MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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101502	NC_010524	CGC	2	6	3869077	3869082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060137
101503	NC_010524	ATCG	2	8	3869134	3869141	25 %	25 %	25 %	25 %	171060137
101504	NC_010524	CGGC	2	8	3869148	3869155	0 %	0 %	50 %	50 %	171060137
101505	NC_010524	CGC	2	6	3869159	3869164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060137
101506	NC_010524	TCT	2	6	3869171	3869176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171060137
101507	NC_010524	GCG	2	6	3869202	3869207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060137
101508	NC_010524	CGG	2	6	3869229	3869234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060137
101509	NC_010524	GCC	2	6	3869247	3869252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060137
101510	NC_010524	GCA	2	6	3869256	3869261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060137
101511	NC_010524	GC	3	6	3869325	3869330	0 %	0 %	50 %	50 %	171060137
101512	NC_010524	CGG	2	6	3869334	3869339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060137
101513	NC_010524	GCT	2	6	3869371	3869376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060137
101514	NC_010524	GC	3	6	3869429	3869434	0 %	0 %	50 %	50 %	171060137
101515	NC_010524	GTC	2	6	3869446	3869451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101517	NC_010524	GC	3	6	3869472	3869477	0 %	0 %	50 %	50 %	171060137
101518	NC_010524	CGCCGG	2	12	3869478	3869489	0 %	0 %	50 %	50 %	171060137
101519	NC_010524	TCG	2	6	3869504	3869509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060137
101520	NC_010524	GA	3	6	3869519	3869524	50 %	0 %	50 %	0 %	171060137
101521	NC_010524	GC	3	6	3869553	3869558	0 %	0 %	50 %	50 %	171060137
101522	NC_010524	CGC	2	6	3869574	3869579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060137
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101524	NC_010524	GCC	2	6	3869626	3869631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060137
101525	NC_010524	GCG	2	6	3869635	3869640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060137
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101528	NC_010524	GATGCC	2	12	3869701	3869712	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101531	NC_010524	GCA	3	9	3869775	3869783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101533	NC_010524	CAG	2	6	3869818	3869823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101535	NC_010524	GC	3	6	3869919	3869924	0 %	0 %	50 %	50 %	171060137
101536	NC_010524	GTC	2	6	3869947	3869952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101540	NC_010524	GGC	2	6	3870102	3870107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060137
101541	NC_010524	CGA	2	6	3870132	3870137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060137
101542	NC_010524	CGC	2	6	3870139	3870144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060137
101543	NC_010524	GGC	2	6	3870193	3870198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060137
101544	NC_010524	GCGG	2	8	3870223	3870230	0 %	0 %	75 %	25 %	171060137
101545	NC_010524	TGCGC	2	10	3870258	3870267	0 %	20 %	40 %	40 %	171060137
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101551	NC_010524	CGGGT	2	10	3870494	3870503	0 %	20 %	60 %	20 %	171060137
101552	NC_010524	TCG	2	6	3870551	3870556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101554	NC_010524	CGT	2	6	3870657	3870662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101557	NC_010524	TGC	2	6	3870738	3870743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101568	NC_010524	CAG	3	9	3871072	3871080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060137
101569	NC_010524	GCA	2	6	3871083	3871088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101579	NC_010524	AGC	2	6	3871469	3871474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060137
101580	NC_010524	CGCTGG	2	12	3871485	3871496	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171060137
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101582	NC_010524	CAG	2	6	3871522	3871527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101585	NC_010524	ATC	2	6	3871586	3871591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060137
101586	NC_010524	CAG	3	9	3871699	3871707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101595	NC_010524	G	6	6	3871913	3871918	0 %	0 %	100 %	0 %	171060137
101596	NC_010524	TCG	2	6	3871928	3871933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060137
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101598	NC_010524	ACGGC	2	10	3871949	3871958	20 %	0 %	40 %	40 %	171060137
101599	NC_010524	ACC	2	6	3871995	3872000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060138
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101601	NC_010524	GCG	2	6	3872046	3872051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060138
101602	NC_010524	GCA	2	6	3872104	3872109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060138
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101843	NC_010524	CGA	2	6	3883157	3883162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060141
101844	NC_010524	GC	3	6	3883164	3883169	0 %	0 %	50 %	50 %	171060141
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101948	NC_010524	CG	3	6	3888539	3888544	0 %	0 %	50 %	50 %	171060148
101949	NC_010524	ACCG	2	8	3888583	3888590	25 %	0 %	25 %	50 %	171060148
101950	NC_010524	GGCC	2	8	3888592	3888599	0 %	0 %	50 %	50 %	171060148
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101954	NC_010524	GCC	2	6	3888764	3888769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060148
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