MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_008526	CGCATC	2	12	2147073	2147084	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116495613
33502	NC_008526	GGTG	2	8	2147090	2147097	0 %	25 %	75 %	0 %	116495613
33503	NC_008526	AAT	2	6	2147277	2147282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495613
33504	NC_008526	ACCG	2	8	2147283	2147290	25 %	0 %	25 %	50 %	116495613
33505	NC_008526	GGCC	2	8	2147318	2147325	0 %	0 %	50 %	50 %	116495613
33506	NC_008526	ATC	2	6	2147334	2147339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495613
33507	NC_008526	CTTCG	2	10	2147340	2147349	0 %	40 %	20 %	40 %	116495613
33508	NC_008526	GCTT	2	8	2147355	2147362	0 %	50 %	25 %	25 %	116495613
33509	NC_008526	GGC	2	6	2147466	2147471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495613
33510	NC_008526	AGC	2	6	2147664	2147669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495613
33511	NC_008526	TCA	2	6	2147695	2147700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495613
33512	NC_008526	GCC	2	6	2147810	2147815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495614
33513	NC_008526	CCG	2	6	2147867	2147872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495614
33514	NC_008526	CG	3	6	2147913	2147918	0 %	0 %	50 %	50 %	116495614
33515	NC_008526	AAG	2	6	2148035	2148040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495614
33516	NC_008526	CTTC	2	8	2148060	2148067	0 %	50 %	0 %	50 %	116495614
33517	NC_008526	ATC	2	6	2148079	2148084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495614
33518	NC_008526	CTT	2	6	2148102	2148107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495614
33519	NC_008526	GCG	2	6	2148110	2148115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495614
33520	NC_008526	TGG	2	6	2148126	2148131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495614
33521	NC_008526	TCGTGA	2	12	2148138	2148149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116495614
33522	NC_008526	ACTT	2	8	2148154	2148161	25 %	50 %	0 %	25 %	116495614
33523	NC_008526	CTG	2	6	2148169	2148174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495614
33524	NC_008526	CATGG	2	10	2148220	2148229	20 %	20 %	40 %	20 %	116495614
33525	NC_008526	TCA	2	6	2148323	2148328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495614
33526	NC_008526	CTG	2	6	2148360	2148365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495614
33527	NC_008526	CG	3	6	2148382	2148387	0 %	0 %	50 %	50 %	116495614
33528	NC_008526	TCG	2	6	2148411	2148416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495614
33529	NC_008526	AAC	2	6	2148427	2148432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495614
33530	NC_008526	TTTG	2	8	2148448	2148455	0 %	75 %	25 %	0 %	116495614
33531	NC_008526	TCT	2	6	2148500	2148505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495614
33532	NC_008526	CAA	2	6	2148538	2148543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495614
33533	NC_008526	TCG	2	6	2148693	2148698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495614
33534	NC_008526	TGGC	2	8	2148707	2148714	0 %	25 %	50 %	25 %	116495614
33535	NC_008526	AGC	2	6	2148715	2148720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495614
33536	NC_008526	CTTTG	2	10	2148738	2148747	0 %	60 %	20 %	20 %	116495614
33537	NC_008526	GCC	2	6	2148788	2148793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495614
33538	NC_008526	GCA	2	6	2148866	2148871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495614
33539	NC_008526	GCT	2	6	2148900	2148905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495614
33540	NC_008526	TTG	2	6	2149266	2149271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495615
33541	NC_008526	A	6	6	2149398	2149403	100 %	0 %	0 %	0 %	116495616
33542	NC_008526	AAG	2	6	2149474	2149479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495616
33543	NC_008526	TTG	2	6	2149486	2149491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495616
33544	NC_008526	CATCT	2	10	2149522	2149531	20 %	40 %	0 %	40 %	116495616
33545	NC_008526	TAA	2	6	2149533	2149538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495616
33546	NC_008526	TGTT	2	8	2149651	2149658	0 %	75 %	25 %	0 %	116495616
33547	NC_008526	TGT	2	6	2149670	2149675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495616
33548	NC_008526	TTGC	2	8	2149698	2149705	0 %	50 %	25 %	25 %	116495616
33549	NC_008526	ATT	2	6	2150049	2150054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495617
33550	NC_008526	AAG	2	6	2150189	2150194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495617
33551	NC_008526	GCG	2	6	2150238	2150243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495617
33552	NC_008526	T	6	6	2150248	2150253	0 %	100 %	0 %	0 %	116495617
33553	NC_008526	TTA	2	6	2150319	2150324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495617
33554	NC_008526	TGA	2	6	2150338	2150343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495617
33555	NC_008526	TTTG	2	8	2150434	2150441	0 %	75 %	25 %	0 %	116495617
33556	NC_008526	TTC	2	6	2150456	2150461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495617
33557	NC_008526	CTG	2	6	2150472	2150477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495617
33558	NC_008526	CAT	2	6	2150512	2150517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495617
33559	NC_008526	TGAT	2	8	2150550	2150557	25 %	50 %	25 %	0 %	116495617
33560	NC_008526	ACA	2	6	2150595	2150600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495617
33561	NC_008526	CAG	2	6	2150946	2150951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495618
33562	NC_008526	ATC	2	6	2150959	2150964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495618
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33565	NC_008526	GATC	2	8	2151069	2151076	25 %	25 %	25 %	25 %	116495618
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33569	NC_008526	CAT	2	6	2151280	2151285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495618
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33572	NC_008526	CGA	2	6	2151495	2151500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495619
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33574	NC_008526	TACG	2	8	2151519	2151526	25 %	25 %	25 %	25 %	116495619
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33584	NC_008526	AGGA	2	8	2152288	2152295	50 %	0 %	50 %	0 %	116495619
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33589	NC_008526	TGA	2	6	2152505	2152510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495619
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33592	NC_008526	CG	3	6	2152878	2152883	0 %	0 %	50 %	50 %	116495619
33593	NC_008526	CTT	2	6	2152895	2152900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495619
33594	NC_008526	AAGG	2	8	2152916	2152923	50 %	0 %	50 %	0 %	116495619
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33600	NC_008526	AT	3	6	2153178	2153183	50 %	50 %	0 %	0 %	116495619
33601	NC_008526	CGC	2	6	2153185	2153190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495619
33602	NC_008526	CAT	2	6	2153222	2153227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495619
33603	NC_008526	TTA	2	6	2153229	2153234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495619
33604	NC_008526	TTGTC	2	10	2153257	2153266	0 %	60 %	20 %	20 %	116495619
33605	NC_008526	GAT	2	6	2153276	2153281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495619
33606	NC_008526	AGC	2	6	2154312	2154317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495620
33607	NC_008526	TAT	2	6	2154351	2154356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495620
33608	NC_008526	ACC	2	6	2154385	2154390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495620
33609	NC_008526	AGCT	2	8	2154400	2154407	25 %	25 %	25 %	25 %	116495620
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33611	NC_008526	CAA	2	6	2156030	2156035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495621
33612	NC_008526	TTTG	2	8	2156055	2156062	0 %	75 %	25 %	0 %	116495621
33613	NC_008526	TAT	2	6	2156090	2156095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495621
33614	NC_008526	CAAT	2	8	2156150	2156157	50 %	25 %	0 %	25 %	116495621
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33616	NC_008526	A	7	7	2156172	2156178	100 %	0 %	0 %	0 %	116495621
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33733	NC_008526	TGA	3	9	2165842	2165850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495629
33734	NC_008526	GC	3	6	2165890	2165895	0 %	0 %	50 %	50 %	116495629
33735	NC_008526	TGA	2	6	2165902	2165907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495629
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