MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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79003	NC_010524	GGCG	2	8	3008529	3008536	0 %	0 %	75 %	25 %	171059407
79004	NC_010524	GGC	2	6	3008563	3008568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059407
79005	NC_010524	GC	3	6	3008594	3008599	0 %	0 %	50 %	50 %	171059407
79006	NC_010524	CGT	2	6	3008625	3008630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059407
79007	NC_010524	GC	3	6	3008636	3008641	0 %	0 %	50 %	50 %	171059407
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79011	NC_010524	GCC	2	6	3008800	3008805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059407
79012	NC_010524	GTT	2	6	3008824	3008829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171059407
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79019	NC_010524	TGC	2	6	3009058	3009063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059407
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79116	NC_010524	CTG	2	6	3012318	3012323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059411
79117	NC_010524	GC	3	6	3012333	3012338	0 %	0 %	50 %	50 %	171059411
79118	NC_010524	ATC	2	6	3012346	3012351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059411
79119	NC_010524	GGCG	2	8	3012407	3012414	0 %	0 %	75 %	25 %	171059411
79120	NC_010524	CGGC	2	8	3012422	3012429	0 %	0 %	50 %	50 %	171059411
79121	NC_010524	CGG	2	6	3012440	3012445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059411
79122	NC_010524	CGT	2	6	3012458	3012463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059411
79123	NC_010524	GCG	2	6	3012476	3012481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059411
79124	NC_010524	CAGCTT	2	12	3012495	3012506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	171059411
79125	NC_010524	GCC	2	6	3012522	3012527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059411
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79128	NC_010524	GCC	2	6	3012600	3012605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059411
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79134	NC_010524	CGC	2	6	3012833	3012838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059411
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79143	NC_010524	GC	3	6	3013295	3013300	0 %	0 %	50 %	50 %	171059412
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79146	NC_010524	CGG	3	9	3013456	3013464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059412
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79152	NC_010524	TCT	2	6	3013627	3013632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059412
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79230	NC_010524	GGC	2	6	3016510	3016515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059416
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79232	NC_010524	CG	3	6	3016528	3016533	0 %	0 %	50 %	50 %	171059416
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79349	NC_010524	GC	3	6	3021516	3021521	0 %	0 %	50 %	50 %	171059424
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79463	NC_010524	CGGC	2	8	3025786	3025793	0 %	0 %	50 %	50 %	171059428
79464	NC_010524	CAGCG	2	10	3025828	3025837	20 %	0 %	40 %	40 %	171059428
79465	NC_010524	CCT	2	6	3025865	3025870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171059428
79466	NC_010524	CGA	2	6	3025886	3025891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059428
79467	NC_010524	TGC	2	6	3025895	3025900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059428
79468	NC_010524	TGC	2	6	3025921	3025926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059428
79469	NC_010524	GTC	2	6	3025944	3025949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059428
79470	NC_010524	GAT	2	6	3025959	3025964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059428
79471	NC_010524	CCT	2	6	3026066	3026071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171059428
79472	NC_010524	GC	3	6	3026107	3026112	0 %	0 %	50 %	50 %	171059428
79473	NC_010524	GACG	2	8	3026133	3026140	25 %	0 %	50 %	25 %	171059428
79474	NC_010524	GGGC	2	8	3026147	3026154	0 %	0 %	75 %	25 %	171059428
79475	NC_010524	GGC	2	6	3026372	3026377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059429
79476	NC_010524	AGC	2	6	3026403	3026408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059429
79477	NC_010524	GC	3	6	3026457	3026462	0 %	0 %	50 %	50 %	171059429
79478	NC_010524	CGC	3	9	3026460	3026468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059429
79479	NC_010524	TCA	2	6	3026490	3026495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059429
79480	NC_010524	GGCGT	2	10	3026513	3026522	0 %	20 %	60 %	20 %	171059429
79481	NC_010524	CAG	2	6	3026573	3026578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059429
79482	NC_010524	TCA	2	6	3026619	3026624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059429
79483	NC_010524	GGCG	2	8	3026659	3026666	0 %	0 %	75 %	25 %	171059429
79484	NC_010524	GCT	2	6	3026698	3026703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059429
79485	NC_010524	GTG	2	6	3026714	3026719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059429
79486	NC_010524	GCA	2	6	3026743	3026748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059429
79487	NC_010524	CCG	2	6	3026832	3026837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059429
79488	NC_010524	CTG	2	6	3026873	3026878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059429
79489	NC_010524	GC	3	6	3026881	3026886	0 %	0 %	50 %	50 %	171059429
79490	NC_010524	CAA	2	6	3026902	3026907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059429
79491	NC_010524	CGA	2	6	3026916	3026921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059429
79492	NC_010524	GAT	2	6	3026986	3026991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059429
79493	NC_010524	GC	3	6	3026994	3026999	0 %	0 %	50 %	50 %	171059429
79494	NC_010524	GAT	2	6	3027046	3027051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059429
79495	NC_010524	TGC	2	6	3027060	3027065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059429
79496	NC_010524	GCC	2	6	3027086	3027091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059429
79497	NC_010524	GCC	2	6	3027095	3027100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059429
79498	NC_010524	GAC	2	6	3027105	3027110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059429
79499	NC_010524	CG	3	6	3027118	3027123	0 %	0 %	50 %	50 %	171059430
79500	NC_010524	CGC	2	6	3027133	3027138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059430

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