MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78001	NC_010524	CATCG	2	10	2970416	2970425	20 %	20 %	20 %	40 %	171059380
78002	NC_010524	GGC	2	6	2970432	2970437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059380
78003	NC_010524	ATC	2	6	2970477	2970482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059380
78004	NC_010524	GCCG	2	8	2970554	2970561	0 %	0 %	50 %	50 %	171059380
78005	NC_010524	GCT	2	6	2970604	2970609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059380
78006	NC_010524	GACG	2	8	2970617	2970624	25 %	0 %	50 %	25 %	171059380
78007	NC_010524	GGC	2	6	2970666	2970671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059380
78008	NC_010524	TCG	2	6	2970733	2970738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059380
78009	NC_010524	CGA	2	6	2970752	2970757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059380
78010	NC_010524	AGA	2	6	2970758	2970763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059380
78011	NC_010524	TGGCGA	2	12	2970850	2970861	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171059380
78012	NC_010524	CGG	2	6	2970884	2970889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059380
78013	NC_010524	CGG	2	6	2970914	2970919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059380
78014	NC_010524	CCG	2	6	2970928	2970933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059380
78015	NC_010524	CGG	2	6	2971004	2971009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059380
78016	NC_010524	CAT	2	6	2971010	2971015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059380
78017	NC_010524	TGG	2	6	2971081	2971086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059380
78018	NC_010524	AAG	2	6	2971119	2971124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059380
78019	NC_010524	ATC	2	6	2971149	2971154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059380
78020	NC_010524	CCGCGA	2	12	2971177	2971188	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059380
78021	NC_010524	TCA	2	6	2971236	2971241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059381
78022	NC_010524	TCA	2	6	2971257	2971262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059381
78023	NC_010524	TCG	2	6	2971338	2971343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059381
78024	NC_010524	GAA	2	6	2971357	2971362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059381
78025	NC_010524	GGCG	2	8	2971363	2971370	0 %	0 %	75 %	25 %	171059381
78026	NC_010524	GCA	3	9	2971417	2971425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059381
78027	NC_010524	GCC	2	6	2971453	2971458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059381
78028	NC_010524	GCG	2	6	2971472	2971477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059381
78029	NC_010524	GACCTG	2	12	2971499	2971510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171059381
78030	NC_010524	CAA	2	6	2971561	2971566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059381
78031	NC_010524	GCC	2	6	2971583	2971588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059381
78032	NC_010524	GGC	2	6	2971589	2971594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059381
78033	NC_010524	AAG	2	6	2971595	2971600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059381
78034	NC_010524	GCT	3	9	2971603	2971611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059381
78035	NC_010524	GAG	2	6	2971643	2971648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171059381
78036	NC_010524	CAT	2	6	2971660	2971665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059381
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78038	NC_010524	CGG	2	6	2971786	2971791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059381
78039	NC_010524	GC	3	6	2971828	2971833	0 %	0 %	50 %	50 %	171059381
78040	NC_010524	ACG	2	6	2971839	2971844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059381
78041	NC_010524	CGG	2	6	2971882	2971887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059381
78042	NC_010524	GCG	2	6	2971904	2971909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059381
78043	NC_010524	GAA	2	6	2971930	2971935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059381
78044	NC_010524	TCG	2	6	2971941	2971946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059381
78045	NC_010524	CGG	2	6	2972025	2972030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059381
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78048	NC_010524	GCT	2	6	2972110	2972115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059381
78049	NC_010524	GATC	2	8	2972282	2972289	25 %	25 %	25 %	25 %	171059382
78050	NC_010524	CG	3	6	2972314	2972319	0 %	0 %	50 %	50 %	171059382
78051	NC_010524	GGC	2	6	2972347	2972352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059382
78052	NC_010524	ATC	2	6	2972376	2972381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059382
78053	NC_010524	GC	3	6	2972460	2972465	0 %	0 %	50 %	50 %	171059382
78054	NC_010524	TCT	2	6	2972539	2972544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059382
78055	NC_010524	CGC	2	6	2972734	2972739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059382
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78058	NC_010524	CAGG	2	8	2972807	2972814	25 %	0 %	50 %	25 %	171059382
78059	NC_010524	CGG	2	6	2972821	2972826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059382
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78061	NC_010524	CGA	2	6	2972852	2972857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059382
78062	NC_010524	GGTCGA	2	12	2972873	2972884	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171059382
78063	NC_010524	GC	4	8	2972929	2972936	0 %	0 %	50 %	50 %	171059382
78064	NC_010524	CTC	2	6	2972960	2972965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171059382
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78084	NC_010524	CGG	2	6	2973886	2973891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059383
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78088	NC_010524	GCA	2	6	2974164	2974169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059384
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78099	NC_010524	AGC	2	6	2974574	2974579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059384
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78105	NC_010524	CGCAT	2	10	2975024	2975033	20 %	20 %	20 %	40 %	171059385
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78109	NC_010524	GGCG	2	8	2975166	2975173	0 %	0 %	75 %	25 %	171059385
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78112	NC_010524	CG	3	6	2975257	2975262	0 %	0 %	50 %	50 %	171059385
78113	NC_010524	CAG	2	6	2975272	2975277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059385
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