MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_008526	GAC	2	6	2115536	2115541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495586
33003	NC_008526	TCA	2	6	2115545	2115550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495586
33004	NC_008526	ATC	2	6	2115580	2115585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495586
33005	NC_008526	TCA	2	6	2115614	2115619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495586
33006	NC_008526	CTTC	2	8	2115669	2115676	0 %	50 %	0 %	50 %	116495586
33007	NC_008526	ATC	2	6	2115712	2115717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495586
33008	NC_008526	GCC	2	6	2115740	2115745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495586
33009	NC_008526	TCACTG	2	12	2115773	2115784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116495586
33010	NC_008526	TCATCG	2	12	2115791	2115802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116495586
33011	NC_008526	TTC	2	6	2115808	2115813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495586
33012	NC_008526	GCTG	2	8	2115844	2115851	0 %	25 %	50 %	25 %	116495586
33013	NC_008526	CTT	2	6	2115852	2115857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495586
33014	NC_008526	GCCGAA	2	12	2115863	2115874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495586
33015	NC_008526	CGA	2	6	2115919	2115924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495586
33016	NC_008526	CGC	3	9	2115937	2115945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495586
33017	NC_008526	TGC	2	6	2115980	2115985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495586
33018	NC_008526	GCT	2	6	2116010	2116015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495586
33019	NC_008526	ACA	2	6	2116022	2116027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495586
33020	NC_008526	CCA	2	6	2116032	2116037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495586
33021	NC_008526	CCA	2	6	2116091	2116096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495586
33022	NC_008526	CGG	2	6	2116120	2116125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495586
33023	NC_008526	TGT	2	6	2116148	2116153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495586
33024	NC_008526	TTCAC	2	10	2116184	2116193	20 %	40 %	0 %	40 %	116495586
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33027	NC_008526	GCA	2	6	2116414	2116419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495587
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33030	NC_008526	TG	3	6	2116467	2116472	0 %	50 %	50 %	0 %	116495587
33031	NC_008526	CTG	2	6	2116712	2116717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495587
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33035	NC_008526	GTA	2	6	2116867	2116872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495587
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33037	NC_008526	CTG	2	6	2116903	2116908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495587
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33040	NC_008526	CTG	2	6	2116954	2116959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495587
33041	NC_008526	TCA	2	6	2116983	2116988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495587
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33043	NC_008526	GCA	2	6	2117047	2117052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495587
33044	NC_008526	AT	3	6	2117106	2117111	50 %	50 %	0 %	0 %	116495587
33045	NC_008526	CGC	2	6	2117150	2117155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495587
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33049	NC_008526	CTGA	2	8	2117260	2117267	25 %	25 %	25 %	25 %	116495587
33050	NC_008526	GAC	2	6	2117272	2117277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495587
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33053	NC_008526	TC	3	6	2117563	2117568	0 %	50 %	0 %	50 %	116495588
33054	NC_008526	CAA	2	6	2117571	2117576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495588
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33058	NC_008526	CAT	2	6	2117739	2117744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495588
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33065	NC_008526	TGCT	2	8	2118087	2118094	0 %	50 %	25 %	25 %	116495588
33066	NC_008526	GCT	2	6	2118160	2118165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495588
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33102	NC_008526	CAT	2	6	2121038	2121043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495590
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33108	NC_008526	GGCC	2	8	2121394	2121401	0 %	0 %	50 %	50 %	116495590
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33111	NC_008526	T	6	6	2121514	2121519	0 %	100 %	0 %	0 %	116495590
33112	NC_008526	CAT	2	6	2121527	2121532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495590
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33115	NC_008526	GGC	2	6	2121793	2121798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495591
33116	NC_008526	TCAAAG	2	12	2121805	2121816	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116495591
33117	NC_008526	GCC	2	6	2121861	2121866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495591
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33123	NC_008526	TGC	2	6	2122157	2122162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495591
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33215	NC_008526	GTCATC	2	12	2127787	2127798	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116495597
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33222	NC_008526	ATTTTA	2	12	2128117	2128128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495598
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33224	NC_008526	GAT	2	6	2128269	2128274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495599
33225	NC_008526	ATTA	2	8	2128276	2128283	50 %	50 %	0 %	0 %	116495599
33226	NC_008526	CGG	2	6	2128293	2128298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495599
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33228	NC_008526	T	7	7	2128404	2128410	0 %	100 %	0 %	0 %	116495599
33229	NC_008526	CAA	2	6	2128413	2128418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495599
33230	NC_008526	ACT	2	6	2128439	2128444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495599
33231	NC_008526	TTG	2	6	2128504	2128509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495599
33232	NC_008526	TGATCA	2	12	2128520	2128531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116495599
33233	NC_008526	TCA	2	6	2128586	2128591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495599
33234	NC_008526	TCT	2	6	2128610	2128615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495599
33235	NC_008526	A	6	6	2128636	2128641	100 %	0 %	0 %	0 %	116495599
33236	NC_008526	T	6	6	2128694	2128699	0 %	100 %	0 %	0 %	116495600
33237	NC_008526	GCA	2	6	2128706	2128711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495600
33238	NC_008526	TTGGT	2	10	2128723	2128732	0 %	60 %	40 %	0 %	116495600
33239	NC_008526	TTC	2	6	2128761	2128766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495600
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33244	NC_008526	T	7	7	2129059	2129065	0 %	100 %	0 %	0 %	116495600
33245	NC_008526	GCA	2	6	2129092	2129097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495600
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33247	NC_008526	TTA	2	6	2129194	2129199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495600
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33249	NC_008526	ATC	2	6	2129325	2129330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495600
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33253	NC_008526	TG	3	6	2129859	2129864	0 %	50 %	50 %	0 %	116495601
33254	NC_008526	CTT	2	6	2129911	2129916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495601
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33259	NC_008526	TCC	2	6	2130170	2130175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116495601
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33325	NC_008526	GCT	2	6	2136412	2136417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495604
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33329	NC_008526	TCA	5	15	2136652	2136666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495604
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33331	NC_008526	ATC	2	6	2136711	2136716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495604
33332	NC_008526	AT	3	6	2136839	2136844	50 %	50 %	0 %	0 %	116495605
33333	NC_008526	TCA	2	6	2136846	2136851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495605
33334	NC_008526	ATGTC	2	10	2136867	2136876	20 %	40 %	20 %	20 %	116495605
33335	NC_008526	CGT	2	6	2136892	2136897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495605
33336	NC_008526	TCA	2	6	2137013	2137018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495605
33337	NC_008526	GAT	2	6	2137167	2137172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495605
33338	NC_008526	TGATC	2	10	2137230	2137239	20 %	40 %	20 %	20 %	116495605
33339	NC_008526	GAA	2	6	2137289	2137294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495605
33340	NC_008526	CAT	2	6	2137330	2137335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495605
33341	NC_008526	TGA	2	6	2137343	2137348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495605
33342	NC_008526	TCA	2	6	2137388	2137393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495605
33343	NC_008526	GTTGC	2	10	2137583	2137592	0 %	40 %	40 %	20 %	116495605
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33345	NC_008526	AAC	2	6	2137787	2137792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495605
33346	NC_008526	TCGGA	2	10	2137851	2137860	20 %	20 %	40 %	20 %	116495605
33347	NC_008526	GTT	2	6	2137917	2137922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495605
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33349	NC_008526	ATC	2	6	2137952	2137957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495605
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33449	NC_008526	GCT	2	6	2143830	2143835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495610
33450	NC_008526	TGCT	2	8	2143838	2143845	0 %	50 %	25 %	25 %	116495610
33451	NC_008526	CGG	2	6	2143936	2143941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495610
33452	NC_008526	GC	3	6	2144007	2144012	0 %	0 %	50 %	50 %	116495610
33453	NC_008526	ACGC	2	8	2144045	2144052	25 %	0 %	25 %	50 %	116495610
33454	NC_008526	TCTTTT	2	12	2144106	2144117	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116495610
33455	NC_008526	CTTG	2	8	2144122	2144129	0 %	50 %	25 %	25 %	116495610
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33457	NC_008526	AGC	2	6	2144150	2144155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495610
33458	NC_008526	CTGC	2	8	2144161	2144168	0 %	25 %	25 %	50 %	116495610
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33460	NC_008526	CTT	2	6	2144272	2144277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495610
33461	NC_008526	CGCTTG	2	12	2144282	2144293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495610
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33464	NC_008526	GAT	2	6	2144423	2144428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495610
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