MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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82002	NC_010524	CTG	2	6	3128272	3128277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059523
82003	NC_010524	TGC	2	6	3128289	3128294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059523
82004	NC_010524	CGC	2	6	3128310	3128315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059523
82005	NC_010524	TGC	2	6	3128418	3128423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059523
82006	NC_010524	GAA	2	6	3128449	3128454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059523
82007	NC_010524	TGG	2	6	3128484	3128489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059523
82008	NC_010524	CGATGC	2	12	3128496	3128507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171059523
82009	NC_010524	CGC	2	6	3128554	3128559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059523
82010	NC_010524	TGG	2	6	3128607	3128612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059523
82011	NC_010524	ACC	2	6	3128678	3128683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059523
82012	NC_010524	AGCG	2	8	3128684	3128691	25 %	0 %	50 %	25 %	171059523
82013	NC_010524	CAG	3	9	3128806	3128814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059523
82014	NC_010524	GGT	2	6	3128881	3128886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059523
82015	NC_010524	CG	3	6	3128931	3128936	0 %	0 %	50 %	50 %	171059523
82016	NC_010524	GC	4	8	3128947	3128954	0 %	0 %	50 %	50 %	171059523
82017	NC_010524	CGT	2	6	3128955	3128960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059523
82018	NC_010524	CGG	2	6	3128990	3128995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059523
82019	NC_010524	TCG	2	6	3129002	3129007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059523
82020	NC_010524	CG	3	6	3129006	3129011	0 %	0 %	50 %	50 %	171059523
82021	NC_010524	GC	3	6	3129055	3129060	0 %	0 %	50 %	50 %	171059523
82022	NC_010524	CTGCAC	2	12	3129076	3129087	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171059523
82023	NC_010524	CG	3	6	3129128	3129133	0 %	0 %	50 %	50 %	171059523
82024	NC_010524	TCG	2	6	3129242	3129247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059523
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82027	NC_010524	TCGAC	2	10	3129363	3129372	20 %	20 %	20 %	40 %	171059523
82028	NC_010524	GC	3	6	3129440	3129445	0 %	0 %	50 %	50 %	171059523
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82033	NC_010524	CGC	2	6	3129570	3129575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059523
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82039	NC_010524	CG	3	6	3129814	3129819	0 %	0 %	50 %	50 %	171059523
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82054	NC_010524	GCA	2	6	3130504	3130509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059524
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82061	NC_010524	G	6	6	3130670	3130675	0 %	0 %	100 %	0 %	171059524
82062	NC_010524	GTGAC	2	10	3130759	3130768	20 %	20 %	40 %	20 %	171059524
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82232	NC_010524	CAT	2	6	3136712	3136717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059530
82233	NC_010524	GC	3	6	3136734	3136739	0 %	0 %	50 %	50 %	171059530
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82243	NC_010524	GCGATC	2	12	3137106	3137117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171059531
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82334	NC_010524	CTG	2	6	3140442	3140447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059533
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82344	NC_010524	GCC	2	6	3140717	3140722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059534
82345	NC_010524	CGC	2	6	3140778	3140783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059534
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82347	NC_010524	GAC	2	6	3140819	3140824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059534
82348	NC_010524	CGC	2	6	3140852	3140857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059534
82349	NC_010524	CG	3	6	3140882	3140887	0 %	0 %	50 %	50 %	171059534
82350	NC_010524	CTG	2	6	3140888	3140893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059534
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82352	NC_010524	CGCC	2	8	3140937	3140944	0 %	0 %	25 %	75 %	171059534
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82376	NC_010524	CG	3	6	3141874	3141879	0 %	0 %	50 %	50 %	171059535
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82401	NC_010524	GC	3	6	3142683	3142688	0 %	0 %	50 %	50 %	171059536
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82450	NC_010524	CGT	2	6	3144251	3144256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059536
82451	NC_010524	GCC	2	6	3144331	3144336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059536
82452	NC_010524	CGATCT	2	12	3144416	3144427	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171059536
82453	NC_010524	GTC	2	6	3144438	3144443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059536
82454	NC_010524	GGC	2	6	3144496	3144501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059536
82455	NC_010524	CCA	2	6	3144518	3144523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059536
82456	NC_010524	CCA	2	6	3144599	3144604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059536
82457	NC_010524	AGC	2	6	3144625	3144630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059536
82458	NC_010524	GAT	2	6	3144636	3144641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059536
82459	NC_010524	GC	4	8	3144644	3144651	0 %	0 %	50 %	50 %	171059536
82460	NC_010524	AGAT	2	8	3144766	3144773	50 %	25 %	25 %	0 %	171059536
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82462	NC_010524	TCA	2	6	3144848	3144853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059536
82463	NC_010524	CGTC	2	8	3145237	3145244	0 %	25 %	25 %	50 %	171059537
82464	NC_010524	CTT	2	6	3145255	3145260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059537
82465	NC_010524	TCG	2	6	3145283	3145288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059537
82466	NC_010524	CTC	2	6	3145291	3145296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171059537
82467	NC_010524	TGG	2	6	3145304	3145309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059537
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82491	NC_010524	CAG	2	6	3146607	3146612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059538
82492	NC_010524	GGC	2	6	3146625	3146630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059538
82493	NC_010524	GC	3	6	3146666	3146671	0 %	0 %	50 %	50 %	171059538
82494	NC_010524	GGT	2	6	3146715	3146720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059538
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82496	NC_010524	GCC	2	6	3146845	3146850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059538
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82500	NC_010524	ATG	2	6	3146932	3146937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059538

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