MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
102001	NC_010524	TGG	2	6	3890221	3890226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060149
102002	NC_010524	GGCGC	2	10	3890327	3890336	0 %	0 %	60 %	40 %	171060149
102003	NC_010524	TGGC	2	8	3890439	3890446	0 %	25 %	50 %	25 %	171060149
102004	NC_010524	TTC	2	6	3890505	3890510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060149
102005	NC_010524	CCGG	2	8	3890605	3890612	0 %	0 %	50 %	50 %	171060149
102006	NC_010524	TGC	2	6	3890623	3890628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060149
102007	NC_010524	AGCG	2	8	3890739	3890746	25 %	0 %	50 %	25 %	171060149
102008	NC_010524	GAAC	2	8	3891204	3891211	50 %	0 %	25 %	25 %	171060150
102009	NC_010524	GCCGAC	2	12	3891235	3891246	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171060150
102010	NC_010524	GGC	2	6	3891311	3891316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060150
102011	NC_010524	CAG	2	6	3891438	3891443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060151
102012	NC_010524	GAC	2	6	3891461	3891466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060151
102013	NC_010524	ATG	2	6	3891542	3891547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060151
102014	NC_010524	CAA	2	6	3891574	3891579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060151
102015	NC_010524	CAA	2	6	3891614	3891619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060151
102016	NC_010524	GCC	2	6	3891680	3891685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060151
102017	NC_010524	CGG	2	6	3891837	3891842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060151
102018	NC_010524	ACC	2	6	3891866	3891871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060151
102019	NC_010524	GCA	2	6	3891877	3891882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060151
102020	NC_010524	CAA	2	6	3891886	3891891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060151
102021	NC_010524	GCAC	2	8	3891894	3891901	25 %	0 %	25 %	50 %	171060151
102022	NC_010524	CG	3	6	3891920	3891925	0 %	0 %	50 %	50 %	171060151
102023	NC_010524	A	6	6	3891927	3891932	100 %	0 %	0 %	0 %	171060151
102024	NC_010524	ACT	2	6	3891952	3891957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060151
102025	NC_010524	GGC	2	6	3892004	3892009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060151
102026	NC_010524	GC	3	6	3892023	3892028	0 %	0 %	50 %	50 %	171060151
102027	NC_010524	CACG	2	8	3892054	3892061	25 %	0 %	25 %	50 %	171060151
102028	NC_010524	GCC	2	6	3892301	3892306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060152
102029	NC_010524	GCC	2	6	3892343	3892348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060152
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102032	NC_010524	GCT	2	6	3893199	3893204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060153
102033	NC_010524	AGT	2	6	3893355	3893360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060153
102034	NC_010524	CAG	2	6	3893377	3893382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060153
102035	NC_010524	CGG	2	6	3893400	3893405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060153
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102037	NC_010524	TCG	2	6	3893465	3893470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060153
102038	NC_010524	CAC	2	6	3893521	3893526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060153
102039	NC_010524	GCCA	2	8	3893567	3893574	25 %	0 %	25 %	50 %	171060153
102040	NC_010524	GGC	2	6	3893584	3893589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060153
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102042	NC_010524	ACG	2	6	3893675	3893680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060153
102043	NC_010524	TTG	3	9	3893681	3893689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171060153
102044	NC_010524	CGA	2	6	3893709	3893714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060153
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102049	NC_010524	CGT	2	6	3894012	3894017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060153
102050	NC_010524	CGGC	2	8	3894060	3894067	0 %	0 %	50 %	50 %	171060153
102051	NC_010524	GTC	2	6	3894076	3894081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060153
102052	NC_010524	CTT	2	6	3894088	3894093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060153
102053	NC_010524	GTG	2	6	3894139	3894144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060153
102054	NC_010524	GCAT	2	8	3894149	3894156	25 %	25 %	25 %	25 %	171060153
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102058	NC_010524	GC	3	6	3894411	3894416	0 %	0 %	50 %	50 %	171060154
102059	NC_010524	CGA	2	6	3894430	3894435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060154
102060	NC_010524	CTTG	2	8	3894520	3894527	0 %	50 %	25 %	25 %	171060154
102061	NC_010524	CGT	2	6	3894568	3894573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060154
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102064	NC_010524	TGG	2	6	3894751	3894756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060154
102065	NC_010524	CGG	2	6	3894772	3894777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060154
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102068	NC_010524	CGA	2	6	3894910	3894915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060154
102069	NC_010524	GCA	2	6	3894946	3894951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060154
102070	NC_010524	GCC	2	6	3895058	3895063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060154
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102072	NC_010524	GTC	2	6	3895184	3895189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060154
102073	NC_010524	ATG	2	6	3895287	3895292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060154
102074	NC_010524	CGA	2	6	3895396	3895401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060154
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102080	NC_010524	CGGC	2	8	3895790	3895797	0 %	0 %	50 %	50 %	171060155
102081	NC_010524	GC	4	8	3895796	3895803	0 %	0 %	50 %	50 %	171060155
102082	NC_010524	GCG	2	6	3895811	3895816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060155
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102105	NC_010524	GCTG	2	8	3896567	3896574	0 %	25 %	50 %	25 %	171060155
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102114	NC_010524	CCA	2	6	3896855	3896860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060155
102115	NC_010524	GCA	3	9	3896861	3896869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060155
102116	NC_010524	TGC	2	6	3896915	3896920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060155
102117	NC_010524	CATCG	2	10	3896955	3896964	20 %	20 %	20 %	40 %	171060155
102118	NC_010524	TCT	2	6	3897059	3897064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060155
102119	NC_010524	CGGT	2	8	3897094	3897101	0 %	25 %	50 %	25 %	171060155
102120	NC_010524	CGA	2	6	3897104	3897109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060155
102121	NC_010524	CCTCGA	2	12	3897164	3897175	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171060155
102122	NC_010524	GGT	2	6	3897222	3897227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060155
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102124	NC_010524	GCGCA	2	10	3897243	3897252	20 %	0 %	40 %	40 %	171060155
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102128	NC_010524	TGA	2	6	3897341	3897346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060155
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102135	NC_010524	GCCC	2	8	3897709	3897716	0 %	0 %	25 %	75 %	171060156
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102143	NC_010524	GGCG	2	8	3897931	3897938	0 %	0 %	75 %	25 %	171060156
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102335	NC_010524	GC	3	6	3904920	3904925	0 %	0 %	50 %	50 %	171060163
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102339	NC_010524	CGC	2	6	3905051	3905056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060163
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102457	NC_010524	CGCC	2	8	3908925	3908932	0 %	0 %	25 %	75 %	171060165
102458	NC_010524	GC	3	6	3908946	3908951	0 %	0 %	50 %	50 %	171060165
102459	NC_010524	CG	3	6	3908980	3908985	0 %	0 %	50 %	50 %	171060165
102460	NC_010524	CGA	2	6	3909034	3909039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060165
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102475	NC_010524	CGA	2	6	3909454	3909459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060165
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102480	NC_010524	TCA	2	6	3909615	3909620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060165
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102483	NC_010524	ACG	2	6	3909759	3909764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060165
102484	NC_010524	GC	3	6	3909781	3909786	0 %	0 %	50 %	50 %	171060165
102485	NC_010524	CAA	2	6	3909805	3909810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171060165
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102491	NC_010524	CGC	2	6	3910251	3910256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060166
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