MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34503	NC_008526	ATG	2	6	2214354	2214359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495674
34504	NC_008526	TAA	2	6	2214360	2214365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495674
34505	NC_008526	TCA	2	6	2214492	2214497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495674
34506	NC_008526	CTT	2	6	2214753	2214758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495675
34507	NC_008526	ACC	2	6	2214951	2214956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495675
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34509	NC_008526	TGT	2	6	2215120	2215125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495675
34510	NC_008526	AAT	2	6	2215163	2215168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495675
34511	NC_008526	TACTT	2	10	2215179	2215188	20 %	60 %	0 %	20 %	116495675
34512	NC_008526	TAA	2	6	2216405	2216410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495676
34513	NC_008526	AAT	2	6	2216469	2216474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495676
34514	NC_008526	CAC	2	6	2216497	2216502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495676
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34517	NC_008526	T	6	6	2216857	2216862	0 %	100 %	0 %	0 %	116495676
34518	NC_008526	CAT	2	6	2216865	2216870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495676
34519	NC_008526	TGAT	2	8	2216935	2216942	25 %	50 %	25 %	0 %	116495676
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34523	NC_008526	TGT	3	9	2217332	2217340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495677
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34528	NC_008526	A	7	7	2217993	2217999	100 %	0 %	0 %	0 %	116495678
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34615	NC_008526	GCT	2	6	2221813	2221818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495682
34616	NC_008526	ATG	2	6	2221847	2221852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495682
34617	NC_008526	TCTGAG	2	12	2221903	2221914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116495682
34618	NC_008526	ATG	2	6	2221950	2221955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495682
34619	NC_008526	CAT	2	6	2222005	2222010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495682
34620	NC_008526	TTGT	2	8	2222027	2222034	0 %	75 %	25 %	0 %	116495682
34621	NC_008526	CAC	3	9	2222044	2222052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495682
34622	NC_008526	AAG	2	6	2222058	2222063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495682
34623	NC_008526	GTT	2	6	2222105	2222110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495682
34624	NC_008526	GATAAG	2	12	2222120	2222131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116495682
34625	NC_008526	CAAG	2	8	2222164	2222171	50 %	0 %	25 %	25 %	116495682
34626	NC_008526	CAT	2	6	2222215	2222220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495682
34627	NC_008526	TTG	2	6	2222286	2222291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495682
34628	NC_008526	TGG	2	6	2222308	2222313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495682
34629	NC_008526	GAA	2	6	2222348	2222353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495682
34630	NC_008526	TGA	2	6	2222380	2222385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495682
34631	NC_008526	TGA	2	6	2222392	2222397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495682
34632	NC_008526	GAT	2	6	2222414	2222419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495682
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34634	NC_008526	ATC	2	6	2222510	2222515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495682
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34636	NC_008526	AAAC	2	8	2222660	2222667	75 %	0 %	0 %	25 %	116495682
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34638	NC_008526	ACG	2	6	2222697	2222702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495682
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34642	NC_008526	TTG	2	6	2222982	2222987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495683
34643	NC_008526	ACA	2	6	2223000	2223005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495683
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34650	NC_008526	TGC	2	6	2223472	2223477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495683
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34683	NC_008526	TTGAC	2	10	2225389	2225398	20 %	40 %	20 %	20 %	116495686
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34685	NC_008526	GTC	2	6	2225511	2225516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495686
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34700	NC_008526	GAT	2	6	2226255	2226260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495687
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34719	NC_008526	TGC	2	6	2227331	2227336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495687
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34725	NC_008526	CGT	2	6	2227570	2227575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495687
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34954	NC_008526	GAC	2	6	2241049	2241054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495698
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34960	NC_008526	ATC	2	6	2241485	2241490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495698
34961	NC_008526	ACCA	2	8	2241503	2241510	50 %	0 %	0 %	50 %	116495698
34962	NC_008526	GTCA	2	8	2241578	2241585	25 %	25 %	25 %	25 %	116495698
34963	NC_008526	ATC	2	6	2241633	2241638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495698
34964	NC_008526	ACTA	2	8	2241659	2241666	50 %	25 %	0 %	25 %	116495698
34965	NC_008526	TCAAGC	2	12	2241697	2241708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116495698
34966	NC_008526	AGC	2	6	2241726	2241731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495698
34967	NC_008526	GAA	2	6	2241734	2241739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495698
34968	NC_008526	CAC	2	6	2241787	2241792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495698
34969	NC_008526	A	6	6	2241825	2241830	100 %	0 %	0 %	0 %	116495698
34970	NC_008526	CTG	2	6	2241849	2241854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495698
34971	NC_008526	ATA	2	6	2241858	2241863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495698
34972	NC_008526	TGGC	2	8	2241960	2241967	0 %	25 %	50 %	25 %	116495698
34973	NC_008526	ATC	2	6	2242007	2242012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495698
34974	NC_008526	GAT	2	6	2242186	2242191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495698
34975	NC_008526	GTCCG	2	10	2242205	2242214	0 %	20 %	40 %	40 %	116495698
34976	NC_008526	CCTT	2	8	2242224	2242231	0 %	50 %	0 %	50 %	116495698
34977	NC_008526	T	7	7	2242230	2242236	0 %	100 %	0 %	0 %	116495698
34978	NC_008526	GAC	2	6	2242241	2242246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495698
34979	NC_008526	GGC	2	6	2242274	2242279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495698
34980	NC_008526	TGA	2	6	2242339	2242344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495698
34981	NC_008526	ACCA	2	8	2242349	2242356	50 %	0 %	0 %	50 %	116495698
34982	NC_008526	AAG	2	6	2242374	2242379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495698
34983	NC_008526	TCA	2	6	2242443	2242448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495698
34984	NC_008526	CAA	2	6	2242458	2242463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495698
34985	NC_008526	GCA	2	6	2242488	2242493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495698
34986	NC_008526	AGC	2	6	2242552	2242557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495698
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34988	NC_008526	GCT	2	6	2242568	2242573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495698
34989	NC_008526	CTG	2	6	2242596	2242601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495698
34990	NC_008526	CAG	2	6	2242616	2242621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495698
34991	NC_008526	AGA	2	6	2242627	2242632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495698
34992	NC_008526	GAT	2	6	2242667	2242672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495698
34993	NC_008526	AGC	2	6	2242677	2242682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495698
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34995	NC_008526	CAGA	2	8	2242775	2242782	50 %	0 %	25 %	25 %	116495698
34996	NC_008526	AAAC	2	8	2242799	2242806	75 %	0 %	0 %	25 %	116495698
34997	NC_008526	GAA	2	6	2242829	2242834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495698
34998	NC_008526	ATGC	2	8	2242856	2242863	25 %	25 %	25 %	25 %	116495698
34999	NC_008526	TACT	2	8	2243154	2243161	25 %	50 %	0 %	25 %	116495699
35000	NC_008526	TCA	2	6	2243172	2243177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495699

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