MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35005	NC_008526	CTG	2	6	2243407	2243412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495699
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35009	NC_008526	TAT	2	6	2243582	2243587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495700
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35021	NC_008526	CCGG	2	8	2244062	2244069	0 %	0 %	50 %	50 %	116495700
35022	NC_008526	CGG	2	6	2244114	2244119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495700
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35115	NC_008526	ATG	2	6	2249665	2249670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495706
35116	NC_008526	AAT	2	6	2249723	2249728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495706
35117	NC_008526	GTAA	2	8	2249733	2249740	50 %	25 %	25 %	0 %	116495706
35118	NC_008526	GTC	2	6	2249755	2249760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495706
35119	NC_008526	CATC	2	8	2249861	2249868	25 %	25 %	0 %	50 %	116495706
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35123	NC_008526	TTTG	2	8	2250150	2250157	0 %	75 %	25 %	0 %	116495707
35124	NC_008526	TTTGG	2	10	2250179	2250188	0 %	60 %	40 %	0 %	116495707
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35152	NC_008526	CTG	2	6	2251907	2251912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495709
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35202	NC_008526	TGC	2	6	2255976	2255981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495715
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35223	NC_008526	TCC	2	6	2256874	2256879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116495715
35224	NC_008526	CTT	2	6	2257013	2257018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495715
35225	NC_008526	TGC	2	6	2257039	2257044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495715
35226	NC_008526	GGC	2	6	2257712	2257717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495716
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35228	NC_008526	TGA	2	6	2257803	2257808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495716
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35230	NC_008526	CA	3	6	2257918	2257923	50 %	0 %	0 %	50 %	116495716
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35342	NC_008526	GCT	2	6	2264881	2264886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495722
35343	NC_008526	CAT	3	9	2264903	2264911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495722
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35345	NC_008526	CCGTGA	2	12	2265083	2265094	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116495722
35346	NC_008526	CCA	2	6	2265127	2265132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495722
35347	NC_008526	TGC	2	6	2265228	2265233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495722
35348	NC_008526	GTA	2	6	2265252	2265257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495722
35349	NC_008526	TCT	2	6	2265266	2265271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495722
35350	NC_008526	GTG	2	6	2265277	2265282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495722
35351	NC_008526	TTGATG	2	12	2265379	2265390	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116495722
35352	NC_008526	TGGC	2	8	2265400	2265407	0 %	25 %	50 %	25 %	116495722
35353	NC_008526	CTT	2	6	2265563	2265568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495722
35354	NC_008526	GTG	2	6	2265586	2265591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495722
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35357	NC_008526	TCG	2	6	2265731	2265736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495722
35358	NC_008526	TTC	2	6	2265826	2265831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495722
35359	NC_008526	CGT	2	6	2265873	2265878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495722
35360	NC_008526	TCG	2	6	2265892	2265897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495722
35361	NC_008526	TGT	2	6	2265958	2265963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495722
35362	NC_008526	TGC	2	6	2265972	2265977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495722
35363	NC_008526	TTG	2	6	2266066	2266071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495722
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35367	NC_008526	TTTC	2	8	2266251	2266258	0 %	75 %	0 %	25 %	116495722
35368	NC_008526	GCT	2	6	2266288	2266293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495722
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35372	NC_008526	TGG	2	6	2266628	2266633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495722
35373	NC_008526	ATC	2	6	2266650	2266655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495722
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35375	NC_008526	CGC	2	6	2266781	2266786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495722
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35438	NC_008526	GCTT	2	8	2269570	2269577	0 %	50 %	25 %	25 %	116495722
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35443	NC_008526	CTTT	2	8	2269718	2269725	0 %	75 %	0 %	25 %	116495722
35444	NC_008526	GAA	2	6	2270027	2270032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495723
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35449	NC_008526	GGC	2	6	2270136	2270141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495723
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35451	NC_008526	ACAA	2	8	2270290	2270297	75 %	0 %	0 %	25 %	116495723
35452	NC_008526	A	6	6	2270408	2270413	100 %	0 %	0 %	0 %	116495723
35453	NC_008526	CGA	2	6	2270489	2270494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495723
35454	NC_008526	AGC	2	6	2270525	2270530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495723
35455	NC_008526	CGG	2	6	2270591	2270596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495723
35456	NC_008526	TGC	2	6	2270648	2270653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495723
35457	NC_008526	A	6	6	2270663	2270668	100 %	0 %	0 %	0 %	116495723
35458	NC_008526	TTA	2	6	2270716	2270721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495723
35459	NC_008526	CAT	2	6	2270813	2270818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495723
35460	NC_008526	TCAG	2	8	2270830	2270837	25 %	25 %	25 %	25 %	116495723
35461	NC_008526	GAA	2	6	2270843	2270848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495723
35462	NC_008526	AAG	2	6	2270901	2270906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495723
35463	NC_008526	GTT	2	6	2271133	2271138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495724
35464	NC_008526	CGT	2	6	2271154	2271159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495724
35465	NC_008526	CCTT	2	8	2271171	2271178	0 %	50 %	0 %	50 %	116495724
35466	NC_008526	GCG	2	6	2271192	2271197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495724
35467	NC_008526	CGT	2	6	2271295	2271300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495724
35468	NC_008526	AGC	2	6	2271311	2271316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495724
35469	NC_008526	CAG	2	6	2271331	2271336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495724
35470	NC_008526	CAG	2	6	2271343	2271348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495724
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35472	NC_008526	ATG	2	6	2271441	2271446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495724
35473	NC_008526	CATCTA	2	12	2271448	2271459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495724
35474	NC_008526	TGTT	2	8	2271466	2271473	0 %	75 %	25 %	0 %	116495724
35475	NC_008526	GCA	2	6	2271511	2271516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495725
35476	NC_008526	TTC	2	6	2271519	2271524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495725
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35478	NC_008526	ACA	2	6	2271602	2271607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495725
35479	NC_008526	AAG	2	6	2271653	2271658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495725
35480	NC_008526	GAT	2	6	2271672	2271677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495725
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35482	NC_008526	ATG	2	6	2271724	2271729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495725
35483	NC_008526	ACG	2	6	2271825	2271830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495725
35484	NC_008526	TTC	2	6	2271841	2271846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495725
35485	NC_008526	T	7	7	2271987	2271993	0 %	100 %	0 %	0 %	116495725
35486	NC_008526	GCA	2	6	2272470	2272475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495726
35487	NC_008526	ATTT	2	8	2272539	2272546	25 %	75 %	0 %	0 %	116495726
35488	NC_008526	CGC	2	6	2272672	2272677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495726
35489	NC_008526	TGC	2	6	2272694	2272699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495726
35490	NC_008526	CAT	3	9	2272719	2272727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495726
35491	NC_008526	GCA	2	6	2272792	2272797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495726
35492	NC_008526	CGG	2	6	2272917	2272922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495726
35493	NC_008526	TCA	3	9	2272958	2272966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495726
35494	NC_008526	TGC	2	6	2272976	2272981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495726
35495	NC_008526	AC	3	6	2273024	2273029	50 %	0 %	0 %	50 %	116495726
35496	NC_008526	CAA	2	6	2273046	2273051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495726
35497	NC_008526	AAT	2	6	2273083	2273088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495726
35498	NC_008526	GTT	2	6	2273209	2273214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495726
35499	NC_008526	GCA	2	6	2273363	2273368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495726
35500	NC_008526	GC	3	6	2273414	2273419	0 %	0 %	50 %	50 %	116495726

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