MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_010524	GCG	4	12	274740	274751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056950
7502	NC_010524	GC	3	6	274761	274766	0 %	0 %	50 %	50 %	171056950
7503	NC_010524	GTG	2	6	274785	274790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056950
7504	NC_010524	CGG	2	6	274802	274807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056950
7505	NC_010524	AGC	2	6	274888	274893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056950
7506	NC_010524	ACG	2	6	274906	274911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056950
7507	NC_010524	CAT	2	6	274916	274921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056950
7508	NC_010524	GC	3	6	274931	274936	0 %	0 %	50 %	50 %	171056950
7509	NC_010524	GC	3	6	275010	275015	0 %	0 %	50 %	50 %	171056950
7510	NC_010524	GC	4	8	275035	275042	0 %	0 %	50 %	50 %	171056950
7511	NC_010524	CAACGT	2	12	275048	275059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171056950
7512	NC_010524	CGG	3	9	275150	275158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056950
7513	NC_010524	GGC	2	6	275174	275179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056950
7514	NC_010524	GC	3	6	275237	275242	0 %	0 %	50 %	50 %	171056950
7515	NC_010524	TGG	2	6	275254	275259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056950
7516	NC_010524	GC	3	6	275299	275304	0 %	0 %	50 %	50 %	171056950
7517	NC_010524	ACC	2	6	275307	275312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056950
7518	NC_010524	ACCG	2	8	275355	275362	25 %	0 %	25 %	50 %	171056950
7519	NC_010524	GCG	2	6	275368	275373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056950
7520	NC_010524	GATC	2	8	275384	275391	25 %	25 %	25 %	25 %	171056950
7521	NC_010524	GCC	2	6	275461	275466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056950
7522	NC_010524	ATC	3	9	275475	275483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056950
7523	NC_010524	CGC	2	6	275519	275524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056950
7524	NC_010524	GAC	2	6	275534	275539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056950
7525	NC_010524	ACC	2	6	275605	275610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056950
7526	NC_010524	GGT	2	6	275624	275629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056950
7527	NC_010524	GGC	2	6	275630	275635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056950
7528	NC_010524	GCC	2	6	275684	275689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056951
7529	NC_010524	CTG	2	6	275709	275714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056951
7530	NC_010524	GCA	2	6	275792	275797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
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7532	NC_010524	CG	3	6	275843	275848	0 %	0 %	50 %	50 %	171056951
7533	NC_010524	GCA	2	6	275861	275866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
7534	NC_010524	GC	4	8	275884	275891	0 %	0 %	50 %	50 %	171056951
7535	NC_010524	GTT	2	6	275913	275918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056951
7536	NC_010524	GCACCG	2	12	275936	275947	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056951
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7538	NC_010524	TCG	2	6	275986	275991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056951
7539	NC_010524	GCT	2	6	276000	276005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056951
7540	NC_010524	CAGG	2	8	276012	276019	25 %	0 %	50 %	25 %	171056951
7541	NC_010524	CGG	2	6	276035	276040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056951
7542	NC_010524	GCC	2	6	276082	276087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056951
7543	NC_010524	GC	4	8	276114	276121	0 %	0 %	50 %	50 %	171056951
7544	NC_010524	GTC	2	6	276195	276200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056951
7545	NC_010524	GCA	2	6	276245	276250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
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7549	NC_010524	GCA	2	6	276323	276328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
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7551	NC_010524	GC	3	6	276392	276397	0 %	0 %	50 %	50 %	171056951
7552	NC_010524	CGC	2	6	276416	276421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056951
7553	NC_010524	GCA	2	6	276434	276439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
7554	NC_010524	CG	3	6	276442	276447	0 %	0 %	50 %	50 %	171056951
7555	NC_010524	GCT	2	6	276455	276460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056951
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7557	NC_010524	TGG	2	6	276479	276484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056951
7558	NC_010524	CGG	2	6	276509	276514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056951
7559	NC_010524	CGA	2	6	276539	276544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056951
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7561	NC_010524	TCG	2	6	276752	276757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056952
7562	NC_010524	CTG	2	6	276758	276763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056952
7563	NC_010524	CGA	2	6	276784	276789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056952
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7565	NC_010524	TCG	2	6	276858	276863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056952
7566	NC_010524	GCGCG	2	10	276931	276940	0 %	0 %	60 %	40 %	171056952
7567	NC_010524	GCGCAC	2	12	276970	276981	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056952
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7572	NC_010524	GCT	2	6	277111	277116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056952
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7588	NC_010524	GC	3	6	277640	277645	0 %	0 %	50 %	50 %	171056953
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7602	NC_010524	CTGG	2	8	278005	278012	0 %	25 %	50 %	25 %	171056953
7603	NC_010524	CG	4	8	278020	278027	0 %	0 %	50 %	50 %	171056953
7604	NC_010524	GCG	2	6	278032	278037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056953
7605	NC_010524	GC	4	8	278058	278065	0 %	0 %	50 %	50 %	171056953
7606	NC_010524	CCG	2	6	278252	278257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056954
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7616	NC_010524	CTGC	2	8	278679	278686	0 %	25 %	25 %	50 %	171056954
7617	NC_010524	CGG	2	6	278790	278795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056955
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7621	NC_010524	CTT	2	6	279031	279036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056955
7622	NC_010524	CCA	2	6	279042	279047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056955
7623	NC_010524	GCCTGT	2	12	279048	279059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056955
7624	NC_010524	CGA	2	6	279079	279084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056955
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7626	NC_010524	GCCG	2	8	279109	279116	0 %	0 %	50 %	50 %	171056955
7627	NC_010524	GC	3	6	279172	279177	0 %	0 %	50 %	50 %	171056955
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7632	NC_010524	CTG	2	6	279308	279313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056955
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7634	NC_010524	GCC	2	6	279401	279406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056955
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7654	NC_010524	GCAGC	2	10	279952	279961	20 %	0 %	40 %	40 %	171056955
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7681	NC_010524	CCGCG	2	10	280732	280741	0 %	0 %	40 %	60 %	171056956
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7685	NC_010524	CGA	2	6	280825	280830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056956
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7693	NC_010524	GGCG	2	8	281029	281036	0 %	0 %	75 %	25 %	171056956
7694	NC_010524	TCGG	2	8	281183	281190	0 %	25 %	50 %	25 %	171056956
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7701	NC_010524	ATC	2	6	281411	281416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056956
7702	NC_010524	CTG	2	6	281420	281425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056956
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7705	NC_010524	TCGA	2	8	281459	281466	25 %	25 %	25 %	25 %	171056956
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7728	NC_010524	CCG	2	6	282599	282604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056957
7729	NC_010524	CACG	2	8	282610	282617	25 %	0 %	25 %	50 %	171056957
7730	NC_010524	AGGTC	2	10	282684	282693	20 %	20 %	40 %	20 %	171056958
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7733	NC_010524	GC	3	6	282808	282813	0 %	0 %	50 %	50 %	171056958
7734	NC_010524	GGC	2	6	282858	282863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056958
7735	NC_010524	TCGATT	2	12	282922	282933	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	171056958
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7738	NC_010524	ACC	2	6	283086	283091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056958
7739	NC_010524	CTC	2	6	283145	283150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056958
7740	NC_010524	GCG	2	6	283160	283165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056958
7741	NC_010524	GCA	2	6	283192	283197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056958
7742	NC_010524	TCG	2	6	283281	283286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056958
7743	NC_010524	TCG	2	6	283338	283343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056958
7744	NC_010524	GGCGAT	2	12	283373	283384	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171056958
7745	NC_010524	GCA	3	9	283390	283398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056958
7746	NC_010524	TGG	2	6	283399	283404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056958
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7748	NC_010524	GCCA	2	8	283523	283530	25 %	0 %	25 %	50 %	171056959
7749	NC_010524	CGGGC	2	10	283591	283600	0 %	0 %	60 %	40 %	171056959
7750	NC_010524	GCG	2	6	283604	283609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056959
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7752	NC_010524	CAT	2	6	283642	283647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056959
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7754	NC_010524	TCG	2	6	283694	283699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056959
7755	NC_010524	GCG	2	6	283723	283728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056959
7756	NC_010524	CG	3	6	283727	283732	0 %	0 %	50 %	50 %	171056959
7757	NC_010524	GCA	2	6	283737	283742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056959
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7759	NC_010524	CAG	2	6	283825	283830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056959
7760	NC_010524	CG	3	6	283862	283867	0 %	0 %	50 %	50 %	171056959
7761	NC_010524	GCCG	2	8	283912	283919	0 %	0 %	50 %	50 %	171056959
7762	NC_010524	CGC	3	9	283920	283928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056959
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7765	NC_010524	CGG	2	6	283980	283985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056959
7766	NC_010524	GCGG	2	8	284034	284041	0 %	0 %	75 %	25 %	171056959
7767	NC_010524	GCA	2	6	284049	284054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056959
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7772	NC_010524	GTG	2	6	284137	284142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056959
7773	NC_010524	CAG	2	6	284215	284220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056959
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7775	NC_010524	GCG	2	6	284256	284261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056959
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7981	NC_010524	CAG	2	6	291860	291865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056968
7982	NC_010524	CG	3	6	291880	291885	0 %	0 %	50 %	50 %	171056968
7983	NC_010524	CGC	2	6	291916	291921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056968
7984	NC_010524	GC	3	6	291940	291945	0 %	0 %	50 %	50 %	171056968
7985	NC_010524	GGC	2	6	291955	291960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056968
7986	NC_010524	GCGG	2	8	291977	291984	0 %	0 %	75 %	25 %	171056968
7987	NC_010524	GTC	2	6	292019	292024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056968
7988	NC_010524	CG	4	8	292066	292073	0 %	0 %	50 %	50 %	171056968
7989	NC_010524	CG	3	6	292102	292107	0 %	0 %	50 %	50 %	171056968
7990	NC_010524	GCA	2	6	292120	292125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056968
7991	NC_010524	GGC	2	6	292163	292168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056968
7992	NC_010524	AGC	2	6	292194	292199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056968
7993	NC_010524	GCG	3	9	292236	292244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056968
7994	NC_010524	GCGCG	2	10	292285	292294	0 %	0 %	60 %	40 %	171056968
7995	NC_010524	GCT	2	6	292298	292303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056968
7996	NC_010524	ATC	2	6	292308	292313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056968
7997	NC_010524	CGA	2	6	292324	292329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056968
7998	NC_010524	AGG	2	6	292332	292337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056968
7999	NC_010524	CGG	2	6	292443	292448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056969
8000	NC_010524	CAG	2	6	292462	292467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056969

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