MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
77501	NC_010524	TCGAT	2	10	2951142	2951151	20 %	40 %	20 %	20 %	171059365
77502	NC_010524	CGC	2	6	2951160	2951165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059365
77503	NC_010524	CGC	2	6	2951208	2951213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059365
77504	NC_010524	TCG	2	6	2951240	2951245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77505	NC_010524	AGC	2	6	2951270	2951275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77506	NC_010524	GCGCA	2	10	2951326	2951335	20 %	0 %	40 %	40 %	171059365
77507	NC_010524	GCC	3	9	2951339	2951347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059365
77508	NC_010524	CGGT	2	8	2951353	2951360	0 %	25 %	50 %	25 %	171059365
77509	NC_010524	GCTC	2	8	2951393	2951400	0 %	25 %	25 %	50 %	171059365
77510	NC_010524	CG	3	6	2951427	2951432	0 %	0 %	50 %	50 %	171059365
77511	NC_010524	GCCG	2	8	2951452	2951459	0 %	0 %	50 %	50 %	171059365
77512	NC_010524	GGC	2	6	2951464	2951469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059365
77513	NC_010524	GCGCC	2	10	2951476	2951485	0 %	0 %	40 %	60 %	171059365
77514	NC_010524	TCG	2	6	2951501	2951506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77515	NC_010524	GGCC	2	8	2951511	2951518	0 %	0 %	50 %	50 %	171059365
77516	NC_010524	GCG	2	6	2951548	2951553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059365
77517	NC_010524	CGA	2	6	2951562	2951567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77518	NC_010524	GC	3	6	2951604	2951609	0 %	0 %	50 %	50 %	171059365
77519	NC_010524	CGG	2	6	2951614	2951619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059365
77520	NC_010524	GAT	2	6	2951629	2951634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059365
77521	NC_010524	ACA	2	6	2951661	2951666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171059365
77522	NC_010524	CTG	2	6	2951713	2951718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77523	NC_010524	ATGCGC	2	12	2951720	2951731	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77524	NC_010524	CG	3	6	2951751	2951756	0 %	0 %	50 %	50 %	171059365
77525	NC_010524	GCA	2	6	2951883	2951888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77526	NC_010524	TCG	2	6	2951891	2951896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77527	NC_010524	GC	3	6	2951962	2951967	0 %	0 %	50 %	50 %	171059365
77528	NC_010524	GCG	2	6	2951986	2951991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059365
77529	NC_010524	CGA	2	6	2952028	2952033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77530	NC_010524	ACC	2	6	2952065	2952070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059365
77531	NC_010524	CGT	2	6	2952081	2952086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77532	NC_010524	CCGG	2	8	2952117	2952124	0 %	0 %	50 %	50 %	171059365
77533	NC_010524	GCA	2	6	2952201	2952206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77534	NC_010524	GC	3	6	2952235	2952240	0 %	0 %	50 %	50 %	171059365
77535	NC_010524	CGC	2	6	2952291	2952296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059365
77536	NC_010524	GTC	2	6	2952343	2952348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77537	NC_010524	CGC	2	6	2952394	2952399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059365
77538	NC_010524	GC	3	6	2952415	2952420	0 %	0 %	50 %	50 %	171059365
77539	NC_010524	GCC	2	6	2952449	2952454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059365
77540	NC_010524	CACG	2	8	2952501	2952508	25 %	0 %	25 %	50 %	171059365
77541	NC_010524	TCG	2	6	2952578	2952583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77542	NC_010524	GGT	2	6	2952712	2952717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059365
77543	NC_010524	GTC	2	6	2952742	2952747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77544	NC_010524	CG	3	6	2952798	2952803	0 %	0 %	50 %	50 %	171059365
77545	NC_010524	GCAC	2	8	2952812	2952819	25 %	0 %	25 %	50 %	171059365
77546	NC_010524	GCG	2	6	2952841	2952846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059365
77547	NC_010524	CGG	2	6	2952885	2952890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059365
77548	NC_010524	TGC	2	6	2952894	2952899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77549	NC_010524	TCG	2	6	2952911	2952916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77550	NC_010524	GGC	2	6	2952964	2952969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059365
77551	NC_010524	TGC	2	6	2952983	2952988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059365
77552	NC_010524	CTT	2	6	2953002	2953007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059365
77553	NC_010524	TGC	2	6	2953635	2953640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059366
77554	NC_010524	GC	3	6	2953665	2953670	0 %	0 %	50 %	50 %	171059366
77555	NC_010524	GAA	2	6	2953694	2953699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059366
77556	NC_010524	TCCT	2	8	2953704	2953711	0 %	50 %	0 %	50 %	171059366
77557	NC_010524	CGA	2	6	2953720	2953725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059366
77558	NC_010524	CTT	2	6	2953763	2953768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059366
77559	NC_010524	CGTG	2	8	2953783	2953790	0 %	25 %	50 %	25 %	171059366
77560	NC_010524	ACC	2	6	2953791	2953796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059366
77561	NC_010524	ATC	2	6	2953797	2953802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059366
77562	NC_010524	CCA	2	6	2953849	2953854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059366
77563	NC_010524	TCG	2	6	2953881	2953886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059366
77564	NC_010524	GC	5	10	2953915	2953924	0 %	0 %	50 %	50 %	171059366
77565	NC_010524	GCT	3	9	2953936	2953944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059366
77566	NC_010524	GCC	2	6	2953946	2953951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059366
77567	NC_010524	TG	3	6	2953978	2953983	0 %	50 %	50 %	0 %	171059366
77568	NC_010524	CG	4	8	2954017	2954024	0 %	0 %	50 %	50 %	171059366
77569	NC_010524	CGT	2	6	2954029	2954034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059366
77570	NC_010524	GGTC	2	8	2954152	2954159	0 %	25 %	50 %	25 %	171059366
77571	NC_010524	GAC	2	6	2954186	2954191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059366
77572	NC_010524	GCCCGA	2	12	2954249	2954260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171059366
77573	NC_010524	ACC	2	6	2954271	2954276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059366
77574	NC_010524	GGT	2	6	2954300	2954305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059366
77575	NC_010524	TCTGGA	2	12	2954350	2954361	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171059366
77576	NC_010524	CGG	2	6	2954365	2954370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059366
77577	NC_010524	GAT	2	6	2954384	2954389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059367
77578	NC_010524	TCT	3	9	2954395	2954403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059367
77579	NC_010524	GAC	2	6	2954450	2954455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059367
77580	NC_010524	GGC	2	6	2954456	2954461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059367
77581	NC_010524	AGGT	2	8	2954466	2954473	25 %	25 %	50 %	0 %	171059367
77582	NC_010524	CCGG	2	8	2954479	2954486	0 %	0 %	50 %	50 %	171059367
77583	NC_010524	GAT	2	6	2954570	2954575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059367
77584	NC_010524	CAG	2	6	2954585	2954590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059367
77585	NC_010524	GCA	2	6	2954596	2954601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059367
77586	NC_010524	GCA	2	6	2954620	2954625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059367
77587	NC_010524	CCA	2	6	2954626	2954631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059367
77588	NC_010524	CG	3	6	2954708	2954713	0 %	0 %	50 %	50 %	171059367
77589	NC_010524	AGT	2	6	2954725	2954730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059367
77590	NC_010524	GCC	2	6	2954733	2954738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059367
77591	NC_010524	GCCG	2	8	2954785	2954792	0 %	0 %	50 %	50 %	171059367
77592	NC_010524	CAG	2	6	2954795	2954800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059367
77593	NC_010524	CAG	2	6	2954807	2954812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059367
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77598	NC_010524	CAG	2	6	2954918	2954923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059367
77599	NC_010524	CAG	2	6	2954930	2954935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059367
77600	NC_010524	GCC	2	6	2954939	2954944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059367
77601	NC_010524	ATC	2	6	2954946	2954951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059367
77602	NC_010524	CCA	2	6	2954953	2954958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059367
77603	NC_010524	CGA	2	6	2955004	2955009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059367
77604	NC_010524	GCC	2	6	2955046	2955051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059368
77605	NC_010524	TGA	2	6	2955105	2955110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059368
77606	NC_010524	CGC	2	6	2955159	2955164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059368
77607	NC_010524	TTC	2	6	2955172	2955177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059368
77608	NC_010524	GAG	2	6	2955233	2955238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171059368
77609	NC_010524	TGA	2	6	2955243	2955248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059368
77610	NC_010524	GCG	2	6	2955270	2955275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059368
77611	NC_010524	GCA	3	9	2955300	2955308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059368
77612	NC_010524	GAA	2	6	2955421	2955426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059368
77613	NC_010524	CGA	2	6	2955435	2955440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059368
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77615	NC_010524	GCA	2	6	2955489	2955494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059368
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