MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_008526	TGA	2	6	1856499	1856504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495325
29003	NC_008526	CATCAA	2	12	1856508	1856519	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116495325
29004	NC_008526	CAC	2	6	1856554	1856559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495325
29005	NC_008526	GCC	2	6	1856566	1856571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495325
29006	NC_008526	CAT	2	6	1856797	1856802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495325
29007	NC_008526	TTC	2	6	1856805	1856810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495325
29008	NC_008526	TCC	2	6	1856833	1856838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116495326
29009	NC_008526	GCG	2	6	1856875	1856880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495326
29010	NC_008526	TGA	2	6	1856989	1856994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495326
29011	NC_008526	CAG	2	6	1857089	1857094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495326
29012	NC_008526	TGC	2	6	1857164	1857169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495327
29013	NC_008526	TTG	2	6	1857184	1857189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495327
29014	NC_008526	CG	3	6	1857199	1857204	0 %	0 %	50 %	50 %	116495327
29015	NC_008526	AAC	2	6	1857220	1857225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495327
29016	NC_008526	ACG	2	6	1857251	1857256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495327
29017	NC_008526	CGA	2	6	1857344	1857349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495327
29018	NC_008526	CAG	2	6	1857411	1857416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495327
29019	NC_008526	AGT	2	6	1857460	1857465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495327
29020	NC_008526	GTTG	2	8	1857484	1857491	0 %	50 %	50 %	0 %	116495327
29021	NC_008526	ACG	2	6	1857500	1857505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495327
29022	NC_008526	AGCG	2	8	1857513	1857520	25 %	0 %	50 %	25 %	116495327
29023	NC_008526	GCC	2	6	1857693	1857698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495327
29024	NC_008526	GCT	2	6	1857699	1857704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495327
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29026	NC_008526	TGC	2	6	1857772	1857777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495327
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29030	NC_008526	TGA	2	6	1857939	1857944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495327
29031	NC_008526	GTC	2	6	1858037	1858042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495327
29032	NC_008526	TGC	3	9	1858057	1858065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495327
29033	NC_008526	GCCA	2	8	1858082	1858089	25 %	0 %	25 %	50 %	116495327
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29043	NC_008526	GCCG	2	8	1858588	1858595	0 %	0 %	50 %	50 %	116495329
29044	NC_008526	ATCTT	2	10	1858613	1858622	20 %	60 %	0 %	20 %	116495329
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29054	NC_008526	GAT	2	6	1859134	1859139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495329
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29064	NC_008526	GC	3	6	1859484	1859489	0 %	0 %	50 %	50 %	116495329
29065	NC_008526	CAT	2	6	1859497	1859502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495329
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29119	NC_008526	CAGA	2	8	1862542	1862549	50 %	0 %	25 %	25 %	116495334
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29224	NC_008526	CAT	2	6	1867822	1867827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495340
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29228	NC_008526	CAAA	2	8	1867973	1867980	75 %	0 %	0 %	25 %	116495341
29229	NC_008526	ATG	2	6	1868019	1868024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495341
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29232	NC_008526	TGC	2	6	1868098	1868103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495341
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29348	NC_008526	GCT	2	6	1874350	1874355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495346
29349	NC_008526	CCA	3	9	1874507	1874515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495346
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29459	NC_008526	AACC	2	8	1880001	1880008	50 %	0 %	0 %	50 %	116495353
29460	NC_008526	GC	3	6	1880170	1880175	0 %	0 %	50 %	50 %	116495353
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29462	NC_008526	GTT	2	6	1880261	1880266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495353
29463	NC_008526	CCAA	2	8	1880288	1880295	50 %	0 %	0 %	50 %	116495353
29464	NC_008526	TTGC	2	8	1880349	1880356	0 %	50 %	25 %	25 %	116495353
29465	NC_008526	ACT	2	6	1880443	1880448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495354
29466	NC_008526	TGG	2	6	1880511	1880516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116495354
29467	NC_008526	TAA	2	6	1880541	1880546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495354
29468	NC_008526	CGG	2	6	1880586	1880591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495354
29469	NC_008526	T	6	6	1880595	1880600	0 %	100 %	0 %	0 %	116495354
29470	NC_008526	ATC	2	6	1880709	1880714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495354
29471	NC_008526	GAT	2	6	1880762	1880767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495354
29472	NC_008526	CATA	2	8	1880810	1880817	50 %	25 %	0 %	25 %	116495354
29473	NC_008526	TGA	2	6	1880864	1880869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495354
29474	NC_008526	ACGTC	2	10	1880933	1880942	20 %	20 %	20 %	40 %	116495354
29475	NC_008526	TCA	2	6	1880959	1880964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495354
29476	NC_008526	ATC	2	6	1881004	1881009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495354
29477	NC_008526	CGC	2	6	1881093	1881098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116495354
29478	NC_008526	CTGC	2	8	1881104	1881111	0 %	25 %	25 %	50 %	116495354
29479	NC_008526	GGC	2	6	1881164	1881169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495354
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29481	NC_008526	CAG	2	6	1881299	1881304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495354
29482	NC_008526	CAC	2	6	1881306	1881311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495354
29483	NC_008526	CAA	2	6	1881324	1881329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495354
29484	NC_008526	ACTT	2	8	1881546	1881553	25 %	50 %	0 %	25 %	116495355
29485	NC_008526	CGA	2	6	1881571	1881576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495355
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29487	NC_008526	AATC	2	8	1881686	1881693	50 %	25 %	0 %	25 %	116495355
29488	NC_008526	AAG	2	6	1881725	1881730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495355
29489	NC_008526	TGA	2	6	1881741	1881746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495355
29490	NC_008526	CAA	2	6	1881755	1881760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495355
29491	NC_008526	TGT	2	6	1881797	1881802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495355
29492	NC_008526	CAA	2	6	1881806	1881811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495355
29493	NC_008526	ATG	2	6	1881845	1881850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495355
29494	NC_008526	CAAC	2	8	1882034	1882041	50 %	0 %	0 %	50 %	116495356
29495	NC_008526	TGC	2	6	1882072	1882077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495356
29496	NC_008526	CAAAAT	2	12	1882203	1882214	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116495356
29497	NC_008526	TCA	2	6	1882217	1882222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495356
29498	NC_008526	AATCC	2	10	1882292	1882301	40 %	20 %	0 %	40 %	116495356
29499	NC_008526	CG	3	6	1882322	1882327	0 %	0 %	50 %	50 %	116495356
29500	NC_008526	ATC	2	6	1882402	1882407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495356

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