MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_008526	AGA	2	6	2781484	2781489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116496221
43502	NC_008526	TAA	2	6	2781598	2781603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496221
43503	NC_008526	CCA	2	6	2781742	2781747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496221
43504	NC_008526	TGCT	2	8	2781913	2781920	0 %	50 %	25 %	25 %	116496221
43505	NC_008526	TGC	2	6	2781926	2781931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496221
43506	NC_008526	CCA	2	6	2781951	2781956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496221
43507	NC_008526	ATC	2	6	2781975	2781980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496221
43508	NC_008526	CAA	2	6	2782012	2782017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496221
43509	NC_008526	CCG	2	6	2782018	2782023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496221
43510	NC_008526	GCAA	2	8	2782029	2782036	50 %	0 %	25 %	25 %	116496221
43511	NC_008526	AGCA	2	8	2782184	2782191	50 %	0 %	25 %	25 %	116496221
43512	NC_008526	CAT	2	6	2782193	2782198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496221
43513	NC_008526	TCA	2	6	2782216	2782221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496221
43514	NC_008526	ATCA	2	8	2782585	2782592	50 %	25 %	0 %	25 %	116496222
43515	NC_008526	TGA	2	6	2782602	2782607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496222
43516	NC_008526	GATC	2	8	2782639	2782646	25 %	25 %	25 %	25 %	116496222
43517	NC_008526	CAT	2	6	2782657	2782662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496222
43518	NC_008526	CGT	2	6	2782756	2782761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496222
43519	NC_008526	CTC	2	6	2782781	2782786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116496222
43520	NC_008526	GAC	2	6	2782957	2782962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496222
43521	NC_008526	AAAG	2	8	2782973	2782980	75 %	0 %	25 %	0 %	116496222
43522	NC_008526	ACG	2	6	2783000	2783005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496222
43523	NC_008526	GCC	2	6	2783194	2783199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496223
43524	NC_008526	TGTCA	2	10	2783206	2783215	20 %	40 %	20 %	20 %	116496223
43525	NC_008526	CAT	2	6	2783229	2783234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496223
43526	NC_008526	GGC	2	6	2783245	2783250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496223
43527	NC_008526	TCA	2	6	2783291	2783296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496223
43528	NC_008526	AAT	2	6	2783346	2783351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496223
43529	NC_008526	ATC	2	6	2783419	2783424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496223
43530	NC_008526	ATTT	2	8	2783448	2783455	25 %	75 %	0 %	0 %	116496223
43531	NC_008526	CAT	2	6	2783499	2783504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496223
43532	NC_008526	AAGT	2	8	2783549	2783556	50 %	25 %	25 %	0 %	116496223
43533	NC_008526	CTG	3	9	2783559	2783567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496223
43534	NC_008526	TTGA	2	8	2783570	2783577	25 %	50 %	25 %	0 %	116496223
43535	NC_008526	CTG	2	6	2784247	2784252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496224
43536	NC_008526	TTAAT	2	10	2784273	2784282	40 %	60 %	0 %	0 %	116496224
43537	NC_008526	GCT	2	6	2784323	2784328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496224
43538	NC_008526	CAT	2	6	2784366	2784371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496224
43539	NC_008526	CAG	2	6	2784384	2784389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496224
43540	NC_008526	CTG	2	6	2784398	2784403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496224
43541	NC_008526	CTG	2	6	2784469	2784474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496224
43542	NC_008526	TTGA	2	8	2784550	2784557	25 %	50 %	25 %	0 %	116496224
43543	NC_008526	TCA	2	6	2784572	2784577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496224
43544	NC_008526	TGG	2	6	2784606	2784611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116496224
43545	NC_008526	CGA	2	6	2784654	2784659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496224
43546	NC_008526	ACC	2	6	2784685	2784690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496224
43547	NC_008526	GCCTG	2	10	2784734	2784743	0 %	20 %	40 %	40 %	116496224
43548	NC_008526	ATC	2	6	2784757	2784762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496224
43549	NC_008526	CAA	2	6	2784960	2784965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496224
43550	NC_008526	AAC	2	6	2785024	2785029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496224
43551	NC_008526	TCTT	2	8	2785061	2785068	0 %	75 %	0 %	25 %	116496224
43552	NC_008526	ACT	3	9	2785129	2785137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496224
43553	NC_008526	CGC	2	6	2785380	2785385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496224
43554	NC_008526	CAA	2	6	2785419	2785424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496224
43555	NC_008526	T	6	6	2785457	2785462	0 %	100 %	0 %	0 %	116496224
43556	NC_008526	TCC	2	6	2785536	2785541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116496225
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43558	NC_008526	T	6	6	2785719	2785724	0 %	100 %	0 %	0 %	116496225
43559	NC_008526	T	6	6	2785776	2785781	0 %	100 %	0 %	0 %	116496225
43560	NC_008526	A	6	6	2785793	2785798	100 %	0 %	0 %	0 %	116496225
43561	NC_008526	TGC	2	6	2785896	2785901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496225
43562	NC_008526	TCGCAG	2	12	2785912	2785923	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116496225
43563	NC_008526	GCTTT	2	10	2786018	2786027	0 %	60 %	20 %	20 %	116496226
43564	NC_008526	TTG	2	6	2786101	2786106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496226
43565	NC_008526	TAT	2	6	2786145	2786150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116496226
43566	NC_008526	TGT	2	6	2786151	2786156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496226
43567	NC_008526	TAAA	2	8	2786173	2786180	75 %	25 %	0 %	0 %	116496226
43568	NC_008526	CATC	2	8	2786205	2786212	25 %	25 %	0 %	50 %	116496226
43569	NC_008526	ATG	2	6	2786416	2786421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496226
43570	NC_008526	GCA	2	6	2786444	2786449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496226
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43573	NC_008526	CGT	2	6	2786606	2786611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496226
43574	NC_008526	TGA	2	6	2786655	2786660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496226
43575	NC_008526	GTTGC	2	10	2786774	2786783	0 %	40 %	40 %	20 %	116496226
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43582	NC_008526	ACA	2	6	2787284	2787289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496227
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43585	NC_008526	GCA	2	6	2787479	2787484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496227
43586	NC_008526	TGCT	2	8	2787533	2787540	0 %	50 %	25 %	25 %	116496227
43587	NC_008526	GGC	2	6	2787586	2787591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496227
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43591	NC_008526	GACT	2	8	2787773	2787780	25 %	25 %	25 %	25 %	116496228
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43603	NC_008526	CGG	2	6	2788410	2788415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496228
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43605	NC_008526	TC	3	6	2788582	2788587	0 %	50 %	0 %	50 %	116496228
43606	NC_008526	TTG	2	6	2788637	2788642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496228
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43615	NC_008526	CTTC	2	8	2789305	2789312	0 %	50 %	0 %	50 %	116496229
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