MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 36903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_009513	GGGT	2	8	863394	863401	0 %	25 %	75 %	0 %	148544019
16002	NC_009513	GTC	2	6	863422	863427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544019
16003	NC_009513	TAT	2	6	863513	863518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544019
16004	NC_009513	ATA	2	6	863572	863577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544019
16005	NC_009513	ATT	2	6	863696	863701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544019
16006	NC_009513	T	7	7	863863	863869	0 %	100 %	0 %	0 %	148544020
16007	NC_009513	CTT	3	9	863871	863879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544020
16008	NC_009513	CAT	2	6	863889	863894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544020
16009	NC_009513	AACA	2	8	863961	863968	75 %	0 %	0 %	25 %	148544020
16010	NC_009513	TTG	2	6	864063	864068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544020
16011	NC_009513	T	6	6	864165	864170	0 %	100 %	0 %	0 %	148544020
16012	NC_009513	ATC	2	6	864181	864186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544020
16013	NC_009513	TCA	2	6	864200	864205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544020
16014	NC_009513	TAT	2	6	864213	864218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544020
16015	NC_009513	TTTA	2	8	864288	864295	25 %	75 %	0 %	0 %	148544021
16016	NC_009513	TTTG	2	8	864479	864486	0 %	75 %	25 %	0 %	148544022
16017	NC_009513	ACTTA	2	10	864494	864503	40 %	40 %	0 %	20 %	148544022
16018	NC_009513	TTA	2	6	864513	864518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544022
16019	NC_009513	AGT	2	6	864564	864569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544022
16020	NC_009513	CAT	2	6	864605	864610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544022
16021	NC_009513	AGT	2	6	864698	864703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544022
16022	NC_009513	TTA	2	6	864741	864746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544022
16023	NC_009513	GTT	2	6	864780	864785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544022
16024	NC_009513	AAT	2	6	864947	864952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544022
16025	NC_009513	CAT	2	6	864962	864967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544022
16026	NC_009513	T	6	6	864986	864991	0 %	100 %	0 %	0 %	148544022
16027	NC_009513	ATT	2	6	865186	865191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544023
16028	NC_009513	TTG	2	6	865249	865254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544023
16029	NC_009513	TGGT	2	8	865300	865307	0 %	50 %	50 %	0 %	148544023
16030	NC_009513	ACT	2	6	865382	865387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544023
16031	NC_009513	TTCC	2	8	865563	865570	0 %	50 %	0 %	50 %	148544023
16032	NC_009513	CG	3	6	865629	865634	0 %	0 %	50 %	50 %	148544023
16033	NC_009513	CTG	2	6	865701	865706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544023
16034	NC_009513	GTTC	2	8	865752	865759	0 %	50 %	25 %	25 %	148544023
16035	NC_009513	CTA	2	6	865769	865774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544023
16036	NC_009513	TTA	2	6	865817	865822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544023
16037	NC_009513	CCA	2	6	865829	865834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544023
16038	NC_009513	ATAGC	2	10	865856	865865	40 %	20 %	20 %	20 %	148544023
16039	NC_009513	AGA	2	6	865866	865871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544023
16040	NC_009513	CGT	2	6	865874	865879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544023
16041	NC_009513	CACCAA	2	12	865965	865976	50 %	0 %	0 %	50 %	148544023
16042	NC_009513	CAT	2	6	865992	865997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544023
16043	NC_009513	GTT	2	6	866075	866080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544023
16044	NC_009513	CAA	2	6	866085	866090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544023
16045	NC_009513	TCA	2	6	866163	866168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544023
16046	NC_009513	TAAA	2	8	866265	866272	75 %	25 %	0 %	0 %	148544023
16047	NC_009513	AT	3	6	866345	866350	50 %	50 %	0 %	0 %	148544023
16048	NC_009513	TTG	2	6	866353	866358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544023
16049	NC_009513	TCA	2	6	866367	866372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544023
16050	NC_009513	CG	3	6	866389	866394	0 %	0 %	50 %	50 %	148544023
16051	NC_009513	CTT	2	6	866437	866442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544023
16052	NC_009513	TAA	2	6	866452	866457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544023
16053	NC_009513	GAG	2	6	866458	866463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148544023
16054	NC_009513	TAG	2	6	866494	866499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544023
16055	NC_009513	CAT	2	6	866532	866537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544023
16056	NC_009513	CAG	2	6	866550	866555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544023
16057	NC_009513	CTT	2	6	866565	866570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544023
16058	NC_009513	TG	3	6	866630	866635	0 %	50 %	50 %	0 %	148544023
16059	NC_009513	AGT	2	6	866703	866708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544023
16060	NC_009513	TTG	2	6	866823	866828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544024
16061	NC_009513	GCT	2	6	866854	866859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544024
16062	NC_009513	ATC	2	6	866931	866936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544024
16063	NC_009513	CTAA	2	8	866941	866948	50 %	25 %	0 %	25 %	148544024
16064	NC_009513	GAAA	2	8	866964	866971	75 %	0 %	25 %	0 %	148544024
16065	NC_009513	CAG	2	6	867032	867037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544024
16066	NC_009513	CAG	3	9	867137	867145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148544024
16067	NC_009513	TCA	2	6	867307	867312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544024
16068	NC_009513	AAT	2	6	867396	867401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544024
16069	NC_009513	GTT	2	6	867413	867418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544024
16070	NC_009513	GTT	2	6	867459	867464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544024
16071	NC_009513	GAG	2	6	867474	867479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148544024
16072	NC_009513	TTG	2	6	867495	867500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544024
16073	NC_009513	CAT	2	6	867506	867511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544024
16074	NC_009513	ATA	2	6	867694	867699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148544024
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16076	NC_009513	TAG	2	6	867749	867754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544024
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16079	NC_009513	AAAGT	2	10	867936	867945	60 %	20 %	20 %	0 %	148544025
16080	NC_009513	ATC	2	6	867977	867982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544025
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16090	NC_009513	CTTG	2	8	868245	868252	0 %	50 %	25 %	25 %	148544025
16091	NC_009513	CAC	4	12	868257	868268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544025
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16093	NC_009513	T	6	6	868335	868340	0 %	100 %	0 %	0 %	148544025
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16096	NC_009513	TAG	2	6	868467	868472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544025
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16101	NC_009513	GTG	2	6	868737	868742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148544025
16102	NC_009513	GCC	2	6	868772	868777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148544025
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16107	NC_009513	GTT	2	6	868946	868951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148544025
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16109	NC_009513	TAT	2	6	869130	869135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544026
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16111	NC_009513	T	6	6	869165	869170	0 %	100 %	0 %	0 %	148544026
16112	NC_009513	TCA	2	6	869255	869260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544026
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16115	NC_009513	TCT	2	6	869300	869305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148544026
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16117	NC_009513	TCAA	2	8	869375	869382	50 %	25 %	0 %	25 %	148544026
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16480	NC_009513	GATACA	2	12	889336	889347	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148544065
16481	NC_009513	GCAC	2	8	889365	889372	25 %	0 %	25 %	50 %	148544065
16482	NC_009513	TGAT	2	8	889400	889407	25 %	50 %	25 %	0 %	148544065
16483	NC_009513	A	6	6	889443	889448	100 %	0 %	0 %	0 %	148544065
16484	NC_009513	AAG	2	6	889457	889462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544065
16485	NC_009513	AAC	2	6	889615	889620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544065
16486	NC_009513	GTG	2	6	889639	889644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148544065
16487	NC_009513	ACC	2	6	889734	889739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148544065
16488	NC_009513	CCAC	2	8	889743	889750	25 %	0 %	0 %	75 %	148544065
16489	NC_009513	CAT	2	6	889764	889769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544065
16490	NC_009513	TTA	2	6	889845	889850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148544066
16491	NC_009513	AAC	2	6	889860	889865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544066
16492	NC_009513	GTAT	2	8	889920	889927	25 %	50 %	25 %	0 %	148544066
16493	NC_009513	ACA	2	6	889956	889961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544066
16494	NC_009513	GAT	2	6	889988	889993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148544066
16495	NC_009513	AAG	2	6	890280	890285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148544067
16496	NC_009513	AAC	2	6	890313	890318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148544067
16497	NC_009513	TGCTT	2	10	890332	890341	0 %	60 %	20 %	20 %	148544067
16498	NC_009513	CTG	2	6	890427	890432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148544067
16499	NC_009513	GCAA	2	8	890481	890488	50 %	0 %	25 %	25 %	148544067
16500	NC_009513	TAC	2	6	890551	890556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148544067

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