MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_008526	AGC	2	6	2688208	2688213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496124
42003	NC_008526	CGG	2	6	2688258	2688263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496124
42004	NC_008526	TTC	2	6	2688418	2688423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496124
42005	NC_008526	CAT	2	6	2688448	2688453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496124
42006	NC_008526	T	6	6	2688531	2688536	0 %	100 %	0 %	0 %	116496124
42007	NC_008526	T	6	6	2688538	2688543	0 %	100 %	0 %	0 %	116496124
42008	NC_008526	CATT	2	8	2688556	2688563	25 %	50 %	0 %	25 %	116496124
42009	NC_008526	T	6	6	2689067	2689072	0 %	100 %	0 %	0 %	116496125
42010	NC_008526	CAAT	2	8	2689111	2689118	50 %	25 %	0 %	25 %	116496125
42011	NC_008526	ACC	2	6	2689130	2689135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496125
42012	NC_008526	CAGCAT	2	12	2689142	2689153	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116496125
42013	NC_008526	CAA	2	6	2689432	2689437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496126
42014	NC_008526	GGC	2	6	2689669	2689674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496126
42015	NC_008526	TCG	2	6	2689695	2689700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496126
42016	NC_008526	CCT	2	6	2689902	2689907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116496127
42017	NC_008526	TGC	2	6	2689912	2689917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496127
42018	NC_008526	CAT	2	6	2689927	2689932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496127
42019	NC_008526	TAA	2	6	2689965	2689970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496127
42020	NC_008526	GCC	2	6	2689981	2689986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496127
42021	NC_008526	CTT	2	6	2690014	2690019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496127
42022	NC_008526	GCT	2	6	2690045	2690050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496127
42023	NC_008526	CAT	2	6	2690088	2690093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496127
42024	NC_008526	TCA	2	6	2690111	2690116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496127
42025	NC_008526	TTGG	2	8	2690144	2690151	0 %	50 %	50 %	0 %	116496127
42026	NC_008526	ATC	2	6	2690159	2690164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496127
42027	NC_008526	CG	3	6	2690188	2690193	0 %	0 %	50 %	50 %	116496127
42028	NC_008526	AGC	2	6	2690372	2690377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496127
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42033	NC_008526	TAAA	2	8	2690454	2690461	75 %	25 %	0 %	0 %	116496127
42034	NC_008526	GCA	2	6	2690480	2690485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496127
42035	NC_008526	CAT	2	6	2690517	2690522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496127
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42116	NC_008526	GAC	2	6	2695000	2695005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496132
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42123	NC_008526	TCG	2	6	2695306	2695311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496132
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42230	NC_008526	ATC	2	6	2701663	2701668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496138
42231	NC_008526	CCG	2	6	2701678	2701683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496138
42232	NC_008526	AAC	2	6	2701696	2701701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496138
42233	NC_008526	CGA	2	6	2701708	2701713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496138
42234	NC_008526	CAGC	2	8	2701727	2701734	25 %	0 %	25 %	50 %	116496138
42235	NC_008526	AGAAT	2	10	2701736	2701745	60 %	20 %	20 %	0 %	116496138
42236	NC_008526	ACA	2	6	2701855	2701860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496138
42237	NC_008526	AAT	2	6	2701866	2701871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496138
42238	NC_008526	TTC	2	6	2701927	2701932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496138
42239	NC_008526	CAA	2	6	2701935	2701940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496138
42240	NC_008526	CTG	2	6	2701943	2701948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496138
42241	NC_008526	GGTG	2	8	2701970	2701977	0 %	25 %	75 %	0 %	116496138
42242	NC_008526	GAA	3	9	2702025	2702033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116496138
42243	NC_008526	GGC	2	6	2702142	2702147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496138
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42247	NC_008526	GCT	2	6	2702484	2702489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496139
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42249	NC_008526	TTG	2	6	2702521	2702526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496139
42250	NC_008526	TTCA	2	8	2702572	2702579	25 %	50 %	0 %	25 %	116496139
42251	NC_008526	CTT	2	6	2702655	2702660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496140
42252	NC_008526	CTT	2	6	2702715	2702720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496140
42253	NC_008526	GAACG	2	10	2702721	2702730	40 %	0 %	40 %	20 %	116496140
42254	NC_008526	GCCA	2	8	2702748	2702755	25 %	0 %	25 %	50 %	116496140
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42258	NC_008526	T	6	6	2703137	2703142	0 %	100 %	0 %	0 %	116496141
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42260	NC_008526	TGC	2	6	2703417	2703422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496141
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42267	NC_008526	TGC	2	6	2703734	2703739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496142
42268	NC_008526	CTG	2	6	2703778	2703783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496142
42269	NC_008526	TGT	2	6	2703788	2703793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496142
42270	NC_008526	ACT	2	6	2703821	2703826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496142
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42272	NC_008526	T	6	6	2703865	2703870	0 %	100 %	0 %	0 %	116496142
42273	NC_008526	CTC	2	6	2703879	2703884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116496142
42274	NC_008526	AC	3	6	2703960	2703965	50 %	0 %	0 %	50 %	116496142
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42277	NC_008526	CG	3	6	2704004	2704009	0 %	0 %	50 %	50 %	116496142
42278	NC_008526	TCA	2	6	2704010	2704015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496142
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42281	NC_008526	T	6	6	2704233	2704238	0 %	100 %	0 %	0 %	116496142
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42284	NC_008526	GAT	2	6	2704408	2704413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496142
42285	NC_008526	ATA	2	6	2704480	2704485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496142
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42288	NC_008526	TCGGT	2	10	2704773	2704782	0 %	40 %	40 %	20 %	116496142
42289	NC_008526	CTG	2	6	2704834	2704839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496142
42290	NC_008526	TGA	2	6	2704842	2704847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496142
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42292	NC_008526	ATA	2	6	2704900	2704905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496142
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42294	NC_008526	CTG	2	6	2705008	2705013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496142
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42296	NC_008526	GGA	2	6	2705058	2705063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116496142
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42300	NC_008526	CTT	2	6	2705898	2705903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496143
42301	NC_008526	CAT	2	6	2705922	2705927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496143
42302	NC_008526	GCT	2	6	2705930	2705935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496143
42303	NC_008526	GTT	2	6	2705949	2705954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496143
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42305	NC_008526	GAAT	2	8	2706073	2706080	50 %	25 %	25 %	0 %	116496143
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42311	NC_008526	CCTT	2	8	2706437	2706444	0 %	50 %	0 %	50 %	116496143
42312	NC_008526	CAA	2	6	2706448	2706453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496143
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42321	NC_008526	GAC	2	6	2706917	2706922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496144
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42329	NC_008526	CT	3	6	2707575	2707580	0 %	50 %	0 %	50 %	116496145
42330	NC_008526	TGC	2	6	2707592	2707597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496145
42331	NC_008526	GTG	2	6	2707616	2707621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116496145
42332	NC_008526	CAT	2	6	2707681	2707686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496145
42333	NC_008526	TTC	2	6	2707800	2707805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496145
42334	NC_008526	CGCAA	2	10	2707819	2707828	40 %	0 %	20 %	40 %	116496145
42335	NC_008526	CAAT	2	8	2707839	2707846	50 %	25 %	0 %	25 %	116496145
42336	NC_008526	TCT	2	6	2707866	2707871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496145
42337	NC_008526	ACC	2	6	2707949	2707954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496145
42338	NC_008526	T	7	7	2707977	2707983	0 %	100 %	0 %	0 %	116496145
42339	NC_008526	CCA	2	6	2708007	2708012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496145
42340	NC_008526	CTT	2	6	2708100	2708105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496146
42341	NC_008526	GTTT	2	8	2708153	2708160	0 %	75 %	25 %	0 %	116496146
42342	NC_008526	CCA	2	6	2708195	2708200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496146
42343	NC_008526	TCA	2	6	2708208	2708213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496146
42344	NC_008526	ACAA	2	8	2708297	2708304	75 %	0 %	0 %	25 %	116496146
42345	NC_008526	AC	3	6	2708328	2708333	50 %	0 %	0 %	50 %	116496146
42346	NC_008526	AGC	2	6	2708362	2708367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496146
42347	NC_008526	GTA	2	6	2708383	2708388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496146
42348	NC_008526	TTC	2	6	2708515	2708520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496146
42349	NC_008526	AAT	2	6	2708533	2708538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496146
42350	NC_008526	TAC	2	6	2708580	2708585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496146
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42352	NC_008526	AT	3	6	2708654	2708659	50 %	50 %	0 %	0 %	116496146
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42355	NC_008526	TCA	2	6	2708971	2708976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496147
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42359	NC_008526	ATT	2	6	2709245	2709250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116496148
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42366	NC_008526	GC	4	8	2709610	2709617	0 %	0 %	50 %	50 %	116496148
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42453	NC_008526	CGA	2	6	2716179	2716184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496155
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