MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_010524	GTC	2	6	337538	337543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057003
9002	NC_010524	CCG	2	6	337568	337573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057003
9003	NC_010524	GCC	2	6	337605	337610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057003
9004	NC_010524	GTC	2	6	337628	337633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057003
9005	NC_010524	CTG	2	6	337640	337645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057003
9006	NC_010524	AGCGTG	2	12	337655	337666	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171057003
9007	NC_010524	GCC	2	6	337676	337681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057003
9008	NC_010524	CGGCC	2	10	337705	337714	0 %	0 %	40 %	60 %	171057003
9009	NC_010524	TGG	2	6	337719	337724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057003
9010	NC_010524	CGT	2	6	337737	337742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057003
9011	NC_010524	GGC	2	6	337743	337748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057003
9012	NC_010524	CAC	2	6	337937	337942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057004
9013	NC_010524	GCT	2	6	337979	337984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057004
9014	NC_010524	TCG	2	6	337996	338001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057004
9015	NC_010524	GCA	2	6	338002	338007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057004
9016	NC_010524	CAGC	2	8	338018	338025	25 %	0 %	25 %	50 %	171057004
9017	NC_010524	GGC	2	6	338081	338086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057004
9018	NC_010524	GCTC	2	8	338089	338096	0 %	25 %	25 %	50 %	171057004
9019	NC_010524	CACCG	2	10	338106	338115	20 %	0 %	20 %	60 %	171057004
9020	NC_010524	CCGA	2	8	338133	338140	25 %	0 %	25 %	50 %	171057004
9021	NC_010524	TCGA	2	8	338187	338194	25 %	25 %	25 %	25 %	171057004
9022	NC_010524	TGG	2	6	338209	338214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057004
9023	NC_010524	TGC	2	6	338347	338352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057004
9024	NC_010524	CGG	2	6	338365	338370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057004
9025	NC_010524	TGG	2	6	338400	338405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057004
9026	NC_010524	GAG	2	6	338466	338471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057004
9027	NC_010524	CGG	2	6	338474	338479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057004
9028	NC_010524	GCC	2	6	338525	338530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057004
9029	NC_010524	CGG	2	6	338534	338539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057004
9030	NC_010524	CG	3	6	338600	338605	0 %	0 %	50 %	50 %	171057004
9031	NC_010524	ACG	2	6	338611	338616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057004
9032	NC_010524	GCC	2	6	338659	338664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057004
9033	NC_010524	ACGC	2	8	338673	338680	25 %	0 %	25 %	50 %	171057004
9034	NC_010524	GC	3	6	338701	338706	0 %	0 %	50 %	50 %	171057004
9035	NC_010524	GCG	3	9	338728	338736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057004
9036	NC_010524	AGG	2	6	338761	338766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057004
9037	NC_010524	CG	3	6	338807	338812	0 %	0 %	50 %	50 %	171057004
9038	NC_010524	CGG	2	6	338825	338830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057004
9039	NC_010524	TGC	2	6	338914	338919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057004
9040	NC_010524	CTGG	2	8	338921	338928	0 %	25 %	50 %	25 %	171057004
9041	NC_010524	ACG	2	6	338974	338979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057004
9042	NC_010524	CCG	2	6	339040	339045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057004
9043	NC_010524	CGA	2	6	339107	339112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057004
9044	NC_010524	GGC	2	6	339122	339127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057004
9045	NC_010524	CTGAG	2	10	339144	339153	20 %	20 %	40 %	20 %	171057004
9046	NC_010524	GC	3	6	339167	339172	0 %	0 %	50 %	50 %	171057005
9047	NC_010524	CGC	2	6	339180	339185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057005
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9051	NC_010524	GCC	2	6	339329	339334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057005
9052	NC_010524	CGC	2	6	339336	339341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057005
9053	NC_010524	CGG	2	6	339429	339434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057005
9054	NC_010524	GGCC	2	8	339468	339475	0 %	0 %	50 %	50 %	171057005
9055	NC_010524	GC	3	6	339493	339498	0 %	0 %	50 %	50 %	171057005
9056	NC_010524	TGC	2	6	339527	339532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057005
9057	NC_010524	GCT	2	6	339690	339695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057005
9058	NC_010524	GAT	2	6	339709	339714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057005
9059	NC_010524	GC	3	6	339717	339722	0 %	0 %	50 %	50 %	171057005
9060	NC_010524	GAC	2	6	339739	339744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057005
9061	NC_010524	GCCGC	2	10	339767	339776	0 %	0 %	40 %	60 %	171057005
9062	NC_010524	TGC	2	6	339779	339784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057005
9063	NC_010524	CGGCG	2	10	339792	339801	0 %	0 %	60 %	40 %	171057005
9064	NC_010524	TGCG	2	8	339803	339810	0 %	25 %	50 %	25 %	171057005
9065	NC_010524	CAC	2	6	339825	339830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057005
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9069	NC_010524	CGGCG	2	10	339933	339942	0 %	0 %	60 %	40 %	171057005
9070	NC_010524	CGC	2	6	340050	340055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057005
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9102	NC_010524	TAC	2	6	340879	340884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057006
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9115	NC_010524	GCCCG	2	10	341490	341499	0 %	0 %	40 %	60 %	171057007
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9243	NC_010524	GCA	2	6	346450	346455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057011
9244	NC_010524	GC	3	6	346501	346506	0 %	0 %	50 %	50 %	171057011
9245	NC_010524	GCCGG	2	10	346569	346578	0 %	0 %	60 %	40 %	171057011
9246	NC_010524	GCA	2	6	346636	346641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057011
9247	NC_010524	GCA	2	6	346684	346689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057011
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9363	NC_010524	TGC	2	6	351020	351025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057015
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9480	NC_010524	CGG	2	6	355241	355246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057019
9481	NC_010524	TCT	3	9	355256	355264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057019
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9483	NC_010524	GC	3	6	355286	355291	0 %	0 %	50 %	50 %	171057019
9484	NC_010524	GCTG	2	8	355293	355300	0 %	25 %	50 %	25 %	171057019
9485	NC_010524	GC	6	12	355303	355314	0 %	0 %	50 %	50 %	171057019
9486	NC_010524	CGC	2	6	355382	355387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057019
9487	NC_010524	ACC	2	6	355390	355395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057019
9488	NC_010524	CGC	2	6	355403	355408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057019
9489	NC_010524	GC	3	6	355407	355412	0 %	0 %	50 %	50 %	171057019
9490	NC_010524	GCC	3	9	355426	355434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057019
9491	NC_010524	TGC	2	6	355439	355444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057019
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