MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 36903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_009513	CTA	2	6	520048	520053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543700
9502	NC_009513	TCT	2	6	520081	520086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543700
9503	NC_009513	TGG	2	6	520154	520159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543700
9504	NC_009513	GAA	2	6	520181	520186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543700
9505	NC_009513	AGA	2	6	520346	520351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543700
9506	NC_009513	ATT	2	6	520364	520369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543700
9507	NC_009513	GCT	2	6	520437	520442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543700
9508	NC_009513	CATG	2	8	520445	520452	25 %	25 %	25 %	25 %	148543700
9509	NC_009513	ACC	2	6	520456	520461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543700
9510	NC_009513	AAG	2	6	520482	520487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543700
9511	NC_009513	A	6	6	520559	520564	100 %	0 %	0 %	0 %	148543700
9512	NC_009513	GAA	2	6	520575	520580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543700
9513	NC_009513	GATT	2	8	520654	520661	25 %	50 %	25 %	0 %	148543701
9514	NC_009513	TGT	2	6	520779	520784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543701
9515	NC_009513	GAT	2	6	520829	520834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543701
9516	NC_009513	GC	3	6	520858	520863	0 %	0 %	50 %	50 %	148543701
9517	NC_009513	TGGT	2	8	520908	520915	0 %	50 %	50 %	0 %	148543701
9518	NC_009513	ATG	2	6	520952	520957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543701
9519	NC_009513	ACA	2	6	520980	520985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543701
9520	NC_009513	CGGT	2	8	520998	521005	0 %	25 %	50 %	25 %	148543701
9521	NC_009513	AAG	2	6	521027	521032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543701
9522	NC_009513	GAAT	2	8	521037	521044	50 %	25 %	25 %	0 %	148543701
9523	NC_009513	CCTA	2	8	521078	521085	25 %	25 %	0 %	50 %	148543701
9524	NC_009513	CTG	2	6	521112	521117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543701
9525	NC_009513	TGA	2	6	521143	521148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543701
9526	NC_009513	ATG	2	6	521205	521210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543701
9527	NC_009513	AAT	2	6	521276	521281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543701
9528	NC_009513	AATGC	2	10	521432	521441	40 %	20 %	20 %	20 %	148543701
9529	NC_009513	TGA	2	6	521461	521466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543701
9530	NC_009513	AGC	2	6	521509	521514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543701
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9532	NC_009513	TGG	2	6	521542	521547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543701
9533	NC_009513	AAT	2	6	521562	521567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543701
9534	NC_009513	ACA	2	6	521588	521593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543702
9535	NC_009513	GTT	2	6	521629	521634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543702
9536	NC_009513	AAC	2	6	521715	521720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543702
9537	NC_009513	GTT	2	6	521749	521754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543702
9538	NC_009513	ATGG	2	8	521767	521774	25 %	25 %	50 %	0 %	148543702
9539	NC_009513	TGA	2	6	521841	521846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543702
9540	NC_009513	ATG	2	6	521951	521956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543702
9541	NC_009513	AAT	2	6	521962	521967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543702
9542	NC_009513	GTG	2	6	522026	522031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543702
9543	NC_009513	GGT	2	6	522049	522054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543702
9544	NC_009513	ATGAA	2	10	522176	522185	60 %	20 %	20 %	0 %	148543702
9545	NC_009513	GAAC	2	8	522231	522238	50 %	0 %	25 %	25 %	148543702
9546	NC_009513	AAG	2	6	522463	522468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543702
9547	NC_009513	TGA	2	6	522507	522512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543702
9548	NC_009513	ACA	2	6	522535	522540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543702
9549	NC_009513	ACT	2	6	522559	522564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543702
9550	NC_009513	TTG	2	6	522650	522655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543702
9551	NC_009513	TTC	2	6	522695	522700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543702
9552	NC_009513	ATC	2	6	522724	522729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543702
9553	NC_009513	GAA	2	6	522760	522765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543702
9554	NC_009513	CGG	2	6	522787	522792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543702
9555	NC_009513	ATG	2	6	522911	522916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543702
9556	NC_009513	AGA	2	6	522924	522929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543702
9557	NC_009513	GTT	2	6	522961	522966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543702
9558	NC_009513	AGA	2	6	523011	523016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543702
9559	NC_009513	AGG	2	6	523019	523024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543702
9560	NC_009513	TAT	2	6	523058	523063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543703
9561	NC_009513	ATGATA	2	12	523084	523095	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148543703
9562	NC_009513	CTG	2	6	523120	523125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543703
9563	NC_009513	TGC	2	6	523166	523171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543703
9564	NC_009513	TGA	2	6	523214	523219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543703
9565	NC_009513	ATT	2	6	523242	523247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543703
9566	NC_009513	AG	3	6	523324	523329	50 %	0 %	50 %	0 %	148543703
9567	NC_009513	AGA	2	6	523366	523371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543703
9568	NC_009513	TGC	2	6	523436	523441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543703
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9571	NC_009513	T	7	7	523797	523803	0 %	100 %	0 %	0 %	148543704
9572	NC_009513	ACC	2	6	523809	523814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543704
9573	NC_009513	ACTGG	2	10	523849	523858	20 %	20 %	40 %	20 %	148543704
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9583	NC_009513	ATTT	2	8	524422	524429	25 %	75 %	0 %	0 %	148543705
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9588	NC_009513	TTG	2	6	524528	524533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543705
9589	NC_009513	CGT	2	6	524700	524705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543705
9590	NC_009513	ATTG	2	8	524739	524746	25 %	50 %	25 %	0 %	148543705
9591	NC_009513	GGA	2	6	524754	524759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543705
9592	NC_009513	AAG	2	6	524783	524788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543705
9593	NC_009513	AGA	2	6	524958	524963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543705
9594	NC_009513	ACG	2	6	524967	524972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543705
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9597	NC_009513	ACA	2	6	525171	525176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543705
9598	NC_009513	AAATT	2	10	525215	525224	60 %	40 %	0 %	0 %	148543705
9599	NC_009513	CAAGG	2	10	525425	525434	40 %	0 %	40 %	20 %	148543706
9600	NC_009513	CAT	2	6	525658	525663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543706
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9602	NC_009513	TGG	3	9	525730	525738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543706
9603	NC_009513	AGC	2	6	525769	525774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543706
9604	NC_009513	GTG	2	6	525831	525836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543706
9605	NC_009513	CTT	2	6	525927	525932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543706
9606	NC_009513	CTG	2	6	525972	525977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543706
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9608	NC_009513	GATG	2	8	526030	526037	25 %	25 %	50 %	0 %	148543706
9609	NC_009513	AATGAA	2	12	526085	526096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148543706
9610	NC_009513	GAA	2	6	526100	526105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543706
9611	NC_009513	CAG	2	6	526137	526142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543706
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9613	NC_009513	ATT	2	6	526187	526192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543706
9614	NC_009513	AAT	2	6	526201	526206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543706
9615	NC_009513	GGT	2	6	526214	526219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543706
9616	NC_009513	CTT	2	6	526221	526226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543706
9617	NC_009513	ATT	2	6	526246	526251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543706
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