MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010524	GCG	2	6	292496	292501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056969
8002	NC_010524	TGC	2	6	292583	292588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056969
8003	NC_010524	GGCT	2	8	292589	292596	0 %	25 %	50 %	25 %	171056969
8004	NC_010524	CGA	2	6	292623	292628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056969
8005	NC_010524	CG	3	6	292674	292679	0 %	0 %	50 %	50 %	171056969
8006	NC_010524	GC	3	6	292727	292732	0 %	0 %	50 %	50 %	171056969
8007	NC_010524	CTC	2	6	292910	292915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056970
8008	NC_010524	C	6	6	292917	292922	0 %	0 %	0 %	100 %	171056970
8009	NC_010524	GCC	2	6	292943	292948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8010	NC_010524	CCG	2	6	293002	293007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8011	NC_010524	CG	3	6	293029	293034	0 %	0 %	50 %	50 %	171056970
8012	NC_010524	GCCA	2	8	293039	293046	25 %	0 %	25 %	50 %	171056970
8013	NC_010524	CGC	2	6	293077	293082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8014	NC_010524	CGC	2	6	293193	293198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8015	NC_010524	GCT	2	6	293200	293205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056970
8016	NC_010524	ACC	2	6	293222	293227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056970
8017	NC_010524	CG	3	6	293260	293265	0 %	0 %	50 %	50 %	171056970
8018	NC_010524	GC	3	6	293313	293318	0 %	0 %	50 %	50 %	171056970
8019	NC_010524	CCA	2	6	293344	293349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056970
8020	NC_010524	CTG	2	6	293351	293356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056970
8021	NC_010524	CGA	2	6	293362	293367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056970
8022	NC_010524	CGC	2	6	293392	293397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056970
8023	NC_010524	CGG	2	6	293422	293427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056970
8024	NC_010524	GCGCG	2	10	293476	293485	0 %	0 %	60 %	40 %	171056970
8025	NC_010524	CAC	2	6	293494	293499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056970
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8028	NC_010524	CGG	2	6	293575	293580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056970
8029	NC_010524	TCG	2	6	293637	293642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056970
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8031	NC_010524	TGC	3	9	293721	293729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056970
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8033	NC_010524	GAC	2	6	293753	293758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056970
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8037	NC_010524	CTGGGC	2	12	293840	293851	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056970
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8039	NC_010524	GCA	2	6	293923	293928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056970
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8041	NC_010524	CAG	2	6	293991	293996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056971
8042	NC_010524	CATCGG	2	12	294018	294029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171056971
8043	NC_010524	CAGGG	2	10	294031	294040	20 %	0 %	60 %	20 %	171056971
8044	NC_010524	GGC	2	6	294045	294050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056971
8045	NC_010524	GC	3	6	294066	294071	0 %	0 %	50 %	50 %	171056971
8046	NC_010524	CG	3	6	294077	294082	0 %	0 %	50 %	50 %	171056971
8047	NC_010524	CGC	2	6	294098	294103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056971
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8052	NC_010524	GCC	2	6	294231	294236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056971
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8054	NC_010524	GC	3	6	294284	294289	0 %	0 %	50 %	50 %	171056971
8055	NC_010524	CAG	2	6	294330	294335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056971
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8057	NC_010524	TGC	2	6	294352	294357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056971
8058	NC_010524	CGTGT	2	10	294360	294369	0 %	40 %	40 %	20 %	171056971
8059	NC_010524	CGG	2	6	294394	294399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056971
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8062	NC_010524	GCC	2	6	294452	294457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056971
8063	NC_010524	CAG	2	6	294465	294470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056971
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8065	NC_010524	GCG	2	6	294539	294544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056971
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8067	NC_010524	CGA	2	6	294566	294571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056971
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8070	NC_010524	GC	3	6	294756	294761	0 %	0 %	50 %	50 %	171056971
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8081	NC_010524	CAG	2	6	295074	295079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056971
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8112	NC_010524	GAC	2	6	296442	296447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056972
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8119	NC_010524	ACG	2	6	296710	296715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056972
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8122	NC_010524	GC	4	8	296833	296840	0 %	0 %	50 %	50 %	171056972
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8244	NC_010524	GGC	2	6	300960	300965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056974
8245	NC_010524	GCCGC	2	10	300969	300978	0 %	0 %	40 %	60 %	171056974
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8248	NC_010524	GC	3	6	301138	301143	0 %	0 %	50 %	50 %	171056974
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8252	NC_010524	GCT	2	6	301436	301441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056974
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8357	NC_010524	CG	4	8	305588	305595	0 %	0 %	50 %	50 %	171056979
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8360	NC_010524	GGTC	2	8	305645	305652	0 %	25 %	50 %	25 %	171056979
8361	NC_010524	GTG	2	6	305658	305663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056979
8362	NC_010524	GCAGGC	2	12	305696	305707	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056979
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8472	NC_010524	GCGCC	2	10	310858	310867	0 %	0 %	40 %	60 %	171056984
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8484	NC_010524	CGG	2	6	311235	311240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
8485	NC_010524	GGGCG	2	10	311248	311257	0 %	0 %	80 %	20 %	171056985
8486	NC_010524	CGA	2	6	311268	311273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056985
8487	NC_010524	GGC	2	6	311278	311283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
8488	NC_010524	GCG	2	6	311284	311289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
8489	NC_010524	CGGG	2	8	311314	311321	0 %	0 %	75 %	25 %	171056985
8490	NC_010524	TGC	2	6	311322	311327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985
8491	NC_010524	CGG	2	6	311332	311337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
8492	NC_010524	CGA	2	6	311421	311426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056985
8493	NC_010524	GCT	2	6	311462	311467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985
8494	NC_010524	CGG	2	6	311475	311480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056985
8495	NC_010524	CTGCGC	2	12	311483	311494	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056985
8496	NC_010524	GCT	2	6	311524	311529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056985
8497	NC_010524	CGC	2	6	311535	311540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
8498	NC_010524	GC	3	6	311553	311558	0 %	0 %	50 %	50 %	171056985
8499	NC_010524	CGC	2	6	311587	311592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985
8500	NC_010524	GCC	2	6	311606	311611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056985

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