MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_008526	CTG	3	9	1009614	1009622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494524
15502	NC_008526	TGGTTA	2	12	1009646	1009657	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116494524
15503	NC_008526	GGC	2	6	1009659	1009664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494524
15504	NC_008526	GCA	2	6	1009851	1009856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494525
15505	NC_008526	GGT	2	6	1009863	1009868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494525
15506	NC_008526	CCTTC	2	10	1009887	1009896	0 %	40 %	0 %	60 %	116494525
15507	NC_008526	AAAGCT	2	12	1009911	1009922	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116494525
15508	NC_008526	GGT	2	6	1010022	1010027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494525
15509	NC_008526	GCT	2	6	1010121	1010126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494525
15510	NC_008526	TGA	2	6	1010177	1010182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494525
15511	NC_008526	AGA	2	6	1010210	1010215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494525
15512	NC_008526	AGA	2	6	1010234	1010239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494525
15513	NC_008526	AGA	2	6	1010381	1010386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494525
15514	NC_008526	TGAT	2	8	1010410	1010417	25 %	50 %	25 %	0 %	116494525
15515	NC_008526	GAC	2	6	1010427	1010432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494525
15516	NC_008526	GAT	2	6	1010433	1010438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494525
15517	NC_008526	CGAG	2	8	1010731	1010738	25 %	0 %	50 %	25 %	116494526
15518	NC_008526	GCA	2	6	1010752	1010757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494526
15519	NC_008526	ATTA	2	8	1010762	1010769	50 %	50 %	0 %	0 %	116494526
15520	NC_008526	CGC	2	6	1010807	1010812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494526
15521	NC_008526	CAG	2	6	1010844	1010849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494526
15522	NC_008526	T	6	6	1010851	1010856	0 %	100 %	0 %	0 %	116494526
15523	NC_008526	GGT	2	6	1010885	1010890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494526
15524	NC_008526	TGC	2	6	1010929	1010934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494526
15525	NC_008526	TCGA	2	8	1011080	1011087	25 %	25 %	25 %	25 %	116494526
15526	NC_008526	ATCA	2	8	1011101	1011108	50 %	25 %	0 %	25 %	116494526
15527	NC_008526	GGC	2	6	1011172	1011177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494526
15528	NC_008526	GCG	2	6	1011251	1011256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494526
15529	NC_008526	GCG	2	6	1011299	1011304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494526
15530	NC_008526	TAG	2	6	1011348	1011353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494526
15531	NC_008526	CGG	2	6	1011354	1011359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494526
15532	NC_008526	GCG	2	6	1011374	1011379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494526
15533	NC_008526	CAAG	2	8	1011433	1011440	50 %	0 %	25 %	25 %	116494526
15534	NC_008526	AGG	2	6	1011456	1011461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494526
15535	NC_008526	TGC	2	6	1011525	1011530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494527
15536	NC_008526	CAA	2	6	1011679	1011684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494527
15537	NC_008526	TGGG	2	8	1011908	1011915	0 %	25 %	75 %	0 %	116494527
15538	NC_008526	TTGG	2	8	1011944	1011951	0 %	50 %	50 %	0 %	116494527
15539	NC_008526	TCAGTT	2	12	1012029	1012040	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116494527
15540	NC_008526	GCC	2	6	1012051	1012056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494527
15541	NC_008526	CTT	2	6	1012059	1012064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116494527
15542	NC_008526	CAA	2	6	1012147	1012152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494527
15543	NC_008526	CAA	2	6	1012159	1012164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494527
15544	NC_008526	AAC	2	6	1012280	1012285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494527
15545	NC_008526	GCA	2	6	1012299	1012304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494527
15546	NC_008526	TGG	2	6	1012356	1012361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494527
15547	NC_008526	ATTG	2	8	1012454	1012461	25 %	50 %	25 %	0 %	116494528
15548	NC_008526	GCA	2	6	1012470	1012475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494528
15549	NC_008526	ATT	2	6	1012485	1012490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494528
15550	NC_008526	TTAG	2	8	1012647	1012654	25 %	50 %	25 %	0 %	116494528
15551	NC_008526	AGGCA	2	10	1012697	1012706	40 %	0 %	40 %	20 %	116494528
15552	NC_008526	CCG	2	6	1012725	1012730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494528
15553	NC_008526	GTG	2	6	1012778	1012783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494529
15554	NC_008526	GGC	2	6	1012816	1012821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494529
15555	NC_008526	ATT	2	6	1012897	1012902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494529
15556	NC_008526	TGTC	2	8	1012941	1012948	0 %	50 %	25 %	25 %	116494529
15557	NC_008526	ATG	2	6	1012950	1012955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494529
15558	NC_008526	ACG	2	6	1013051	1013056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494529
15559	NC_008526	CTTTA	2	10	1013470	1013479	20 %	60 %	0 %	20 %	116494530
15560	NC_008526	GTG	2	6	1013486	1013491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494530
15561	NC_008526	GCG	2	6	1013510	1013515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494530
15562	NC_008526	ATT	2	6	1013764	1013769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494530
15563	NC_008526	GAC	2	6	1013833	1013838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494530
15564	NC_008526	AGA	2	6	1013844	1013849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494530
15565	NC_008526	AC	3	6	1013899	1013904	50 %	0 %	0 %	50 %	116494531
15566	NC_008526	GCC	2	6	1014122	1014127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494531
15567	NC_008526	AAG	2	6	1014145	1014150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494531
15568	NC_008526	CAA	2	6	1014369	1014374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494532
15569	NC_008526	TGC	2	6	1014392	1014397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494532
15570	NC_008526	AAG	2	6	1014442	1014447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494532
15571	NC_008526	AAG	2	6	1014474	1014479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494532
15572	NC_008526	GTT	2	6	1014488	1014493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494532
15573	NC_008526	GATCA	2	10	1014495	1014504	40 %	20 %	20 %	20 %	116494532
15574	NC_008526	A	6	6	1014665	1014670	100 %	0 %	0 %	0 %	116494532
15575	NC_008526	TGA	2	6	1014721	1014726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494532
15576	NC_008526	TCA	2	6	1014845	1014850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494532
15577	NC_008526	TGT	3	9	1014887	1014895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494532
15578	NC_008526	TAC	2	6	1014915	1014920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494532
15579	NC_008526	CGG	2	6	1014955	1014960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494532
15580	NC_008526	CAT	2	6	1014981	1014986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494532
15581	NC_008526	AGG	2	6	1015022	1015027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116494532
15582	NC_008526	GTTT	2	8	1015033	1015040	0 %	75 %	25 %	0 %	116494532
15583	NC_008526	GAA	2	6	1015068	1015073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494532
15584	NC_008526	GCG	2	6	1015074	1015079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494532
15585	NC_008526	TGGC	2	8	1015092	1015099	0 %	25 %	50 %	25 %	116494532
15586	NC_008526	CTG	2	6	1015173	1015178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494532
15587	NC_008526	GCT	2	6	1015299	1015304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494532
15588	NC_008526	TGAT	3	12	1015314	1015325	25 %	50 %	25 %	0 %	116494532
15589	NC_008526	ATT	2	6	1015540	1015545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494533
15590	NC_008526	CTG	2	6	1015559	1015564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494533
15591	NC_008526	ATT	2	6	1015571	1015576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494533
15592	NC_008526	GCA	2	6	1015690	1015695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494533
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15596	NC_008526	GTT	2	6	1015838	1015843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494533
15597	NC_008526	GCT	2	6	1015867	1015872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494533
15598	NC_008526	CCA	2	6	1015961	1015966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494533
15599	NC_008526	AAGA	2	8	1016141	1016148	75 %	0 %	25 %	0 %	116494534
15600	NC_008526	ATCC	2	8	1016248	1016255	25 %	25 %	0 %	50 %	116494534
15601	NC_008526	TCA	2	6	1016289	1016294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494534
15602	NC_008526	TTA	2	6	1016376	1016381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494534
15603	NC_008526	AT	3	6	1016386	1016391	50 %	50 %	0 %	0 %	116494534
15604	NC_008526	CTGG	2	8	1016415	1016422	0 %	25 %	50 %	25 %	116494534
15605	NC_008526	TTG	2	6	1016434	1016439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494534
15606	NC_008526	TGC	2	6	1016544	1016549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494534
15607	NC_008526	ATT	2	6	1016621	1016626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494534
15608	NC_008526	T	6	6	1016720	1016725	0 %	100 %	0 %	0 %	116494534
15609	NC_008526	TGG	2	6	1016763	1016768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494534
15610	NC_008526	TCG	2	6	1016778	1016783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494534
15611	NC_008526	TTGT	2	8	1016894	1016901	0 %	75 %	25 %	0 %	116494534
15612	NC_008526	GCC	3	9	1016984	1016992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494534
15613	NC_008526	ATT	2	6	1016996	1017001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494534
15614	NC_008526	CTGC	2	8	1017030	1017037	0 %	25 %	25 %	50 %	116494534
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15616	NC_008526	TTTG	2	8	1017257	1017264	0 %	75 %	25 %	0 %	116494534
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15732	NC_008526	TCA	2	6	1025020	1025025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494542
15733	NC_008526	ATC	2	6	1025114	1025119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494542
15734	NC_008526	T	7	7	1025193	1025199	0 %	100 %	0 %	0 %	116494542
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15742	NC_008526	ATG	2	6	1025405	1025410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494543
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15758	NC_008526	TGA	2	6	1026249	1026254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494544
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15768	NC_008526	GC	3	6	1026687	1026692	0 %	0 %	50 %	50 %	116494544
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15842	NC_008526	AATT	2	8	1031323	1031330	50 %	50 %	0 %	0 %	116494551
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15846	NC_008526	CAA	2	6	1031427	1031432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494551
15847	NC_008526	AT	3	6	1031557	1031562	50 %	50 %	0 %	0 %	116494551
15848	NC_008526	T	7	7	1031562	1031568	0 %	100 %	0 %	0 %	116494551
15849	NC_008526	GCC	2	6	1031596	1031601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494551
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15851	NC_008526	CCG	2	6	1031896	1031901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494552
15852	NC_008526	CAT	2	6	1031931	1031936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494552
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15856	NC_008526	GCC	2	6	1032035	1032040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494552
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15858	NC_008526	CGA	2	6	1032263	1032268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494553
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15865	NC_008526	TCA	2	6	1032511	1032516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494553
15866	NC_008526	ATC	4	12	1032519	1032530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494553
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15959	NC_008526	GTTGA	2	10	1037670	1037679	20 %	40 %	40 %	0 %	116494557
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15964	NC_008526	GCT	2	6	1037973	1037978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494557
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