MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
81501	NC_010524	GGC	2	6	3107905	3107910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059503
81502	NC_010524	GCA	2	6	3107923	3107928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81503	NC_010524	CGG	2	6	3107945	3107950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059503
81504	NC_010524	ATG	2	6	3108003	3108008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
81505	NC_010524	CAT	2	6	3108014	3108019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059503
81506	NC_010524	CAG	2	6	3108083	3108088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81507	NC_010524	CG	3	6	3108167	3108172	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
81508	NC_010524	CAC	2	6	3108197	3108202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059503
81509	NC_010524	GCGCCA	2	12	3108223	3108234	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059503
81510	NC_010524	CTT	2	6	3108241	3108246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059503
81511	NC_010524	GC	3	6	3108251	3108256	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
81512	NC_010524	GCT	2	6	3108271	3108276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81513	NC_010524	GCA	2	6	3108292	3108297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81514	NC_010524	TCGA	2	8	3108330	3108337	25 %	25 %	25 %	25 %	171059503
81515	NC_010524	GAT	2	6	3108353	3108358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
81516	NC_010524	CG	3	6	3108368	3108373	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
81517	NC_010524	GCG	2	6	3108397	3108402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059503
81518	NC_010524	GCC	2	6	3108407	3108412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
81519	NC_010524	CGA	2	6	3108448	3108453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81520	NC_010524	GTCG	2	8	3108512	3108519	0 %	25 %	50 %	25 %	171059503
81521	NC_010524	ATG	2	6	3108546	3108551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
81522	NC_010524	GCA	2	6	3108593	3108598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81523	NC_010524	CCA	2	6	3108636	3108641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059503
81524	NC_010524	TCT	2	6	3108655	3108660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059503
81525	NC_010524	TGGT	2	8	3108816	3108823	0 %	50 %	50 %	0 %	171059503
81526	NC_010524	GGC	2	6	3108841	3108846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059503
81527	NC_010524	CTT	3	9	3108860	3108868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059503
81528	NC_010524	CTCGGT	2	12	3108920	3108931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81529	NC_010524	GCT	2	6	3108940	3108945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81530	NC_010524	TCG	2	6	3108993	3108998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81531	NC_010524	GGCC	2	8	3109048	3109055	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
81532	NC_010524	GAT	2	6	3109070	3109075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
81533	NC_010524	CGT	2	6	3109202	3109207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81534	NC_010524	GAC	2	6	3109262	3109267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81535	NC_010524	TCGA	2	8	3109272	3109279	25 %	25 %	25 %	25 %	171059503
81536	NC_010524	GCC	2	6	3109304	3109309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
81537	NC_010524	TTC	2	6	3109320	3109325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059503
81538	NC_010524	TCG	2	6	3109329	3109334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81539	NC_010524	GGC	2	6	3109358	3109363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059503
81540	NC_010524	CGA	2	6	3109406	3109411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81541	NC_010524	CG	3	6	3109420	3109425	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
81542	NC_010524	GAC	2	6	3109439	3109444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81543	NC_010524	GCC	2	6	3109487	3109492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
81544	NC_010524	GCA	2	6	3109537	3109542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81545	NC_010524	CGGT	2	8	3109554	3109561	0 %	25 %	50 %	25 %	171059503
81546	NC_010524	TCGA	2	8	3109626	3109633	25 %	25 %	25 %	25 %	171059503
81547	NC_010524	GAT	2	6	3109640	3109645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
81548	NC_010524	CAG	2	6	3109715	3109720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059503
81549	NC_010524	GCC	3	9	3109790	3109798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
81550	NC_010524	GCC	2	6	3109802	3109807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
81551	NC_010524	GCC	2	6	3109847	3109852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
81552	NC_010524	CTT	2	6	3109888	3109893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059503
81553	NC_010524	ATC	2	6	3110004	3110009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059503
81554	NC_010524	GC	3	6	3110053	3110058	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
81555	NC_010524	GCC	2	6	3110075	3110080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059503
81556	NC_010524	GAT	2	6	3110117	3110122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
81557	NC_010524	ACC	2	6	3110130	3110135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059503
81558	NC_010524	GGTC	2	8	3110179	3110186	0 %	25 %	50 %	25 %	171059503
81559	NC_010524	GC	3	6	3110257	3110262	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
81560	NC_010524	AGT	2	6	3110266	3110271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
81561	NC_010524	GAT	3	9	3110291	3110299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
81562	NC_010524	GAT	2	6	3110312	3110317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059503
81563	NC_010524	GGAT	2	8	3110320	3110327	25 %	25 %	50 %	0 %	171059503
81564	NC_010524	GC	3	6	3110337	3110342	0 %	0 %	50 %	50 %	171059503
81565	NC_010524	TTC	3	9	3110350	3110358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059503
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81567	NC_010524	GC	3	6	3110469	3110474	0 %	0 %	50 %	50 %	171059504
81568	NC_010524	CGTG	2	8	3110507	3110514	0 %	25 %	50 %	25 %	171059504
81569	NC_010524	CTGG	2	8	3110565	3110572	0 %	25 %	50 %	25 %	171059504
81570	NC_010524	GTG	2	6	3110622	3110627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059504
81571	NC_010524	TGG	2	6	3110677	3110682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059504
81572	NC_010524	GCC	2	6	3110731	3110736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059504
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81574	NC_010524	CGG	2	6	3110816	3110821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059504
81575	NC_010524	GGCA	2	8	3110832	3110839	25 %	0 %	50 %	25 %	171059504
81576	NC_010524	GAG	2	6	3110967	3110972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171059504
81577	NC_010524	GGT	2	6	3111009	3111014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059504
81578	NC_010524	GAC	2	6	3111015	3111020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059504
81579	NC_010524	GGCC	2	8	3111035	3111042	0 %	0 %	50 %	50 %	171059504
81580	NC_010524	TCG	2	6	3111076	3111081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059504
81581	NC_010524	ACG	2	6	3111097	3111102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059504
81582	NC_010524	GGC	2	6	3111167	3111172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059504
81583	NC_010524	TGA	2	6	3111272	3111277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059504
81584	NC_010524	GGTC	2	8	3111383	3111390	0 %	25 %	50 %	25 %	171059504
81585	NC_010524	ACCGT	2	10	3111478	3111487	20 %	20 %	20 %	40 %	171059504
81586	NC_010524	TGCGAG	2	12	3111489	3111500	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171059504
81587	NC_010524	GCA	2	6	3111521	3111526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059504
81588	NC_010524	CGAC	2	8	3111785	3111792	25 %	0 %	25 %	50 %	171059505
81589	NC_010524	CGC	2	6	3111797	3111802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059505
81590	NC_010524	ATG	2	6	3111838	3111843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059505
81591	NC_010524	GC	3	6	3111878	3111883	0 %	0 %	50 %	50 %	171059505
81592	NC_010524	AGGA	2	8	3111886	3111893	50 %	0 %	50 %	0 %	171059505
81593	NC_010524	ATC	2	6	3111910	3111915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059505
81594	NC_010524	GC	3	6	3111957	3111962	0 %	0 %	50 %	50 %	171059505
81595	NC_010524	CAG	2	6	3112020	3112025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059505
81596	NC_010524	C	6	6	3112029	3112034	0 %	0 %	0 %	100 %	171059505
81597	NC_010524	CGA	2	6	3112040	3112045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059505
81598	NC_010524	GTT	3	9	3112065	3112073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171059505
81599	NC_010524	GCCTCG	2	12	3112078	3112089	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171059505
81600	NC_010524	TGC	2	6	3112397	3112402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059506
81601	NC_010524	GCT	2	6	3112416	3112421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059506
81602	NC_010524	TGC	2	6	3112433	3112438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059506
81603	NC_010524	CAT	2	6	3112476	3112481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059506
81604	NC_010524	TGC	2	6	3112586	3112591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059506
81605	NC_010524	TTC	2	6	3112603	3112608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059506
81606	NC_010524	CGG	2	6	3112659	3112664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059506
81607	NC_010524	ATG	2	6	3112675	3112680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059506
81608	NC_010524	CGG	2	6	3112686	3112691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059506
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81610	NC_010524	TCT	2	6	3112703	3112708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059506
81611	NC_010524	TCG	2	6	3112772	3112777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059506
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81613	NC_010524	GGCC	2	8	3112797	3112804	0 %	0 %	50 %	50 %	171059506
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81615	NC_010524	CTG	2	6	3112981	3112986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059506
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81960	NC_010524	GCG	2	6	3126735	3126740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059521
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