MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_010524	CTG	2	6	258877	258882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056931
7002	NC_010524	GCG	2	6	258883	258888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056931
7003	NC_010524	GC	3	6	258913	258918	0 %	0 %	50 %	50 %	171056931
7004	NC_010524	TCG	2	6	258935	258940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056931
7005	NC_010524	TGC	2	6	258959	258964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056931
7006	NC_010524	TGG	2	6	259001	259006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056931
7007	NC_010524	CGG	2	6	259074	259079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056931
7008	NC_010524	TCG	2	6	259106	259111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056931
7009	NC_010524	ACG	2	6	259130	259135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056931
7010	NC_010524	CGC	2	6	259158	259163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056931
7011	NC_010524	CTG	3	9	259183	259191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056931
7012	NC_010524	CG	3	6	259202	259207	0 %	0 %	50 %	50 %	171056931
7013	NC_010524	CGG	2	6	259277	259282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056932
7014	NC_010524	GGC	2	6	259296	259301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056932
7015	NC_010524	CGGCC	2	10	259302	259311	0 %	0 %	40 %	60 %	171056932
7016	NC_010524	AGC	2	6	259351	259356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7017	NC_010524	GCG	2	6	259417	259422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056932
7018	NC_010524	GAA	2	6	259452	259457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056932
7019	NC_010524	CG	3	6	259472	259477	0 %	0 %	50 %	50 %	171056932
7020	NC_010524	GC	3	6	259496	259501	0 %	0 %	50 %	50 %	171056932
7021	NC_010524	GCCA	2	8	259543	259550	25 %	0 %	25 %	50 %	171056932
7022	NC_010524	GCA	3	9	259571	259579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7023	NC_010524	GCA	2	6	259583	259588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7024	NC_010524	AGC	2	6	259621	259626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7025	NC_010524	GCC	2	6	259633	259638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056932
7026	NC_010524	CAGG	2	8	259647	259654	25 %	0 %	50 %	25 %	171056932
7027	NC_010524	GGC	2	6	259688	259693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056932
7028	NC_010524	TGGC	2	8	259759	259766	0 %	25 %	50 %	25 %	171056932
7029	NC_010524	TCA	2	6	259799	259804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056932
7030	NC_010524	CAG	2	6	259818	259823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7031	NC_010524	CAG	2	6	259833	259838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7032	NC_010524	GGCA	2	8	259846	259853	25 %	0 %	50 %	25 %	171056932
7033	NC_010524	GCA	2	6	259874	259879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7034	NC_010524	GTGC	2	8	259889	259896	0 %	25 %	50 %	25 %	171056932
7035	NC_010524	GCG	3	9	259904	259912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056932
7036	NC_010524	GTG	2	6	259928	259933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056932
7037	NC_010524	CAG	2	6	259947	259952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7038	NC_010524	GCCGC	2	10	259984	259993	0 %	0 %	40 %	60 %	171056932
7039	NC_010524	CAG	2	6	260040	260045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7040	NC_010524	GAC	2	6	260049	260054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7041	NC_010524	GCG	2	6	260077	260082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056932
7042	NC_010524	GTC	2	6	260100	260105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7043	NC_010524	CAC	2	6	260178	260183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056932
7044	NC_010524	CAC	2	6	260200	260205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056932
7045	NC_010524	AGC	2	6	260206	260211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056932
7046	NC_010524	CGC	2	6	260229	260234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056932
7047	NC_010524	GC	3	6	260233	260238	0 %	0 %	50 %	50 %	171056932
7048	NC_010524	GCCG	2	8	260267	260274	0 %	0 %	50 %	50 %	171056932
7049	NC_010524	TCAGCA	2	12	260312	260323	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171056932
7050	NC_010524	GGC	2	6	260340	260345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056932
7051	NC_010524	CGGCGT	2	12	260351	260362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056932
7052	NC_010524	CCA	2	6	260384	260389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056932
7053	NC_010524	CAGG	2	8	260397	260404	25 %	0 %	50 %	25 %	171056932
7054	NC_010524	CAGCG	2	10	260472	260481	20 %	0 %	40 %	40 %	171056933
7055	NC_010524	CAG	2	6	260483	260488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056933
7056	NC_010524	GTGC	2	8	260540	260547	0 %	25 %	50 %	25 %	171056933
7057	NC_010524	CG	3	6	260604	260609	0 %	0 %	50 %	50 %	171056933
7058	NC_010524	GCTCG	2	10	260657	260666	0 %	20 %	40 %	40 %	171056933
7059	NC_010524	CGC	2	6	260726	260731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056933
7060	NC_010524	GC	3	6	260764	260769	0 %	0 %	50 %	50 %	171056933
7061	NC_010524	GC	3	6	260791	260796	0 %	0 %	50 %	50 %	171056933
7062	NC_010524	GCC	2	6	260799	260804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056933
7063	NC_010524	CGCGG	2	10	260809	260818	0 %	0 %	60 %	40 %	171056933
7064	NC_010524	CG	3	6	260854	260859	0 %	0 %	50 %	50 %	171056933
7065	NC_010524	GC	3	6	260870	260875	0 %	0 %	50 %	50 %	171056933
7066	NC_010524	GGC	2	6	260881	260886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056933
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7070	NC_010524	CGC	2	6	260977	260982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056933
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7103	NC_010524	GCC	2	6	261797	261802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056934
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7105	NC_010524	CGAT	2	8	261858	261865	25 %	25 %	25 %	25 %	171056934
7106	NC_010524	GGCG	2	8	261894	261901	0 %	0 %	75 %	25 %	171056934
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7111	NC_010524	GCCC	2	8	262092	262099	0 %	0 %	25 %	75 %	171056934
7112	NC_010524	GCG	4	12	262122	262133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7113	NC_010524	CG	3	6	262162	262167	0 %	0 %	50 %	50 %	171056934
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7119	NC_010524	CAG	2	6	262399	262404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056934
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7121	NC_010524	CGG	3	9	262483	262491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056934
7122	NC_010524	CGT	2	6	262498	262503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7123	NC_010524	GCT	3	9	262543	262551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056934
7124	NC_010524	CGC	2	6	262667	262672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056935
7125	NC_010524	GCGCCG	2	12	262675	262686	0 %	0 %	50 %	50 %	171056935
7126	NC_010524	GCT	2	6	262710	262715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056935
7127	NC_010524	ACC	2	6	262768	262773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056935
7128	NC_010524	CTGC	2	8	262778	262785	0 %	25 %	25 %	50 %	171056935
7129	NC_010524	GCTTCG	2	12	262793	262804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056935
7130	NC_010524	CGC	2	6	262821	262826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056935
7131	NC_010524	TGCTCG	2	12	262955	262966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056936
7132	NC_010524	GCC	2	6	262972	262977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056936
7133	NC_010524	GGC	2	6	262981	262986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056936
7134	NC_010524	GC	3	6	263028	263033	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7135	NC_010524	GC	3	6	263036	263041	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7136	NC_010524	GC	5	10	263049	263058	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7137	NC_010524	GTC	2	6	263064	263069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056936
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7139	NC_010524	GC	4	8	263139	263146	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7140	NC_010524	GC	4	8	263163	263170	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7141	NC_010524	GTG	2	6	263194	263199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056936
7142	NC_010524	ACCAC	2	10	263219	263228	40 %	0 %	0 %	60 %	171056936
7143	NC_010524	TGC	2	6	263240	263245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056936
7144	NC_010524	GCCGCT	2	12	263259	263270	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056936
7145	NC_010524	GTG	2	6	263271	263276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056936
7146	NC_010524	CGGC	2	8	263349	263356	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7147	NC_010524	GTTC	2	8	263378	263385	0 %	50 %	25 %	25 %	171056936
7148	NC_010524	CGC	2	6	263453	263458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056936
7149	NC_010524	CTG	2	6	263494	263499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056936
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7151	NC_010524	TGA	2	6	263576	263581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056936
7152	NC_010524	CGT	2	6	263592	263597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056936
7153	NC_010524	CGA	3	9	263622	263630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056936
7154	NC_010524	GAT	2	6	263631	263636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056936
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7156	NC_010524	CG	4	8	263661	263668	0 %	0 %	50 %	50 %	171056936
7157	NC_010524	GCG	2	6	263690	263695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056936
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7162	NC_010524	CAA	2	6	263760	263765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056936
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7164	NC_010524	CGC	2	6	263792	263797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056936
7165	NC_010524	CGC	2	6	263800	263805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056936
7166	NC_010524	CGG	2	6	263816	263821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056936
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7168	NC_010524	ATCGAG	2	12	263845	263856	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	171056936
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7178	NC_010524	CGG	2	6	264328	264333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056937
7179	NC_010524	CG	3	6	264365	264370	0 %	0 %	50 %	50 %	171056937
7180	NC_010524	AGG	2	6	264385	264390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056937
7181	NC_010524	TCG	2	6	264399	264404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056937
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7184	NC_010524	CG	3	6	264571	264576	0 %	0 %	50 %	50 %	171056937
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7187	NC_010524	CGATG	2	10	264638	264647	20 %	20 %	40 %	20 %	171056937
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7189	NC_010524	GC	3	6	264728	264733	0 %	0 %	50 %	50 %	171056938
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7192	NC_010524	GCG	2	6	264881	264886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056938
7193	NC_010524	TGA	2	6	264927	264932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056938
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7198	NC_010524	GCT	2	6	265020	265025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056939
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7200	NC_010524	CCG	2	6	265118	265123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056939
7201	NC_010524	TGC	2	6	265136	265141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056939
7202	NC_010524	GCG	2	6	265184	265189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056939
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7205	NC_010524	CTG	2	6	265258	265263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056939
7206	NC_010524	GC	3	6	265290	265295	0 %	0 %	50 %	50 %	171056939
7207	NC_010524	CGC	3	9	265293	265301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056939
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7209	NC_010524	CAGCT	2	10	265330	265339	20 %	20 %	20 %	40 %	171056939
7210	NC_010524	AGC	2	6	265400	265405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056939
7211	NC_010524	TGA	2	6	265445	265450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056939
7212	NC_010524	GTG	2	6	265453	265458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056939
7213	NC_010524	CAT	2	6	265491	265496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056939
7214	NC_010524	TAC	2	6	265549	265554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056939
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7216	NC_010524	TGC	2	6	265583	265588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056939
7217	NC_010524	CACG	2	8	265590	265597	25 %	0 %	25 %	50 %	171056939
7218	NC_010524	GC	3	6	265608	265613	0 %	0 %	50 %	50 %	171056939
7219	NC_010524	CGA	2	6	265626	265631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056939
7220	NC_010524	TCG	2	6	265670	265675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056939
7221	NC_010524	AAG	2	6	265702	265707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056939
7222	NC_010524	ACGGC	2	10	265751	265760	20 %	0 %	40 %	40 %	171056939
7223	NC_010524	CTTGC	2	10	265761	265770	0 %	40 %	20 %	40 %	171056939
7224	NC_010524	TGC	2	6	265784	265789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056939
7225	NC_010524	CGTG	2	8	265892	265899	0 %	25 %	50 %	25 %	171056939
7226	NC_010524	CGG	2	6	265926	265931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056939
7227	NC_010524	CTG	2	6	265951	265956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056939
7228	NC_010524	CGGCCG	2	12	265967	265978	0 %	0 %	50 %	50 %	171056939
7229	NC_010524	GGC	2	6	266019	266024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056939
7230	NC_010524	CGGTGC	2	12	266048	266059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056939
7231	NC_010524	TGTT	2	8	266214	266221	0 %	75 %	25 %	0 %	171056940
7232	NC_010524	GCA	2	6	266262	266267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056940
7233	NC_010524	GC	4	8	266289	266296	0 %	0 %	50 %	50 %	171056940
7234	NC_010524	ACG	2	6	266382	266387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056940
7235	NC_010524	GCT	2	6	266413	266418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056940
7236	NC_010524	GAG	2	6	266429	266434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056940
7237	NC_010524	CGGC	2	8	266445	266452	0 %	0 %	50 %	50 %	171056940
7238	NC_010524	GCC	2	6	266510	266515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056940
7239	NC_010524	CACG	2	8	266548	266555	25 %	0 %	25 %	50 %	171056940
7240	NC_010524	GCT	2	6	266626	266631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056940
7241	NC_010524	GAA	2	6	266735	266740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056941
7242	NC_010524	CG	3	6	266746	266751	0 %	0 %	50 %	50 %	171056941
7243	NC_010524	ACCAGC	2	12	266790	266801	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171056941
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7363	NC_010524	ATC	2	6	270083	270088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056944
7364	NC_010524	GTA	2	6	270109	270114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056944
7365	NC_010524	TGA	2	6	270126	270131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056944
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7367	NC_010524	GGT	2	6	270262	270267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056944
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7384	NC_010524	GTC	2	6	270664	270669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056945
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7465	NC_010524	CGATGG	2	12	273150	273161	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171056948
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7474	NC_010524	GCCG	2	8	273635	273642	0 %	0 %	50 %	50 %	171056949
7475	NC_010524	CG	3	6	273691	273696	0 %	0 %	50 %	50 %	171056949
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7482	NC_010524	TC	3	6	274140	274145	0 %	50 %	0 %	50 %	171056950
7483	NC_010524	GAC	2	6	274146	274151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056950
7484	NC_010524	CTG	2	6	274179	274184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056950
7485	NC_010524	CGA	2	6	274229	274234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056950
7486	NC_010524	CGGC	2	8	274267	274274	0 %	0 %	50 %	50 %	171056950
7487	NC_010524	CGA	2	6	274277	274282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056950
7488	NC_010524	GCC	2	6	274284	274289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056950
7489	NC_010524	GCT	2	6	274346	274351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056950
7490	NC_010524	CGG	2	6	274358	274363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056950
7491	NC_010524	GTG	2	6	274470	274475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056950
7492	NC_010524	GAC	2	6	274520	274525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056950
7493	NC_010524	GC	3	6	274534	274539	0 %	0 %	50 %	50 %	171056950
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7495	NC_010524	CG	3	6	274667	274672	0 %	0 %	50 %	50 %	171056950
7496	NC_010524	CGGCT	2	10	274678	274687	0 %	20 %	40 %	40 %	171056950
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7500	NC_010524	CGGC	2	8	274732	274739	0 %	0 %	50 %	50 %	171056950

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