MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_008526	ATG	2	6	2399779	2399784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495857
37503	NC_008526	ATC	2	6	2399796	2399801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495857
37504	NC_008526	TGCT	2	8	2399809	2399816	0 %	50 %	25 %	25 %	116495857
37505	NC_008526	AGC	2	6	2399862	2399867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495857
37506	NC_008526	GGTT	2	8	2399890	2399897	0 %	50 %	50 %	0 %	116495857
37507	NC_008526	GCC	2	6	2399935	2399940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495857
37508	NC_008526	TCA	2	6	2399995	2400000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495857
37509	NC_008526	GC	3	6	2400151	2400156	0 %	0 %	50 %	50 %	116495857
37510	NC_008526	A	6	6	2400204	2400209	100 %	0 %	0 %	0 %	116495857
37511	NC_008526	GCC	2	6	2400212	2400217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495857
37512	NC_008526	CGC	2	6	2400218	2400223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495857
37513	NC_008526	CTT	2	6	2400237	2400242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495857
37514	NC_008526	CATA	2	8	2400275	2400282	50 %	25 %	0 %	25 %	116495857
37515	NC_008526	ACA	2	6	2400314	2400319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495857
37516	NC_008526	TAA	2	6	2400333	2400338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495857
37517	NC_008526	TCT	2	6	2400358	2400363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495857
37518	NC_008526	CCATC	2	10	2400371	2400380	20 %	20 %	0 %	60 %	116495857
37519	NC_008526	ATT	2	6	2400538	2400543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495858
37520	NC_008526	CAAA	2	8	2400658	2400665	75 %	0 %	0 %	25 %	116495858
37521	NC_008526	ATG	2	6	2400808	2400813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495859
37522	NC_008526	GAT	2	6	2400842	2400847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495859
37523	NC_008526	GAA	2	6	2400852	2400857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495859
37524	NC_008526	CAGTC	2	10	2400891	2400900	20 %	20 %	20 %	40 %	116495859
37525	NC_008526	TCA	2	6	2401046	2401051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495859
37526	NC_008526	TGC	2	6	2401072	2401077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495859
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37528	NC_008526	AACC	2	8	2401143	2401150	50 %	0 %	0 %	50 %	116495859
37529	NC_008526	ATG	2	6	2401192	2401197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495859
37530	NC_008526	ACCTG	2	10	2401198	2401207	20 %	20 %	20 %	40 %	116495859
37531	NC_008526	TGG	2	6	2401223	2401228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495859
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37539	NC_008526	GAAT	2	8	2401643	2401650	50 %	25 %	25 %	0 %	116495859
37540	NC_008526	TCGGA	2	10	2401673	2401682	20 %	20 %	40 %	20 %	116495859
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37551	NC_008526	ATC	2	6	2402262	2402267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495859
37552	NC_008526	CATG	2	8	2402656	2402663	25 %	25 %	25 %	25 %	116495860
37553	NC_008526	GAA	2	6	2402664	2402669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495860
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37556	NC_008526	GCA	2	6	2402717	2402722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495860
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37615	NC_008526	CAT	2	6	2406455	2406460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495862
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37847	NC_008526	TCA	2	6	2421106	2421111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495875
37848	NC_008526	GTGAT	2	10	2421152	2421161	20 %	40 %	40 %	0 %	116495875
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37850	NC_008526	CAA	2	6	2421222	2421227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495875
37851	NC_008526	CAT	2	6	2421232	2421237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495875
37852	NC_008526	GGCT	2	8	2421265	2421272	0 %	25 %	50 %	25 %	116495875
37853	NC_008526	GCA	2	6	2421356	2421361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495876
37854	NC_008526	ATGAA	2	10	2421367	2421376	60 %	20 %	20 %	0 %	116495876
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37858	NC_008526	TTGC	2	8	2421413	2421420	0 %	50 %	25 %	25 %	116495876
37859	NC_008526	TACGC	2	10	2421435	2421444	20 %	20 %	20 %	40 %	116495876
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37864	NC_008526	GCA	2	6	2421572	2421577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495877
37865	NC_008526	CGG	2	6	2421636	2421641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495877
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37952	NC_008526	TAA	2	6	2426322	2426327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495882
37953	NC_008526	GC	3	6	2426336	2426341	0 %	0 %	50 %	50 %	116495882
37954	NC_008526	AATTG	2	10	2426491	2426500	40 %	40 %	20 %	0 %	116495882
37955	NC_008526	TTTGC	2	10	2426516	2426525	0 %	60 %	20 %	20 %	116495882
37956	NC_008526	TGC	2	6	2426596	2426601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495882
37957	NC_008526	ATAA	2	8	2426700	2426707	75 %	25 %	0 %	0 %	116495882
37958	NC_008526	TTG	2	6	2426710	2426715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495882
37959	NC_008526	TCC	2	6	2426743	2426748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116495882
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37961	NC_008526	CAG	2	6	2426888	2426893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495882
37962	NC_008526	CAT	2	6	2426900	2426905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495882
37963	NC_008526	GTT	2	6	2426911	2426916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495882
37964	NC_008526	CTTG	2	8	2426938	2426945	0 %	50 %	25 %	25 %	116495882
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37975	NC_008526	TAA	2	6	2427662	2427667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495883
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37988	NC_008526	ACC	2	6	2428994	2428999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495885
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37990	NC_008526	TGA	2	6	2429147	2429152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495885
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37998	NC_008526	GCAA	2	8	2429445	2429452	50 %	0 %	25 %	25 %	116495886
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