MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosome

Total Repeats: 46118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009004	GTT	2	6	215703	215708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623103
4002	NC_009004	TAA	2	6	215732	215737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125623103
4003	NC_009004	CTT	2	6	215796	215801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125623103
4004	NC_009004	CAAT	2	8	215802	215809	50 %	25 %	0 %	25 %	125623103
4005	NC_009004	TCC	2	6	215849	215854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125623103
4006	NC_009004	GGA	2	6	215886	215891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125623103
4007	NC_009004	TTG	2	6	215953	215958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623103
4008	NC_009004	TAT	2	6	215975	215980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623103
4009	NC_009004	CTTT	2	8	216048	216055	0 %	75 %	0 %	25 %	125623103
4010	NC_009004	AGC	2	6	216075	216080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623103
4011	NC_009004	AGTA	2	8	216128	216135	50 %	25 %	25 %	0 %	125623103
4012	NC_009004	CTA	2	6	216151	216156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623103
4013	NC_009004	TGA	2	6	216200	216205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623103
4014	NC_009004	ACC	2	6	216239	216244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125623103
4015	NC_009004	TAT	2	6	216245	216250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623103
4016	NC_009004	AAC	2	6	216289	216294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125623103
4017	NC_009004	CCA	2	6	216366	216371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125623103
4018	NC_009004	TGT	2	6	216416	216421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623103
4019	NC_009004	CAA	2	6	216444	216449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125623103
4020	NC_009004	TAC	2	6	216464	216469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623103
4021	NC_009004	AATG	2	8	216473	216480	50 %	25 %	25 %	0 %	125623103
4022	NC_009004	AAT	2	6	216510	216515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125623103
4023	NC_009004	TTG	2	6	216604	216609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623103
4024	NC_009004	AAATAA	2	12	216620	216631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	125623103
4025	NC_009004	GAA	2	6	216662	216667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623103
4026	NC_009004	GGT	2	6	216672	216677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623103
4027	NC_009004	TTA	2	6	216756	216761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623103
4028	NC_009004	TGA	3	9	216788	216796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623103
4029	NC_009004	AAT	2	6	216816	216821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125623103
4030	NC_009004	ATTATG	2	12	216832	216843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	125623103
4031	NC_009004	AATC	2	8	216861	216868	50 %	25 %	0 %	25 %	125623103
4032	NC_009004	ATT	2	6	216878	216883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623103
4033	NC_009004	ATT	2	6	216904	216909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623103
4034	NC_009004	CTA	2	6	216931	216936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623103
4035	NC_009004	ACT	2	6	216937	216942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623103
4036	NC_009004	T	6	6	216973	216978	0 %	100 %	0 %	0 %	125623103
4037	NC_009004	AGCA	2	8	217034	217041	50 %	0 %	25 %	25 %	125623103
4038	NC_009004	CTC	2	6	217117	217122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125623103
4039	NC_009004	AAT	2	6	217154	217159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125623103
4040	NC_009004	ATT	3	9	217166	217174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623103
4041	NC_009004	TGG	2	6	217199	217204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623103
4042	NC_009004	AGA	2	6	217246	217251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623104
4043	NC_009004	A	6	6	217283	217288	100 %	0 %	0 %	0 %	125623104
4044	NC_009004	AGAAA	2	10	217332	217341	80 %	0 %	20 %	0 %	125623104
4045	NC_009004	TATCC	2	10	217383	217392	20 %	40 %	0 %	40 %	125623104
4046	NC_009004	ATT	2	6	217550	217555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623104
4047	NC_009004	A	6	6	217558	217563	100 %	0 %	0 %	0 %	125623104
4048	NC_009004	TAT	2	6	217631	217636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623104
4049	NC_009004	T	6	6	217644	217649	0 %	100 %	0 %	0 %	125623104
4050	NC_009004	TTGG	2	8	217677	217684	0 %	50 %	50 %	0 %	125623104
4051	NC_009004	TG	3	6	217719	217724	0 %	50 %	50 %	0 %	125623104
4052	NC_009004	T	6	6	217765	217770	0 %	100 %	0 %	0 %	125623104
4053	NC_009004	ATC	2	6	217771	217776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623104
4054	NC_009004	AAT	2	6	217809	217814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125623104
4055	NC_009004	TGT	2	6	217827	217832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623104
4056	NC_009004	TCTT	2	8	217851	217858	0 %	75 %	0 %	25 %	125623104
4057	NC_009004	TGG	2	6	217913	217918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623104
4058	NC_009004	ATT	2	6	217957	217962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623104
4059	NC_009004	GCA	2	6	217984	217989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623104
4060	NC_009004	ATT	2	6	218029	218034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623104
4061	NC_009004	A	6	6	218061	218066	100 %	0 %	0 %	0 %	125623104
4062	NC_009004	TAT	2	6	218067	218072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623104
4063	NC_009004	AGA	2	6	218074	218079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623104
4064	NC_009004	TTG	2	6	218111	218116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623104
4065	NC_009004	ATT	2	6	218122	218127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623104
4066	NC_009004	TGG	2	6	218136	218141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623104
4067	NC_009004	TCG	2	6	218154	218159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623104
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4069	NC_009004	TTAT	2	8	218180	218187	25 %	75 %	0 %	0 %	125623104
4070	NC_009004	ATT	2	6	218190	218195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623104
4071	NC_009004	ATG	2	6	218280	218285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623104
4072	NC_009004	GCT	2	6	218328	218333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623105
4073	NC_009004	ATTA	2	8	218363	218370	50 %	50 %	0 %	0 %	125623105
4074	NC_009004	TTTTG	2	10	218390	218399	0 %	80 %	20 %	0 %	125623105
4075	NC_009004	TA	3	6	218415	218420	50 %	50 %	0 %	0 %	125623105
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4080	NC_009004	CGG	2	6	218584	218589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125623105
4081	NC_009004	ATA	2	6	218595	218600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125623105
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4083	NC_009004	ATTTA	4	20	218781	218800	40 %	60 %	0 %	0 %	125623106
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4088	NC_009004	ATT	2	6	218960	218965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623106
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4090	NC_009004	GCT	2	6	218992	218997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623106
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4093	NC_009004	CCAA	2	8	219113	219120	50 %	0 %	0 %	50 %	125623106
4094	NC_009004	GTTT	2	8	219131	219138	0 %	75 %	25 %	0 %	125623106
4095	NC_009004	ATT	2	6	219230	219235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623106
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4101	NC_009004	CAGT	2	8	219652	219659	25 %	25 %	25 %	25 %	125623106
4102	NC_009004	T	6	6	219666	219671	0 %	100 %	0 %	0 %	125623106
4103	NC_009004	GCA	2	6	219690	219695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623106
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4105	NC_009004	GAGT	2	8	219830	219837	25 %	25 %	50 %	0 %	125623106
4106	NC_009004	AG	3	6	219848	219853	50 %	0 %	50 %	0 %	125623106
4107	NC_009004	TGC	2	6	219869	219874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623106
4108	NC_009004	GCT	2	6	219879	219884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623106
4109	NC_009004	TCA	2	6	219939	219944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623106
4110	NC_009004	CTTG	2	8	219970	219977	0 %	50 %	25 %	25 %	125623106
4111	NC_009004	GAT	2	6	219994	219999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623106
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4114	NC_009004	T	6	6	220082	220087	0 %	100 %	0 %	0 %	125623106
4115	NC_009004	A	6	6	220503	220508	100 %	0 %	0 %	0 %	125623107
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4121	NC_009004	ATT	2	6	220890	220895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623107
4122	NC_009004	TTA	2	6	220915	220920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623107
4123	NC_009004	CAA	2	6	220932	220937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125623107
4124	NC_009004	ATG	2	6	220947	220952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623107
4125	NC_009004	AAC	2	6	220985	220990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125623107
4126	NC_009004	TGA	2	6	221048	221053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623107
4127	NC_009004	TGC	2	6	221117	221122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623107
4128	NC_009004	TTG	2	6	221146	221151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623107
4129	NC_009004	TCT	2	6	221169	221174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125623107
4130	NC_009004	GCT	2	6	221205	221210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623107
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4132	NC_009004	ATG	2	6	221455	221460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623107
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4134	NC_009004	TGC	2	6	221543	221548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623107
4135	NC_009004	TGG	2	6	221549	221554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623107
4136	NC_009004	TGA	2	6	221591	221596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623107
4137	NC_009004	A	6	6	221673	221678	100 %	0 %	0 %	0 %	125623107
4138	NC_009004	TGG	2	6	221798	221803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623107
4139	NC_009004	GGGAT	2	10	221814	221823	20 %	20 %	60 %	0 %	125623107
4140	NC_009004	ATG	2	6	221911	221916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623107
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4142	NC_009004	GAA	2	6	222260	222265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623108
4143	NC_009004	A	9	9	222264	222272	100 %	0 %	0 %	0 %	125623108
4144	NC_009004	GAAG	2	8	222312	222319	50 %	0 %	50 %	0 %	125623108
4145	NC_009004	GTT	2	6	222358	222363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125623108
4146	NC_009004	T	6	6	222416	222421	0 %	100 %	0 %	0 %	125623108
4147	NC_009004	TGG	2	6	222524	222529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623108
4148	NC_009004	TTA	2	6	222537	222542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623108
4149	NC_009004	CAAA	2	8	222550	222557	75 %	0 %	0 %	25 %	125623108
4150	NC_009004	GA	3	6	222608	222613	50 %	0 %	50 %	0 %	125623108
4151	NC_009004	TCA	2	6	222652	222657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623108
4152	NC_009004	GAT	2	6	222675	222680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623108
4153	NC_009004	TCG	2	6	222713	222718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623108
4154	NC_009004	TGGT	2	8	222736	222743	0 %	50 %	50 %	0 %	125623108
4155	NC_009004	ATT	2	6	222780	222785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623108
4156	NC_009004	TGA	2	6	222866	222871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623108
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4158	NC_009004	AC	3	6	222889	222894	50 %	0 %	0 %	50 %	125623108
4159	NC_009004	ATT	2	6	222900	222905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623108
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4162	NC_009004	TGG	2	6	223019	223024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623108
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4164	NC_009004	TGGT	2	8	223168	223175	0 %	50 %	50 %	0 %	125623108
4165	NC_009004	TCG	2	6	223187	223192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623108
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4232	NC_009004	A	7	7	228101	228107	100 %	0 %	0 %	0 %	125623116
4233	NC_009004	AGC	2	6	228128	228133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623116
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4235	NC_009004	A	6	6	228141	228146	100 %	0 %	0 %	0 %	125623116
4236	NC_009004	ATT	2	6	228196	228201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125623116
4237	NC_009004	GTC	2	6	228226	228231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623116
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4239	NC_009004	AGC	2	6	228287	228292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623116
4240	NC_009004	TTGA	2	8	228330	228337	25 %	50 %	25 %	0 %	125623116
4241	NC_009004	ATG	2	6	228370	228375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125623116
4242	NC_009004	AAT	2	6	228448	228453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125623116
4243	NC_009004	AAG	2	6	228712	228717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623117
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4245	NC_009004	A	6	6	228771	228776	100 %	0 %	0 %	0 %	125623117
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4253	NC_009004	GAA	2	6	229146	229151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623117
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4352	NC_009004	GAC	2	6	235371	235376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623123
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4354	NC_009004	A	6	6	235623	235628	100 %	0 %	0 %	0 %	125623124
4355	NC_009004	TCAAG	2	10	235629	235638	40 %	20 %	20 %	20 %	125623124
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4358	NC_009004	CTTT	2	8	235738	235745	0 %	75 %	0 %	25 %	125623124
4359	NC_009004	TTTA	2	8	235844	235851	25 %	75 %	0 %	0 %	125623124
4360	NC_009004	TGC	2	6	235874	235879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125623124
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4364	NC_009004	GCCA	2	8	235932	235939	25 %	0 %	25 %	50 %	125623124
4365	NC_009004	TACT	2	8	236001	236008	25 %	50 %	0 %	25 %	125623124
4366	NC_009004	GAA	2	6	236079	236084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623124
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4490	NC_009004	GGT	2	6	244991	244996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125623133
4491	NC_009004	GAA	2	6	245048	245053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623133
4492	NC_009004	T	6	6	245078	245083	0 %	100 %	0 %	0 %	125623133
4493	NC_009004	GAAT	2	8	245100	245107	50 %	25 %	25 %	0 %	125623133
4494	NC_009004	GACA	2	8	245128	245135	50 %	0 %	25 %	25 %	125623133
4495	NC_009004	A	6	6	245238	245243	100 %	0 %	0 %	0 %	125623133
4496	NC_009004	T	7	7	245934	245940	0 %	100 %	0 %	0 %	125623134
4497	NC_009004	AAG	2	6	245999	246004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125623134
4498	NC_009004	GATT	2	8	246060	246067	25 %	50 %	25 %	0 %	125623134
4499	NC_009004	ATC	2	6	246131	246136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125623134
4500	NC_009004	CAG	2	6	246178	246183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125623134

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