MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365 chromosome

Total Repeats: 29133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_008529	GTA	2	6	1849763	1849768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514943
29002	NC_008529	GGCCG	2	10	1849847	1849856	0 %	0 %	60 %	40 %	116514943
29003	NC_008529	TCT	2	6	1849861	1849866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514943
29004	NC_008529	TTC	2	6	1849871	1849876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514943
29005	NC_008529	GGTT	2	8	1849983	1849990	0 %	50 %	50 %	0 %	116514943
29006	NC_008529	GTT	2	6	1850002	1850007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116514943
29007	NC_008529	ACA	2	6	1850043	1850048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116514943
29008	NC_008529	TGT	2	6	1850062	1850067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116514943
29009	NC_008529	AGTA	2	8	1850078	1850085	50 %	25 %	25 %	0 %	116514943
29010	NC_008529	TTC	2	6	1850087	1850092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514943
29011	NC_008529	TCA	2	6	1850095	1850100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514943
29012	NC_008529	AGC	2	6	1850168	1850173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514943
29013	NC_008529	AGT	2	6	1850210	1850215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514943
29014	NC_008529	TTGC	2	8	1850222	1850229	0 %	50 %	25 %	25 %	116514943
29015	NC_008529	ACGT	2	8	1850246	1850253	25 %	25 %	25 %	25 %	116514943
29016	NC_008529	TTG	2	6	1850310	1850315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116514943
29017	NC_008529	GTC	2	6	1850366	1850371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514943
29018	NC_008529	TTC	2	6	1850399	1850404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514943
29019	NC_008529	AGC	2	6	1850417	1850422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514943
29020	NC_008529	GTG	2	6	1850431	1850436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116514943
29021	NC_008529	TTC	2	6	1850438	1850443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514943
29022	NC_008529	CTT	2	6	1850480	1850485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514943
29023	NC_008529	CTTGC	2	10	1850522	1850531	0 %	40 %	20 %	40 %	116514943
29024	NC_008529	GTT	2	6	1850600	1850605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116514943
29025	NC_008529	CAT	2	6	1850732	1850737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514943
29026	NC_008529	CAG	2	6	1850776	1850781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514943
29027	NC_008529	CTG	2	6	1850782	1850787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514943
29028	NC_008529	AAC	2	6	1850807	1850812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116514943
29029	NC_008529	CAG	2	6	1850860	1850865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514943
29030	NC_008529	AGC	2	6	1850870	1850875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514943
29031	NC_008529	TTGC	2	8	1850895	1850902	0 %	50 %	25 %	25 %	116514943
29032	NC_008529	CTT	2	6	1850972	1850977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514943
29033	NC_008529	CTTGG	2	10	1851032	1851041	0 %	40 %	40 %	20 %	116514943
29034	NC_008529	GAA	2	6	1851092	1851097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514943
29035	NC_008529	GAG	2	6	1851112	1851117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116514943
29036	NC_008529	CGT	2	6	1851166	1851171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514943
29037	NC_008529	TCA	2	6	1851181	1851186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514943
29038	NC_008529	CTG	2	6	1851250	1851255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514943
29039	NC_008529	CTT	2	6	1851274	1851279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514943
29040	NC_008529	ACC	2	6	1851350	1851355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116514943
29041	NC_008529	GGT	2	6	1851370	1851375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116514943
29042	NC_008529	CCGG	2	8	1851845	1851852	0 %	0 %	50 %	50 %	116514944
29043	NC_008529	TCT	2	6	1851923	1851928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514944
29044	NC_008529	CTT	2	6	1851969	1851974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514944
29045	NC_008529	CCG	2	6	1852111	1852116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116514944
29046	NC_008529	CTT	2	6	1852218	1852223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514944
29047	NC_008529	ATC	2	6	1852245	1852250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514944
29048	NC_008529	TCAA	2	8	1852252	1852259	50 %	25 %	0 %	25 %	116514944
29049	NC_008529	TTC	2	6	1852356	1852361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514944
29050	NC_008529	GGCT	2	8	1852428	1852435	0 %	25 %	50 %	25 %	116514944
29051	NC_008529	CGG	2	6	1852484	1852489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116514944
29052	NC_008529	CTT	2	6	1852490	1852495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514944
29053	NC_008529	CTGCC	2	10	1852518	1852527	0 %	20 %	20 %	60 %	116514944
29054	NC_008529	CGT	2	6	1852589	1852594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514944
29055	NC_008529	CAT	2	6	1852617	1852622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514944
29056	NC_008529	GCA	2	6	1852652	1852657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514944
29057	NC_008529	CTT	2	6	1852670	1852675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514944
29058	NC_008529	TTC	2	6	1852710	1852715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514944
29059	NC_008529	GAC	2	6	1852773	1852778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514944
29060	NC_008529	CGA	2	6	1852817	1852822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514944
29061	NC_008529	TGA	2	6	1852862	1852867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514944
29062	NC_008529	CAG	2	6	1852900	1852905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514944
29063	NC_008529	CTG	2	6	1852936	1852941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514944
29064	NC_008529	CTT	2	6	1852979	1852984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514944
29065	NC_008529	GCG	2	6	1853024	1853029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116514944
29066	NC_008529	GCG	2	6	1853043	1853048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116514944
29067	NC_008529	TC	3	6	1853064	1853069	0 %	50 %	0 %	50 %	116514944
29068	NC_008529	GTT	2	6	1853103	1853108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116514944
29069	NC_008529	AGT	2	6	1853120	1853125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514944
29070	NC_008529	CGT	2	6	1853166	1853171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514944
29071	NC_008529	GTC	2	6	1853250	1853255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514944
29072	NC_008529	GGCCG	2	10	1853466	1853475	0 %	0 %	60 %	40 %	116514944
29073	NC_008529	CCA	2	6	1853504	1853509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116514944
29074	NC_008529	AGC	2	6	1853527	1853532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514944
29075	NC_008529	TCT	2	6	1853537	1853542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514944
29076	NC_008529	GCT	2	6	1853566	1853571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514944
29077	NC_008529	T	7	7	1853636	1853642	0 %	100 %	0 %	0 %	116514944
29078	NC_008529	TGC	2	6	1853823	1853828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514945
29079	NC_008529	TTGGCC	2	12	1853829	1853840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514945
29080	NC_008529	TGGT	2	8	1853859	1853866	0 %	50 %	50 %	0 %	116514945
29081	NC_008529	GAA	2	6	1853903	1853908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514945
29082	NC_008529	CTT	2	6	1853912	1853917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514945
29083	NC_008529	TCA	2	6	1853950	1853955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514945
29084	NC_008529	TCACT	2	10	1853971	1853980	20 %	40 %	0 %	40 %	116514945
29085	NC_008529	CTTT	2	8	1853985	1853992	0 %	75 %	0 %	25 %	116514945
29086	NC_008529	GAT	2	6	1854044	1854049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514945
29087	NC_008529	CGG	2	6	1854061	1854066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116514945
29088	NC_008529	TCT	2	6	1854087	1854092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514945
29089	NC_008529	CTT	2	6	1854152	1854157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514945
29090	NC_008529	T	6	6	1854175	1854180	0 %	100 %	0 %	0 %	116514945
29091	NC_008529	TCAA	2	8	1854216	1854223	50 %	25 %	0 %	25 %	116514945
29092	NC_008529	GACA	2	8	1854242	1854249	50 %	0 %	25 %	25 %	116514945
29093	NC_008529	GGT	2	6	1854272	1854277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116514945
29094	NC_008529	GGA	2	6	1854332	1854337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116514945
29095	NC_008529	GGCC	2	8	1854351	1854358	0 %	0 %	50 %	50 %	116514945
29096	NC_008529	CCT	2	6	1854397	1854402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116514945
29097	NC_008529	CAG	2	6	1854413	1854418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514945
29098	NC_008529	CAG	2	6	1854455	1854460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514945
29099	NC_008529	CTT	3	9	1854475	1854483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514945
29100	NC_008529	GCC	2	6	1854572	1854577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116514945
29101	NC_008529	GCT	2	6	1854583	1854588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514945
29102	NC_008529	GAT	2	6	1854626	1854631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514945
29103	NC_008529	AGC	2	6	1854732	1854737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514945
29104	NC_008529	C	6	6	1854764	1854769	0 %	0 %	0 %	100 %	116514945
29105	NC_008529	TCG	2	6	1854840	1854845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514945
29106	NC_008529	GCG	2	6	1854997	1855002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116514945
29107	NC_008529	CGC	2	6	1855010	1855015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116514945
29108	NC_008529	ATT	2	6	1855155	1855160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514946
29109	NC_008529	CCG	2	6	1855183	1855188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116514946
29110	NC_008529	CTT	2	6	1855215	1855220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514946
29111	NC_008529	ATG	2	6	1855352	1855357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514946
29112	NC_008529	TCA	2	6	1855371	1855376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514946
29113	NC_008529	GTA	2	6	1855471	1855476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514946
29114	NC_008529	TCCA	2	8	1855496	1855503	25 %	25 %	0 %	50 %	116514946
29115	NC_008529	GGCA	2	8	1855586	1855593	25 %	0 %	50 %	25 %	116514946
29116	NC_008529	TTC	2	6	1855639	1855644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514946
29117	NC_008529	AGG	2	6	1855763	1855768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116514946
29118	NC_008529	GAT	2	6	1855777	1855782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514946
29119	NC_008529	GAT	3	9	1855792	1855800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514946
29120	NC_008529	GTA	2	6	1855858	1855863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514946
29121	NC_008529	CCA	2	6	1855879	1855884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116514946
29122	NC_008529	GGT	2	6	1855921	1855926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116514946
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29124	NC_008529	TTC	2	6	1856049	1856054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514947
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29126	NC_008529	GACC	2	8	1856234	1856241	25 %	0 %	25 %	50 %	116514947
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.