MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 36903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_009513	TGA	2	6	1811333	1811338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544965
33502	NC_009513	TGT	2	6	1811360	1811365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544965
33503	NC_009513	CAT	2	6	1811397	1811402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544965
33504	NC_009513	CTG	2	6	1811403	1811408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544965
33505	NC_009513	CGAT	2	8	1811456	1811463	25 %	25 %	25 %	25 %	148544965
33506	NC_009513	TCA	2	6	1811486	1811491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544965
33507	NC_009513	CAACA	2	10	1811519	1811528	60 %	0 %	0 %	40 %	148544965
33508	NC_009513	ATA	2	6	1811591	1811596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544965
33509	NC_009513	TAA	2	6	1811625	1811630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544965
33510	NC_009513	AAT	2	6	1811743	1811748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544966
33511	NC_009513	GAAAA	2	10	1811766	1811775	80 %	0 %	20 %	0 %	148544966
33512	NC_009513	CTT	2	6	1811792	1811797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544966
33513	NC_009513	CAT	2	6	1811876	1811881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544966
33514	NC_009513	TAA	2	6	1811926	1811931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544966
33515	NC_009513	TCC	2	6	1812046	1812051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148544966
33516	NC_009513	AGG	3	9	1812100	1812108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148544966
33517	NC_009513	GTT	2	6	1812125	1812130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544966
33518	NC_009513	GCA	2	6	1812145	1812150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544966
33519	NC_009513	ATG	2	6	1812222	1812227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544966
33520	NC_009513	CAT	2	6	1812278	1812283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544966
33521	NC_009513	ATA	2	6	1812380	1812385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544966
33522	NC_009513	TCT	2	6	1812388	1812393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544966
33523	NC_009513	GCT	2	6	1812400	1812405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544966
33524	NC_009513	CAT	2	6	1812491	1812496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544966
33525	NC_009513	TAC	2	6	1812518	1812523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544966
33526	NC_009513	ATC	2	6	1812736	1812741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544967
33527	NC_009513	GCA	2	6	1812757	1812762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544967
33528	NC_009513	AGC	2	6	1812771	1812776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544967
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33530	NC_009513	GCAA	2	8	1812822	1812829	50 %	0 %	25 %	25 %	148544967
33531	NC_009513	CT	3	6	1812983	1812988	0 %	50 %	0 %	50 %	148544967
33532	NC_009513	TTC	3	9	1813049	1813057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544967
33533	NC_009513	TGTT	2	8	1813133	1813140	0 %	75 %	25 %	0 %	148544967
33534	NC_009513	ACC	2	6	1813141	1813146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544967
33535	NC_009513	AGCC	2	8	1813235	1813242	25 %	0 %	25 %	50 %	148544967
33536	NC_009513	ATT	2	6	1813276	1813281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544967
33537	NC_009513	GGT	2	6	1813306	1813311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148544967
33538	NC_009513	TA	3	6	1813334	1813339	50 %	50 %	0 %	0 %	148544967
33539	NC_009513	GATC	2	8	1813386	1813393	25 %	25 %	25 %	25 %	148544967
33540	NC_009513	TGATAA	2	12	1813488	1813499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148544967
33541	NC_009513	CTA	2	6	1813595	1813600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544967
33542	NC_009513	GTC	2	6	1813663	1813668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544967
33543	NC_009513	GTT	2	6	1813669	1813674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544967
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33545	NC_009513	GAA	2	6	1813723	1813728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544967
33546	NC_009513	GA	3	6	1813743	1813748	50 %	0 %	50 %	0 %	148544967
33547	NC_009513	CTT	2	6	1813842	1813847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544967
33548	NC_009513	ATA	2	6	1813919	1813924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544967
33549	NC_009513	AT	3	6	1813989	1813994	50 %	50 %	0 %	0 %	148544967
33550	NC_009513	TAC	2	6	1814010	1814015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544967
33551	NC_009513	ATT	2	6	1814155	1814160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544968
33552	NC_009513	CTT	2	6	1814190	1814195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544968
33553	NC_009513	ACA	2	6	1814220	1814225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544968
33554	NC_009513	CTT	2	6	1814251	1814256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544968
33555	NC_009513	AAG	2	6	1814264	1814269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544968
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33557	NC_009513	GTA	2	6	1814434	1814439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544968
33558	NC_009513	TAA	2	6	1814448	1814453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544968
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33561	NC_009513	CATTA	2	10	1814717	1814726	40 %	40 %	0 %	20 %	148544969
33562	NC_009513	CTT	2	6	1814815	1814820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544969
33563	NC_009513	T	6	6	1814890	1814895	0 %	100 %	0 %	0 %	148544969
33564	NC_009513	CAC	2	6	1814914	1814919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544969
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33566	NC_009513	ATA	2	6	1815023	1815028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544969
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33568	NC_009513	TA	3	6	1815069	1815074	50 %	50 %	0 %	0 %	148544969
33569	NC_009513	GTATGC	2	12	1815319	1815330	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148544970
33570	NC_009513	ACT	2	6	1815387	1815392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544970
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33574	NC_009513	TTA	2	6	1815603	1815608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544970
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33576	NC_009513	TGC	2	6	1815686	1815691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544970
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33587	NC_009513	ATG	2	6	1816116	1816121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544970
33588	NC_009513	TTC	2	6	1816122	1816127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544970
33589	NC_009513	TA	3	6	1816149	1816154	50 %	50 %	0 %	0 %	148544970
33590	NC_009513	ACT	3	9	1816185	1816193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544970
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33594	NC_009513	CATTA	2	10	1816733	1816742	40 %	40 %	0 %	20 %	148544971
33595	NC_009513	CGT	2	6	1816848	1816853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544971
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33598	NC_009513	TCGT	2	8	1816882	1816889	0 %	50 %	25 %	25 %	148544971
33599	NC_009513	ATG	2	6	1816966	1816971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544971
33600	NC_009513	TCT	2	6	1817053	1817058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544971
33601	NC_009513	CAC	2	6	1817071	1817076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544971
33602	NC_009513	TTC	2	6	1817079	1817084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544971
33603	NC_009513	GAA	2	6	1817105	1817110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544971
33604	NC_009513	ATT	2	6	1817117	1817122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544971
33605	NC_009513	AAG	2	6	1817187	1817192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544971
33606	NC_009513	AAT	2	6	1817322	1817327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544971
33607	NC_009513	ACA	2	6	1817338	1817343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544971
33608	NC_009513	GAA	2	6	1817376	1817381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544971
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33612	NC_009513	CTGATG	2	12	1817485	1817496	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148544971
33613	NC_009513	AGC	2	6	1817552	1817557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544971
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33615	NC_009513	AAG	2	6	1817721	1817726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544971
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