MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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105002	NC_010524	GCA	2	6	4006672	4006677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060259
105003	NC_010524	CGC	2	6	4006910	4006915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060259
105004	NC_010524	GGCCG	2	10	4006917	4006926	0 %	0 %	60 %	40 %	171060259
105005	NC_010524	AGC	2	6	4006972	4006977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060259
105006	NC_010524	CCA	2	6	4006996	4007001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060259
105007	NC_010524	GCG	2	6	4007055	4007060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060259
105008	NC_010524	AGC	2	6	4007085	4007090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060259
105009	NC_010524	GCG	2	6	4007091	4007096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060259
105010	NC_010524	GCC	2	6	4007118	4007123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060259
105011	NC_010524	CGGCAC	2	12	4007168	4007179	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060259
105012	NC_010524	GCA	2	6	4007191	4007196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060259
105013	NC_010524	GCG	2	6	4007240	4007245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060259
105014	NC_010524	CGC	2	6	4007299	4007304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060259
105015	NC_010524	GC	3	6	4007303	4007308	0 %	0 %	50 %	50 %	171060259
105016	NC_010524	CGA	2	6	4007344	4007349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060259
105017	NC_010524	CG	3	6	4007359	4007364	0 %	0 %	50 %	50 %	171060259
105018	NC_010524	AGC	2	6	4007373	4007378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060259
105019	NC_010524	CGA	2	6	4007401	4007406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060259
105020	NC_010524	ATCC	2	8	4007713	4007720	25 %	25 %	0 %	50 %	171060260
105021	NC_010524	ACG	2	6	4007723	4007728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060260
105022	NC_010524	TCG	2	6	4007756	4007761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060260
105023	NC_010524	GC	3	6	4007787	4007792	0 %	0 %	50 %	50 %	171060260
105024	NC_010524	GCC	3	9	4007870	4007878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060260
105025	NC_010524	GC	3	6	4007885	4007890	0 %	0 %	50 %	50 %	171060260
105026	NC_010524	GGCG	2	8	4007898	4007905	0 %	0 %	75 %	25 %	171060260
105027	NC_010524	GGC	2	6	4007925	4007930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060260
105028	NC_010524	TGC	2	6	4007933	4007938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060260
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105030	NC_010524	TGC	2	6	4008065	4008070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060260
105031	NC_010524	ACCG	2	8	4008073	4008080	25 %	0 %	25 %	50 %	171060260
105032	NC_010524	GGCGCT	2	12	4008105	4008116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060260
105033	NC_010524	CCGC	2	8	4008129	4008136	0 %	0 %	25 %	75 %	171060260
105034	NC_010524	TCGAGG	2	12	4008143	4008154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171060260
105035	NC_010524	CGGC	2	8	4008167	4008174	0 %	0 %	50 %	50 %	171060260
105036	NC_010524	CGG	2	6	4008213	4008218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060260
105037	NC_010524	CGA	3	9	4008246	4008254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060260
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105040	NC_010524	CGC	2	6	4008342	4008347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060260
105041	NC_010524	GCA	2	6	4008375	4008380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060260
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105049	NC_010524	GCC	2	6	4008785	4008790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060260
105050	NC_010524	GCA	2	6	4008810	4008815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060260
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105053	NC_010524	TGA	2	6	4008905	4008910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060260
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105113	NC_010524	CCG	2	6	4011387	4011392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060263
105114	NC_010524	GTC	2	6	4011434	4011439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060263
105115	NC_010524	CGG	2	6	4011448	4011453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060263
105116	NC_010524	CTTC	2	8	4011501	4011508	0 %	50 %	0 %	50 %	171060263
105117	NC_010524	GTC	2	6	4011523	4011528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060263
105118	NC_010524	GC	3	6	4011531	4011536	0 %	0 %	50 %	50 %	171060263
105119	NC_010524	ATC	2	6	4011539	4011544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060263
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105144	NC_010524	CTG	2	6	4012274	4012279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060264
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105212	NC_010524	TGA	2	6	4014764	4014769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060266
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105216	NC_010524	GC	4	8	4014913	4014920	0 %	0 %	50 %	50 %	171060266
105217	NC_010524	GCA	2	6	4014959	4014964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060266
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105220	NC_010524	GC	3	6	4015015	4015020	0 %	0 %	50 %	50 %	171060266
105221	NC_010524	TGCG	2	8	4015031	4015038	0 %	25 %	50 %	25 %	171060266
105222	NC_010524	CTA	2	6	4015044	4015049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060266
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105340	NC_010524	GCT	2	6	4019586	4019591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060270
105341	NC_010524	TGC	2	6	4019609	4019614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060270
105342	NC_010524	GCC	2	6	4019634	4019639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060270
105343	NC_010524	CG	3	6	4019703	4019708	0 %	0 %	50 %	50 %	171060270
105344	NC_010524	CTG	2	6	4019728	4019733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060270
105345	NC_010524	GAG	2	6	4019737	4019742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171060270
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105348	NC_010524	CAG	2	6	4019869	4019874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060271
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105351	NC_010524	CGC	2	6	4019941	4019946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060271
105352	NC_010524	GCT	2	6	4019958	4019963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060271
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105355	NC_010524	GCC	2	6	4020043	4020048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060271
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105358	NC_010524	CAG	2	6	4020121	4020126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060271
105359	NC_010524	ACG	2	6	4020140	4020145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060271
105360	NC_010524	CATCGT	2	12	4020174	4020185	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171060271
105361	NC_010524	GCT	2	6	4020255	4020260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060271
105362	NC_010524	CGC	2	6	4020263	4020268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060271
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105368	NC_010524	CGA	2	6	4020558	4020563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060271
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105374	NC_010524	GGT	2	6	4020906	4020911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060271
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105440	NC_010524	GC	3	6	4023051	4023056	0 %	0 %	50 %	50 %	171060273
105441	NC_010524	GC	3	6	4023071	4023076	0 %	0 %	50 %	50 %	171060273
105442	NC_010524	CGG	2	6	4023083	4023088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060273
105443	NC_010524	GGCC	2	8	4023117	4023124	0 %	0 %	50 %	50 %	171060273
105444	NC_010524	ATC	2	6	4023130	4023135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060273
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105447	NC_010524	GC	3	6	4023326	4023331	0 %	0 %	50 %	50 %	171060273
105448	NC_010524	ACC	2	6	4023355	4023360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060273
105449	NC_010524	GCTC	2	8	4023368	4023375	0 %	25 %	25 %	50 %	171060273
105450	NC_010524	GCCA	2	8	4023376	4023383	25 %	0 %	25 %	50 %	171060273
105451	NC_010524	TGC	2	6	4023385	4023390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060273
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105453	NC_010524	CG	3	6	4023476	4023481	0 %	0 %	50 %	50 %	171060273
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