MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008526	AAT	2	6	1040010	1040015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494558
16002	NC_008526	GAA	2	6	1040123	1040128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494558
16003	NC_008526	GTG	2	6	1040157	1040162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494558
16004	NC_008526	CTT	2	6	1040231	1040236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494558
16005	NC_008526	GGT	2	6	1040277	1040282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494558
16006	NC_008526	AC	3	6	1040311	1040316	50 %	0 %	0 %	50 %	116494558
16007	NC_008526	AT	3	6	1040354	1040359	50 %	50 %	0 %	0 %	116494558
16008	NC_008526	TTA	2	6	1040492	1040497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494558
16009	NC_008526	CCAG	2	8	1040629	1040636	25 %	0 %	25 %	50 %	116494559
16010	NC_008526	AAC	2	6	1040662	1040667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494559
16011	NC_008526	ACT	2	6	1040700	1040705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494559
16012	NC_008526	TTG	2	6	1040772	1040777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494559
16013	NC_008526	CCAA	2	8	1040787	1040794	50 %	0 %	0 %	50 %	116494559
16014	NC_008526	ATC	2	6	1040823	1040828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494559
16015	NC_008526	AGG	2	6	1040836	1040841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494559
16016	NC_008526	CAG	2	6	1040912	1040917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494560
16017	NC_008526	CTT	2	6	1040975	1040980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494560
16018	NC_008526	GCT	2	6	1041012	1041017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494560
16019	NC_008526	ACA	2	6	1041082	1041087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494560
16020	NC_008526	ACG	2	6	1041108	1041113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494560
16021	NC_008526	ATG	2	6	1041151	1041156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494560
16022	NC_008526	CG	3	6	1041286	1041291	0 %	0 %	50 %	50 %	116494560
16023	NC_008526	GTC	2	6	1041302	1041307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494560
16024	NC_008526	GGC	2	6	1041309	1041314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494560
16025	NC_008526	CTG	2	6	1041388	1041393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494560
16026	NC_008526	TCG	2	6	1041406	1041411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494560
16027	NC_008526	CAC	2	6	1041557	1041562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494560
16028	NC_008526	AC	3	6	1041568	1041573	50 %	0 %	0 %	50 %	116494560
16029	NC_008526	AGC	2	6	1041686	1041691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494560
16030	NC_008526	TAC	2	6	1041768	1041773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494560
16031	NC_008526	ATC	2	6	1041774	1041779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494560
16032	NC_008526	GTTC	2	8	1041873	1041880	0 %	50 %	25 %	25 %	116494560
16033	NC_008526	ATG	2	6	1041955	1041960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494560
16034	NC_008526	GGCAG	2	10	1041974	1041983	20 %	0 %	60 %	20 %	116494560
16035	NC_008526	ATT	2	6	1042038	1042043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494560
16036	NC_008526	CGG	2	6	1042153	1042158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494560
16037	NC_008526	TGC	2	6	1042247	1042252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494560
16038	NC_008526	ACT	2	6	1042273	1042278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494560
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16040	NC_008526	ACA	2	6	1042318	1042323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494561
16041	NC_008526	GTTGA	2	10	1042342	1042351	20 %	40 %	40 %	0 %	116494561
16042	NC_008526	CAT	2	6	1042482	1042487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494561
16043	NC_008526	AAG	2	6	1042639	1042644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494561
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16045	NC_008526	GAA	2	6	1042689	1042694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494561
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16047	NC_008526	GCTTAT	2	12	1042795	1042806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116494561
16048	NC_008526	GTTCA	2	10	1042828	1042837	20 %	40 %	20 %	20 %	116494561
16049	NC_008526	GAA	2	6	1042861	1042866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494561
16050	NC_008526	GAA	2	6	1042987	1042992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494561
16051	NC_008526	GCA	2	6	1042998	1043003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494561
16052	NC_008526	GCG	2	6	1043018	1043023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494561
16053	NC_008526	AAGG	2	8	1043089	1043096	50 %	0 %	50 %	0 %	116494561
16054	NC_008526	GAT	2	6	1043101	1043106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494561
16055	NC_008526	CCA	2	6	1043134	1043139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494561
16056	NC_008526	GAC	2	6	1043164	1043169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494561
16057	NC_008526	CAG	2	6	1043195	1043200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494561
16058	NC_008526	GCG	2	6	1043202	1043207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494561
16059	NC_008526	ATG	2	6	1043243	1043248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494561
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16061	NC_008526	CAAG	2	8	1043319	1043326	50 %	0 %	25 %	25 %	116494561
16062	NC_008526	GGCA	2	8	1043415	1043422	25 %	0 %	50 %	25 %	116494561
16063	NC_008526	ATT	2	6	1043569	1043574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494561
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16065	NC_008526	AAAC	2	8	1043665	1043672	75 %	0 %	0 %	25 %	116494561
16066	NC_008526	CAGG	2	8	1044099	1044106	25 %	0 %	50 %	25 %	116494562
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16069	NC_008526	GCT	2	6	1044201	1044206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494562
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16071	NC_008526	ATT	2	6	1044276	1044281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494562
16072	NC_008526	CAG	2	6	1044283	1044288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494562
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16075	NC_008526	GAT	2	6	1044330	1044335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494562
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16089	NC_008526	TCA	2	6	1044986	1044991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494562
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16099	NC_008526	CAT	2	6	1045638	1045643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494563
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16101	NC_008526	CAGT	2	8	1045883	1045890	25 %	25 %	25 %	25 %	116494563
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16108	NC_008526	GCC	2	6	1046311	1046316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494563
16109	NC_008526	CCAG	2	8	1046340	1046347	25 %	0 %	25 %	50 %	116494563
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16113	NC_008526	GGTG	2	8	1047189	1047196	0 %	25 %	75 %	0 %	116494564
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16115	NC_008526	CTG	2	6	1047303	1047308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494564
16116	NC_008526	ACG	2	6	1047342	1047347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494564
16117	NC_008526	GGTT	2	8	1047430	1047437	0 %	50 %	50 %	0 %	116494564
16118	NC_008526	TGC	2	6	1047463	1047468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494564
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16120	NC_008526	TTG	2	6	1047534	1047539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494564
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16122	NC_008526	GCG	2	6	1047592	1047597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494564
16123	NC_008526	TTA	2	6	1047801	1047806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494564
16124	NC_008526	TTG	2	6	1047867	1047872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494564
16125	NC_008526	TA	3	6	1047888	1047893	50 %	50 %	0 %	0 %	116494564
16126	NC_008526	GAT	2	6	1047908	1047913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494564
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16227	NC_008526	GGC	2	6	1053910	1053915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494569
16228	NC_008526	CAT	2	6	1053937	1053942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494569
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16230	NC_008526	AGC	2	6	1054076	1054081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494569
16231	NC_008526	TCA	2	6	1054092	1054097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494569
16232	NC_008526	ATA	2	6	1054124	1054129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494569
16233	NC_008526	ATA	2	6	1054144	1054149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494569
16234	NC_008526	CGT	2	6	1054159	1054164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494569
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16237	NC_008526	CGC	2	6	1054554	1054559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494570
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16239	NC_008526	TG	3	6	1054612	1054617	0 %	50 %	50 %	0 %	116494570
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16246	NC_008526	CTT	2	6	1055054	1055059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494570
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16250	NC_008526	TGA	2	6	1055246	1055251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494570
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16259	NC_008526	CTT	2	6	1055666	1055671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494570
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16330	NC_008526	TCG	2	6	1060307	1060312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494576
16331	NC_008526	TGA	2	6	1060317	1060322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494576
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16333	NC_008526	CGA	2	6	1060374	1060379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494576
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16336	NC_008526	TTC	2	6	1060490	1060495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494576
16337	NC_008526	GCCAAT	2	12	1060496	1060507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116494576
16338	NC_008526	TGA	3	9	1060538	1060546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494576
16339	NC_008526	A	6	6	1060580	1060585	100 %	0 %	0 %	0 %	116494576
16340	NC_008526	GGC	2	6	1060989	1060994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494577
16341	NC_008526	CGA	2	6	1061003	1061008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494577
16342	NC_008526	GC	3	6	1061051	1061056	0 %	0 %	50 %	50 %	116494577
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16344	NC_008526	TGT	2	6	1061130	1061135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494577
16345	NC_008526	GAA	2	6	1061268	1061273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494577
16346	NC_008526	CTT	2	6	1061276	1061281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494577
16347	NC_008526	GTC	2	6	1061329	1061334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494577
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16453	NC_008526	AGC	3	9	1066762	1066770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494582
16454	NC_008526	TGA	2	6	1066841	1066846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494582
16455	NC_008526	TCT	2	6	1066900	1066905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494582
16456	NC_008526	ACG	2	6	1067125	1067130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494583
16457	NC_008526	CAT	2	6	1067175	1067180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494583
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16482	NC_008526	A	7	7	1068474	1068480	100 %	0 %	0 %	0 %	116494584
16483	NC_008526	TTTG	2	8	1068497	1068504	0 %	75 %	25 %	0 %	116494584
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16497	NC_008526	CGAA	2	8	1069811	1069818	50 %	0 %	25 %	25 %	116494586
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