MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010524	GC	3	6	372650	372655	0 %	0 %	50 %	50 %	171057032
10002	NC_010524	CGA	2	6	372695	372700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057032
10003	NC_010524	GCG	2	6	372709	372714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057032
10004	NC_010524	CAT	2	6	372746	372751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057032
10005	NC_010524	GCCA	2	8	372786	372793	25 %	0 %	25 %	50 %	171057032
10006	NC_010524	CCG	2	6	372814	372819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057032
10007	NC_010524	CGC	2	6	372833	372838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057032
10008	NC_010524	CCGGCG	2	12	372853	372864	0 %	0 %	50 %	50 %	171057032
10009	NC_010524	TGG	3	9	372865	372873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057032
10010	NC_010524	GCGT	2	8	372889	372896	0 %	25 %	50 %	25 %	171057032
10011	NC_010524	CTG	2	6	372921	372926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057032
10012	NC_010524	TCA	2	6	372940	372945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057032
10013	NC_010524	ACG	2	6	372964	372969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057032
10014	NC_010524	CGACGC	2	12	372980	372991	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057032
10015	NC_010524	GCGGCA	2	12	373027	373038	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171057032
10016	NC_010524	CAG	3	9	373049	373057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057032
10017	NC_010524	GGCAC	2	10	373060	373069	20 %	0 %	40 %	40 %	171057032
10018	NC_010524	CGC	2	6	373088	373093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057032
10019	NC_010524	TGC	2	6	373144	373149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057032
10020	NC_010524	GGC	2	6	373173	373178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057032
10021	NC_010524	CGGC	2	8	373213	373220	0 %	0 %	50 %	50 %	171057032
10022	NC_010524	GCA	2	6	373222	373227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057032
10023	NC_010524	GC	3	6	373257	373262	0 %	0 %	50 %	50 %	171057032
10024	NC_010524	GCG	2	6	373288	373293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057032
10025	NC_010524	CAC	3	9	373301	373309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057032
10026	NC_010524	CGGTG	2	10	373340	373349	0 %	20 %	60 %	20 %	171057032
10027	NC_010524	GTG	4	12	373347	373358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057032
10028	NC_010524	CGGC	2	8	373360	373367	0 %	0 %	50 %	50 %	171057032
10029	NC_010524	CGG	2	6	373372	373377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057032
10030	NC_010524	CGGC	2	8	373384	373391	0 %	0 %	50 %	50 %	171057032
10031	NC_010524	GCCG	2	8	373397	373404	0 %	0 %	50 %	50 %	171057032
10032	NC_010524	GGT	2	6	373415	373420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057032
10033	NC_010524	GGC	2	6	373427	373432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057032
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10035	NC_010524	CG	3	6	373448	373453	0 %	0 %	50 %	50 %	171057032
10036	NC_010524	GGT	2	6	373478	373483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057032
10037	NC_010524	CGC	2	6	373490	373495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057032
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10039	NC_010524	CGT	2	6	373573	373578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057032
10040	NC_010524	CGC	2	6	373600	373605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057032
10041	NC_010524	GTG	2	6	373617	373622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057032
10042	NC_010524	GC	3	6	373635	373640	0 %	0 %	50 %	50 %	171057032
10043	NC_010524	CGA	2	6	373658	373663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057032
10044	NC_010524	CG	4	8	373694	373701	0 %	0 %	50 %	50 %	171057032
10045	NC_010524	CGC	2	6	373763	373768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057032
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10051	NC_010524	CGC	2	6	374045	374050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057032
10052	NC_010524	ACC	2	6	374130	374135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057032
10053	NC_010524	TGC	2	6	374149	374154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057032
10054	NC_010524	GCG	2	6	374161	374166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057032
10055	NC_010524	CGG	2	6	374180	374185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057032
10056	NC_010524	GCG	2	6	374235	374240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057033
10057	NC_010524	GCGCC	2	10	374253	374262	0 %	0 %	40 %	60 %	171057033
10058	NC_010524	GC	3	6	374281	374286	0 %	0 %	50 %	50 %	171057033
10059	NC_010524	CGGCG	2	10	374323	374332	0 %	0 %	60 %	40 %	171057033
10060	NC_010524	GCCGGC	2	12	374357	374368	0 %	0 %	50 %	50 %	171057033
10061	NC_010524	CGC	2	6	374386	374391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057033
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10063	NC_010524	TCG	2	6	374456	374461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057033
10064	NC_010524	GAT	2	6	374548	374553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057033
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10066	NC_010524	GCCGTC	2	12	374572	374583	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171057033
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10068	NC_010524	CGA	2	6	374650	374655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057033
10069	NC_010524	GTC	2	6	374671	374676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057033
10070	NC_010524	GCA	2	6	374703	374708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057033
10071	NC_010524	CAG	2	6	374710	374715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057033
10072	NC_010524	GTGGCG	2	12	374729	374740	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171057033
10073	NC_010524	GCGG	2	8	374743	374750	0 %	0 %	75 %	25 %	171057033
10074	NC_010524	CGG	3	9	374748	374756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057033
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10077	NC_010524	CG	3	6	374838	374843	0 %	0 %	50 %	50 %	171057033
10078	NC_010524	GCT	2	6	374856	374861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057033
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10086	NC_010524	GC	3	6	375072	375077	0 %	0 %	50 %	50 %	171057033
10087	NC_010524	GGCGC	2	10	375133	375142	0 %	0 %	60 %	40 %	171057033
10088	NC_010524	GC	3	6	375145	375150	0 %	0 %	50 %	50 %	171057033
10089	NC_010524	ACTGGC	2	12	375201	375212	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057033
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10091	NC_010524	GCC	2	6	375251	375256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057033
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10106	NC_010524	GC	3	6	375625	375630	0 %	0 %	50 %	50 %	171057033
10107	NC_010524	TCG	2	6	375644	375649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057033
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10115	NC_010524	GCCG	2	8	375770	375777	0 %	0 %	50 %	50 %	171057033
10116	NC_010524	GGC	2	6	375794	375799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057033
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10119	NC_010524	GTC	2	6	375874	375879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057033
10120	NC_010524	CAG	2	6	375886	375891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057033
10121	NC_010524	GC	3	6	375897	375902	0 %	0 %	50 %	50 %	171057033
10122	NC_010524	GCA	2	6	375957	375962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057033
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10128	NC_010524	GC	4	8	376132	376139	0 %	0 %	50 %	50 %	171057033
10129	NC_010524	GCA	2	6	376146	376151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057033
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10132	NC_010524	GGCA	2	8	376243	376250	25 %	0 %	50 %	25 %	171057033
10133	NC_010524	GAG	2	6	376395	376400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057034
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10139	NC_010524	GTG	2	6	376504	376509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057034
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10143	NC_010524	CGA	2	6	376587	376592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057034
10144	NC_010524	CGG	2	6	376605	376610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057034
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10148	NC_010524	TGG	2	6	376843	376848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057035
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10151	NC_010524	GCCG	2	8	376920	376927	0 %	0 %	50 %	50 %	171057035
10152	NC_010524	CG	3	6	376979	376984	0 %	0 %	50 %	50 %	171057035
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10215	NC_010524	CGGG	2	8	379062	379069	0 %	0 %	75 %	25 %	171057036
10216	NC_010524	CAGC	2	8	379107	379114	25 %	0 %	25 %	50 %	171057036
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10222	NC_010524	CAT	2	6	379278	379283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057036
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10224	NC_010524	ATC	2	6	379330	379335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057036
10225	NC_010524	ACG	2	6	379346	379351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057036
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10230	NC_010524	CCG	2	6	379485	379490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057036
10231	NC_010524	GAC	2	6	379503	379508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057036
10232	NC_010524	CAT	2	6	379554	379559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057036
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10234	NC_010524	TGC	2	6	379595	379600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057036
10235	NC_010524	ACT	2	6	379622	379627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057036
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10237	NC_010524	GGC	3	9	379683	379691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057036
10238	NC_010524	GCT	3	9	379907	379915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057037
10239	NC_010524	TGA	2	6	379966	379971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057037
10240	NC_010524	CGG	2	6	380001	380006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057037
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10242	NC_010524	CGGC	2	8	380109	380116	0 %	0 %	50 %	50 %	171057037
10243	NC_010524	CGA	3	9	380159	380167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057037
10244	NC_010524	TCG	2	6	380185	380190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057037
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10353	NC_010524	CGGG	2	8	384094	384101	0 %	0 %	75 %	25 %	171057039
10354	NC_010524	TCG	2	6	384216	384221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057040
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10356	NC_010524	GTC	2	6	384434	384439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057040
10357	NC_010524	CGG	2	6	384443	384448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057040
10358	NC_010524	CGG	2	6	384451	384456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057040
10359	NC_010524	CCT	2	6	384478	384483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057040
10360	NC_010524	GGT	2	6	384524	384529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057040
10361	NC_010524	CCGG	2	8	384551	384558	0 %	0 %	50 %	50 %	171057040
10362	NC_010524	CGA	2	6	384580	384585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057040
10363	NC_010524	CGC	2	6	384610	384615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057040
10364	NC_010524	GGC	2	6	384669	384674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057040
10365	NC_010524	CGC	2	6	384679	384684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057040
10366	NC_010524	AGC	2	6	384711	384716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057040
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10370	NC_010524	CGG	2	6	384847	384852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057040
10371	NC_010524	CG	5	10	384853	384862	0 %	0 %	50 %	50 %	171057040
10372	NC_010524	TG	3	6	384876	384881	0 %	50 %	50 %	0 %	171057040
10373	NC_010524	CG	3	6	384893	384898	0 %	0 %	50 %	50 %	171057040
10374	NC_010524	CCGT	2	8	384917	384924	0 %	25 %	25 %	50 %	171057040
10375	NC_010524	ACCAGC	2	12	384933	384944	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171057040
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10380	NC_010524	G	7	7	385271	385277	0 %	0 %	100 %	0 %	171057040
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10384	NC_010524	CGTGAT	2	12	385634	385645	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171057041
10385	NC_010524	TCG	2	6	385696	385701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057041
10386	NC_010524	ATG	2	6	385716	385721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057041
10387	NC_010524	CGA	2	6	385727	385732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057041
10388	NC_010524	GCAGGT	2	12	385781	385792	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057041
10389	NC_010524	CTG	2	6	385842	385847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057041
10390	NC_010524	GTGC	2	8	385853	385860	0 %	25 %	50 %	25 %	171057041
10391	NC_010524	TCG	2	6	385894	385899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057041
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10396	NC_010524	CG	3	6	386017	386022	0 %	0 %	50 %	50 %	171057042
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10399	NC_010524	ACG	2	6	386055	386060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057042
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10404	NC_010524	GCTGC	2	10	386222	386231	0 %	20 %	40 %	40 %	171057042
10405	NC_010524	GGC	2	6	386233	386238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057042
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10407	NC_010524	GCT	2	6	386335	386340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057042
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10422	NC_010524	GCC	2	6	386783	386788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057042
10423	NC_010524	CGC	2	6	386817	386822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057042
10424	NC_010524	TCG	2	6	386823	386828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057042
10425	NC_010524	GCG	2	6	386832	386837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057042
10426	NC_010524	CGG	2	6	386872	386877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057042
10427	NC_010524	CCGG	2	8	386911	386918	0 %	0 %	50 %	50 %	171057042
10428	NC_010524	CAT	2	6	387025	387030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057043
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10448	NC_010524	CTG	2	6	387754	387759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057044
10449	NC_010524	CGC	2	6	387795	387800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057044
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10451	NC_010524	GTG	2	6	387835	387840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057044
10452	NC_010524	TGA	2	6	387842	387847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057044
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10454	NC_010524	CGG	2	6	387906	387911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057044
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10459	NC_010524	TCG	2	6	388082	388087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057044
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10464	NC_010524	CGG	2	6	388208	388213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057044
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10471	NC_010524	GC	3	6	388356	388361	0 %	0 %	50 %	50 %	171057044
10472	NC_010524	TCG	2	6	388447	388452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057045
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10475	NC_010524	CG	3	6	388477	388482	0 %	0 %	50 %	50 %	171057045
10476	NC_010524	CGC	2	6	388549	388554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057045
10477	NC_010524	TGG	2	6	388564	388569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057045
10478	NC_010524	TCG	2	6	388573	388578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057045
10479	NC_010524	TGC	2	6	388588	388593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057045
10480	NC_010524	GCT	2	6	388607	388612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057045
10481	NC_010524	CG	3	6	388628	388633	0 %	0 %	50 %	50 %	171057045
10482	NC_010524	GAGC	2	8	388747	388754	25 %	0 %	50 %	25 %	171057045
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10492	NC_010524	AGA	2	6	389213	389218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057046
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10499	NC_010524	GCG	2	6	389474	389479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057046
10500	NC_010524	CTG	2	6	389497	389502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057046

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