MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108501	NC_010524	CAA	2	6	4133400	4133405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060368
108502	NC_010524	ACG	2	6	4133423	4133428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060368
108503	NC_010524	ACCGC	2	10	4133435	4133444	20 %	0 %	20 %	60 %	171060368
108504	NC_010524	CGA	2	6	4133454	4133459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060368
108505	NC_010524	CAG	2	6	4133494	4133499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060368
108506	NC_010524	CCGCAA	2	12	4133511	4133522	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171060368
108507	NC_010524	TGC	2	6	4133525	4133530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060368
108508	NC_010524	GCT	2	6	4133532	4133537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060368
108509	NC_010524	GCC	2	6	4133539	4133544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060368
108510	NC_010524	GGC	2	6	4133545	4133550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060368
108511	NC_010524	CTA	2	6	4133556	4133561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060368
108512	NC_010524	CAG	2	6	4133614	4133619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060368
108513	NC_010524	CAT	2	6	4133686	4133691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060369
108514	NC_010524	CGT	2	6	4133698	4133703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060369
108515	NC_010524	TTC	2	6	4133774	4133779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060369
108516	NC_010524	CGC	2	6	4133790	4133795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060369
108517	NC_010524	CGT	2	6	4133827	4133832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060369
108518	NC_010524	GGT	2	6	4133833	4133838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060369
108519	NC_010524	CTT	2	6	4133863	4133868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060369
108520	NC_010524	GCGCC	2	10	4133898	4133907	0 %	0 %	40 %	60 %	171060369
108521	NC_010524	CGA	2	6	4133923	4133928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060369
108522	NC_010524	CGG	2	6	4133943	4133948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060369
108523	NC_010524	CAG	2	6	4133966	4133971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060369
108524	NC_010524	CAT	2	6	4133986	4133991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060369
108525	NC_010524	GAC	2	6	4134022	4134027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060369
108526	NC_010524	CCG	2	6	4134096	4134101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060369
108527	NC_010524	GCC	2	6	4134103	4134108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060369
108528	NC_010524	G	6	6	4134130	4134135	0 %	0 %	100 %	0 %	171060369
108529	NC_010524	GGT	2	6	4134181	4134186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060369
108530	NC_010524	CGG	2	6	4134225	4134230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060369
108531	NC_010524	GCT	2	6	4134234	4134239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060369
108532	NC_010524	GGCGA	2	10	4134248	4134257	20 %	0 %	60 %	20 %	171060369
108533	NC_010524	CGA	2	6	4134286	4134291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060369
108534	NC_010524	GTGATG	2	12	4134296	4134307	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	171060369
108535	NC_010524	CGG	2	6	4134313	4134318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060369
108536	NC_010524	TCA	2	6	4134354	4134359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060369
108537	NC_010524	CAG	2	6	4134374	4134379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060369
108538	NC_010524	CGA	2	6	4134397	4134402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060369
108539	NC_010524	TGGC	2	8	4134479	4134486	0 %	25 %	50 %	25 %	171060369
108540	NC_010524	CG	4	8	4134487	4134494	0 %	0 %	50 %	50 %	171060369
108541	NC_010524	GC	3	6	4134495	4134500	0 %	0 %	50 %	50 %	171060369
108542	NC_010524	GAAG	2	8	4134514	4134521	50 %	0 %	50 %	0 %	171060369
108543	NC_010524	CCG	3	9	4134555	4134563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060369
108544	NC_010524	TCCA	2	8	4134754	4134761	25 %	25 %	0 %	50 %	171060370
108545	NC_010524	TCA	2	6	4134789	4134794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060370
108546	NC_010524	GC	3	6	4134810	4134815	0 %	0 %	50 %	50 %	171060370
108547	NC_010524	TGG	2	6	4134857	4134862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060370
108548	NC_010524	GCT	2	6	4134868	4134873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060370
108549	NC_010524	GCT	2	6	4134910	4134915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060370
108550	NC_010524	GCT	3	9	4134919	4134927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060370
108551	NC_010524	GCTGG	2	10	4134937	4134946	0 %	20 %	60 %	20 %	171060370
108552	NC_010524	TGA	2	6	4135047	4135052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060370
108553	NC_010524	ACA	2	6	4135056	4135061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060370
108554	NC_010524	CGA	2	6	4135078	4135083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060370
108555	NC_010524	GAG	2	6	4135112	4135117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060370
108556	NC_010524	TGC	2	6	4135119	4135124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060370
108557	NC_010524	CGTGAT	2	12	4135138	4135149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171060370
108558	NC_010524	CGC	2	6	4135215	4135220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060370
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108563	NC_010524	CGA	2	6	4135432	4135437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060370
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108565	NC_010524	TCG	2	6	4135571	4135576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060370
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108567	NC_010524	CTG	2	6	4135592	4135597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060370
108568	NC_010524	CGGCTA	2	12	4135636	4135647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060370
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108570	NC_010524	TCG	2	6	4135737	4135742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060370
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108574	NC_010524	AGCG	2	8	4135986	4135993	25 %	0 %	50 %	25 %	171060371
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108954	NC_010524	CG	3	6	4148578	4148583	0 %	0 %	50 %	50 %	171060378
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