MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 45276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15003	NC_008526	CAT	2	6	976892	976897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494495
15004	NC_008526	GAT	2	6	976902	976907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494495
15005	NC_008526	CTGC	2	8	976934	976941	0 %	25 %	25 %	50 %	116494495
15006	NC_008526	GCTA	2	8	976965	976972	25 %	25 %	25 %	25 %	116494495
15007	NC_008526	GAACT	2	10	977074	977083	40 %	20 %	20 %	20 %	116494495
15008	NC_008526	ATG	2	6	977110	977115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494495
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15012	NC_008526	T	6	6	977514	977519	0 %	100 %	0 %	0 %	116494495
15013	NC_008526	A	6	6	977538	977543	100 %	0 %	0 %	0 %	116494495
15014	NC_008526	ACA	2	6	977564	977569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494495
15015	NC_008526	CCG	3	9	977602	977610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494495
15016	NC_008526	CAG	2	6	977619	977624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494495
15017	NC_008526	GCT	2	6	978030	978035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494496
15018	NC_008526	TTCA	2	8	978059	978066	25 %	50 %	0 %	25 %	116494496
15019	NC_008526	T	7	7	978088	978094	0 %	100 %	0 %	0 %	116494496
15020	NC_008526	ATA	2	6	978096	978101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494496
15021	NC_008526	AAG	2	6	978195	978200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494496
15022	NC_008526	TGG	2	6	978268	978273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116494496
15023	NC_008526	CGA	2	6	978338	978343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494496
15024	NC_008526	GTT	2	6	978356	978361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494496
15025	NC_008526	T	6	6	978394	978399	0 %	100 %	0 %	0 %	116494496
15026	NC_008526	ATT	2	6	978485	978490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494496
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15028	NC_008526	TGA	2	6	978613	978618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494496
15029	NC_008526	TGC	2	6	978643	978648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494496
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15032	NC_008526	T	7	7	979257	979263	0 %	100 %	0 %	0 %	116494497
15033	NC_008526	T	6	6	979323	979328	0 %	100 %	0 %	0 %	116494497
15034	NC_008526	CGC	2	6	979350	979355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116494497
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15039	NC_008526	GCCAT	2	10	979718	979727	20 %	20 %	20 %	40 %	116494498
15040	NC_008526	TGT	2	6	979848	979853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494498
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15043	NC_008526	TGA	2	6	980160	980165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494498
15044	NC_008526	GTC	2	6	980179	980184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494498
15045	NC_008526	ACC	2	6	980240	980245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116494498
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15047	NC_008526	AATG	2	8	980287	980294	50 %	25 %	25 %	0 %	116494498
15048	NC_008526	GGC	2	6	980311	980316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494498
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15056	NC_008526	TTG	2	6	980955	980960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494499
15057	NC_008526	TGC	2	6	981032	981037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494499
15058	NC_008526	TGC	2	6	981041	981046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494499
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15063	NC_008526	ATT	2	6	981135	981140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116494499
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15091	NC_008526	GAC	2	6	983407	983412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494503
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15098	NC_008526	TGGC	2	8	983793	983800	0 %	25 %	50 %	25 %	116494503
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15104	NC_008526	T	6	6	984292	984297	0 %	100 %	0 %	0 %	116494504
15105	NC_008526	A	6	6	984417	984422	100 %	0 %	0 %	0 %	116494504
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15118	NC_008526	CAAT	2	8	985377	985384	50 %	25 %	0 %	25 %	116494504
15119	NC_008526	CCT	2	6	985390	985395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116494504
15120	NC_008526	A	6	6	985428	985433	100 %	0 %	0 %	0 %	116494504
15121	NC_008526	TCA	2	6	985590	985595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494505
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15124	NC_008526	GCG	2	6	985791	985796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494505
15125	NC_008526	TGAATG	2	12	985955	985966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494505
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15235	NC_008526	ATGTG	2	10	992263	992272	20 %	40 %	40 %	0 %	116494511
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15358	NC_008526	AGA	2	6	999606	999611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494518
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15360	NC_008526	ATG	2	6	999674	999679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494518
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15471	NC_008526	GAT	2	6	1006104	1006109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494523
15472	NC_008526	AGA	2	6	1006130	1006135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116494523
15473	NC_008526	ATC	2	6	1006279	1006284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494523
15474	NC_008526	TGT	2	6	1006291	1006296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494523
15475	NC_008526	CTG	2	6	1006339	1006344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494523
15476	NC_008526	GTTGCA	2	12	1006445	1006456	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116494523
15477	NC_008526	GGC	2	6	1006458	1006463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116494523
15478	NC_008526	GCT	2	6	1006560	1006565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116494523
15479	NC_008526	GCA	2	6	1006599	1006604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494523
15480	NC_008526	CAG	2	6	1006611	1006616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494523
15481	NC_008526	TTGA	2	8	1006620	1006627	25 %	50 %	25 %	0 %	116494523
15482	NC_008526	GAT	2	6	1006704	1006709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116494523
15483	NC_008526	AGC	2	6	1006727	1006732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494523
15484	NC_008526	TTGA	2	8	1006809	1006816	25 %	50 %	25 %	0 %	116494523
15485	NC_008526	CAG	2	6	1006858	1006863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494523
15486	NC_008526	GCA	2	6	1006873	1006878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116494523
15487	NC_008526	AATC	2	8	1006970	1006977	50 %	25 %	0 %	25 %	116494523
15488	NC_008526	TTACT	2	10	1007024	1007033	20 %	60 %	0 %	20 %	116494523
15489	NC_008526	AAT	2	6	1007095	1007100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116494523
15490	NC_008526	T	6	6	1009193	1009198	0 %	100 %	0 %	0 %	116494524
15491	NC_008526	A	6	6	1009199	1009204	100 %	0 %	0 %	0 %	116494524
15492	NC_008526	TGGC	2	8	1009217	1009224	0 %	25 %	50 %	25 %	116494524
15493	NC_008526	TTTG	2	8	1009234	1009241	0 %	75 %	25 %	0 %	116494524
15494	NC_008526	T	6	6	1009247	1009252	0 %	100 %	0 %	0 %	116494524
15495	NC_008526	AAC	2	6	1009279	1009284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116494524
15496	NC_008526	AAGC	2	8	1009325	1009332	50 %	0 %	25 %	25 %	116494524
15497	NC_008526	CAAT	2	8	1009370	1009377	50 %	25 %	0 %	25 %	116494524
15498	NC_008526	TTG	2	6	1009401	1009406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116494524
15499	NC_008526	TCA	2	6	1009558	1009563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116494524
15500	NC_008526	GGCG	2	8	1009574	1009581	0 %	0 %	75 %	25 %	116494524

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