MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_010524	TGG	2	6	311661	311666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056985
8502	NC_010524	GGCC	2	8	311728	311735	0 %	0 %	50 %	50 %	171056985
8503	NC_010524	GCC	2	6	311738	311743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
8504	NC_010524	GCG	2	6	311746	311751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
8505	NC_010524	GCTG	2	8	311770	311777	0 %	25 %	50 %	25 %	171056985
8506	NC_010524	CGC	2	6	311781	311786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
8507	NC_010524	GTT	2	6	311830	311835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056985
8508	NC_010524	GC	3	6	311892	311897	0 %	0 %	50 %	50 %	171056985
8509	NC_010524	CGC	2	6	311910	311915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
8510	NC_010524	GTC	2	6	311921	311926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985
8511	NC_010524	GC	3	6	311940	311945	0 %	0 %	50 %	50 %	171056985
8512	NC_010524	CGG	2	6	312004	312009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
8513	NC_010524	GGCG	2	8	312028	312035	0 %	0 %	75 %	25 %	171056985
8514	NC_010524	GCC	2	6	312110	312115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
8515	NC_010524	CAT	2	6	312123	312128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056985
8516	NC_010524	CGG	2	6	312129	312134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
8517	NC_010524	AGG	2	6	312142	312147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056985
8518	NC_010524	GCC	2	6	312229	312234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056986
8519	NC_010524	GCT	2	6	312236	312241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056986
8520	NC_010524	GCTG	2	8	312289	312296	0 %	25 %	50 %	25 %	171056986
8521	NC_010524	GCG	2	6	312397	312402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056986
8522	NC_010524	GTG	2	6	312405	312410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056986
8523	NC_010524	GAG	2	6	312414	312419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056986
8524	NC_010524	ACCA	2	8	312432	312439	50 %	0 %	0 %	50 %	171056986
8525	NC_010524	CAGC	2	8	312470	312477	25 %	0 %	25 %	50 %	171056986
8526	NC_010524	ACC	2	6	312518	312523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056986
8527	NC_010524	GCC	2	6	312542	312547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056986
8528	NC_010524	CGCGC	2	10	312588	312597	0 %	0 %	40 %	60 %	171056986
8529	NC_010524	AGC	2	6	312601	312606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056986
8530	NC_010524	GGCCG	2	10	312620	312629	0 %	0 %	60 %	40 %	171056986
8531	NC_010524	GCG	2	6	312730	312735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056986
8532	NC_010524	GC	3	6	312771	312776	0 %	0 %	50 %	50 %	171056986
8533	NC_010524	CCG	2	6	312791	312796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056986
8534	NC_010524	GCT	2	6	312809	312814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056986
8535	NC_010524	GCA	2	6	312818	312823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056986
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8537	NC_010524	CG	4	8	312870	312877	0 %	0 %	50 %	50 %	171056986
8538	NC_010524	GCCC	2	8	312911	312918	0 %	0 %	25 %	75 %	171056987
8539	NC_010524	TGGC	2	8	312922	312929	0 %	25 %	50 %	25 %	171056987
8540	NC_010524	CTG	2	6	312965	312970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056987
8541	NC_010524	GC	5	10	312977	312986	0 %	0 %	50 %	50 %	171056987
8542	NC_010524	GGC	3	9	313097	313105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056987
8543	NC_010524	GCG	2	6	313120	313125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056987
8544	NC_010524	GC	3	6	313139	313144	0 %	0 %	50 %	50 %	171056987
8545	NC_010524	GCG	2	6	313150	313155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056987
8546	NC_010524	GCACG	2	10	313195	313204	20 %	0 %	40 %	40 %	171056987
8547	NC_010524	GGC	2	6	313213	313218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056987
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8551	NC_010524	GCTG	2	8	313308	313315	0 %	25 %	50 %	25 %	171056987
8552	NC_010524	TGC	2	6	313326	313331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056987
8553	NC_010524	GC	3	6	313338	313343	0 %	0 %	50 %	50 %	171056987
8554	NC_010524	GCC	3	9	313435	313443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056987
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8558	NC_010524	GCA	3	9	313540	313548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056987
8559	NC_010524	CGCGG	2	10	313552	313561	0 %	0 %	60 %	40 %	171056987
8560	NC_010524	TGG	3	9	313563	313571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056987
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8563	NC_010524	GC	4	8	313604	313611	0 %	0 %	50 %	50 %	171056987
8564	NC_010524	TCG	2	6	313644	313649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056987
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8569	NC_010524	GCA	2	6	313915	313920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056987
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8574	NC_010524	TGG	2	6	314096	314101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056988
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8583	NC_010524	GTG	2	6	314518	314523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056988
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8586	NC_010524	CGA	2	6	314610	314615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056988
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8589	NC_010524	CGC	3	9	314748	314756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056988
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8593	NC_010524	CG	4	8	314823	314830	0 %	0 %	50 %	50 %	171056988
8594	NC_010524	GCT	2	6	314895	314900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056988
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8601	NC_010524	GCG	2	6	315198	315203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056988
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8605	NC_010524	GC	3	6	315285	315290	0 %	0 %	50 %	50 %	171056989
8606	NC_010524	GCC	2	6	315375	315380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056989
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8609	NC_010524	CG	4	8	315470	315477	0 %	0 %	50 %	50 %	171056989
8610	NC_010524	GCG	2	6	315520	315525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056989
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8985	NC_010524	TGG	2	6	337020	337025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057003
8986	NC_010524	GCT	2	6	337036	337041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057003
8987	NC_010524	GCTG	2	8	337060	337067	0 %	25 %	50 %	25 %	171057003
8988	NC_010524	CGT	2	6	337111	337116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057003
8989	NC_010524	CTG	2	6	337145	337150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057003
8990	NC_010524	CGA	2	6	337195	337200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057003
8991	NC_010524	GGT	2	6	337201	337206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057003
8992	NC_010524	GC	3	6	337231	337236	0 %	0 %	50 %	50 %	171057003
8993	NC_010524	CTG	2	6	337295	337300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057003
8994	NC_010524	CG	3	6	337363	337368	0 %	0 %	50 %	50 %	171057003
8995	NC_010524	TGC	2	6	337383	337388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057003
8996	NC_010524	GCG	2	6	337412	337417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057003
8997	NC_010524	CTG	2	6	337418	337423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057003
8998	NC_010524	AGA	2	6	337467	337472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057003
8999	NC_010524	CGC	2	6	337489	337494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057003
9000	NC_010524	TG	3	6	337509	337514	0 %	50 %	50 %	0 %	171057003

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