MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_008526	ACT	2	6	1753766	1753771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495238
27503	NC_008526	GAA	2	6	1753812	1753817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495238
27504	NC_008526	CTA	2	6	1753891	1753896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495238
27505	NC_008526	GAT	2	6	1753939	1753944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495238
27506	NC_008526	TG	3	6	1753945	1753950	0 %	50 %	50 %	0 %	116495238
27507	NC_008526	TGAT	2	8	1753955	1753962	25 %	50 %	25 %	0 %	116495238
27508	NC_008526	GTT	2	6	1754278	1754283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495239
27509	NC_008526	TCA	2	6	1754305	1754310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495239
27510	NC_008526	CTT	2	6	1754370	1754375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495239
27511	NC_008526	CAG	2	6	1754468	1754473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495239
27512	NC_008526	CA	3	6	1754480	1754485	50 %	0 %	0 %	50 %	116495239
27513	NC_008526	CCTT	2	8	1754500	1754507	0 %	50 %	0 %	50 %	116495239
27514	NC_008526	AATC	2	8	1754516	1754523	50 %	25 %	0 %	25 %	116495239
27515	NC_008526	GGAT	2	8	1754543	1754550	25 %	25 %	50 %	0 %	116495239
27516	NC_008526	GAA	2	6	1754640	1754645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495239
27517	NC_008526	CTGCAG	2	12	1754678	1754689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116495239
27518	NC_008526	ATC	2	6	1754718	1754723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495239
27519	NC_008526	TTC	2	6	1754760	1754765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495239
27520	NC_008526	TGCTT	2	10	1754776	1754785	0 %	60 %	20 %	20 %	116495239
27521	NC_008526	CAA	2	6	1754853	1754858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495239
27522	NC_008526	GC	3	6	1754860	1754865	0 %	0 %	50 %	50 %	116495239
27523	NC_008526	GTTCT	2	10	1754931	1754940	0 %	60 %	20 %	20 %	116495239
27524	NC_008526	CCA	2	6	1754974	1754979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116495239
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27526	NC_008526	CTT	2	6	1755030	1755035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495239
27527	NC_008526	CAG	2	6	1755071	1755076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495239
27528	NC_008526	GCA	2	6	1755169	1755174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495239
27529	NC_008526	TGAT	2	8	1755200	1755207	25 %	50 %	25 %	0 %	116495239
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27531	NC_008526	TCGG	2	8	1755289	1755296	0 %	25 %	50 %	25 %	116495239
27532	NC_008526	CAA	3	9	1755299	1755307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495239
27533	NC_008526	TTA	2	6	1755346	1755351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495239
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27538	NC_008526	GGTCA	2	10	1755495	1755504	20 %	20 %	40 %	20 %	116495239
27539	NC_008526	CTT	2	6	1755521	1755526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495239
27540	NC_008526	AT	3	6	1755619	1755624	50 %	50 %	0 %	0 %	116495239
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27542	NC_008526	CTT	2	6	1755671	1755676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495239
27543	NC_008526	ATC	2	6	1755754	1755759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495239
27544	NC_008526	CTT	2	6	1755785	1755790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116495239
27545	NC_008526	TCA	2	6	1755832	1755837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495239
27546	NC_008526	CGAT	2	8	1755865	1755872	25 %	25 %	25 %	25 %	116495239
27547	NC_008526	ATC	2	6	1755885	1755890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495239
27548	NC_008526	T	7	7	1755898	1755904	0 %	100 %	0 %	0 %	116495239
27549	NC_008526	AGC	2	6	1755963	1755968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495239
27550	NC_008526	ATT	2	6	1755991	1755996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116495239
27551	NC_008526	CCTT	2	8	1756005	1756012	0 %	50 %	0 %	50 %	116495240
27552	NC_008526	AGC	2	6	1756031	1756036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495240
27553	NC_008526	CAG	2	6	1756063	1756068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495240
27554	NC_008526	CTTG	2	8	1756175	1756182	0 %	50 %	25 %	25 %	116495240
27555	NC_008526	CAA	2	6	1756193	1756198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495240
27556	NC_008526	CGTG	2	8	1756209	1756216	0 %	25 %	50 %	25 %	116495240
27557	NC_008526	AAT	2	6	1756232	1756237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116495240
27558	NC_008526	CG	3	6	1756498	1756503	0 %	0 %	50 %	50 %	116495241
27559	NC_008526	GAT	2	6	1756987	1756992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495242
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27561	NC_008526	CAGG	2	8	1757059	1757066	25 %	0 %	50 %	25 %	116495242
27562	NC_008526	GGC	2	6	1757071	1757076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116495242
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27564	NC_008526	CTG	2	6	1757116	1757121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495242
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27567	NC_008526	A	6	6	1757232	1757237	100 %	0 %	0 %	0 %	116495242
27568	NC_008526	CTG	2	6	1757276	1757281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495242
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27573	NC_008526	TTAT	2	8	1757458	1757465	25 %	75 %	0 %	0 %	116495242
27574	NC_008526	TGA	2	6	1757466	1757471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495242
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27588	NC_008526	AGA	2	6	1757970	1757975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495242
27589	NC_008526	TTG	2	6	1758047	1758052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495242
27590	NC_008526	A	6	6	1758056	1758061	100 %	0 %	0 %	0 %	116495242
27591	NC_008526	AGCA	2	8	1758095	1758102	50 %	0 %	25 %	25 %	116495242
27592	NC_008526	GAA	2	6	1758108	1758113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116495242
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27596	NC_008526	TCG	2	6	1758239	1758244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495242
27597	NC_008526	AACTG	2	10	1758264	1758273	40 %	20 %	20 %	20 %	116495242
27598	NC_008526	TGA	2	6	1758488	1758493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495242
27599	NC_008526	TGA	2	6	1758705	1758710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495242
27600	NC_008526	GAC	2	6	1758739	1758744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116495242
27601	NC_008526	TTG	2	6	1758745	1758750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495242
27602	NC_008526	TGA	2	6	1758764	1758769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116495242
27603	NC_008526	CAA	2	6	1758780	1758785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495242
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27606	NC_008526	GTT	2	6	1759264	1759269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116495243
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27611	NC_008526	GCT	2	6	1759911	1759916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116495244
27612	NC_008526	TCA	2	6	1759944	1759949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116495244
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27616	NC_008526	CAA	2	6	1760073	1760078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116495244
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