MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_008526	GCT	2	6	2183086	2183091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495645
34003	NC_008526	CGAC	2	8	2183173	2183180	25 %	0 %	25 %	50 %	116495645
34004	NC_008526	GCT	2	6	2183350	2183355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495645
34005	NC_008526	TCT	2	6	2183454	2183459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495645
34006	NC_008526	CAA	2	6	2183480	2183485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495645
34007	NC_008526	AGACCT	2	12	2183542	2183553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116495645
34008	NC_008526	AAC	2	6	2183586	2183591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495645
34009	NC_008526	AAT	2	6	2183594	2183599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495645
34010	NC_008526	ATT	2	6	2183726	2183731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495646
34011	NC_008526	CAT	2	6	2183819	2183824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495646
34012	NC_008526	GAA	2	6	2183869	2183874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495646
34013	NC_008526	CAT	2	6	2183927	2183932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495646
34014	NC_008526	TGC	2	6	2183959	2183964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495646
34015	NC_008526	AATC	2	8	2183972	2183979	50 %	25 %	0 %	25 %	116495646
34016	NC_008526	ATC	2	6	2183985	2183990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495646
34017	NC_008526	CAA	2	6	2184041	2184046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495646
34018	NC_008526	CGG	2	6	2184212	2184217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495646
34019	NC_008526	TAG	2	6	2184223	2184228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495646
34020	NC_008526	GAT	2	6	2184251	2184256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495646
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34024	NC_008526	TGC	2	6	2184397	2184402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495646
34025	NC_008526	CAT	2	6	2184431	2184436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495646
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34031	NC_008526	TACTT	2	10	2184649	2184658	20 %	60 %	0 %	20 %	116495646
34032	NC_008526	GCC	2	6	2184729	2184734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495646
34033	NC_008526	TCA	2	6	2184823	2184828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495646
34034	NC_008526	TCA	2	6	2184862	2184867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495646
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34038	NC_008526	A	6	6	2185147	2185152	100 %	0 %	0 %	0 %	116495646
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34042	NC_008526	CTT	2	6	2185534	2185539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495647
34043	NC_008526	TGC	2	6	2185853	2185858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495647
34044	NC_008526	AAGT	2	8	2185932	2185939	50 %	25 %	25 %	0 %	116495647
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34048	NC_008526	TGC	2	6	2186240	2186245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495647
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34050	NC_008526	GCA	2	6	2186269	2186274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495647
34051	NC_008526	CAT	2	6	2186282	2186287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495647
34052	NC_008526	TCA	3	9	2186317	2186325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495647
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34054	NC_008526	CCAA	2	8	2186437	2186444	50 %	0 %	0 %	50 %	116495647
34055	NC_008526	CTG	2	6	2186445	2186450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495647
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34100	NC_008526	GC	4	8	2189149	2189156	0 %	0 %	50 %	50 %	116495649
34101	NC_008526	GGTCA	2	10	2189177	2189186	20 %	20 %	40 %	20 %	116495649
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34115	NC_008526	ATAA	2	8	2189939	2189946	75 %	25 %	0 %	0 %	116495649
34116	NC_008526	ACCGC	2	10	2190084	2190093	20 %	0 %	20 %	60 %	116495649
34117	NC_008526	CAA	2	6	2190160	2190165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495649
34118	NC_008526	CCG	2	6	2190169	2190174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495649
34119	NC_008526	GAT	2	6	2190176	2190181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495649
34120	NC_008526	AAC	2	6	2190219	2190224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495649
34121	NC_008526	ATC	2	6	2190225	2190230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495649
34122	NC_008526	ACG	2	6	2190246	2190251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495649
34123	NC_008526	TGA	2	6	2190289	2190294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495649
34124	NC_008526	TGG	2	6	2190312	2190317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495649
34125	NC_008526	ATG	2	6	2190342	2190347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495649
34126	NC_008526	CTT	2	6	2190354	2190359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495650
34127	NC_008526	GCTG	2	8	2190398	2190405	0 %	25 %	50 %	25 %	116495650
34128	NC_008526	TGA	2	6	2190443	2190448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495650
34129	NC_008526	AAC	2	6	2190463	2190468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495650
34130	NC_008526	CGC	2	6	2190541	2190546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495650
34131	NC_008526	GCA	2	6	2190557	2190562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495650
34132	NC_008526	GCA	2	6	2190566	2190571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495650
34133	NC_008526	GC	3	6	2190628	2190633	0 %	0 %	50 %	50 %	116495650
34134	NC_008526	CTG	2	6	2190643	2190648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495650
34135	NC_008526	TCA	2	6	2190740	2190745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495650
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34137	NC_008526	ATTG	2	8	2190771	2190778	25 %	50 %	25 %	0 %	116495650
34138	NC_008526	A	6	6	2190810	2190815	100 %	0 %	0 %	0 %	116495650
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34140	NC_008526	CG	3	6	2190850	2190855	0 %	0 %	50 %	50 %	116495650
34141	NC_008526	CAA	2	6	2190928	2190933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495650
34142	NC_008526	GTC	2	6	2191115	2191120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495650
34143	NC_008526	CAT	3	9	2191213	2191221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495650
34144	NC_008526	GCA	2	6	2191253	2191258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495650
34145	NC_008526	GCA	2	6	2191271	2191276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495650
34146	NC_008526	AACA	2	8	2191336	2191343	75 %	0 %	0 %	25 %	116495650
34147	NC_008526	TGCG	2	8	2191355	2191362	0 %	25 %	50 %	25 %	116495650
34148	NC_008526	TGCC	2	8	2191378	2191385	0 %	25 %	25 %	50 %	116495650
34149	NC_008526	ATC	2	6	2191399	2191404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495650
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34151	NC_008526	TCAT	2	8	2191469	2191476	25 %	50 %	0 %	25 %	116495650
34152	NC_008526	ACC	2	6	2191483	2191488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495650
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34155	NC_008526	A	6	6	2191589	2191594	100 %	0 %	0 %	0 %	116495650
34156	NC_008526	GCCA	2	8	2191595	2191602	25 %	0 %	25 %	50 %	116495650
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34173	NC_008526	TTGCC	2	10	2192995	2193004	0 %	40 %	20 %	40 %	116495652
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34177	NC_008526	TGT	2	6	2193257	2193262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495652
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34180	NC_008526	ATAG	2	8	2193302	2193309	50 %	25 %	25 %	0 %	116495652
34181	NC_008526	GTAA	2	8	2193313	2193320	50 %	25 %	25 %	0 %	116495652
34182	NC_008526	CTT	2	6	2193365	2193370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495652
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34185	NC_008526	TCA	2	6	2193621	2193626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495652
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34191	NC_008526	AAAT	2	8	2194326	2194333	75 %	25 %	0 %	0 %	116495653
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34200	NC_008526	GTG	2	6	2194907	2194912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495653
34201	NC_008526	AAACA	2	10	2194969	2194978	80 %	0 %	0 %	20 %	116495653
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34216	NC_008526	CGA	2	6	2195532	2195537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495654
34217	NC_008526	AAG	2	6	2195565	2195570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495654
34218	NC_008526	GC	3	6	2195594	2195599	0 %	0 %	50 %	50 %	116495654
34219	NC_008526	CAT	2	6	2195724	2195729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495654
34220	NC_008526	CCA	2	6	2195738	2195743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495654
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34222	NC_008526	AACTTC	2	12	2195902	2195913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495654
34223	NC_008526	T	6	6	2196075	2196080	0 %	100 %	0 %	0 %	116495654
34224	NC_008526	ACC	2	6	2196181	2196186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495654
34225	NC_008526	ATATGA	2	12	2196468	2196479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116495655
34226	NC_008526	A	7	7	2196479	2196485	100 %	0 %	0 %	0 %	116495655
34227	NC_008526	TTA	2	6	2196568	2196573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495655
34228	NC_008526	ACG	2	6	2196584	2196589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495655
34229	NC_008526	AAG	2	6	2196596	2196601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495655
34230	NC_008526	GAT	2	6	2196614	2196619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495655
34231	NC_008526	TGC	2	6	2196628	2196633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495655
34232	NC_008526	ATG	2	6	2196669	2196674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495655
34233	NC_008526	AGC	2	6	2196817	2196822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495655
34234	NC_008526	TAT	2	6	2196909	2196914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495656
34235	NC_008526	ATT	2	6	2197057	2197062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495656
34236	NC_008526	ATCTTT	2	12	2197078	2197089	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116495656
34237	NC_008526	TTC	2	6	2197111	2197116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495656
34238	NC_008526	CCG	2	6	2197139	2197144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495656
34239	NC_008526	TTG	2	6	2197163	2197168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495656
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34242	NC_008526	TCAT	2	8	2197381	2197388	25 %	50 %	0 %	25 %	116495657
34243	NC_008526	TTGA	2	8	2197428	2197435	25 %	50 %	25 %	0 %	116495657
34244	NC_008526	ATG	2	6	2197446	2197451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495657
34245	NC_008526	CAC	2	6	2197607	2197612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495657
34246	NC_008526	CTG	2	6	2197642	2197647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495657
34247	NC_008526	AGC	2	6	2197701	2197706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495657
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34249	NC_008526	TTG	2	6	2197750	2197755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495657
34250	NC_008526	TGC	2	6	2197816	2197821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495657
34251	NC_008526	CAA	2	6	2197896	2197901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495657
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34253	NC_008526	TGC	2	6	2198017	2198022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495657
34254	NC_008526	TTG	3	9	2198055	2198063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495657
34255	NC_008526	AAC	2	6	2198178	2198183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495657
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34257	NC_008526	T	6	6	2198343	2198348	0 %	100 %	0 %	0 %	116495657
34258	NC_008526	GCC	2	6	2198353	2198358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495657
34259	NC_008526	TAA	2	6	2198393	2198398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495657
34260	NC_008526	CAT	2	6	2198444	2198449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495657
34261	NC_008526	CCA	2	6	2198499	2198504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495657
34262	NC_008526	ACA	2	6	2198525	2198530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495657
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34264	NC_008526	CAA	2	6	2198577	2198582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495657
34265	NC_008526	ATC	2	6	2198626	2198631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495657
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34339	NC_008526	TCT	2	6	2203030	2203035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495660
34340	NC_008526	ACAT	2	8	2203059	2203066	50 %	25 %	0 %	25 %	116495660
34341	NC_008526	AGA	2	6	2203117	2203122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495660
34342	NC_008526	GTC	2	6	2203134	2203139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495660
34343	NC_008526	ATA	2	6	2203165	2203170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495660
34344	NC_008526	CTT	2	6	2203442	2203447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495661
34345	NC_008526	GCG	2	6	2203454	2203459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495661
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34347	NC_008526	T	6	6	2203584	2203589	0 %	100 %	0 %	0 %	116495661
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