MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_008526	ATC	2	6	2626462	2626467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496066
41002	NC_008526	CCG	2	6	2626515	2626520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496066
41003	NC_008526	ATG	2	6	2626543	2626548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496066
41004	NC_008526	AAT	2	6	2626591	2626596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496066
41005	NC_008526	AAG	2	6	2626668	2626673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116496066
41006	NC_008526	CGC	2	6	2626674	2626679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496066
41007	NC_008526	ATG	2	6	2626726	2626731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496066
41008	NC_008526	TAA	2	6	2626761	2626766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496066
41009	NC_008526	CAA	2	6	2626953	2626958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496067
41010	NC_008526	AGA	2	6	2626978	2626983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116496067
41011	NC_008526	CAAG	2	8	2627021	2627028	50 %	0 %	25 %	25 %	116496067
41012	NC_008526	A	6	6	2627072	2627077	100 %	0 %	0 %	0 %	116496067
41013	NC_008526	GAA	2	6	2627094	2627099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116496067
41014	NC_008526	TGT	2	6	2627140	2627145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496067
41015	NC_008526	TTGC	2	8	2627176	2627183	0 %	50 %	25 %	25 %	116496067
41016	NC_008526	GAAAAA	2	12	2627500	2627511	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116496068
41017	NC_008526	GTT	2	6	2627530	2627535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496068
41018	NC_008526	TGTCA	2	10	2627536	2627545	20 %	40 %	20 %	20 %	116496068
41019	NC_008526	AAG	2	6	2627546	2627551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116496068
41020	NC_008526	CGG	3	9	2627703	2627711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496068
41021	NC_008526	A	7	7	2627751	2627757	100 %	0 %	0 %	0 %	116496068
41022	NC_008526	CAAA	3	12	2627845	2627856	75 %	0 %	0 %	25 %	116496069
41023	NC_008526	GACAG	2	10	2627869	2627878	40 %	0 %	40 %	20 %	116496069
41024	NC_008526	CTG	2	6	2627880	2627885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496069
41025	NC_008526	T	7	7	2627892	2627898	0 %	100 %	0 %	0 %	116496069
41026	NC_008526	TCAT	2	8	2627926	2627933	25 %	50 %	0 %	25 %	116496069
41027	NC_008526	CAG	2	6	2628104	2628109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496070
41028	NC_008526	CTG	2	6	2628110	2628115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496070
41029	NC_008526	TTG	2	6	2628187	2628192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496070
41030	NC_008526	GCC	2	6	2628274	2628279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496070
41031	NC_008526	ACTGCA	2	12	2628285	2628296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116496070
41032	NC_008526	A	6	6	2628304	2628309	100 %	0 %	0 %	0 %	116496070
41033	NC_008526	AAC	2	6	2628326	2628331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496070
41034	NC_008526	GCC	2	6	2628403	2628408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496070
41035	NC_008526	CGC	3	9	2628429	2628437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496070
41036	NC_008526	GGC	2	6	2628466	2628471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496070
41037	NC_008526	TGA	3	9	2628485	2628493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496070
41038	NC_008526	ATG	2	6	2628527	2628532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496070
41039	NC_008526	GCA	2	6	2628546	2628551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496070
41040	NC_008526	ATT	2	6	2628586	2628591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116496070
41041	NC_008526	TGC	2	6	2628609	2628614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496070
41042	NC_008526	TAG	2	6	2628656	2628661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496070
41043	NC_008526	T	6	6	2628695	2628700	0 %	100 %	0 %	0 %	116496070
41044	NC_008526	TGCA	2	8	2628750	2628757	25 %	25 %	25 %	25 %	116496071
41045	NC_008526	TGT	2	6	2628854	2628859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496071
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41047	NC_008526	CGCA	2	8	2628951	2628958	25 %	0 %	25 %	50 %	116496071
41048	NC_008526	TTC	2	6	2629158	2629163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116496071
41049	NC_008526	GTC	2	6	2629180	2629185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496071
41050	NC_008526	CAAAA	2	10	2629212	2629221	80 %	0 %	0 %	20 %	116496071
41051	NC_008526	CG	3	6	2629236	2629241	0 %	0 %	50 %	50 %	116496071
41052	NC_008526	AAT	2	6	2629477	2629482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496072
41053	NC_008526	CAT	2	6	2629504	2629509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496072
41054	NC_008526	TCAT	2	8	2629611	2629618	25 %	50 %	0 %	25 %	116496072
41055	NC_008526	CAC	2	6	2629732	2629737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496072
41056	NC_008526	GCC	2	6	2629758	2629763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496072
41057	NC_008526	GGC	2	6	2629842	2629847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496072
41058	NC_008526	CCA	2	6	2629930	2629935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496072
41059	NC_008526	CCA	2	6	2629954	2629959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496072
41060	NC_008526	GGAATG	2	12	2630010	2630021	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116496072
41061	NC_008526	GC	3	6	2630068	2630073	0 %	0 %	50 %	50 %	116496072
41062	NC_008526	ATC	2	6	2630085	2630090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496072
41063	NC_008526	GTC	2	6	2630108	2630113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496072
41064	NC_008526	GGA	2	6	2630188	2630193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116496072
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41066	NC_008526	CGAA	2	8	2630525	2630532	50 %	0 %	25 %	25 %	116496073
41067	NC_008526	TCA	2	6	2630625	2630630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496073
41068	NC_008526	GCA	2	6	2630638	2630643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496073
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41088	NC_008526	TCG	2	6	2631453	2631458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496074
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41090	NC_008526	ATGCGG	2	12	2631479	2631490	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116496074
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41097	NC_008526	TCA	2	6	2632007	2632012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496075
41098	NC_008526	A	6	6	2632034	2632039	100 %	0 %	0 %	0 %	116496075
41099	NC_008526	AGA	2	6	2632056	2632061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116496075
41100	NC_008526	TGC	2	6	2632068	2632073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496075
41101	NC_008526	TCATT	2	10	2632088	2632097	20 %	60 %	0 %	20 %	116496075
41102	NC_008526	GGT	2	6	2632102	2632107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116496075
41103	NC_008526	AAC	2	6	2632136	2632141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496075
41104	NC_008526	GAC	2	6	2632251	2632256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496075
41105	NC_008526	CAT	2	6	2632281	2632286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496075
41106	NC_008526	CAA	2	6	2632303	2632308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496075
41107	NC_008526	GTT	2	6	2632357	2632362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496075
41108	NC_008526	ACTT	2	8	2632372	2632379	25 %	50 %	0 %	25 %	116496075
41109	NC_008526	TGC	2	6	2632389	2632394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496075
41110	NC_008526	GGCA	2	8	2632556	2632563	25 %	0 %	50 %	25 %	116496075
41111	NC_008526	TCGCC	2	10	2632569	2632578	0 %	20 %	20 %	60 %	116496075
41112	NC_008526	ATG	2	6	2632586	2632591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496075
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41114	NC_008526	TATC	2	8	2632683	2632690	25 %	50 %	0 %	25 %	116496075
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41116	NC_008526	GGC	2	6	2632783	2632788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116496075
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41341	NC_008526	GCA	2	6	2646701	2646706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496087
41342	NC_008526	CAT	2	6	2646780	2646785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496087
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41344	NC_008526	T	7	7	2646934	2646940	0 %	100 %	0 %	0 %	116496087
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41465	NC_008526	GGT	2	6	2652569	2652574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116496093
41466	NC_008526	ACC	2	6	2652580	2652585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116496093
41467	NC_008526	AAC	2	6	2652634	2652639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496093
41468	NC_008526	ATAA	2	8	2652683	2652690	75 %	25 %	0 %	0 %	116496093
41469	NC_008526	GCC	2	6	2652737	2652742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496093
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41475	NC_008526	GCT	2	6	2653213	2653218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496094
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41480	NC_008526	TAA	2	6	2653656	2653661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496095
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41484	NC_008526	CAT	2	6	2653940	2653945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496095
41485	NC_008526	TAA	2	6	2653954	2653959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496095
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