MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008526	GCA	2	6	251660	251665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493821
4002	NC_008526	TTG	2	6	251736	251741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493821
4003	NC_008526	GGC	2	6	251894	251899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493821
4004	NC_008526	TGA	2	6	251911	251916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493821
4005	NC_008526	TTA	2	6	251927	251932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493821
4006	NC_008526	GAA	2	6	252008	252013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493821
4007	NC_008526	TGG	2	6	252034	252039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493821
4008	NC_008526	ATC	2	6	252048	252053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493821
4009	NC_008526	TTC	2	6	252062	252067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493821
4010	NC_008526	GGC	3	9	252190	252198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493821
4011	NC_008526	GGT	2	6	252214	252219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493821
4012	NC_008526	TTA	2	6	252294	252299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493821
4013	NC_008526	A	6	6	252305	252310	100 %	0 %	0 %	0 %	116493821
4014	NC_008526	AAC	2	6	252369	252374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493821
4015	NC_008526	CAT	2	6	252475	252480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493822
4016	NC_008526	GAT	2	6	252572	252577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493822
4017	NC_008526	ATGG	2	8	252725	252732	25 %	25 %	50 %	0 %	116493822
4018	NC_008526	ATG	2	6	252776	252781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493822
4019	NC_008526	GAT	2	6	252821	252826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493822
4020	NC_008526	AGC	2	6	252867	252872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493822
4021	NC_008526	TTAT	2	8	252928	252935	25 %	75 %	0 %	0 %	116493822
4022	NC_008526	TGA	2	6	252985	252990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493822
4023	NC_008526	ATC	2	6	253077	253082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493822
4024	NC_008526	TGT	2	6	253084	253089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493822
4025	NC_008526	TCG	2	6	253090	253095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493822
4026	NC_008526	ATC	2	6	253121	253126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493822
4027	NC_008526	GCA	2	6	253138	253143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493822
4028	NC_008526	TCA	2	6	253165	253170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493822
4029	NC_008526	ACG	2	6	253186	253191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493822
4030	NC_008526	AAGA	2	8	253208	253215	75 %	0 %	25 %	0 %	116493822
4031	NC_008526	AAG	2	6	253314	253319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493823
4032	NC_008526	ATC	2	6	253385	253390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493823
4033	NC_008526	GCT	2	6	253603	253608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493823
4034	NC_008526	TAC	2	6	253710	253715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493823
4035	NC_008526	TCT	2	6	253873	253878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493823
4036	NC_008526	ATTT	2	8	253896	253903	25 %	75 %	0 %	0 %	116493823
4037	NC_008526	TAT	2	6	253946	253951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493823
4038	NC_008526	GC	3	6	253960	253965	0 %	0 %	50 %	50 %	116493823
4039	NC_008526	GCC	2	6	254156	254161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493824
4040	NC_008526	TGA	2	6	254230	254235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493824
4041	NC_008526	GCC	2	6	254312	254317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493824
4042	NC_008526	GAT	2	6	254377	254382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493824
4043	NC_008526	CAAAC	2	10	254390	254399	60 %	0 %	0 %	40 %	116493824
4044	NC_008526	GATC	2	8	254410	254417	25 %	25 %	25 %	25 %	116493824
4045	NC_008526	ACA	2	6	254766	254771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493825
4046	NC_008526	CAA	2	6	254794	254799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493825
4047	NC_008526	CTG	2	6	254945	254950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493825
4048	NC_008526	TTA	2	6	254961	254966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493825
4049	NC_008526	TCG	2	6	254970	254975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493825
4050	NC_008526	TCT	2	6	255010	255015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493825
4051	NC_008526	AG	3	6	255088	255093	50 %	0 %	50 %	0 %	116493825
4052	NC_008526	TAA	2	6	255115	255120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493825
4053	NC_008526	CAC	2	6	255209	255214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493825
4054	NC_008526	AGT	2	6	255240	255245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493825
4055	NC_008526	AGA	2	6	255256	255261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493825
4056	NC_008526	CAA	2	6	255537	255542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493826
4057	NC_008526	GC	3	6	255543	255548	0 %	0 %	50 %	50 %	116493826
4058	NC_008526	TAA	2	6	255640	255645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493826
4059	NC_008526	GATCG	2	10	255649	255658	20 %	20 %	40 %	20 %	116493826
4060	NC_008526	ATC	2	6	255682	255687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493826
4061	NC_008526	GCT	2	6	255695	255700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493826
4062	NC_008526	TTG	2	6	255758	255763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493826
4063	NC_008526	CGT	2	6	255796	255801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493826
4064	NC_008526	CAG	2	6	255837	255842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493826
4065	NC_008526	GGC	3	9	255991	255999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493826
4066	NC_008526	TCA	2	6	256121	256126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493826
4067	NC_008526	TGC	2	6	256133	256138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493826
4068	NC_008526	CAG	2	6	256188	256193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493826
4069	NC_008526	TGG	2	6	256221	256226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493826
4070	NC_008526	TGC	2	6	256234	256239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493826
4071	NC_008526	ACC	2	6	256809	256814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493827
4072	NC_008526	AAG	2	6	257010	257015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493827
4073	NC_008526	ATC	2	6	257049	257054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493827
4074	NC_008526	CAA	2	6	257090	257095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493827
4075	NC_008526	AAC	2	6	257128	257133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493827
4076	NC_008526	ATC	2	6	257181	257186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493827
4077	NC_008526	GGC	2	6	257204	257209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493827
4078	NC_008526	TGATTT	2	12	257362	257373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116493827
4079	NC_008526	AGC	2	6	257502	257507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493827
4080	NC_008526	AGGC	2	8	257550	257557	25 %	0 %	50 %	25 %	116493827
4081	NC_008526	CG	3	6	257559	257564	0 %	0 %	50 %	50 %	116493827
4082	NC_008526	AGC	2	6	257589	257594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493827
4083	NC_008526	CCT	2	6	257618	257623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116493827
4084	NC_008526	TGG	2	6	257682	257687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493827
4085	NC_008526	ATT	2	6	257722	257727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493827
4086	NC_008526	AGATC	2	10	257755	257764	40 %	20 %	20 %	20 %	116493827
4087	NC_008526	GTT	2	6	257803	257808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493827
4088	NC_008526	TGT	2	6	257866	257871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493827
4089	NC_008526	CTA	2	6	257878	257883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493827
4090	NC_008526	GCACT	2	10	257988	257997	20 %	20 %	20 %	40 %	116493827
4091	NC_008526	TGT	2	6	258030	258035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493827
4092	NC_008526	CGA	2	6	258111	258116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493827
4093	NC_008526	GAC	3	9	258125	258133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493827
4094	NC_008526	CAA	2	6	258161	258166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493827
4095	NC_008526	GTATAA	2	12	258467	258478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116493828
4096	NC_008526	GCA	2	6	258542	258547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493828
4097	NC_008526	GTT	2	6	258596	258601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493828
4098	NC_008526	ATC	2	6	258677	258682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493828
4099	NC_008526	CGGG	2	8	258683	258690	0 %	0 %	75 %	25 %	116493828
4100	NC_008526	TGG	2	6	258706	258711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493828
4101	NC_008526	CAC	2	6	258781	258786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493828
4102	NC_008526	TCA	2	6	258804	258809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493828
4103	NC_008526	ACAA	2	8	258851	258858	75 %	0 %	0 %	25 %	116493828
4104	NC_008526	TTG	2	6	258928	258933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493828
4105	NC_008526	ATGC	2	8	258934	258941	25 %	25 %	25 %	25 %	116493828
4106	NC_008526	GAC	2	6	258968	258973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493828
4107	NC_008526	CAAT	2	8	258974	258981	50 %	25 %	0 %	25 %	116493828
4108	NC_008526	CAT	2	6	259006	259011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493828
4109	NC_008526	GCAG	2	8	259061	259068	25 %	0 %	50 %	25 %	116493828
4110	NC_008526	CAT	2	6	264625	264630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493829
4111	NC_008526	GTG	2	6	264706	264711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493829
4112	NC_008526	GGT	2	6	264775	264780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493829
4113	NC_008526	GC	3	6	264869	264874	0 %	0 %	50 %	50 %	116493829
4114	NC_008526	TGCT	3	12	265003	265014	0 %	50 %	25 %	25 %	116493830
4115	NC_008526	CGA	2	6	265069	265074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493830
4116	NC_008526	ACG	2	6	265114	265119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493830
4117	NC_008526	CGAT	2	8	265183	265190	25 %	25 %	25 %	25 %	116493830
4118	NC_008526	CG	3	6	265208	265213	0 %	0 %	50 %	50 %	116493830
4119	NC_008526	CT	3	6	265222	265227	0 %	50 %	0 %	50 %	116493830
4120	NC_008526	CGTT	2	8	265228	265235	0 %	50 %	25 %	25 %	116493830
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4133	NC_008526	TG	3	6	265949	265954	0 %	50 %	50 %	0 %	116493831
4134	NC_008526	T	6	6	265960	265965	0 %	100 %	0 %	0 %	116493831
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4142	NC_008526	TCA	2	6	266522	266527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493832
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4152	NC_008526	GCG	2	6	267399	267404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493833
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4158	NC_008526	TAT	2	6	267615	267620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493833
4159	NC_008526	TCA	2	6	267637	267642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493833
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4222	NC_008526	TGC	2	6	270294	270299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493836
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4230	NC_008526	ACATG	2	10	270577	270586	40 %	20 %	20 %	20 %	116493836
4231	NC_008526	TGA	2	6	270594	270599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493836
4232	NC_008526	TGG	2	6	270746	270751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493837
4233	NC_008526	TTG	2	6	270861	270866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493837
4234	NC_008526	ATGGC	2	10	270910	270919	20 %	20 %	40 %	20 %	116493837
4235	NC_008526	AAGC	2	8	271032	271039	50 %	0 %	25 %	25 %	116493837
4236	NC_008526	GGT	2	6	271122	271127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493837
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4239	NC_008526	AAC	2	6	271265	271270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493837
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4241	NC_008526	CTT	2	6	271898	271903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493838
4242	NC_008526	ATG	2	6	271905	271910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493838
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4244	NC_008526	GGT	2	6	272016	272021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493838
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4360	NC_008526	TTCG	2	8	280129	280136	0 %	50 %	25 %	25 %	116493847
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4484	NC_008526	GAT	2	6	289256	289261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493856
4485	NC_008526	TCA	2	6	289434	289439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493856
4486	NC_008526	TGCTT	2	10	289546	289555	0 %	60 %	20 %	20 %	116493856
4487	NC_008526	CAAA	2	8	289657	289664	75 %	0 %	0 %	25 %	116493856
4488	NC_008526	GCG	2	6	289695	289700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493856
4489	NC_008526	GATG	2	8	289754	289761	25 %	25 %	50 %	0 %	116493856
4490	NC_008526	CGT	2	6	289767	289772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493856
4491	NC_008526	TGA	2	6	289774	289779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493856
4492	NC_008526	TTC	2	6	289811	289816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493856
4493	NC_008526	ATC	2	6	289832	289837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493856
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4497	NC_008526	TG	3	6	289998	290003	0 %	50 %	50 %	0 %	116493856
4498	NC_008526	GC	3	6	290018	290023	0 %	0 %	50 %	50 %	116493856
4499	NC_008526	CGG	2	6	290119	290124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493856
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