG	2	6	4152360	4152365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109067	NC_010524	CGT	2	6	4152392	4152397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109068	NC_010524	GGTGCA	2	12	4152400	4152411	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171060382
109069	NC_010524	GCCG	2	8	4152420	4152427	0 %	0 %	50 %	50 %	171060382
109070	NC_010524	CGG	2	6	4152438	4152443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060382
109071	NC_010524	CGT	2	6	4152455	4152460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109072	NC_010524	AGC	3	9	4152478	4152486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109073	NC_010524	CTG	2	6	4152525	4152530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109074	NC_010524	GC	3	6	4152531	4152536	0 %	0 %	50 %	50 %	171060382
109075	NC_010524	CAG	2	6	4152552	4152557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109076	NC_010524	CTC	2	6	4152573	4152578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060382
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109079	NC_010524	CCA	2	6	4152716	4152721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060382
109080	NC_010524	GCCG	2	8	4152740	4152747	0 %	0 %	50 %	50 %	171060382
109081	NC_010524	CAG	2	6	4152759	4152764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109082	NC_010524	GCGG	2	8	4152771	4152778	0 %	0 %	75 %	25 %	171060382
109083	NC_010524	CGT	2	6	4152779	4152784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109084	NC_010524	CGG	2	6	4152839	4152844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060382
109085	NC_010524	GC	3	6	4152881	4152886	0 %	0 %	50 %	50 %	171060382
109086	NC_010524	GGC	2	6	4152891	4152896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060382
109087	NC_010524	TCG	2	6	4152911	4152916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060382
109088	NC_010524	GGGCGC	2	12	4152947	4152958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060382
109089	NC_010524	GTT	2	6	4152993	4152998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060382
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109091	NC_010524	CGGCG	2	10	4153021	4153030	0 %	0 %	60 %	40 %	171060382
109092	NC_010524	GCCAG	2	10	4153052	4153061	20 %	0 %	40 %	40 %	171060382
109093	NC_010524	CGGCG	2	10	4153062	4153071	0 %	0 %	60 %	40 %	171060382
109094	NC_010524	GCC	2	6	4153099	4153104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060382
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109096	NC_010524	CGG	2	6	4153187	4153192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060382
109097	NC_010524	CGG	2	6	4153249	4153254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060383
109098	NC_010524	CGA	2	6	4153274	4153279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060383
109099	NC_010524	GCC	2	6	4153286	4153291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060383
109100	NC_010524	GGTG	2	8	4153303	4153310	0 %	25 %	75 %	0 %	171060383
109101	NC_010524	GAC	2	6	4153331	4153336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060383
109102	NC_010524	GAA	2	6	4153337	4153342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060383
109103	NC_010524	GCC	2	6	4153385	4153390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060383
109104	NC_010524	GCTG	2	8	4153414	4153421	0 %	25 %	50 %	25 %	171060383
109105	NC_010524	GCA	2	6	4153453	4153458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060383
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109107	NC_010524	GAT	2	6	4153574	4153579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060383
109108	NC_010524	GAT	2	6	4153607	4153612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060383
109109	NC_010524	CGT	2	6	4153639	4153644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060383
109110	NC_010524	CAC	2	6	4153697	4153702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060383
109111	NC_010524	CAG	2	6	4153703	4153708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060383
109112	NC_010524	CAG	2	6	4153781	4153786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060383
109113	NC_010524	CG	3	6	4153819	4153824	0 %	0 %	50 %	50 %	171060383
109114	NC_010524	CGAAGC	2	12	4153840	4153851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060383
109115	NC_010524	GCG	2	6	4153866	4153871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060383
109116	NC_010524	CGC	2	6	4153924	4153929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060383
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109228	NC_010524	GCCG	2	8	4157517	4157524	0 %	0 %	50 %	50 %	171060384
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109242	NC_010524	TGC	2	6	4158127	4158132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060385
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109307	NC_010524	GGT	2	6	4160665	4160670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060389
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109329	NC_010524	CGA	2	6	4161277	4161282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060389
109330	NC_010524	GCC	2	6	4161314	4161319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060389
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109332	NC_010524	CGT	2	6	4161367	4161372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060389
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109337	NC_010524	GCG	3	9	4161522	4161530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060389
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109339	NC_010524	TCG	2	6	4161594	4161599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060389
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