MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
84501	NC_010524	GCA	2	6	3220401	3220406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059598
84502	NC_010524	GCCAGC	2	12	3220428	3220439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059598
84503	NC_010524	CG	3	6	3220450	3220455	0 %	0 %	50 %	50 %	171059598
84504	NC_010524	CG	3	6	3220471	3220476	0 %	0 %	50 %	50 %	171059598
84505	NC_010524	AGCG	2	8	3220520	3220527	25 %	0 %	50 %	25 %	171059598
84506	NC_010524	GTG	2	6	3220529	3220534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059598
84507	NC_010524	CAG	2	6	3220535	3220540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059598
84508	NC_010524	TCGA	2	8	3220541	3220548	25 %	25 %	25 %	25 %	171059598
84509	NC_010524	CAA	2	6	3220561	3220566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059598
84510	NC_010524	CTGATC	2	12	3220571	3220582	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171059598
84511	NC_010524	TGA	2	6	3220671	3220676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059598
84512	NC_010524	GC	3	6	3220799	3220804	0 %	0 %	50 %	50 %	171059599
84513	NC_010524	GCGT	2	8	3220808	3220815	0 %	25 %	50 %	25 %	171059599
84514	NC_010524	CTCG	2	8	3220816	3220823	0 %	25 %	25 %	50 %	171059599
84515	NC_010524	CGGC	2	8	3220866	3220873	0 %	0 %	50 %	50 %	171059599
84516	NC_010524	GCC	2	6	3220885	3220890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059599
84517	NC_010524	GCG	2	6	3220923	3220928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059599
84518	NC_010524	GCC	2	6	3220945	3220950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059599
84519	NC_010524	CGT	2	6	3220968	3220973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059599
84520	NC_010524	CAG	2	6	3220996	3221001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059599
84521	NC_010524	CGC	2	6	3221007	3221012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059599
84522	NC_010524	CAT	2	6	3221065	3221070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059599
84523	NC_010524	GCA	2	6	3221097	3221102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059599
84524	NC_010524	AGGC	2	8	3221120	3221127	25 %	0 %	50 %	25 %	171059599
84525	NC_010524	CGA	2	6	3221226	3221231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059599
84526	NC_010524	GCG	3	9	3221276	3221284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059599
84527	NC_010524	GCACGC	2	12	3221304	3221315	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059599
84528	NC_010524	GC	4	8	3221330	3221337	0 %	0 %	50 %	50 %	171059599
84529	NC_010524	TGGC	2	8	3221393	3221400	0 %	25 %	50 %	25 %	171059599
84530	NC_010524	GT	3	6	3221409	3221414	0 %	50 %	50 %	0 %	171059599
84531	NC_010524	CTT	2	6	3221465	3221470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059600
84532	NC_010524	CGG	2	6	3221471	3221476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
84533	NC_010524	GCG	2	6	3221487	3221492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
84534	NC_010524	GCC	2	6	3221496	3221501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059600
84535	NC_010524	GGC	2	6	3221526	3221531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
84536	NC_010524	CGG	3	9	3221543	3221551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
84537	NC_010524	GGC	2	6	3221571	3221576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
84538	NC_010524	CGC	2	6	3221639	3221644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059600
84539	NC_010524	GGC	2	6	3221697	3221702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
84540	NC_010524	GCA	2	6	3221771	3221776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059600
84541	NC_010524	GCG	2	6	3221783	3221788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
84542	NC_010524	ACG	2	6	3221842	3221847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059600
84543	NC_010524	CGA	2	6	3221849	3221854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059600
84544	NC_010524	CTT	2	6	3221874	3221879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059600
84545	NC_010524	TCA	2	6	3221966	3221971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059600
84546	NC_010524	CGC	2	6	3221972	3221977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059600
84547	NC_010524	CAG	2	6	3221994	3221999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059600
84548	NC_010524	GCC	2	6	3222006	3222011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059600
84549	NC_010524	TCG	2	6	3222052	3222057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059600
84550	NC_010524	CGGC	2	8	3222065	3222072	0 %	0 %	50 %	50 %	171059600
84551	NC_010524	GCG	2	6	3222074	3222079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
84552	NC_010524	GCCG	2	8	3222089	3222096	0 %	0 %	50 %	50 %	171059600
84553	NC_010524	GGC	2	6	3222126	3222131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
84554	NC_010524	GCC	2	6	3222135	3222140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059600
84555	NC_010524	GCAG	2	8	3222167	3222174	25 %	0 %	50 %	25 %	171059600
84556	NC_010524	AGC	2	6	3222184	3222189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059600
84557	NC_010524	GCA	2	6	3222194	3222199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059600
84558	NC_010524	GCC	2	6	3222210	3222215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059600
84559	NC_010524	CAG	2	6	3222267	3222272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059600
84560	NC_010524	GCCG	2	8	3222321	3222328	0 %	0 %	50 %	50 %	171059600
84561	NC_010524	GC	3	6	3222330	3222335	0 %	0 %	50 %	50 %	171059600
84562	NC_010524	GGT	2	6	3222356	3222361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059600
84563	NC_010524	TGG	2	6	3222362	3222367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059600
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84567	NC_010524	ATCG	2	8	3222443	3222450	25 %	25 %	25 %	25 %	171059600
84568	NC_010524	CGCGG	2	10	3222507	3222516	0 %	0 %	60 %	40 %	171059600
84569	NC_010524	AGC	2	6	3222589	3222594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059600
84570	NC_010524	AGGTGC	2	12	3222623	3222634	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171059600
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84573	NC_010524	CGGCC	2	10	3222750	3222759	0 %	0 %	40 %	60 %	171059600
84574	NC_010524	GC	3	6	3222794	3222799	0 %	0 %	50 %	50 %	171059600
84575	NC_010524	CAG	3	9	3222837	3222845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059600
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84577	NC_010524	CG	3	6	3222902	3222907	0 %	0 %	50 %	50 %	171059600
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84582	NC_010524	GCG	3	9	3223195	3223203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
84583	NC_010524	GGC	2	6	3223238	3223243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059600
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84585	NC_010524	CA	3	6	3223453	3223458	50 %	0 %	0 %	50 %	171059601
84586	NC_010524	CGC	2	6	3223481	3223486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059601
84587	NC_010524	GC	3	6	3223499	3223504	0 %	0 %	50 %	50 %	171059601
84588	NC_010524	AGC	2	6	3223600	3223605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059601
84589	NC_010524	CG	3	6	3223610	3223615	0 %	0 %	50 %	50 %	171059601
84590	NC_010524	TCA	2	6	3223625	3223630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059601
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84593	NC_010524	GCTG	2	8	3223813	3223820	0 %	25 %	50 %	25 %	171059601
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84599	NC_010524	TCG	2	6	3224246	3224251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059602
84600	NC_010524	GCCG	2	8	3224310	3224317	0 %	0 %	50 %	50 %	171059602
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84602	NC_010524	GCA	2	6	3224406	3224411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059602
84603	NC_010524	GC	3	6	3224430	3224435	0 %	0 %	50 %	50 %	171059602
84604	NC_010524	GTGC	2	8	3224488	3224495	0 %	25 %	50 %	25 %	171059602
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84606	NC_010524	CAG	2	6	3224506	3224511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059602
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84608	NC_010524	CCA	2	6	3224529	3224534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059602
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84611	NC_010524	AC	3	6	3224576	3224581	50 %	0 %	0 %	50 %	171059602
84612	NC_010524	CGG	2	6	3224589	3224594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059602
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84614	NC_010524	CAC	3	9	3224698	3224706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059602
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84616	NC_010524	CGA	2	6	3225034	3225039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059603
84617	NC_010524	CGC	2	6	3225046	3225051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059603
84618	NC_010524	GCT	2	6	3225061	3225066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059603
84619	NC_010524	GCA	2	6	3225085	3225090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059603
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84621	NC_010524	CCG	2	6	3225144	3225149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059603
84622	NC_010524	GGCC	2	8	3225152	3225159	0 %	0 %	50 %	50 %	171059603
84623	NC_010524	GTG	2	6	3225170	3225175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059603
84624	NC_010524	CG	3	6	3225195	3225200	0 %	0 %	50 %	50 %	171059603
84625	NC_010524	GTG	2	6	3225299	3225304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059603
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84631	NC_010524	TGG	2	6	3225435	3225440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059603
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84728	NC_010524	GC	3	6	3229777	3229782	0 %	0 %	50 %	50 %	171059607
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84732	NC_010524	CGC	2	6	3229847	3229852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059607
84733	NC_010524	GCTC	2	8	3229918	3229925	0 %	25 %	25 %	50 %	171059607
84734	NC_010524	GGC	2	6	3229929	3229934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059607
84735	NC_010524	CTA	2	6	3229940	3229945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059607
84736	NC_010524	CGA	2	6	3229967	3229972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059607
84737	NC_010524	CGG	2	6	3229973	3229978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059607
84738	NC_010524	GCA	2	6	3230015	3230020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059607
84739	NC_010524	GCT	2	6	3230021	3230026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059607
84740	NC_010524	GCAGC	2	10	3230083	3230092	20 %	0 %	40 %	40 %	171059607
84741	NC_010524	GAC	2	6	3230105	3230110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059607
84742	NC_010524	CGA	2	6	3230146	3230151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059607
84743	NC_010524	GCC	2	6	3230156	3230161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059607
84744	NC_010524	CAA	2	6	3230186	3230191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059607
84745	NC_010524	GCCG	2	8	3230580	3230587	0 %	0 %	50 %	50 %	171059608
84746	NC_010524	CAA	2	6	3230616	3230621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059608
84747	NC_010524	CTA	2	6	3230649	3230654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059608
84748	NC_010524	CGG	2	6	3230655	3230660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059608
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84751	NC_010524	CTG	2	6	3230785	3230790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059608
84752	NC_010524	CAT	2	6	3230805	3230810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059608
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84755	NC_010524	ATC	2	6	3230968	3230973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059608
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84759	NC_010524	CGT	2	6	3231123	3231128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059608
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84761	NC_010524	GGC	2	6	3231166	3231171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059608
84762	NC_010524	TGA	2	6	3231179	3231184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059608
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84771	NC_010524	GCGT	2	8	3231653	3231660	0 %	25 %	50 %	25 %	171059608
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84794	NC_010524	GCA	2	6	3232944	3232949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059610
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84800	NC_010524	GCA	2	6	3233095	3233100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059611
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84808	NC_010524	GC	3	6	3233265	3233270	0 %	0 %	50 %	50 %	171059611
84809	NC_010524	GCC	2	6	3233289	3233294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059611
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84820	NC_010524	GCT	3	9	3233523	3233531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059612
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84822	NC_010524	CCG	2	6	3233564	3233569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059612
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84824	NC_010524	GGC	2	6	3233635	3233640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059612
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84826	NC_010524	GCTACA	2	12	3233711	3233722	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171059612
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84828	NC_010524	CAACAC	2	12	3233781	3233792	50 %	0 %	0 %	50 %	171059612
84829	NC_010524	CTG	2	6	3233875	3233880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059612
84830	NC_010524	CGGT	2	8	3233914	3233921	0 %	25 %	50 %	25 %	171059612
84831	NC_010524	GCA	3	9	3233963	3233971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059612
84832	NC_010524	ACGC	2	8	3234026	3234033	25 %	0 %	25 %	50 %	171059612
84833	NC_010524	CAG	2	6	3234036	3234041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059612
84834	NC_010524	GCAGC	2	10	3234045	3234054	20 %	0 %	40 %	40 %	171059612
84835	NC_010524	ACG	2	6	3234080	3234085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059612
84836	NC_010524	TGCC	2	8	3234096	3234103	0 %	25 %	25 %	50 %	171059612
84837	NC_010524	CGG	2	6	3234123	3234128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059613
84838	NC_010524	TGC	2	6	3234156	3234161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059613
84839	NC_010524	CTG	2	6	3234167	3234172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059613
84840	NC_010524	CAGC	2	8	3234199	3234206	25 %	0 %	25 %	50 %	171059613
84841	NC_010524	GC	4	8	3234205	3234212	0 %	0 %	50 %	50 %	171059613
84842	NC_010524	AGC	2	6	3234222	3234227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059613
84843	NC_010524	GC	3	6	3234226	3234231	0 %	0 %	50 %	50 %	171059613
84844	NC_010524	GTGC	2	8	3234245	3234252	0 %	25 %	50 %	25 %	171059613
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