MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 129415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010524	CGC	2	6	242102	242107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056918
6502	NC_010524	CGG	2	6	242129	242134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056918
6503	NC_010524	GCA	3	9	242141	242149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056918
6504	NC_010524	GCCGT	2	10	242176	242185	0 %	20 %	40 %	40 %	171056918
6505	NC_010524	CGGC	2	8	242209	242216	0 %	0 %	50 %	50 %	171056918
6506	NC_010524	CG	3	6	242227	242232	0 %	0 %	50 %	50 %	171056918
6507	NC_010524	GCG	2	6	242321	242326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056918
6508	NC_010524	ACC	3	9	242425	242433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056918
6509	NC_010524	GCC	2	6	242484	242489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056918
6510	NC_010524	GTC	2	6	242499	242504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056918
6511	NC_010524	GCCAGC	2	12	242563	242574	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056918
6512	NC_010524	GCGA	2	8	242623	242630	25 %	0 %	50 %	25 %	171056918
6513	NC_010524	AGCG	2	8	242638	242645	25 %	0 %	50 %	25 %	171056918
6514	NC_010524	GCCG	2	8	242675	242682	0 %	0 %	50 %	50 %	171056918
6515	NC_010524	CCA	2	6	242705	242710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056918
6516	NC_010524	GCAG	2	8	242711	242718	25 %	0 %	50 %	25 %	171056918
6517	NC_010524	GC	3	6	242720	242725	0 %	0 %	50 %	50 %	171056918
6518	NC_010524	GGCGCG	2	12	242733	242744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056918
6519	NC_010524	GCA	2	6	242780	242785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056918
6520	NC_010524	CAG	2	6	242925	242930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056919
6521	NC_010524	CTT	2	6	242939	242944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056919
6522	NC_010524	TCG	2	6	242964	242969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056919
6523	NC_010524	GAA	2	6	242987	242992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056919
6524	NC_010524	CTC	2	6	242996	243001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056919
6525	NC_010524	GC	3	6	243015	243020	0 %	0 %	50 %	50 %	171056919
6526	NC_010524	TGA	2	6	243028	243033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056919
6527	NC_010524	GC	3	6	243070	243075	0 %	0 %	50 %	50 %	171056919
6528	NC_010524	GC	3	6	243092	243097	0 %	0 %	50 %	50 %	171056919
6529	NC_010524	GCT	2	6	243130	243135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056919
6530	NC_010524	GGC	2	6	243187	243192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056919
6531	NC_010524	ATC	2	6	243213	243218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056919
6532	NC_010524	CAG	2	6	243236	243241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056919
6533	NC_010524	TTC	2	6	243249	243254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056919
6534	NC_010524	GCG	2	6	243296	243301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056919
6535	NC_010524	GCG	2	6	243328	243333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056919
6536	NC_010524	CG	3	6	243372	243377	0 %	0 %	50 %	50 %	171056919
6537	NC_010524	GGCT	2	8	243394	243401	0 %	25 %	50 %	25 %	171056919
6538	NC_010524	CCGT	2	8	243569	243576	0 %	25 %	25 %	50 %	171056920
6539	NC_010524	CGTG	2	8	243589	243596	0 %	25 %	50 %	25 %	171056920
6540	NC_010524	GAC	3	9	243601	243609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6541	NC_010524	CGT	2	6	243658	243663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6542	NC_010524	TCG	2	6	243665	243670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6543	NC_010524	CG	3	6	243695	243700	0 %	0 %	50 %	50 %	171056920
6544	NC_010524	ACG	2	6	243711	243716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6545	NC_010524	CAA	2	6	243739	243744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056920
6546	NC_010524	GGT	2	6	243751	243756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056920
6547	NC_010524	GCC	2	6	243757	243762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056920
6548	NC_010524	GGC	2	6	243798	243803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056920
6549	NC_010524	TCA	2	6	243849	243854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056920
6550	NC_010524	CGC	2	6	243969	243974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056920
6551	NC_010524	CG	3	6	244039	244044	0 %	0 %	50 %	50 %	171056920
6552	NC_010524	CTGG	2	8	244063	244070	0 %	25 %	50 %	25 %	171056920
6553	NC_010524	CG	3	6	244110	244115	0 %	0 %	50 %	50 %	171056920
6554	NC_010524	CGG	2	6	244117	244122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056920
6555	NC_010524	CTT	2	6	244123	244128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056920
6556	NC_010524	CAC	2	6	244132	244137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056920
6557	NC_010524	CGGG	2	8	244141	244148	0 %	0 %	75 %	25 %	171056920
6558	NC_010524	GAG	2	6	244184	244189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056920
6559	NC_010524	GCC	3	9	244244	244252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056920
6560	NC_010524	AAG	2	6	244289	244294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056920
6561	NC_010524	GAC	3	9	244295	244303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6562	NC_010524	GCGCC	2	10	244309	244318	0 %	0 %	40 %	60 %	171056920
6563	NC_010524	CGAGGC	2	12	244333	244344	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056920
6564	NC_010524	CGC	3	9	244354	244362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056920
6565	NC_010524	GAG	2	6	244391	244396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056920
6566	NC_010524	GCT	2	6	244423	244428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6567	NC_010524	GAC	2	6	244438	244443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6568	NC_010524	GAC	2	6	244486	244491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6569	NC_010524	GAT	2	6	244603	244608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056920
6570	NC_010524	ACA	2	6	244707	244712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056920
6571	NC_010524	CAT	2	6	244735	244740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056920
6572	NC_010524	TGG	2	6	244797	244802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056920
6573	NC_010524	CGC	2	6	244917	244922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056920
6574	NC_010524	GCTG	2	8	244962	244969	0 %	25 %	50 %	25 %	171056920
6575	NC_010524	AGGACG	2	12	244992	245003	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	171056920
6576	NC_010524	GAG	2	6	245045	245050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056920
6577	NC_010524	CGC	2	6	245061	245066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056920
6578	NC_010524	GCC	2	6	245077	245082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056920
6579	NC_010524	CG	3	6	245083	245088	0 %	0 %	50 %	50 %	171056920
6580	NC_010524	GCT	2	6	245104	245109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6581	NC_010524	CGA	3	9	245140	245148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6582	NC_010524	CG	3	6	245198	245203	0 %	0 %	50 %	50 %	171056920
6583	NC_010524	TGC	2	6	245238	245243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6584	NC_010524	GCT	2	6	245293	245298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6585	NC_010524	GCGCA	2	10	245423	245432	20 %	0 %	40 %	40 %	171056920
6586	NC_010524	AAG	2	6	245438	245443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056920
6587	NC_010524	GCG	3	9	245511	245519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056920
6588	NC_010524	CCG	2	6	245536	245541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056920
6589	NC_010524	GCA	2	6	245571	245576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6590	NC_010524	GCG	2	6	245577	245582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056920
6591	NC_010524	GCGGCT	2	12	245592	245603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056920
6592	NC_010524	CGAGGC	2	12	245647	245658	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056920
6593	NC_010524	CGA	3	9	245746	245754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6594	NC_010524	CAA	2	6	245758	245763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056920
6595	NC_010524	AAG	2	6	245798	245803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056920
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6599	NC_010524	GCA	2	6	245965	245970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6600	NC_010524	CACG	2	8	245977	245984	25 %	0 %	25 %	50 %	171056920
6601	NC_010524	GCT	2	6	245998	246003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6602	NC_010524	GCT	2	6	246022	246027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056920
6603	NC_010524	CAA	2	6	246043	246048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056920
6604	NC_010524	AAG	2	6	246086	246091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056920
6605	NC_010524	GGT	2	6	246100	246105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056920
6606	NC_010524	GTTCGA	2	12	246106	246117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171056920
6607	NC_010524	GCG	2	6	246125	246130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056920
6608	NC_010524	AAG	2	6	246143	246148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056920
6609	NC_010524	TGC	2	6	246242	246247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056921
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6611	NC_010524	CGG	2	6	246272	246277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056921
6612	NC_010524	GC	3	6	246293	246298	0 %	0 %	50 %	50 %	171056921
6613	NC_010524	GCT	2	6	246318	246323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056921
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6619	NC_010524	TTC	2	6	246562	246567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056921
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6621	NC_010524	GCC	2	6	246754	246759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056921
6622	NC_010524	GCAC	2	8	246789	246796	25 %	0 %	25 %	50 %	171056921
6623	NC_010524	ACG	3	9	246803	246811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056921
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6654	NC_010524	CGCTG	2	10	247686	247695	0 %	20 %	40 %	40 %	171056922
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6741	NC_010524	TCA	2	6	250690	250695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056924
6742	NC_010524	CGA	2	6	250724	250729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056924
6743	NC_010524	CGC	2	6	250864	250869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056925
6744	NC_010524	AGC	2	6	250932	250937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056925
6745	NC_010524	CGC	2	6	250966	250971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056925
6746	NC_010524	GCCG	2	8	250978	250985	0 %	0 %	50 %	50 %	171056925
6747	NC_010524	TGCG	2	8	251064	251071	0 %	25 %	50 %	25 %	171056926
6748	NC_010524	GCG	2	6	251108	251113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056926
6749	NC_010524	CTG	3	9	251114	251122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056926
6750	NC_010524	GCT	2	6	251134	251139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056926
6751	NC_010524	CCT	2	6	251224	251229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056926
6752	NC_010524	TTCG	2	8	251284	251291	0 %	50 %	25 %	25 %	171056927
6753	NC_010524	GCT	2	6	251302	251307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056927
6754	NC_010524	TGG	2	6	251321	251326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056927
6755	NC_010524	GC	3	6	251335	251340	0 %	0 %	50 %	50 %	171056927
6756	NC_010524	GGCCG	2	10	251432	251441	0 %	0 %	60 %	40 %	171056927
6757	NC_010524	CGGG	2	8	251445	251452	0 %	0 %	75 %	25 %	171056927
6758	NC_010524	GGT	2	6	251509	251514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056927
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6760	NC_010524	CG	3	6	251533	251538	0 %	0 %	50 %	50 %	171056927
6761	NC_010524	TCG	2	6	251568	251573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056927
6762	NC_010524	GCT	2	6	251596	251601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056927
6763	NC_010524	GGCC	2	8	251602	251609	0 %	0 %	50 %	50 %	171056927
6764	NC_010524	GGT	2	6	251626	251631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056927
6765	NC_010524	CGG	2	6	251674	251679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056927
6766	NC_010524	TGA	2	6	251688	251693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056927
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6768	NC_010524	GCT	2	6	251713	251718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056927
6769	NC_010524	CGCTGG	2	12	251760	251771	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056927
6770	NC_010524	GGT	2	6	251857	251862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056927
6771	NC_010524	TGG	2	6	251868	251873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056927
6772	NC_010524	CGG	2	6	251914	251919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056927
6773	NC_010524	GCCG	2	8	251920	251927	0 %	0 %	50 %	50 %	171056927
6774	NC_010524	GCC	2	6	251942	251947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056927
6775	NC_010524	GCT	2	6	251968	251973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056927
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6777	NC_010524	CGA	2	6	252091	252096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056927
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6779	NC_010524	CTG	3	9	252137	252145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056927
6780	NC_010524	TGC	2	6	252159	252164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056927
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6784	NC_010524	CGG	2	6	252244	252249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056927
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6801	NC_010524	CGGC	2	8	252612	252619	0 %	0 %	50 %	50 %	171056927
6802	NC_010524	TGC	2	6	252645	252650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056927
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6817	NC_010524	CGGC	2	8	253057	253064	0 %	0 %	50 %	50 %	171056927
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6832	NC_010524	CGA	2	6	253384	253389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056927
6833	NC_010524	CAG	2	6	253415	253420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056927
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6845	NC_010524	GTG	2	6	253740	253745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056927
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6860	NC_010524	CTG	2	6	254459	254464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056929
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6982	NC_010524	GC	3	6	258458	258463	0 %	0 %	50 %	50 %	171056931
6983	NC_010524	ATC	2	6	258490	258495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056931
6984	NC_010524	GGCC	2	8	258498	258505	0 %	0 %	50 %	50 %	171056931
6985	NC_010524	GGC	3	9	258513	258521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056931
6986	NC_010524	GGC	2	6	258555	258560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056931
6987	NC_010524	CG	3	6	258591	258596	0 %	0 %	50 %	50 %	171056931
6988	NC_010524	GTG	2	6	258601	258606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056931
6989	NC_010524	CG	3	6	258648	258653	0 %	0 %	50 %	50 %	171056931
6990	NC_010524	TCGCC	2	10	258665	258674	0 %	20 %	20 %	60 %	171056931
6991	NC_010524	CG	3	6	258727	258732	0 %	0 %	50 %	50 %	171056931
6992	NC_010524	CG	3	6	258737	258742	0 %	0 %	50 %	50 %	171056931
6993	NC_010524	GCC	2	6	258745	258750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056931
6994	NC_010524	GTG	2	6	258754	258759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056931
6995	NC_010524	GCA	2	6	258767	258772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056931
6996	NC_010524	CGC	3	9	258782	258790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056931
6997	NC_010524	G	6	6	258793	258798	0 %	0 %	100 %	0 %	171056931
6998	NC_010524	CGGC	2	8	258803	258810	0 %	0 %	50 %	50 %	171056931
6999	NC_010524	CGA	2	6	258822	258827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056931
7000	NC_010524	GC	3	6	258837	258842	0 %	0 %	50 %	50 %	171056931

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