MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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76002	NC_010524	CGG	2	6	2894405	2894410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059315
76003	NC_010524	CAG	2	6	2894423	2894428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059315
76004	NC_010524	GTC	2	6	2894429	2894434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059315
76005	NC_010524	CGG	2	6	2894444	2894449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059315
76006	NC_010524	CGG	2	6	2894456	2894461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059315
76007	NC_010524	CTC	2	6	2894474	2894479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171059315
76008	NC_010524	TCG	2	6	2894583	2894588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059315
76009	NC_010524	GTC	2	6	2894618	2894623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059315
76010	NC_010524	GC	3	6	2894633	2894638	0 %	0 %	50 %	50 %	171059315
76011	NC_010524	GC	3	6	2894685	2894690	0 %	0 %	50 %	50 %	171059315
76012	NC_010524	CTC	2	6	2894782	2894787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171059315
76013	NC_010524	ACC	3	9	2895196	2895204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059316
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76015	NC_010524	GCCG	2	8	2895299	2895306	0 %	0 %	50 %	50 %	171059316
76016	NC_010524	GCA	2	6	2895317	2895322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059316
76017	NC_010524	GGC	2	6	2895323	2895328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059316
76018	NC_010524	GCT	2	6	2895359	2895364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059316
76019	NC_010524	CG	4	8	2895416	2895423	0 %	0 %	50 %	50 %	171059316
76020	NC_010524	CCTT	2	8	2895424	2895431	0 %	50 %	0 %	50 %	171059316
76021	NC_010524	CGT	2	6	2895464	2895469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059316
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76024	NC_010524	CG	3	6	2895503	2895508	0 %	0 %	50 %	50 %	171059316
76025	NC_010524	GCG	2	6	2895530	2895535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059316
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76028	NC_010524	CACCGC	2	12	2895714	2895725	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171059316
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76034	NC_010524	GC	3	6	2895981	2895986	0 %	0 %	50 %	50 %	171059316
76035	NC_010524	CTT	2	6	2896017	2896022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059316
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76042	NC_010524	CGTCAC	2	12	2896533	2896544	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171059316
76043	NC_010524	TGC	2	6	2896565	2896570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059316
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76050	NC_010524	ACCTGC	2	12	2896750	2896761	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171059316
76051	NC_010524	TCACGC	2	12	2896784	2896795	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171059316
76052	NC_010524	GCC	2	6	2896809	2896814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059316
76053	NC_010524	C	6	6	2896831	2896836	0 %	0 %	0 %	100 %	171059316
76054	NC_010524	ACC	2	6	2896888	2896893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059316
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76068	NC_010524	GCCG	2	8	2897510	2897517	0 %	0 %	50 %	50 %	171059317
76069	NC_010524	CTCG	2	8	2897567	2897574	0 %	25 %	25 %	50 %	171059317
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76087	NC_010524	GCCGG	2	10	2898359	2898368	0 %	0 %	60 %	40 %	171059318
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76099	NC_010524	GC	3	6	2898936	2898941	0 %	0 %	50 %	50 %	171059318
76100	NC_010524	CGGC	2	8	2898981	2898988	0 %	0 %	50 %	50 %	171059318
76101	NC_010524	GCC	2	6	2899025	2899030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059318
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76110	NC_010524	GCGAT	2	10	2899409	2899418	20 %	20 %	40 %	20 %	171059319
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76114	NC_010524	GAT	2	6	2899558	2899563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171059320
76115	NC_010524	CGC	2	6	2899605	2899610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059320
76116	NC_010524	GTG	2	6	2899622	2899627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059320
76117	NC_010524	GCG	3	9	2899677	2899685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059320
76118	NC_010524	GGC	2	6	2899686	2899691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059320
76119	NC_010524	CCA	2	6	2899717	2899722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059320
76120	NC_010524	GGT	2	6	2899786	2899791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059320
76121	NC_010524	GTG	2	6	2899847	2899852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171059320
76122	NC_010524	TCG	2	6	2899887	2899892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059320
76123	NC_010524	GGCT	2	8	2899910	2899917	0 %	25 %	50 %	25 %	171059320
76124	NC_010524	CTG	2	6	2899979	2899984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059320
76125	NC_010524	GCC	2	6	2900030	2900035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059320
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76127	NC_010524	CGC	2	6	2900061	2900066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059320
76128	NC_010524	CGC	2	6	2900083	2900088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059320
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76130	NC_010524	GC	3	6	2900129	2900134	0 %	0 %	50 %	50 %	171059320
76131	NC_010524	TTG	2	6	2900215	2900220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171059321
76132	NC_010524	GCA	2	6	2900221	2900226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059321
76133	NC_010524	TCG	2	6	2900227	2900232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059321
76134	NC_010524	ACG	2	6	2900340	2900345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059321
76135	NC_010524	ATC	2	6	2900385	2900390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059321
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76140	NC_010524	CTA	2	6	2900525	2900530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059321
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76142	NC_010524	TGC	2	6	2900638	2900643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059321
76143	NC_010524	ACC	2	6	2900649	2900654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171059321
76144	NC_010524	GC	3	6	2900714	2900719	0 %	0 %	50 %	50 %	171059321
76145	NC_010524	CTG	2	6	2900720	2900725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059321
76146	NC_010524	GCCG	2	8	2900741	2900748	0 %	0 %	50 %	50 %	171059321
76147	NC_010524	CGA	2	6	2900768	2900773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059321
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76149	NC_010524	CGG	2	6	2900801	2900806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059321
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76151	NC_010524	GGCG	2	8	2900876	2900883	0 %	0 %	75 %	25 %	171059321
76152	NC_010524	ACGC	2	8	2900884	2900891	25 %	0 %	25 %	50 %	171059321
76153	NC_010524	CG	4	8	2900894	2900901	0 %	0 %	50 %	50 %	171059321
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76158	NC_010524	GGCC	2	8	2901071	2901078	0 %	0 %	50 %	50 %	171059321
76159	NC_010524	GGC	2	6	2901296	2901301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059322
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76180	NC_010524	CGC	3	9	2902029	2902037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059322
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76184	NC_010524	CGC	2	6	2902291	2902296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059322
76185	NC_010524	CGA	2	6	2902354	2902359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059322
76186	NC_010524	CTG	2	6	2902382	2902387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059322
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76188	NC_010524	CAGC	2	8	2902961	2902968	25 %	0 %	25 %	50 %	171059323
76189	NC_010524	CGT	2	6	2902969	2902974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059323
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76200	NC_010524	GC	4	8	2903266	2903273	0 %	0 %	50 %	50 %	171059323
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76206	NC_010524	CGCTG	2	10	2903434	2903443	0 %	20 %	40 %	40 %	171059323
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76211	NC_010524	GGC	2	6	2903620	2903625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059323
76212	NC_010524	GCC	2	6	2903638	2903643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171059323
76213	NC_010524	CGT	2	6	2903668	2903673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059323
76214	NC_010524	C	6	6	2903700	2903705	0 %	0 %	0 %	100 %	171059323
76215	NC_010524	ATC	2	6	2903721	2903726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171059323
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76217	NC_010524	GAAGCG	2	12	2903753	2903764	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	171059323
76218	NC_010524	CAG	2	6	2903768	2903773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059323
76219	NC_010524	CGG	2	6	2903776	2903781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059323
76220	NC_010524	AGCG	2	8	2903847	2903854	25 %	0 %	50 %	25 %	171059323
76221	NC_010524	TCGCCC	2	12	2903895	2903906	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	171059323
76222	NC_010524	GC	4	8	2903962	2903969	0 %	0 %	50 %	50 %	171059323
76223	NC_010524	CGG	2	6	2903975	2903980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059323
76224	NC_010524	CAG	2	6	2904008	2904013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059323
76225	NC_010524	AGC	2	6	2904066	2904071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171059323
76226	NC_010524	GCAGG	2	10	2904074	2904083	20 %	0 %	60 %	20 %	171059323
76227	NC_010524	GCG	2	6	2904088	2904093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059323
76228	NC_010524	GTC	2	6	2904279	2904284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059324
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76230	NC_010524	TTC	2	6	2904351	2904356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171059324
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76462	NC_010524	CG	3	6	2912292	2912297	0 %	0 %	50 %	50 %	171059330
76463	NC_010524	GGCGC	2	10	2912344	2912353	0 %	0 %	60 %	40 %	171059330
76464	NC_010524	CGT	2	6	2912400	2912405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059330
76465	NC_010524	GTC	2	6	2912440	2912445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171059330
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76472	NC_010524	CGGC	2	8	2913138	2913145	0 %	0 %	50 %	50 %	171059331
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76481	NC_010524	GGC	2	6	2913307	2913312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171059331
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76490	NC_010524	GCCA	2	8	2913729	2913736	25 %	0 %	25 %	50 %	171059332
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76492	NC_010524	GC	3	6	2913778	2913783	0 %	0 %	50 %	50 %	171059332
76493	NC_010524	GAA	2	6	2913792	2913797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171059332
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