MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
100001	NC_010524	CGG	2	6	3812550	3812555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060102
100002	NC_010524	CG	3	6	3812605	3812610	0 %	0 %	50 %	50 %	171060102
100003	NC_010524	TGC	2	6	3812612	3812617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060102
100004	NC_010524	CCT	2	6	3812619	3812624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171060102
100005	NC_010524	CTG	2	6	3812698	3812703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060102
100006	NC_010524	ACC	2	6	3812755	3812760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060102
100007	NC_010524	CAC	2	6	3812796	3812801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060102
100008	NC_010524	GACCT	2	10	3812878	3812887	20 %	20 %	20 %	40 %	171060102
100009	NC_010524	GC	3	6	3812901	3812906	0 %	0 %	50 %	50 %	171060102
100010	NC_010524	TCA	2	6	3812930	3812935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060102
100011	NC_010524	ACG	2	6	3813026	3813031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060102
100012	NC_010524	TGG	2	6	3813239	3813244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060102
100013	NC_010524	CGA	2	6	3813246	3813251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060102
100014	NC_010524	GC	4	8	3813258	3813265	0 %	0 %	50 %	50 %	171060102
100015	NC_010524	CGC	2	6	3813279	3813284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060102
100016	NC_010524	TGG	2	6	3813353	3813358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060102
100017	NC_010524	GCT	2	6	3813384	3813389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060102
100018	NC_010524	ATG	2	6	3813405	3813410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060102
100019	NC_010524	TGC	2	6	3813604	3813609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060103
100020	NC_010524	GC	5	10	3813612	3813621	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100021	NC_010524	AC	3	6	3813656	3813661	50 %	0 %	0 %	50 %	171060103
100022	NC_010524	GCT	2	6	3813680	3813685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060103
100023	NC_010524	CGG	2	6	3813690	3813695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060103
100024	NC_010524	CCA	2	6	3813706	3813711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060103
100025	NC_010524	GC	4	8	3813770	3813777	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100026	NC_010524	CGA	2	6	3813791	3813796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060103
100027	NC_010524	GCT	2	6	3813821	3813826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060103
100028	NC_010524	GC	3	6	3813836	3813841	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100029	NC_010524	CG	3	6	3813866	3813871	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100030	NC_010524	GC	3	6	3813883	3813888	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100031	NC_010524	CGA	2	6	3813899	3813904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060103
100032	NC_010524	CG	3	6	3813912	3813917	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100033	NC_010524	CGGC	2	8	3813925	3813932	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100034	NC_010524	CGA	2	6	3813974	3813979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060103
100035	NC_010524	GAA	2	6	3813984	3813989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171060103
100036	NC_010524	TGG	2	6	3814048	3814053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060103
100037	NC_010524	GATCGT	2	12	3814055	3814066	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171060103
100038	NC_010524	GTG	2	6	3814086	3814091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060103
100039	NC_010524	CGG	2	6	3814115	3814120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060103
100040	NC_010524	GC	4	8	3814124	3814131	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100041	NC_010524	GCTG	2	8	3814186	3814193	0 %	25 %	50 %	25 %	171060103
100042	NC_010524	CTG	4	12	3814191	3814202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060103
100043	NC_010524	GC	3	6	3814236	3814241	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100044	NC_010524	CGC	2	6	3814271	3814276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060103
100045	NC_010524	CG	4	8	3814307	3814314	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100046	NC_010524	GC	3	6	3814424	3814429	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100047	NC_010524	GC	3	6	3814465	3814470	0 %	0 %	50 %	50 %	171060103
100048	NC_010524	GGC	2	6	3814487	3814492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060103
100049	NC_010524	CTG	2	6	3814512	3814517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060103
100050	NC_010524	CGCC	2	8	3814526	3814533	0 %	0 %	25 %	75 %	171060103
100051	NC_010524	TGC	2	6	3814564	3814569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060103
100052	NC_010524	CGC	2	6	3814574	3814579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060103
100053	NC_010524	GCGCC	2	10	3814604	3814613	0 %	0 %	40 %	60 %	171060103
100054	NC_010524	CCA	2	6	3814624	3814629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060103
100055	NC_010524	GCT	2	6	3814640	3814645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060103
100056	NC_010524	GTG	2	6	3814650	3814655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060103
100057	NC_010524	GCG	2	6	3814662	3814667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060103
100058	NC_010524	ATC	2	6	3814701	3814706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171060103
100059	NC_010524	GGC	2	6	3814829	3814834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060104
100060	NC_010524	CAC	3	9	3814862	3814870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060104
100061	NC_010524	GCCG	2	8	3814889	3814896	0 %	0 %	50 %	50 %	171060104
100062	NC_010524	GATC	2	8	3814927	3814934	25 %	25 %	25 %	25 %	171060104
100063	NC_010524	GCT	2	6	3814988	3814993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060104
100064	NC_010524	CCG	2	6	3814996	3815001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060104
100065	NC_010524	CGC	2	6	3815035	3815040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060104
100066	NC_010524	CGTC	2	8	3815088	3815095	0 %	25 %	25 %	50 %	171060104
100067	NC_010524	GGCACT	2	12	3815111	3815122	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171060104
100068	NC_010524	CCG	2	6	3815133	3815138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060104
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100071	NC_010524	CCG	2	6	3815194	3815199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060104
100072	NC_010524	GCC	2	6	3815210	3815215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060104
100073	NC_010524	CGG	2	6	3815284	3815289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060104
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100082	NC_010524	C	6	6	3815463	3815468	0 %	0 %	0 %	100 %	171060104
100083	NC_010524	GCCG	2	8	3815510	3815517	0 %	0 %	50 %	50 %	171060104
100084	NC_010524	CGA	3	9	3815531	3815539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060104
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100087	NC_010524	CAC	2	6	3815639	3815644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171060104
100088	NC_010524	GGCC	2	8	3815746	3815753	0 %	0 %	50 %	50 %	171060104
100089	NC_010524	AGGC	2	8	3815774	3815781	25 %	0 %	50 %	25 %	171060104
100090	NC_010524	CGTCA	2	10	3815804	3815813	20 %	20 %	20 %	40 %	171060104
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100099	NC_010524	GGC	2	6	3816068	3816073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171060104
100100	NC_010524	CAG	2	6	3816116	3816121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060104
100101	NC_010524	GCC	2	6	3816174	3816179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060104
100102	NC_010524	TGA	2	6	3816211	3816216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171060104
100103	NC_010524	CGA	2	6	3816241	3816246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171060104
100104	NC_010524	GTGC	2	8	3816251	3816258	0 %	25 %	50 %	25 %	171060104
100105	NC_010524	CCG	2	6	3816259	3816264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060104
100106	NC_010524	GCC	2	6	3816417	3816422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171060104
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100115	NC_010524	GC	3	6	3816804	3816809	0 %	0 %	50 %	50 %	171060104
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100441	NC_010524	GGT	2	6	3829361	3829366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171060104
100442	NC_010524	TGC	2	6	3829465	3829470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171060104
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