MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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93002	NC_010524	GTC	2	6	3549421	3549426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059878
93003	NC_010524	ATCG	2	8	3549479	3549486	25 %	25 %	25 %	25 %	171059878
93004	NC_010524	CCCA	2	8	3549630	3549637	25 %	0 %	0 %	75 %	171059879
93005	NC_010524	CGC	2	6	3549702	3549707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059879
93006	NC_010524	CGC	3	9	3549738	3549746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059879
93007	NC_010524	GC	3	6	3549776	3549781	0 %	0 %	50 %	50 %	171059879
93008	NC_010524	GAA	2	6	3549835	3549840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059879
93009	NC_010524	TGG	2	6	3549868	3549873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059879
93010	NC_010524	TCG	2	6	3549908	3549913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059879
93011	NC_010524	TGC	2	6	3549956	3549961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059879
93012	NC_010524	CCG	2	6	3549987	3549992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059879
93013	NC_010524	CGA	2	6	3550032	3550037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059879
93014	NC_010524	CGGC	2	8	3550079	3550086	0 %	0 %	50 %	50 %	171059879
93015	NC_010524	TCT	2	6	3550235	3550240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059879
93016	NC_010524	CG	3	6	3550328	3550333	0 %	0 %	50 %	50 %	171059879
93017	NC_010524	TCG	2	6	3550340	3550345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059879
93018	NC_010524	CGC	3	9	3550361	3550369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059879
93019	NC_010524	AAG	2	6	3550384	3550389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059879
93020	NC_010524	CGT	2	6	3550413	3550418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059879
93021	NC_010524	GCAAG	2	10	3550419	3550428	40 %	0 %	40 %	20 %	171059879
93022	NC_010524	GGC	2	6	3550442	3550447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059880
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93024	NC_010524	CGGC	2	8	3550480	3550487	0 %	0 %	50 %	50 %	171059880
93025	NC_010524	CGC	2	6	3550515	3550520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059880
93026	NC_010524	GTG	2	6	3550596	3550601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059880
93027	NC_010524	CGC	2	6	3550658	3550663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059880
93028	NC_010524	GCC	2	6	3550677	3550682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059880
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93030	NC_010524	GTC	2	6	3550710	3550715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059880
93031	NC_010524	CAA	2	6	3550730	3550735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059880
93032	NC_010524	GCC	2	6	3550758	3550763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059880
93033	NC_010524	CGC	2	6	3550766	3550771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059880
93034	NC_010524	CGA	2	6	3550814	3550819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059880
93035	NC_010524	GCTG	2	8	3550832	3550839	0 %	25 %	50 %	25 %	171059880
93036	NC_010524	TGA	2	6	3550864	3550869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059880
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93038	NC_010524	CGG	2	6	3550994	3550999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059880
93039	NC_010524	CGG	3	9	3551024	3551032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059880
93040	NC_010524	CG	3	6	3551132	3551137	0 %	0 %	50 %	50 %	171059880
93041	NC_010524	GCC	2	6	3551142	3551147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059880
93042	NC_010524	GCC	3	9	3551184	3551192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059880
93043	NC_010524	TCA	2	6	3551194	3551199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059880
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93051	NC_010524	GC	3	6	3551530	3551535	0 %	0 %	50 %	50 %	171059880
93052	NC_010524	TGA	2	6	3551610	3551615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059881
93053	NC_010524	CG	3	6	3551692	3551697	0 %	0 %	50 %	50 %	171059881
93054	NC_010524	CG	3	6	3551712	3551717	0 %	0 %	50 %	50 %	171059881
93055	NC_010524	GC	3	6	3551727	3551732	0 %	0 %	50 %	50 %	171059881
93056	NC_010524	GCG	2	6	3551745	3551750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059881
93057	NC_010524	GC	3	6	3551757	3551762	0 %	0 %	50 %	50 %	171059881
93058	NC_010524	CGA	2	6	3551794	3551799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059881
93059	NC_010524	TCG	2	6	3551856	3551861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059881
93060	NC_010524	CGGG	2	8	3551863	3551870	0 %	0 %	75 %	25 %	171059881
93061	NC_010524	GGC	2	6	3551877	3551882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059881
93062	NC_010524	GC	4	8	3551886	3551893	0 %	0 %	50 %	50 %	171059881
93063	NC_010524	GCT	2	6	3551944	3551949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059881
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93066	NC_010524	CGGCG	2	10	3552112	3552121	0 %	0 %	60 %	40 %	171059881
93067	NC_010524	GGC	4	12	3552124	3552135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059881
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93070	NC_010524	GTGGC	2	10	3552192	3552201	0 %	20 %	60 %	20 %	171059881
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93085	NC_010524	TCG	2	6	3552582	3552587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059881
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93089	NC_010524	TCG	2	6	3552677	3552682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059881
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93100	NC_010524	GCT	2	6	3552917	3552922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059882
93101	NC_010524	CGGG	2	8	3552923	3552930	0 %	0 %	75 %	25 %	171059882
93102	NC_010524	GCAT	2	8	3552952	3552959	25 %	25 %	25 %	25 %	171059882
93103	NC_010524	ACC	2	6	3552964	3552969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059882
93104	NC_010524	GC	3	6	3552984	3552989	0 %	0 %	50 %	50 %	171059882
93105	NC_010524	CGTG	2	8	3553001	3553008	0 %	25 %	50 %	25 %	171059882
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93109	NC_010524	TCG	2	6	3553099	3553104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059882
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93114	NC_010524	GC	3	6	3553415	3553420	0 %	0 %	50 %	50 %	171059882
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93116	NC_010524	CTC	2	6	3553431	3553436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171059882
93117	NC_010524	GCAGC	2	10	3553449	3553458	20 %	0 %	40 %	40 %	171059882
93118	NC_010524	GAT	2	6	3553488	3553493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059882
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93129	NC_010524	GC	3	6	3554139	3554144	0 %	0 %	50 %	50 %	171059883
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93230	NC_010524	GCA	2	6	3558045	3558050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059887
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93493	NC_010524	GCA	2	6	3567618	3567623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059891
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