MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 chromosome

Total Repeats: 58349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008555	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	116871423
2	NC_008555	A	8	8	363	370	100 %	0 %	0 %	0 %	116871423
3	NC_008555	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871423
4	NC_008555	TCAT	2	8	416	423	25 %	50 %	0 %	25 %	116871423
5	NC_008555	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871423
6	NC_008555	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871423
7	NC_008555	AGA	2	6	481	486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871423
8	NC_008555	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871423
9	NC_008555	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871423
10	NC_008555	CGG	2	6	764	769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116871423
11	NC_008555	ATGC	2	8	795	802	25 %	25 %	25 %	25 %	116871423
12	NC_008555	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871423
13	NC_008555	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871423
14	NC_008555	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871423
15	NC_008555	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	116871423
16	NC_008555	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871423
17	NC_008555	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871423
18	NC_008555	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871423
19	NC_008555	AACAAA	2	12	1030	1041	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116871423
20	NC_008555	TTA	2	6	1042	1047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871423
21	NC_008555	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	116871423
22	NC_008555	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116871423
23	NC_008555	A	6	6	1173	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	116871423
24	NC_008555	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116871423
25	NC_008555	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871423
26	NC_008555	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871423
27	NC_008555	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	116871423
28	NC_008555	A	7	7	1442	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	116871423
29	NC_008555	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871423
30	NC_008555	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871423
31	NC_008555	ACC	2	6	1557	1562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116871423
32	NC_008555	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	116871423
33	NC_008555	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871423
34	NC_008555	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	116871423
35	NC_008555	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871424
36	NC_008555	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
37	NC_008555	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
38	NC_008555	TTC	2	6	2093	2098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116871424
39	NC_008555	TCGT	2	8	2120	2127	0 %	50 %	25 %	25 %	116871424
40	NC_008555	GAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871424
41	NC_008555	AAC	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871424
42	NC_008555	ATT	2	6	2368	2373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871424
43	NC_008555	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
44	NC_008555	GAT	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
45	NC_008555	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	116871424
46	NC_008555	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871424
47	NC_008555	TTA	2	6	2660	2665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871424
48	NC_008555	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871424
49	NC_008555	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871424
50	NC_008555	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
51	NC_008555	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871424
52	NC_008555	ATG	2	6	3120	3125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871425
53	NC_008555	ACA	2	6	3135	3140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871425
54	NC_008555	CAA	2	6	3148	3153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871425
55	NC_008555	CAG	2	6	3201	3206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871425
56	NC_008555	GAT	2	6	3215	3220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871425
57	NC_008555	TTG	2	6	3232	3237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871425
58	NC_008555	T	7	7	3293	3299	0 %	100 %	0 %	0 %	116871425
59	NC_008555	ATT	2	6	3312	3317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871425
60	NC_008555	GTA	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871425
61	NC_008555	GGT	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871425
62	NC_008555	T	6	6	3418	3423	0 %	100 %	0 %	0 %	116871425
63	NC_008555	ATT	2	6	3429	3434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871425
64	NC_008555	CTTA	2	8	3467	3474	25 %	50 %	0 %	25 %	116871425
65	NC_008555	GAT	2	6	3504	3509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871425
66	NC_008555	T	7	7	3517	3523	0 %	100 %	0 %	0 %	116871425
67	NC_008555	ACT	2	6	3525	3530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871425
68	NC_008555	T	7	7	3616	3622	0 %	100 %	0 %	0 %	116871425
69	NC_008555	T	6	6	3656	3661	0 %	100 %	0 %	0 %	116871425
70	NC_008555	TATGGG	2	12	3674	3685	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116871425
71	NC_008555	GCA	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871425
72	NC_008555	TTAT	2	8	3742	3749	25 %	75 %	0 %	0 %	116871425
73	NC_008555	CTTC	2	8	3840	3847	0 %	50 %	0 %	50 %	116871425
74	NC_008555	ATTT	2	8	3863	3870	25 %	75 %	0 %	0 %	116871425
75	NC_008555	TAAT	2	8	3898	3905	50 %	50 %	0 %	0 %	116871425
76	NC_008555	GTT	2	6	3921	3926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871425
77	NC_008555	GCG	2	6	3927	3932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116871425
78	NC_008555	AGT	2	6	4073	4078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871425
79	NC_008555	TAT	3	9	4135	4143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871425
80	NC_008555	TTA	2	6	4168	4173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871425
81	NC_008555	TGT	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871425
82	NC_008555	TTTG	2	8	4229	4236	0 %	75 %	25 %	0 %	116871425
83	NC_008555	TGG	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871425
84	NC_008555	CGA	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116871425
85	NC_008555	A	8	8	4435	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	116871425
86	NC_008555	TAT	2	6	4580	4585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871426
87	NC_008555	A	7	7	4619	4625	100 %	0 %	0 %	0 %	116871426
88	NC_008555	TGAT	2	8	4701	4708	25 %	50 %	25 %	0 %	116871426
89	NC_008555	TGCT	2	8	5001	5008	0 %	50 %	25 %	25 %	116871427
90	NC_008555	TAT	2	6	5047	5052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871427
91	NC_008555	AGA	2	6	5062	5067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871427
92	NC_008555	AGT	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871427
93	NC_008555	AGA	2	6	5221	5226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871427
94	NC_008555	ATTT	2	8	5300	5307	25 %	75 %	0 %	0 %	116871427
95	NC_008555	ACA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871427
96	NC_008555	GC	3	6	5452	5457	0 %	0 %	50 %	50 %	116871427
97	NC_008555	TCA	2	6	5497	5502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871427
98	NC_008555	A	6	6	5601	5606	100 %	0 %	0 %	0 %	116871427
99	NC_008555	AATC	2	8	5610	5617	50 %	25 %	0 %	25 %	116871427
100	NC_008555	GTG	2	6	5637	5642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871427
101	NC_008555	TTG	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116871427
102	NC_008555	GAT	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871427
103	NC_008555	GAA	2	6	5777	5782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871427
104	NC_008555	CTT	2	6	5804	5809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116871427
105	NC_008555	GAT	2	6	5810	5815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871427
106	NC_008555	GAT	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871427
107	NC_008555	ACA	2	6	5894	5899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871427
108	NC_008555	A	7	7	5968	5974	100 %	0 %	0 %	0 %	116871427
109	NC_008555	AGA	2	6	6034	6039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871428
110	NC_008555	TCA	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871428
111	NC_008555	TGA	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871428
112	NC_008555	GAAATT	2	12	6230	6241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116871428
113	NC_008555	ATA	2	6	6255	6260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871428
114	NC_008555	A	6	6	6309	6314	100 %	0 %	0 %	0 %	116871428
115	NC_008555	GTC	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871428
116	NC_008555	TGG	2	6	6358	6363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871428
117	NC_008555	GGC	3	9	6371	6379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116871428
118	NC_008555	AGT	2	6	6421	6426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871428
119	NC_008555	GTG	2	6	6498	6503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116871428
120	NC_008555	ACA	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871428
121	NC_008555	TTTGAT	2	12	6602	6613	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116871428
122	NC_008555	TCGTAC	2	12	6619	6630	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116871428
123	NC_008555	GAA	2	6	6686	6691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871428
124	NC_008555	TAAA	2	8	6750	6757	75 %	25 %	0 %	0 %	116871428
125	NC_008555	CCA	2	6	6779	6784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116871428
126	NC_008555	ATTT	2	8	6785	6792	25 %	75 %	0 %	0 %	116871428
127	NC_008555	GAT	2	6	6806	6811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871428
128	NC_008555	ACA	2	6	6837	6842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116871428
129	NC_008555	TCATT	2	10	6861	6870	20 %	60 %	0 %	20 %	116871428
130	NC_008555	AAT	2	6	6875	6880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871428
131	NC_008555	TTA	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871428
132	NC_008555	CGT	2	6	6956	6961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871428
133	NC_008555	TGA	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871428
134	NC_008555	ATT	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871428
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259	NC_008555	TAT	2	6	12886	12891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871432
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